今天给大家分享一篇GEO联合Oncomine数据挖掘的文章。这篇主要是通过下载GEO的数据，通过差异分析，GO富集分析，KEGG富集分析，PPI分析，以及联合Oncomine分析，找到了与小细胞肺癌相关的biomaker和pathway。论文…
GEO表达谱芯片分析的技术非常成熟，发表的相关论文也非常多，如果需要深入研究GEO表达谱芯片，多芯片联合分析提供了很好的思路，这样得到的差异基因，更加具有说服力；同时可以联合TC
GEO数据库使用教程及在线数据分析工具.GEO数据库全称GENEEXPRESSIONOMNIBUS，是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。.它创建于2000年，收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据，也就是说只要是目前已经发表的论文，论文中...
这周我们有个老师特地给我们推荐了一个专门针对GEO数据分析的综合在线工具--BART，这个工具最近发表在BMCBioinformatics上，是一个从CELL或expression表达矩阵输入到可视化分析、富集分析的综合分析平台。对于那些生信还没入门的同学来说，该工具的...
GEO数据库单基因文章套路视频(GEO生存分析)--生信自学网今天我们给大家介绍下GEO数据库单基因文章套路”的课程，该课程根据最新发表3分多的文章录制。通过该课程的学习，我们可以单独发表3-5分的文章。也可以通过和TCGA数据库进行联合分析...
GEO数据库全称GENEEXPRESSIONOMNIBUS，是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。它创建于2000年，收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据，也就是说只要是目前已经发表的论文，论…
生信分析：TCGA、GEO、Oncnmine数据挖掘（含代码）.(1)TCGA数据整理和基因注释.(2)GEO数据下载和数据质量分析.(3)寻找差异基因及制作热图和火山图.(4)富集分析.(5)TCGA数据下载.(6)寻找差异基因和制作5年生存率.(7)Oncomine概述及Meta分析.
从课题设计，工具使用，再到零代码，一键分析，原始数据下载，再到论文写作，不得不说，这个由一群医生创建的生信平台，实在是太懂广大科研gou了。02中文版GEO数据库相比TCGA主要存储高通量（二代测序）数据的样本数据，GEO数据库全称GeneExpressionOmnibusdatabase，是由美国NCBI创建并维护...
数据挖掘论文（最新范文6篇）.来源：原创论文网添加时间：2017-12-19.数据挖掘是从大量的、不完全的、有噪声的、模糊的、随机的实际数据中，提取隐含在其中的、人们所不知道的、但又是潜在有用信息和知识的过程。.希望你在阅读了以下数据挖掘论文后对...
本研究通过GEO数据库检索获得GSE6044和GSE40275两个基因芯片数据集，原数据集均纳入肺癌的各个病理类型进行研究，但未对SCLC进行单独讨论且样本量较少。我们将两个数据集进行整合分析，扩大样本量，深入探讨SCLC发生、发展的机制以及潜在的
论文主要分析内容:1、差异表达分析2、GO富集分析3、Pathway富集分析4、蛋白互作网络分析大家可以发现,GEO数据挖掘就是这个套路,下数据,差异表达分析,GO分析,Pathway分析,PPI分...
我们的数据挖掘课程中,有一个课是主讲如何从geo数据库中下载想要的数据,并用R语言进行分析。我们可以得到各种图,如韦恩图、热图、火山图、go和kegg条形图和气泡、蛋白互作图等,我们得...
今天给大家还原一篇GEO数据挖掘的范文。论文题目:Identificationofdifferentiallyexpressedgenesandsignalingpathwaysinovariancancerbyintegratedbioinformaticsan...
目前,从现有数据库挖掘数据进行分析是一个热门领域,生信数据挖掘是直接从现有的数据库挖掘数据进行分析,不用做实验就可以得到一篇生信文章所需要的数据,这个听起来就很有力。GEO...
其中,EPHX2和RMI2被认为是CESC相关化和表达的两个新的关键基因。此外,还定义了4种CESC候选小分子药物(喜树碱、白藜芦醇、伏立诺他和曲古抑菌素A)。研究...
精神医学杂志2018年第31卷第3期JournalofPsychiatry,2018,Vol31,No.3基于GEO数据的精神症差异表达基因分析刘蜀东魏晓云李松曾真秦丽胡黎丹【摘...
GeoTIFF格式分析及其在测量中的应用曹凤海易昌华殷学涛罗桂圆柳安青摘要(东方地球物理公司装备服务处测量服务中心,河北涿州072750)曹凤海...
这篇文章作者们使用GEO里的转录组测序数据,提供了第一个全面的分析人造血干细胞在分化过程中circRNA表达谱系的变化。我们在这里展示了circRNA的表达,且具有细胞...
大家可以发现,GEO数据挖掘,以及TCGA数据的挖掘就是这个套路(点击),先确定自己要分析的疾病,然后下载数据,差异表达分析,筛选得到几个关键的分子(可以是lncRNA,mRNA,miRNA,circRNA...
前段时间主管让我在GEO数据库弄个表达图谱,准备接下来做各种转录组分析,现在回过头来,觉得这个东西比较简单,十分适合上手练习。思考了一下,决定写下来分享给大家。注意了,我所说的都...