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scifinder使用教程有机结构式搜索

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scifinder使用教程有机结构式搜索

从事科研者一般都要知道化合物更详细的信息,一般的搜索是不可能得到想要的结果的,这就需要借助数据库来检索,下面介绍如何根据结构式利用HMDB数据库来检索化合物信息。首先,百度HMDB,找到并打开HMDB数据库。打开HMDB数据库后,点击“Search”下的第一个子选项。弹出页面中,在绘制结构式的区域绘制所要查询的结构式,本例以绘制化合物“瓜氨酸“为例。用周围的工具正确绘制瓜氨酸的结构式,之后点击”Search“。根据化合物英文名以及Score值来选择正确的化合物,一般来说就是第一个。点击”HMDB“开头的那个按钮,就弹出了这个化合物的详细的信息,包括描述以及相关蛋白、基因和通路等等。结构式一定要绘制正确。打开ChemOffice 2014等各种版本文件小的软件,点击后出现图二的界面。界面的左边出现许多的选择相,很多的结构,在这里,我们选择苯环,这时,空白的地方会出现苯环的结构。如果需要加入单链、双键时,先选中苯环上要接入的位置,只需要用鼠标选择后,就会出现一个小“+”,只需要我们选中想要插入的基团或者其他的官能团,如果在,环上加入其他的基团,先双击环上要加入基团的位置,就会出现图片上的效果,其他的位置也可以改变。这个时候我们就可以复制出来,粘贴到word中,步骤如图中的第一步,再选中五元环,右击有出现copy,就完成了。制作结构式时,如果不需要在插入其他的官能团,就可以选着左处的箭头。

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首先绘制好结构式,然后点击工具栏中的Search SciFinder工具(红色标记内)。 此时ChemBioDraw 0会弹出新Search SciFinder对话框。 左侧为Substance Search(物质检索); 右侧为Reaction Search(反应式检索)。

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检索方法:主要分为Explore、Locate和Browse三种检索方式Explore(搜索科技文献):分为ExploreLiterature、ExploreReactions和ExploreSubstances三大部分:1ExploreLiterature(搜索文献):可按照ResearchTopic(研究主题)、AuthorName(作者姓名)和CompanyName/Organization(单位名称)三大途径进行检索。2ExploreReactions(搜索反应):可通过画出反应途径查找特定的反应过程。3ExploreSubstances(搜索物质):可通过画出ChemicalStructure(化学结构)或输入MolecularFormular(分子式)来查找化学物质。Locate(查找特定的文献或物质):分为LocateLiterature和LocateSubstance两大部分:1LocateLiterature(定位文献):可按照BibliographicInformation(文献著录信息:作者姓名、期刊名、文献题名或专利号)以及DocumentIdentifier(文献:专利号或标识号CA文摘号)进行特定文献的检索。2LocateSubstance(定位物质):按照SubstanceIdentifier(物质标识号:化学名称、CAS登记号)查找特定的化学物质。Browse(浏览期刊文献内容):可直接浏览1800多核心期刊的摘要及其引文等编目内容,在期刊列表中选中感兴趣的期刊,查看需要的论文(系统默认为该期刊最新一期的目录,可点击SelectIssue选择查看所有年份的期刊文献。

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