中文核心期刊(2008)中文核心期刊(2004)中文核心期刊(2000)中文核心期刊(1996)中文核心期刊(1992)一直是核心期刊
根据武汉大学发表的《中国学术期刊评价的做法及结果》文章查询，属于A+级核心期刊
《南京农业大学学报》为综合性农业学术期刊，1956年创刊，包括《南京农业大学学报》（自然科学版）和《南京农业大学学报》（社会科学版），主要刊登农业科学、植物保护、园艺科学、动物科学、动物医学、生物技术与工程、资源与环境科学、农业工程等学科具有创新性的研究论文、文献综述、研究简报。《南京农业大学学报》为中文核心期刊、中国精品科技期刊、百种中国杰出学术期刊、中国科学引文数据库(CSCD)源期刊、中国科技期刊引证报告(CJCR)源期刊，12013年的影响因子为221，2014年各项学术指标综合排名在1989种统计源期刊中排第250位。
《华北农学报》(双月刊)《农业现代化研究》《浙江海洋学院学报(自然科学版)》《山东农业大学学报》(自然科学版)《福建农林大学学报(自然科学版)》(双月刊)《上海交通大学学报》(农业科学版)(双月刊)
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中国农业科学植物营养与肥料学报中国棉花种子
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《南京农业大学学报》在线采编系统从2011年11月1日起试运行。采用在线采编系统，可实现作者在线投稿、查稿，专家在线审稿，编辑在线办公。该系统具有快捷、互动、方便的优点，有利于信息及时交流。 由于在线采编系统为试运行，网站暂时由开发采编系统的公司进行服务器托管，所以校内作者投稿和专家审稿要通过网关登录到校外。网址：。 欢迎广大读者、作者和科研人员使用，并将使用过程发现的问题以及需要改进的意见及时反馈给学报编辑部。编辑部电话：025–84395214，或者发送电子邮件到。《南京农业大学学报》编辑部2011 年 11月1日
《南京农业大学学报》为综合性农业学术期刊，1956年创刊，包括《南京农业大学学报》（自然科学版）和《南京农业大学学报》（社会科学版），主要刊登农业科学、植物保护、园艺科学、动物科学、动物医学、生物技术与工程、资源与环境科学、农业工程等学科具有创新性的研究论文、文献综述、研究简报。《南京农业大学学报》为中文核心期刊、中国精品科技期刊、百种中国杰出学术期刊、中国科学引文数据库(CSCD)源期刊、中国科技期刊引证报告(CJCR)源期刊，12013年的影响因子为221，2014年各项学术指标综合排名在1989种统计源期刊中排第250位。
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《南京农业大学学报》为综合性农业学术期刊，1956年创刊，包括《南京农业大学学报》（自然科学版）和《南京农业大学学报》（社会科学版），主要刊登农业科学、植物保护、园艺科学、动物科学、动物医学、生物技术与工程、资源与环境科学、农业工程等学科具有创新性的研究论文、文献综述、研究简报。《南京农业大学学报》为中文核心期刊、中国精品科技期刊、百种中国杰出学术期刊、中国科学引文数据库(CSCD)源期刊、中国科技期刊引证报告(CJCR)源期刊，12013年的影响因子为221，2014年各项学术指标综合排名在1989种统计源期刊中排第250位。
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