刚碰到同样问题，最后解决如下：引用内容选择——段落编号（无上下文）
一定不要自己敲编号，一定要使用交叉引用 。如果你发现自己打了编号，一定要手工整理参考文献是很痛苦的，而且很容易出错。Word没有提供管理参考文献的
选择这个就好了，就会只出现一个了
上标 选择要作为上标的文字 同时按 ctrl shift + 就成为上标了 按 ctrl = 下标
参考文献编号这里没设置对，修改编号的列表级别为一级就可以了
看到你这个问题，我用两种方法都试了一下，都很正常同出现过你这样的问题，一种是WORD2010中另存为PDF，一种是装个Adobe Acrobat 0或0，用它转换都行。
下个DOPDF试试啊~~直接用WORD打印成PDF~~
交叉引用就是在文档的一个位置引用文档另一个位置的内容，类似于超级链接，只不过交叉引用一般是在同一文档中互相引用而已。如果两旁文档是同一篇主控文档的子文档，用户一样可以在一篇文档中引用另一篇文档的内容。交叉引用常常用于需要互相引用内容的地方，如“有关×××× 的使用方法，请参阅第×节”和“有关××××的详细内容，参见 ××××”等。交叉引用可以使读者能够尽快地找到想要找的内容，也能使整个书的结构更有条理，更加紧凑。在长文档处理中，如果是想靠人工来处理交叉引用的内容，既花费大量的时间，又容易出错。如果使用Word 的交叉引用功能，Word 会自动确定引用的页码、编号等内容。如果以超级链接形式插入交叉引用，则读者在阅读文档时，可以通过单击交叉引用直接查看所引用的项目。1 创建交叉引用创建交叉引用的方法如下：（1）在文档输入交叉引用开头的介绍文字，如“有关×××× 的详细使用，请参见××××。”（2）单击【插入】菜单中的【交叉引用】菜单项，出现如图6-35 所示的【交叉引用】对话框。（3）在【引用类型】下拉列表框中选择需要的项目类型，如编号项。如果文档中存在该项目类型的项目，那么它会出现在下面的列表框中供用户选择，如图6-35 所示。（4）在【引用内容】列表框中选择相应要插入的信息。如“段落编号（无内容）”等。（5）在【引用哪一个×××】下面选择相应合适的项目，×× ×表示引用的类型。（6）要使读者能够直接跳转到引用的项目，请选择【以超级链接形式插入】复选框，否则，将直接插入选中项目的内容。（7）单击【插入】按钮即可插入一个交叉引用。用户如果还要插入别的交叉引用，可以不关闭该对话框，直接在文档中选择新的插入点，然后选择相应的引用类型和项目后单击【插入】按钮即可。如果选择了【以超级链接形式插入】复选框，那么把鼠标移到插入点，鼠标指针即可变成小手形状，用户单击可以直接跳转到引用的位置。2 修改交叉引用在创建交叉引用后，有时需要修改其内容，例如，原来要参考2 节的内容，由于章节的改变，需要参考3 节的内容。具体方法如下：（1）选定文档中的交叉引用（如2），注意不要选择介绍性的文字（如有关×××的详细内容，请参看×××）。（2）选择【插入】菜单中的【交叉引用】菜单项，弹出【交叉引用】对话框。（3）在【引用内容】框中选择要新引用的项目。（4）单击【插入】按钮，结果如图6-36 所示。如果要修改说明性的文字，在文档中直接修改即可，并不对交叉引用造成什么影响。3 利用交叉引用在页眉或页眉中插入标题在页眉和页脚中插入章节号和标题是经常用的排版格式，根据章节号和标题可以迅速地查找到所需要的内容，Word 可以利用交叉引用在页眉和页脚中插入章节号和标题，这样可以节省用户的工作量，并能使文档的内容与页面或页脚的内容保持一致。具体操作方法如下：（1）单击【视图】菜单中的【页眉和页脚】菜单项，切换到页面和页脚视图状态。（2）单击【插入】菜单中的【交叉引用】菜单项，打开【交叉引用】对话框，如图6-37 所示。（3）在【引用类型】框所带的下拉列表框中，选择【标题】。（4）在【引用内容】下拉列表框中，选择【标题文字】。（5）在【引用哪一个标题】下面，选择要引用的标题，如本节的标题（7 使用交叉引用）。（6）单击【插入】按钮，即可将章节号和标题插入到页面和标题中。如果以后对文档的章节号或标题作了修改，Word 在打印时会自动更新页面和页脚。而不必人工去修改页面或页脚的章节号。如果想要更新页眉或页脚，可以选择该页面或页脚，然后单击右键，在弹出的快捷菜单中选择【更新域】即可，也可以按F9 键来更新域
第一篇和第二篇所引用的参考文献。
这是output style的问题。如果用IEEE的output style，自动就是【1】的类型。如果你要自己设定，可以edit--output style--edit"你要设定的style",在打开来的窗口中，citation---templates中修改即可
自动设置word编号为[1] [2] [3]的方法：选择要加入编号的文本段落，格式/项目符号和编号/编号/自定义，编号格式默认为“”，你在修改为“[]”，就OK了。系统默认有缩进，如果你的参考文献一行放不下，又不希望在下一行缩进，一般的论文格式规范好象都是如此，就把制表位和缩进值都设为0。
[参考文献] [1]护理质量控制中心设在上海。护理基础知识问题1000 [M]。上海：上海科学技术文献出版社，27 [2]王之盈，杨朱芳雨。精神障碍护理学[M]北京：北京大学医学出版社，208209
项目编号，或是编号，还有多级列表可自由选用，在段落设置里
自动设置word编号为[1] [2] [3]的方法：选择要加入编号的文本段落，格式/项目符号和编号/编号/自定义，编号格式默认为“”，你在修改为“[]”，就OK了。系统默认有缩进，如果你的参考文献一行放不下，又不希望在下一行缩进，一般的论文格式规范好象都是如此，就把制表位和缩进值都设为0。
在Word2010中，用EndNoteX6插入参考文献时，如何使正文内的文献编号自动变成上标形式？如使下图中的3个文献编号变成上标，而不需要在Word中一个一个单独进行调整。上图中所用样式为“Numbered Copy”。切换到EndNote X6的界面，进入Edit菜单下的Output Styles，点击Edit Numbered Copy。左侧点击Cittations下的Templates，右侧可以看到Citation的内容为[Bibliography Number]。选中[Bibliography Number]，点击上方的“A1”按钮，将其更改为上标模式。点击右上角的关闭按钮退出Style的编辑模式，会弹出对话框提示是否保存更改。点击“是”保存更改。最后切换到Word2010的界面。进入EndNote X6的菜单，随便换一个Style，然后再换回成Numbered Copy。
项目编号，或是编号，还有多级列表可自由选用，在段落设置里
打开word2010 点击开始菜单，然后找到段落，上面有个编号，点开右边向下箭头后会 看到定义编号格式，如下图，然后把编号格式1改成[1]，然后确定就可以了