答：当然要查重整篇，这样才能保证整篇论文的原创性，当然论文中的使用的文献、引用部分不会算在重复率里边。
本科论文查重是需要提交全文的，因为只有全文查询才能够彻底的查清楚论文中重复项目和重复的比重。
论文查重各学校要求不一样，有的是论文全部都查，有的不查封面、声明、授权、目录、注释、参考文献。论文审核不通过原因有很多，论文查重率高、文章写作上存在明显问题或错误（格式、结构、逻辑、语言有问题）、文章没创新、论文主题与投刊物不匹配等。
论文查重的部分有很多，包括你的目录，标题，作者，简介，还有思路等，论文一般是全文都要查的，因为它是一个整体不能分隔。
对于即将进入毕业季节的同学来说，论文查重是非常重要的一环，顺利毕业的前提是毕业论文必须经过学校查重，最大的障碍是论文查重，担心查重结果，但事实上，很多同学都是第一次接触论文查重的，对这种查重的工具很陌生。但愿下面的论文能对同学们有所帮助。
为何要进行毕业论文查重？
目前，国内学术界对学术诚信问题的讨论较多，学术诚信也逐渐成为世界关注的焦点。许多刚毕业的大学生的毕业论文全是抄袭别人的论文，抄袭别人的学术成果，通过复制粘贴来拼凑，反映出学术道德的缺失和不良的社会风气。因此，论文查重的初衷就是提醒即将进入学术圈的同学：抵制抄袭，踏实学习。毕业论文查重就是检测毕业论文是否有学术不端行为。虽然现在的论文查重系统还不够完善，但在一定程度上对抵制论文抄袭起到了一定作用，有助于提高当代大学生的诚信意识，在学术界起到了重要作用。
这份论文检测报告的原则是什么？
此后，市场上的查重系统层出不穷，而绝大多数大学都认可了权威查重系统，权威查重系统已经成为90％以上大学指定使用的查重系统。权威查重的基础道理是接纳一种基于数字指纹的多阶倏地检测要领，对指定文档进行数字指纹识别，并与资源库中的相关文档进行指纹比对，然后系统将结果以报告的形式通知用户，用户可自行选择报告的形式和类型。
因为防止论文抄袭，降低论文整体质量。但是现在因为查重太严重，导致很多人就算是自己写的论文也会因为和前辈的太相近而要求改写。
为了避免学术不端，严肃一下学业风气
伴随着信息技术的进步和普及，大家获取信息也变得简单起来，只需一台联网的设备，就可以获取海量信息，在提供方便的同时，也产生了一些负面效应。由于因特网信息量巨大，信息传播速度极快，因此容易产生谣言等一些假消息。对学生来说，网络是一个很好的信息平台，里面有大量的知识和一些其他的内容，查阅资料等都很方便，所以很容易出现抄袭的情况，因此，对于一些重要的论文，是需要进行重复检测的。那么，我们的毕业论文也要查重吗？过去，由于互联网等科技不够发达，计算机、网络的普及率不高，大家写论文主要是参考书上的一些内容，虽然也会有重复率，但没有论文的查重系统能检测出来，所以检测论文的内容质量，重复性基本上靠导师的经验。如今网络基本上已经普及，特别是对于大学生来说，上网并不难，所以论文抄袭现象也更加普遍，因此，很有必要对大家的论文进行查重。所以，是不是所有的毕业论文都要查重？从理论上说，是的。如果是正规的大学，毕业论文都是要查重的，这里主要是讲本科论文，大专论文也有一些学校是不需要论文查重的，因为有些是以产品设计或者做些真实的事件作为考核标准，不太好查重。一些同学也许在想，学校会不会采取抽查的形式去查重论文，确实有抽查这种形式，不过在抽查前，学校已经全部查重过，所以不要把这次检测当成是一次检测，而是一次抽查。知网几乎成了大学专用的论文查重系统，你们学校很可能就是使用的知网查重系统，但知网不对个人用户开放，想要去知网上查重论文，就得找学校，或者找个其他的知网查重系统。在此要注意的是，知网支持验证查重报告的真伪，所以如果使用的是其他网站的知网查重入口，一定要验证论文查重报告。
查重的主要目的就是为了避免学术不端的情况出现，如果不进行一定的要求的话，那么本科的毕业也就没有了相应的意义。不查重就会有很多人盗用论文来冒充自己的论文，这样也不利于形成一个良好的学术环境。所以说为了学术环境和更加检验一个人大学的成功所以要对论文进行查重。
对知识的尊重和课题研究的严谨性，以及看待学习的态度，不能简单的照抄照搬，需要不断学习，不断讨论，不断消化，不断吸收，最终达到提高的目的
一般学校是等论文定稿后才查重，
这种流程是最合理的。
但是，也有些学校要求每次上交都要提供检测报告。这样就会增加很多检测费。如果论文写作时重复率控制得不好，就要反复检测多次。所以，如果有原创的论文，那就好多了。原创文档
很多人会因为论文查重后的重复率过高而感到心烦意乱，因为论文重复率的高低是学校会判断论文是否合格的非常重要工作考核评价标准之一，所以如果达不到要求的话，那么是无法顺利完成毕业的。所以大家在写论文的过程中，要学会检查自己的论文内容是否能通过学校的检测，并且自己提前进行论文查重也是非常有必要的。不过有很多同学都不理解，为什么毕业论文需要通过多次查重？ 接下来小编就给大家说说这个原因。1、论文的写作时间还是比较长的，一般要向学生完成自己毕业设计论文的写作，从选题到最后的定稿这个时间是比较长的。最起码也要我们也要提前数月时间才行，特别是在完成后要重新检查，如果重复率太高的话，那么降低重复率修改的话还需要更多时间。2、论文查重系统的数据库不断更新，无论我们使用什么论文查重系统，都应该知道它们的对比数据库不可能总是不变的，因为它们会不断更新，所以重复率变高也可能造成检测结果出现波动。也许不是重复相同的内容，我们再次检查这一点，但下一次再进行论文查重时，可能出现轻微变化。一旦合格是不够的，我们会要提交到校检中心前几天去检查，并且重新检测。一篇合格的论文都需要我们经历进行多次的修改自己才能更好完成，每一次的修改必然就会是论文变得可以更加完美。
查重顾名思义就是查重复率。因为现在文章的内容越来越多，重复也越来越高。为了防止文章重复率很高，导致出现抄袭或者说相同内容的重复写这种情况，就有查重的出现。查重也是对文章的一种质量的保证，所以主要是论文都需要查重，这是一种认真负责的态度。通过查重的文章，并不代表一定没有任何问题，但是至少可以肯定的是它的重复率相对少一些。而且查重的话，根据你查重的软件不同，对比的数据库不同，重复率也会不一样。
论文查重的主要目的是防止学生的学术不端行为。希望学生能合理引用，杜绝抄袭的可能性。查重也是对毕业生的学习成果进行考核，是毕业前最后次考核。
不同学位的论文，学校是有不同的重复率要求的，本科和硕博的重复率要求是有很大的差别的。但是，如果学校没有明确规定，只能使用某个检测系统，那么我们自己可以在网络上选择可靠、准确的查重网站进行检测，例如常见的papertime、paperfree等。
论文要查重原因如下：
一、判断论文内容是否有抄袭
论文查重检测是每位毕业生都无法逃避的，学生在毕业前是会到论文查重软件进行毕业论文的重复率检测，而学校是会以查重软件检测出的结果，来判断学生是否可以正常毕业，判断学生的毕业论文是否有抄袭，是否存在学术不端的行为。
二、考核业务水平
现在除了高校毕业生的毕业论文要进行查重检测，科研机构技术人员在杂志或是媒体上发表的文章也是要进行查重。这是为了保证论文是作者自己原创撰写出的，不是东拼西凑出来的。这也是考核一个人的业务水平的方法，所以对于高校毕业生来说，是一定要重视论文查重检测的，是要了解论文查重检测的目的和范围、标准的。
其实就是检测论文内容是否和其他著作有重复内容。总之现在有专门的论文查重软件，只要把论文内容上传到查重软件中，就可以知道论文是否是原创的，和其他文章内容是有多少重复的。一定的重复内容是可以的，但有个要求标准的。
每个学校对论文重复率要求标准是不同的，一般情况下高校学生论文重复率是规定不可以超过百分之三十的，个别的专业也许是会宽松一些，也许要求标准是会高一些。
因为防止论文抄袭，降低论文整体质量。但是现在因为查重太严重，导致很多人就算是自己写的论文也会因为和前辈的太相近而要求改写。
论文查重的目的是确保同学们撰写的论文不被他人剽窃，也是一项“专利权”。现在，上级是非常重视版权问题的，论文也被看作是一个人的知识产权，所以对论文的严格审查也是非常重要的。如果有些人在写毕业论文的时候抄袭了其他人的文章但是没有被检测出来，这样对于那些努力撰写论文的人来说是不公平的，而公平公正也是21世纪所要求的，因此现在的论文查重变得越来越严格了。我和大家说这些就是想告诉大家，论文查重是一件非常重要事情，我们不要为了偷懒去想一些邪门歪道，这种做法是不可取的。而且知网查重是非常严格的，我们用的那些小伎俩根本逃不过知网检测系统的“火眼金睛”，所以还是静下心来好好写自己的论文吧。
毕业论文查重是论文中必须通过的一关，虽然在写毕业论文的过程中，每个段落可能都是用键盘敲出的，所引用的内容都有标注。在自以为没有被抄袭的情况，不经意表达某一意思的句子往往与他人的论文中的句子相似，尽管这种相似是无意的，但查重系统却能够发现这些所重复的内容，导致论文重复率过高而无法进行答辩。大学生几乎每一年毕业，遇到的一个问题就是写论文，有些大学有些专业规定本科生论文要写8k-1w万字，硕士更多，一般需要3万字。撰写高质量的论文，要投入大量的精力，查阅大量的文献资料，耗时数月才能完成，完成后，除由导师自定研究内容外，还需要修改毕业论文的格式。现在，网络上不断地曝出某某的论文涉嫌抄袭，某某的论文被剽窃，这些都是论文查重系统为学术界带来的好处，而论文查重则给学术界带来了些许曙光。但是查重只是简单地保证了论文文本不会被抄袭，针对论文的数据和学术成果不能得到实质的维护。论文应该在毕业时，靠自己的努力来完成，但是很多同学无视毕业论文的学术规则，随意拼接别人的论文，然后通过修改来降低重复率。学院一般都有规定的论文查重系统，高校规定的查重系统一般是不会对外进行开放的，只授权给某学术机构和单位使用，并在网站首页作出声明。因此，有不少利用假的查重账号赚取钱财，使许多毕业生上当。
1.保持论文的原创性不管是要写论文、报告、文章都是要保持其创作的原创性，虽然我们论文写作的过程中是需要查询和整理很多很多的资料，并仿照其中的论证方法证明自己的论题，但是这并不意味大家就可以直接抄袭相关的文献，除去引用的部分，大部分的地方还是要求大家自己原创。不管是本科还是硕博的毕业论文，都是属于学术论文，所以觉得严格是很正常的。论文查重之后我们可以根据自己的论文有哪些地方是重复的地方，然后进行精确的修改，修改过的论文，自然重复率就低了。2.保持学生良好的学习风气论文查重合理有效的抑止了学生的学术不端行为表现，这也增强了大家认真负责的工作态度，必竟每一位学生以后基本都是要步入当今社会的，全都是未来建设社会的栋梁之材，不仅要有优良的专业知识和专业的技能以外，还需良好的学习风气。3.保持论文整体的质量学术论文听着深奥，但实际上未来都会有可能会运用在人们的生活之中，很多人也因为学术论文的技术成果深受赞扬。相对而言的剽窃的文章只能被别人唾弃，深受社会舆论谴责。论文查重是确保人们论文原创的基础，也是间接的保障整个学术界的品质。 论文查重尽管是学校的规定要求，实际上也算得上国家对每位毕业生的一个规定要求，也是人们论文合格的基础，因此学生们针对论文查重这一件事依然是要一定高度重视，以确保人们拿到一个不错的成绩，顺利完成毕业。
论文要查重原因如下：
一、判断论文内容是否有抄袭
论文查重检测是每位毕业生都无法逃避的，学生在毕业前是会到论文查重软件进行毕业论文的重复率检测，而学校是会以查重软件检测出的结果，来判断学生是否可以正常毕业，判断学生的毕业论文是否有抄袭，是否存在学术不端的行为。
二、考核业务水平
现在除了高校毕业生的毕业论文要进行查重检测，科研机构技术人员在杂志或是媒体上发表的文章也是要进行查重。这是为了保证论文是作者自己原创撰写出的，不是东拼西凑出来的。这也是考核一个人的业务水平的方法，所以对于高校毕业生来说，是一定要重视论文查重检测的，是要了解论文查重检测的目的和范围、标准的。
其实就是检测论文内容是否和其他著作有重复内容。总之现在有专门的论文查重软件，只要把论文内容上传到查重软件中，就可以知道论文是否是原创的，和其他文章内容是有多少重复的。一定的重复内容是可以的，但有个要求标准的。
每个学校对论文重复率要求标准是不同的，一般情况下高校学生论文重复率是规定不可以超过百分之三十的，个别的专业也许是会宽松一些，也许要求标准是会高一些。