纯生信文章可以评职称的。纯生信是指不用做实验就可以发表的生信文章，生信文章是指生物信息学类的文章只要文章写得好，并且对医学有一定的进步，发展完全可以评得上职称。
我们都知道在科研论文中有两大类：一类是研究型论文；另一类是综述型论文。其中，前者主要是以研究为主的行文思路，根据研究发现的不同发表在不同级别的杂志上；而后者多是本身没有新的研究发现，主要是对前人的研究结果进行评价综述。然而，这两种分类都是针对以实验为主论文分类，那么这两年生信为主的文章发文量逐年增加，是否也有这样的分类呢？ Immugent今天就来解读特别的一类生信文章，姑且把它称为“生信综述”吧，因为我人微言轻，并不会我把它叫什么，以后都是这种叫法，就不绞尽脑汁想这个名字了。 这类“生信综述”文章已经有很多年的发展史了，主要都是围绕对各种火爆一时(引领科研)的重大技术来展开，比如近些年火热的单细胞测序技术。那么今天我就来以单细胞测序为主题，来解读一下如何利用此类思路发表高分文章，注意全都是一分钱没花的那种！ 我先讲的第一篇是2021年发表在J Am Soc Nephrol（IF:）的篇名为“How to Get Started with Single Cell RNA Sequencing Data Analysis”的文章。好吧，看了一下日历，今年已经2022年了，就不吐槽这个文章时效性的问题了。但全文真的很简单，就是介绍了一下单细胞测序数据分析的基本流程。 来看看它的摘要：在过去的5年里，单细胞方法已经能够在一个实验中监测数千个单个细胞的基因和蛋白质表达、遗传和表观遗传变化。随着测量方法的改进以及反应和测序成本的降低，这些数据集的大小正在迅速增加。关键的瓶颈仍然是对单细胞实验产生的丰富信息的分析。在这篇综述中，我们对分析管道进行了一个简化的概述，因为它们通常在该领域中使用。我们的目标是使研究人员开始单细胞分析，以获得挑战和最常用的分析工具的概述。此外，我们希望能够帮助其他人了解单细胞数据集的典型读数在已发表的文献中是如何呈现的。好吧，确实是一篇综述！ 全文虽然有7副图，但大多都是那种最基础的绘图，想必大家都会。但是这里Immugent想说的是这篇文章虽然是综述类，但其实比真正的综述好写多了。类比这篇文章，等到下一次再出现类似于单细胞测序这种现象级技术，是不是有的小伙伴也整一篇类似的呢！ 接下来要讲的第二篇是2020年发表在Comput Struct Biotechnol J （IF:）的篇名为“Benchmarking algorithms for pathway activity transformation of single-cell RNA-seq data”的文章。这类文章就比上一类有些技术含量了，起码像综述的感觉了！ 就像这篇是总结了对单细胞数据进行通路评分的各种算法，并使用已经发表的数据对各类算法的优缺点进行了比较，并在最后给出了自己的见解。嗯，怎么说呢！还是比一般的综述好写一点，比纯算法开发类文章好开发一些。那么如果这类算法在不久的将来出现了更多，那么是不是就科研考虑写一个更新版的呢？ 接下来要讲的第三篇是2021年发表在Genome Biol（IF:）的篇名为“Over 1000 tools reveal trends in the singlecell RNA-seq analysis landscape”的文章。这个文章作为汇总类综述，真的不是吹的了，一篇文章总结了1000+种分析单细胞数据的工具，我对这个作者也是膜拜之至。 并且作者还开发了一个网站： ，并这个网站收录的工具还会一直更新，这真是圈内的劳模啊。 这类文章虽然需要耗费一些时间，但思路还是很简洁的，但是主要是得掌握住时效性，而且最好是自己研究的领域，那样能提出自己的一些思考，就能给文章增色不少。 第四篇是2020年，同样发表在Genome Biol（IF:）的篇名为“A benchmark of batch-effect correction methods for single-cell RNA sequencing data”的文章。作者对当时存在的14种对不同来源的单细胞数据进行去批次处理的算法进行比较，深入揭示它们之间的优缺点和功能表现。 全文的图做的都是很精美的，而且从数据处理的效果来看，这应该是一个大型生信实验室的作品。建议大家有时间都读一下这篇文章，将会有助于以后在处理不同来源的单细胞数据时选择最合适的算法。 放在最后一篇的文章当然是压轴出场了，那就是在2019年发表在Nat Biotechnol（IF:）杂志上，篇名为“A comparison of single-cell trajectory inference methods”的文章。对来自数千个单细胞的全基因组组学数据进行轨迹分析，目前已有很多算法来推断这些细胞沿着发展轨迹的分布。基于这些结果，作者开发了一套指导方针，以帮助用户为他们的数据集选择最佳的方法。 事实上，虽然到目前已经开发了70多种推断单细胞轨迹的工具，但比较它们的性能是具有挑战性的，因为它们需要的输入和产生的输出模型差异很大。在这篇文章中，作者在110个真实数据集和229个合成数据集上对其中的45种方法进行了基准测试，以了解细胞排序、拓扑结构、可伸缩性和可用性。结果表明了现有的一些工具之间的互补性，方法的选择应该主要取决于数据集的维度和轨迹拓扑。 最后，作者还免费提供了多种单细胞数据轨迹分析的评估网站( )，这将有助于开发更多轨迹分析的工具，用于探索日益庞大和复杂的单细胞数据集。对于这篇文章，我不做过多评述，只想着大家有时间都要去读一下，其中无论是对数据的处理还是对结果的讨论上都是前面文章无法媲美的,是难得的优质文章。 如今科技发展日新月异，在21世纪做出有价值的科研成果往往缺的不是技术，而是对热点的灵敏嗅觉以及对时局的掌控。张泽民，汤富酬，郭国骥老师均是凭借单细胞测序技术跻身世界一流领域的科学家，就是因为他们把控住了时局。 同样的，上述几类“生信综述”的着力点均是当时迫切需要解决的单细胞测序技术热点问题，才得以不花费半毛钱发表一系列高分文章。而且，因为是热点科学问题，这些文章截止到目前的引用率都很高，后面肯定还会持续升高。如果说单细胞测序是一个制高点，倒不如说是起点，因为此类技术在未来还会有很多，希望本篇推文能给大家带来一些思考，欢迎有推荐类似生信文章的小伙伴通过后台与我们联系。
生信分析论文写法如下：
这次我们来讲解的这边文献是 2019-10-12 发表的 OTT 杂志上的一篇生信加少量实验验证的文章。实话实说，目前对于生信最最最基本的，如果没有实验验证还是不好发文章的。所以一般都会加一些实验验证的。
这个文章的主要流程是个这样的:这里我们就基于文童的材料方法来说一下具体的内容:公共数据获取：当中关于公共数据获取部分提到了这些东西。使用了 GEO 数据库来进行候选数据筛选。
这 GEO 里面找到了三个芯片，其中描述了这三个芯片的平台。差异表达分析：作者使用了 GEO2R 来进行数据的筛选。富集分析：接着作者对差异表达的基因进行了富集分析，其中包括 GO 分析和 KEGG 分析。
作者使用的富集分析的软件是 DAVID，这个软件我们也吐槽过说，更新不及时，是很好用，所以推荐是 WebSestalt 富集分析软件，或者 clusterprofiler。蛋白相互作用分析：5TCGA 数据库验证再往下作者做的其实是 TCGA 的数据库验证，但是在材料方法里面没写。我们可以在结果当中具体的过程。
对于肿瘤研究，现在如果只是用 GEO 数据集分析，不用 TCGA 再看一下的话，都觉得不好意思，所以一般的肿瘤研究可能都会用到 TCGA 的验证的。其目的也就类似于多加了一个数据集来增加结果准确性。但是对于 TCGA 有些肿瘤正常样本很少。分析的结果可能偏差更大。文章使用的 GEPIA 的数据库。这个数据库对于查询 TCGA 表达结果还是很好用的，简单上手。
核心基因甲基化相关分析：在核心基因选择之后，利用了 TCGA 的甲基化数据MEXPRESS 来查看基因的田基化水平有没有变化。由于版本的更新。现在的这个数据库的 版本的结果会比之前的更加详细一些。
Cover Letter 既投稿信，对于科研论文新手来说，不知该如何下手，而对于论文老司机来说，重视程度普遍比较低。查尔斯沃思论文润色在往期的文章中多次介绍过投稿信的重要性（参见《投稿信的重要性》），投稿信可以告诉杂志及其编辑为什么他们应该考虑你的文章。这是特别重要的，因为当初审编辑在筛选你的论文时，就此决定是否在同行评审环节中寻找特定的专家，所以期刊欢迎增加对你研究的简要总结。
不同的期刊对投稿信的要求各不相同，例如有的杂志会要求推荐几位审稿人。一般会在杂志的作者指南（guide for authors）中看到具体的要求。许多作者并没有注意到投稿信的重要性，即便它的重要性已经成为常识问题。有些作者甚至对此有一些误解。
投稿信应包含哪些内容？这一问题在《投稿信的重要性》中已经有给出了详细的说明，在此再次强调一下，除了一些基本信息外，最主要的是把该篇论文的研究重点及学术贡献、创意简洁的强调下。
我们也为大家准备了一个通用模板，供作者参考，该模板来自SPIE：
[Your Name]
[Your Affiliation]
[Your Address]
[Date]
Dear Dr.[Editor name],
I/We wish to submit a new manuscript entitled “[title of article]” for consideration by the [journal name].
I/We confirm that this work is original and has not been published elsewhere nor is it currently under consideration for publication elsewhere.
In this paper, I/we report on . This is significant because . The paper should be of interest to readers in the areas of .
[Please explain in your own words the significance and novelty of the work, the problem that is being addressed, and why the manuscript belongs in this journal. Do not simply insert your abstract into your cover letter! Briefly describe the research you are reporting in your paper, why it is important, and why you think the readership of the journal would be interested in it.]
Please address all correspondence concerning this manuscript to me at [email address].
Thank you for your consideration of this manuscript.
Sincerely,
[Yourname]
Cover Letter, 即投稿信，是论文投递时与论文一起发送给编辑的信件，其目的是让编辑在阅读你的论文之前，简单了解你文章的基本情况。 不知道编辑是谁的情况下直接用 Dear editor; 但是，只要用心一点，去期刊官网查找，一般都能找到的。 在以第一段直接给出文章的标题 如 Letter, communications, article, review还是comments。 这个其实也可以不写，因为在投稿时会选择投稿文章类型。 简要包括研究背景，发现以及可以发表在期刊上的原因等等 一般为通讯作者姓名，所属机构，通讯地址，联系电话，邮箱等 经将这一部分挪到了投稿网站系统上，Cover letter中可以不再列出） 讲了这么多，分享一个实际的案例吧。 Dear Dr. Ciaccio, 杂志主编 On behalf of all coauthors, I am submitting our manuscript entitled “文章标题”for your consideration for publication in Biology and Medicine. 我谨代表所有合著者，提交我们题为“文章标题”的手稿，供您考虑在生物学和医学上发表。 Although there has been a large amount of research focusing on medical image segmentation, few studies have focused specifically on the segmentation of tiny organs. The difficulty of tiny organ segmentation is that the shape varies greatly among individuals and the boundary with surrounding tissues is not clear. In the current study, we proposed a 方法, which successfully solves the above two difficulties. The experimental results show that our proposed 方法 outperforms the state-of-the-art deep learning method in segmenting xxx with respect to accuracy. Another strength of our method is that it requires fewer trainable parameters and imposes a smaller demand on computational resources. The proposed method can potentially assist clinicians in diagnosis and treatment planning by quickly inspecting abnormalities in xxx and further quantitative analysis. 虽然已经有大量的研究集中在医学图像分割上，但是很少有研究专门针对微小器官的分割。微小器官分割的难点在于个体间形状差异较大，与周围组织的边界不清晰。 在本研究中，我们提出了一种新的xxx方法，成功地解决了上述两个难题。实验结果表明，我们提出的xxx优于最先进的深度学习方法。我们方法的另一个优点是，它需要较少的可训练参数，并且对计算资源的需求较小。 该方法通过快速检测xxx形态计量学异常和进一步定量分析，有可能帮助临床医生制定诊断和治疗计划。 We believe that this article is appropriate for publication by the Biology and Medicine, it would be of great interest to a broad range of readers including radiologists, clinical researchers, computer scientists, and other researchers in related fields. Finally, we would like to make the following declarations: All authors of this paper have read and approved the final version submitted and contents of this manuscript have not been copyrighted or published previously and is not under consideration for publication elsewhere. 我们相信这篇文章适合于生物学和医学出版，它将引起包括放射科医生、临床研究人员、计算机科学家和其他相关领域研究人员在内的广大读者的极大兴趣。 最后，我们谨声明：本文的所有作者均已阅读并批准提交的最终版本，本手稿的内容此前未受版权保护或出版，也未考虑在其他地方出版。(这一段可通用) Thank you for your consideration. I am looking forward to your assessment of our manuscript. 谢谢你的考虑。我期待着你对我们的手稿进行评估。 原文截图： Thank you for your email of Jul 19, 2021 (论文返修时间). We appreciate the encouraging and enthusiastic comments and suggestions made by you and reviewers, on the basis of which we have revised and (we think) strengthened our paper. In particular, we have added a detailed description of xxx, restructured the article to make it more logical and easy to understand. Moreover we added a performance comparison with the xxx algorithm, which is considered as the benchmark in the field of biomedical image segmentation. The results show that our proposed method is superior to xxx in the subfield of xxx segmentation, and our proposed model is much easier to train and deploy. Changes are tracked and highlighted in the revised manuscript, and all our responses to reviewers’ comments are detailed in ‘Response to Reviewers’. (通用，说明修改情况) 感谢您2021年7月19日的电子邮件。我们感谢您和审稿人提出的鼓舞人心和热情的评论和建议，在此基础上，我们修改并（我们认为）加强了我们的论文。 特别是，我们添加了xxx的详细描述，对文章进行了重组，使其更具逻辑性，更易于理解。此外，我们还添加了与xxx算法的性能比较，xxx算法被认为是生物医学图像分割领域的基准。 结果表明，该方法在xxx分割领域优于xxx，且该模型易于训练和部署。修改后的手稿中跟踪并强调了变更，我们对评审员意见的所有回复详见“Response to Reviewers”。 We look forward to hearing your decision on our revised manuscript. 我们期待着听到你对我们修改稿的决定。 原文截图： 有没有给到你启发呢？ 关于论文写作方面的教程一直在更新。查看之前的教程的方法：
投稿信，是个人或集体(写作集体)向报刊、电台或电视台投送稿件时写的专用书信。它一般随稿件同时寄发。投稿信，主要是介绍作者自己和稿件的有关情况，给对方考虑是否采用稿件时作参考。2．投稿信的写作格式投稿信的写作格式与一般书信相同，只是内容侧重点不同，所写事项更明确、更单一。(1)第一行顶格写对方的称呼，如“《××× ×》杂志编辑部"、“编辑同志”、或“×× ×编辑同志"。(2)开头。另起一行，空两格写问候语，如“你好”、“您好"或“你们好"。(3)正文。正文的内容应根据具体情况来写，主要是介绍自己稿件的有关情况。一般应反映出以下几方面内容：①表示对对方刊物、栏目的关注之情，并作出诚挚、中肯的评价，切忌措辞唐突或过分溢美之词。②如实介绍自己的有关情况。③写明投稿的缘由和稿件的有关情况。④希望对方对稿件提出宝贵意见。⑤希望对方采用稿件，并适当表达谢意。⑥希望对方及时复信，表明是否采用稿件的明确态度。(4)结尾。另起一行，写祝敬语，如“顺问编安"之类。(5)署名和日期。
投稿信，是个人或集体(写作集体)向报刊、电台或电视台投送稿件时写的专用书信。它一般随稿件同时寄发。投稿信，主要是介绍作者自己和稿件的有关情况，给对方考虑是否采用稿件时作参考。 2．投稿信的写作格式 投稿信的写作格式与一般书信相同，只是内容侧重点不同，所写事项更明确、更单一。 (1)第一行顶格写对方的称呼，如“《××× ×》杂志编辑部"、“编辑同志”、或“×× ×编辑同志"。 (2)开头。另起一行，空两格写问候语，如“你好”、“您好"或“你们好"。 (3)正文。正文的内容应根据具体情况来写，主要是介绍自己稿件的有关情况。一般应反映出以下几方面内容： ①表示对对方刊物、栏目的关注之情，并作出诚挚、中肯的评价，切忌措辞唐突或过分溢美之词。 ②如实介绍自己的有关情况。 ③写明投稿的缘由和稿件的有关情况。 ④希望对方对稿件提出宝贵意见。 ⑤希望对方采用稿件，并适当表达谢意。 ⑥希望对方及时复信，表明是否采用稿件的明确态度。 (4)结尾。另起一行，写祝敬语，如“顺问编安"之类。 (5)署名和日期。
《信息通信》不是核心期刊，目录里面找不到。论文发表方面有什么问题的话可以找向原上草论文了解。
信息通信主管单位：湖北通信服务公司主办单位：湖北省通信学会快捷分类：电子电信技术出版地区：湖北国际刊号：1673-1131国内刊号：42-1739/TN创刊时间：1987发行周期：月刊期刊开本：A4审稿时间：1个月内所在栏目：信息科技综合影响因子：期刊级别： 省级期刊可以在学术杂志网投稿，一个月左右就可以出刊！
信息技术与信息化期刊级别为省级期刊，出刊周期为双月刊，期刊创办于1976年。信息技术与信息化是山东省经济和信息化委员会主管、山东电子学会主办的学术性期刊。信息技术与信息化主要栏目设有：综述、信息化建设、解决方案、网络与信息安全、信息处理与模式识别、人工智能与知识工程、数据库与数据仓库、计算机技术与应用。信息技术与信息化已被国家图书馆馆藏、上海图书馆馆藏、知网收录(中)、维普收录(中)、万方收录(中)收录。信息技术与信息化获得荣誉情况：中国期刊全文数据库（CJFD）、中国核心期刊遴选数据库。上一篇：计算机时代是什么期刊下一篇：农业网络信息是什么期刊延伸阅读微电子学与计算机是什么期刊电脑与信息技术是什么期刊计算机系统应用是什么期刊中国信息技术教育是什么期刊江苏通信是什么期刊首页电话咨询在线咨
通信学报期刊级别为核心期刊
出刊周期为月刊,期刊创办于1980年。通信学报是由中国科学技术协会主管,中国通信学会主办的一级学术性刊物。
《通信学报》是由中国通信学会主办的一级学术性刊物，创刊于1980年，面向国内外公开发行。其办刊宗旨是及时反映中国信息通信科学技术发展水平，交流国内外通信科技新成果，促进学术进步和人才成长，探索新理论、新技术。主要读者对象为信息通信领域的研究人员、各大院校通信及相关专业的教师和研究生。《通信学报》设有学术论文、综述、学术通信等栏目，有英文目次和英文摘要。
论文中的参考文献需要有：论点、论证过程、论据，这三点缺一不可。
”参考文献“是指在学术研究过程中，对某一著作或论文的整体的参考或借鉴。征引过的文献在注释中已注明，不再出现于文后参考文献中。
按照字面的意思，参考文献是文章或著作等写作过程中参考过的文献。然而，按照GB/T 7714-2015《信息与文献 参考文献著录规则》”的定义，文后参考文献是指：“为撰写或编辑论文和著作而引用的有关文献信息资源。
根据《中国学术期刊（光盘版）检索与评价数据规范（试行）》和《中国高等学校社会科学学报编排规范（修订版）》的要求，很多刊物对参考文献和注释作出区分，将注释规定为“对正文中某一内容作进一步解释或补充说明的文字”，列于文末并与参考文献分列或置于当页脚地。
扩展资料：
书写格式：
（1）顺序编码制的具体编排方式。参考文献按照其在正文中出现的先后以阿拉伯数字连续编码，序号置于方括号内。一种文献被反复引用者，在正文中用同一序号标示。一般来说，引用一次的文献的页码在文后参考文献中列出。
格式为著作的“出版年”或期刊的“年，卷（期）”等+“：页码（或页码范围）.”。多次引用的文献，每处的页码或页码范围分别列于每处参考文献的序号标注处，置于方括号后并作上标。作为正文出现的参考文献序号后需加页码或页码范围的，该页码或页码范围也要作上标。
作者和编辑需要仔细核对顺序编码制下的参考文献序号，做到序号与其所指示的文献同文后参考文献列表一致。另外，参考文献页码或页码范围也要准确无误。
（2）参考文献类型及文献类型，根据GB3469-83《文献类型与文献载体代码》规定，以单字母方式标识：
专著M ； 报纸N ；期刊J ；专利文献P；汇编G ；古籍O；技术标准S ；
学位论文D ；科技报告R；参考工具K ；检索工具W；档案B ；录音带A ；
图表Q；唱片L；产品样本X；录相带V；会议录C；中译文T；
乐谱I； 电影片Y；手稿H；微缩胶卷U ；幻灯片Z；微缩平片F；其他E。
参考资料来源：百度百科-参考文献
应该呈现三个信息，基本信息的时间，还有是谁著作的，还有书名
参考文献格式为：［序号］＋著作作者＋篇名或书名等＋参考文献的类型＋著作的“出版年”或期刊的“年，卷（期）”等＋“：页码（或页码范围）”。
引用别人的毕业论文的标注格式为（毕业论文类型为学位论文［D］）：
［序号］主要责任者，文献题名［D］，出版地：出版单位，出版年：起止页码（可选）。
扩展资料
参考文献按照其在正文中出现的先后以阿拉伯数字连续编码，序号置于方括号内。一种文献被反复引用者，在正文中用同一序号标示。一般来说，引用一次的文献的页码（或页码范围）在文后参考文献中列出。
多次引用的文献，每处的页码或页码范围（有的刊物也将能指示引用文献位置的信息视为页码）分别列于每处参考文献的序号标注处，置于方括号后（仅列数字，不加“p”或“页”等前后文字、字符；页码范围中间的连线为半字线）并作上标。
学位论文是高等院校毕业生用以申请授予相应学位而提出作为考核和评审的文章。学位论文分为学士、硕士、博士三个等级。1、学士论文：学士论文是合格的本科毕业生撰写的论文。毕业论文应反映出作者能够准确地掌握大学阶段所学的专业基础知识，基本学会综合运用所学知识进行科学研究的方法，对所研究的题目有一定的心得体会，论文题目的范围不宜过宽，一般选择本学科某一重要问题的一个侧面或一个难点，选择题目还应避免过小、过旧和过长。2、硕士论文：硕士论文是攻读硕士学位研究生所撰写的论文。它应能反映出作者广泛而深入地掌握专业基础知识，具有独立进行科研的能力，对所研究的题目有新的独立见解，论文具有一定的深度和较好的科学价值，对本专业学术水平的提高有积极作用。3、博士论文：博士论文是攻读博士学位研究生所撰写的论文。它要求作者在博导的指导下，能够自己选择潜在的研究方向，开辟新的研究领域，掌握相当渊博的本学科有关领域的理论知识，具有相当熟练的科学研究能力，对本学科能够提供创造性的见解，论文具有较高的学术价值，对学科的发展具有重要的推动作用。
学位论文是指为了获得所修学位，按要求被授予学位的人所撰写的论文。学位论文分为学士论文、硕士论文、博士论文三种。学位论文是指的完成一定学位必须撰写的论文，格式等方面有严格要求，学位论文是学术论文的一种形式。发表的问题 可以到 脚丫代写 论文 这家网站问下，