elife杂志影响因子

elife杂志影响因子

elife是顶级期刊。

《ELIFE》发布于爱科学网，并永久归类相关SCI期刊导航类别中，杂志真正的价值在于它是否为社会的发展带来积极促进作用。"《ELIFE》" 的价值还取决于各种因素的综合分析。

相关信息：

Elife杂志水平是很高的，但是前景不太看好。

第一，杂志社花费太高，这两年还好，虽然花了500万镑，不过有HHMI, WELLCOME, MAX等机构资助，也算风生水起了，不过长久下去还是会有影响，毕竟靠一本期刊又要学术水平顶级又要能挣钱还是比较难的，PLOS系列的高分杂志主要也都靠PLOS ONE挣钱。第二，快速发表高质量论文的理念虽然好，但是感觉像个悖论。

从CNS到四大神刊——聊聊杂志名的那些八卦

最近，随着中科院推出并立即修改了18年的分区表，各种有关学术期刊的话题又多了起来。今天，我从杂志名称入手，聊一聊有关期刊名称的那些事儿。

三驾马车 vs 四大天王

很多学术期刊由于地位、内容、出版社等方面的相似性，被归为了一类，并且冠以绰号。有三个一组，也有四个一组。

三驾马车之 CNS ：

这大概是学术界最出名的期刊组合了，搞科研的尤其是生物口的都不陌生：Cell，Nature，Science。关于这个名称的起源已很难考证。我在网上看到的最早的一个出处是颜宁老师说当年神经生物学课里，发现中枢神经系统的英文缩写恰好就是CNS（central nervous system），并引发和三大期刊名字的联想【1】。当然，也有不少人把C、N、S三个字母的顺序变换着念，NCS、SNC、SCN等等，其实说的是一回事。

三驾马车之 国产CNS ：

国内期刊现在越来越壮大了。其中，以下三本可谓势头强梦：《细胞研究》Cell Research、《国家科学评论》National Science Review，《科学通告》（英文版）Science Bulletin。有细心的网友发现，这三本期刊的首字母连在一起，不就是CNS吗？于是将它们并称为国产CNS【2】。虽然暂时在影响力方面同国际版CNS都有一定差距，但相信这几本年轻的国内期刊将拥有光明的前途。

三驾马车之三大综合期刊 ：PNAS、Nature Communications、Science Advances

早年间这一块是《美国科学院院报》PNAS的独角戏，10年Nature首推Nature Communications大获成功，成功引领了高水平开放获取期刊的潮流。五年后，Science也推出了有Science版Nature Communications之称的Science Advances，和另两家杂志渐呈分庭抗礼之势。从一度落榜中科院分区一区的大行衰运，到以迅雷不及掩耳盗铃之势重返一区，这三本综合类期刊的影响力还是相当大的！

四大天王系列

似乎四个杂志并称的更多。比如数学界的“四大”：《数学年刊》Annals of Mathematics，《数学新进展》Inventiones Mathematicae，Acta Mathematica，以及《美国数学会杂志》Journal Of The American Mathematical Society。

化学领域也有所谓的“四大”：《德国应化》Angewandte Chemie,《美国化学会志》JACS, 《化学科学》Chemical Science，《自然·化学》Nature Chemistry

生物四大综合期刊：Current Biology、BMC Biology，Elife，Cell Reports

出版社也有四大：Elsevier，Springer/Nature，Wiley，Taylor。

当然，影响力最大的还是四大神刊：PLoS One，Scientific Reports，Oncotarget，Medicine。这几本期刊由于开放获取、发稿量（尤其是国内学者发稿量）巨大、以及文章档次参差不齐而被戏称为“神刊”。其实，“四大神刊”上面有相当多的高质量文章，特别是，有些学者可能不那么在意杂志，或厌倦于频繁更换杂志的繁琐的投稿流程，最后“屈尊”于这几本“神刊”。这些杂志里每一篇认认真真的paper，都凝聚了科研人无数的心血。最重要的应该是文章本身，只不过今时今日的科学界，承载文章的期刊承载了太多它或许不该承载的东西。

说子刊，谁是子刊？

现在的杂志越来越多。很多杂志纷纷推出各种子刊。最出名的当属Nature系列了。那么，什么是子刊？以Nature系列为例，有Nature冠名的期刊都可以成为子刊。按照这一标准，Nature Communication也应算在内，只不过看起来其地位比其他子刊低那么一点点。对此，Nature集团有一个大致相当的英文描述：Nature-branded journals。现在，Nature子刊的数目已达46本（其中包括18本Nature Reviews系列杂志）【3】。

Nature子刊的规模还在膨胀，涉及的领域也越来越多。食品专业的童鞋就要有福了，因为据可靠消息，新子刊Nature Food即将在未来两年和大家见面。那么杂志的主编是不是该由chief editor改为chef editor？照这么下去，也许不久的将来就会出一本Nature Dumplings。那时候，最爱吃饺子的我一定去应聘主编，届时杂志的主页应该是这样的：

随着各种子刊越来越多，也有一些作者把本不属于子刊的期刊说成是子刊。最著名的当属前面提到的Scientific Reports。尽管现在身处“四大神刊”行列，但2011年刚创刊的时候，SR可是作为很多Nature集团文章转投的对象，我就曾听说过不少被Nature和旗下子刊接连拒稿而直接怒投SR的壮举，想必不少文章都有很高的水准。或许是不了解情况，或许是子刊到神刊心有不甘，有作者会把SR称为Nature子刊。更有人在自己的publication记录里的Scientific Reports直接写作Nature Scientific Reports。好了，按照这一逻辑，那么下面几个杂志的名字应该这样改：

Nature Genetics -> Nature Nature genetics

Science Advances -> Science Science Advances

PLOS BIOLOGY -> PLOS PLOS BIOLOGY

最犀利的当属Cell旗下干细胞领域知名期刊Cell Stem Cell，因为它要改成

Cell Cell Stem Cell 读起来不拗口吗？

莫以刊名论英雄

杂志的刊名不是随便起的，遵循先到先得的原则，先创刊的杂志，比如Nature，Science们，往往能在起名上占得先机。而一些学术界的后起之秀只好避开这些名字，另辟蹊径，但这并不意味着它们是所谓的“水刊”。比如下面这几个：

Elife ：电子生活？名字看起来确实像科普杂志。这可是一本高水平杂志，由霍华德·休斯医学研究所(HHMI)的一众大佬（由于不满影响因子的评价体系），联合德国马普学会和英国Wellcome Trust联合打造。

iScience：不知道有多少童鞋会像我一样音译为爱Science？该杂志绝非《我们爱科学》英文版。其作为Cell最新推出的优秀期刊，名字中的i代表的是important。

PLOS系列 ：PLOS全称Public Library of Science。公共科学图书馆？其实，这个名字是为了强调其Open Access，对于所有人免费开放。

类似的情况还有许多。只能说，这些杂志的刊名，不是太省略，就是太谦虚。

既然有名字像“水刊”的“牛刊”，也会有“名过其实”的杂志。比如，来自瑞士的Frontiers系列，名称前沿（frontiers），但其旗下杂志上文章的前沿性，恐怕和上面几本“科普读物”都有所差距，更不要说CNS了。当然，最出名的还是那本名叫《自然与科学》Nature and Science的杂志了：因为只要你在该刊上发paper，就可以说在“自然和科学”杂志上发表过文章啦。

本文纯属调侃，一说一乐，各位切莫当真。最后，祝各位童鞋19年都能在自己心仪的杂志上大把发paper！

引文

1. 颜宁，为何要发CNS？ 2012, 



2. 徐旭，Science Bulletin实现IF突破，国产CNS全面崛起。2017，



3. 

elife投稿难度

molecularcell同级别。dlife是一个生物学期刊，投稿难度十分的高，与molecularcell同级别，被誉为第二个Nature杂志，是一个世界级的生物学期刊。

LncRNA 概述

表观遗传学是研究基因表达发生了可遗传的改变，而DNA序列不发生改变的一门生物学分支，对细胞的生长分化及肿瘤的发生发展至关重要。表观遗传学的主要机制包括DNA甲基化、组蛋白修饰及新近发现的非编码RNA。非编码RNA是指不能翻译为蛋白的功能性RNA分子，其中常见的具调控作用的非编码RNA包括小干涉RNA、miRNA、piRNA以及长链非编码RNA。研究者的大量研究表明非编码RNA在表观遗传学的调控中扮演了越来越重要的角色。

在近十余年的生命科学研究中非编码调控RNA可谓是研究最火的领域之一，从2006年诺奖的siRNA，到这几年异常火爆的microRNA，到即将登场并定能风靡的lncRNA，可谓如火如荼。RNA不仅仅只承担遗传信息中间载体的辅助性角色，而是更多地承担了各种调控功能。

lncRNA在发育和基因表达中发挥的复杂精确的调控功能极大地解释了基因组复杂性之难题，同时也为人们从基因表达调控网络的维度来认识生命体的复杂性开启新的天地。研究者大部分研究集中于短 RNA如 microRNA，piRNA 等一些 ncRNA 生物生成机制和调控通路，甚至在一些人类复杂疾病中的功能，但是这都只是冰山一角。人们对lncRNA（Long noncoding RNAs，lncRNAs）的认识还处在初级阶段，lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”，是RNA聚合酶II转录的副产物，不具有生物学功能。然而，有文献研究表明，lncRNA参与了X染色体沉默、基因组印记以及染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等多种重要的调控过程。lncRNA的这些调控作用也开始引起人们广泛的关注。

哺乳动物基因组序列中，4%~9%的序列产生的转录本是lncRNA（相应的蛋白编码RNA的比例是1%）。虽然关于lncRNA的研究进展迅猛，但是绝大部分的lncRNA的功能仍然是不清楚的，随着研究的推进，各类lncRNA 的大量发现，lncRNA 的研究将是RNA 基因组研究非常吸引人的一个方向，使人们逐渐认识到基因组存在人类知之甚少的“暗物质”。

近年来lncRNA得到了研究界的广泛关注，人们已经在测序技术的帮助下鉴定了大量lncRNA，但lncRNA的生物学功能依然迷雾重重。

西班牙IMIM（Hospital del Mar Medical Research Institute）和加泰罗尼亚理工大学（UPC）的研究团队最近在eLife杂志上发表研究指出，长非编码RNA在新蛋白演化中起到了重要的作用，它们在细胞中有着不为人知的重要功能。长非编码RNA是指长度超过三百个核苷酸的RNA分子，其上没有编码蛋白的阅读框。在细胞内lncRNA的丰度约占到70%至98%，有些lncRNA甚至长达几千bp。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质，但它们的表达在不同组织和发育阶段依然具有特异性，这说明lncRNA具有重要的生物学意义。绝大多数lncRNA位于细胞核，它们对应的DNA区域有的与蛋白编码基因重叠，有的位于基因之间或者内含子中。由于lncRNA似乎没有承担什么生物学功能，它们曾被认为是一种“进化噪声”。现在西班牙的研究人员通过新测序技术向人们展示，许多这样的转录本也有机会翻译成为蛋白。这一发现旋即引起了激烈的争论。

Mar Albà等人在六个物种中（人类、小鼠、鱼、果蝇、酵母和一种植物）验证了这一结果，许多lncRNA与核糖体关联，似乎随时准备翻译成为蛋白。这说明，lncRNA可以成为新蛋白合成的资源。这项研究显示，大多数lncRNA是种系特异性的，很少有lncRNA存在于两个以上的物种中。由此可见，这些lncRNA很可能是最近才演化出来的。事实上，lncRNA分子表现出许多与“年轻”基因相似的特性。新功能性蛋白的出现，是一个反复尝试的过程。因此细胞需要生成大量的转录本，这些转录本不一定都能通过时间的检验。lncRNA与这样的转录本很相符。对近亲物种进行研究，将有助于我们进一步理解新基因的形成机制，鉴定那些可能有功能的转录本。lncRNA表达模式改变与特定疾病的关联，也是一个很有吸引力的研究方向。

随着lncRNA功能逐步显现，其与靶点的作用机制成为进一步的热点。早期认为原位调控是lncRNA 作用的唯一机制，它通过招募形成染色质修饰复合物而沉默邻近基因转录，例如IGF2R 反义RNA（antisense of IGF2R RNA，AIR）、XIST 等。而Hox 基因反义基因间RNA（Hox antisense intergenicRNA，HOTAIR）的发现提示lncRNA可能存在远程调控。

同源异型基因（homeotic genes，HOX）在细胞增殖与定向分化中起关键作用，人类Hox 基因簇约含100个ncRNA 基因，其中HOTAIR 定位于HOXC 基因座12q13.13。HOTAIR的5'端可招募结合多梳蛋白抑制复合物2（polycomb repressivecomplex 2，PRC2），借助PRC2上三个H3K27甲基化酶EZH2、SUZ12和EED，使另一基因座HOXD上长约40 kb的序列转录沉默，从而在乳腺上皮细胞内使细胞内转录倾向于胚胎成纤维细胞样表型。超过20%的lncRNA 能够通过结合PRC2或其他类似复合物发挥作用，提示lncRNA的远程调控机制在生物体内广泛存在。

长链非编码RNA的作用机制非常复杂，至今尚未完全清楚。根据目前的研究，lncRNA的作用机制如要有以下几种。

（1）编码蛋白的基因上游启动子区（橙色）转录，干扰下游基因（蓝色）的表达；

（2）抑制RNA聚合酶II或者介导染色质重构以及组蛋白修饰，影响下游基因（蓝色）的表达；

（3）与编码蛋白基因的转录本形成互补双链（紫色），干扰mRNA的剪切，形成不同的剪切形式；

（4）与编码蛋白基因的转录本形成互补双链（紫色），在Dicer酶的作用下产生内源性siRNA；

（5）与特定蛋白质结合，lncRNA转录本（绿色）可调节相应蛋白的活性；

（6）作为结构组分与蛋白质形成核酸蛋白质复合体；

（7）结合到特定蛋白质上，改变该蛋白质的细胞定位；

（8）作为小分子RNA（如miRNA、piRNA）的前体分子。

目前，发现的参与哺乳动物基因活动的lncRNA已有上千个，其调控基因表达的机制存在共性。一般来说，lncRNA主要从表观遗传学、转录调控及转录后调控等3个层面实现对基因表达的调控。

1 . 表观遗传调控

哺乳动物lncRNA介导的表观遗传改变的研究，最早源于基因组印记（genomic printing）和X染色体失活（X chromosome inactive）两个方面，分别与H19和X ist RNA密切相关。近十年研究证实，lncRNA与表观遗传调控密切相关，并且发现了许多新的与基因调控有关的lncRNA。

2.  转录调控

LncRNA能够通过多种机制在转录水平进行调控，表现在如下几个方面：

LncRNA的转录可以干扰邻近基因的表达。例如，酵母的SER3基因受到上游一段lncRNA——SRG1的干扰。近端启动子转录的lncRNA可将RNA结合蛋白定位至基因启动子区域从而调控基因表达。如，人类细胞中的细胞周期蛋白D1（CCND1）的表达，DNA损伤信号诱导该基因启动子上游一段lncRNA的表达，它可调节RNA结合蛋白——TLS的活性，接着TLS抑制CREB结合蛋白——组蛋白乙酰基转移酶和p300的活动，进而使CCND1基因的表达沉默。

LncRNA可作为共因子调节转录因子的活性。例如，小鼠的一段lncRNA——Evf2转录自一段超保守的远端增强子，它可与转录因子DLX2形成转录复合体，并结合至一个增强子上，从而诱导邻近蛋白编码基因DLX6的表达。通过与影响启动子选择的抑制性复合物相互作用，封锁启动子区域来调控RNA聚合酶（RNAP）II的活动从而干扰基因表达。这可能是存在于真核细胞染色体上的上千种三倍体复合物结构控制启动子作用的普遍机制。

再如，小鼠17号染色体的Igf2r区是第一个被证实的可转录为 lncRNA的位点，父系染色体上一未拼接的 lncRNA——A irn从母源性Igf2r上的ICR区域开始转录，方向与Igf2r相反。这一反义链转录的RNA规模较大,跨越整个Igf2r启动子。并越过基因间区抵达邻近基因。属于一种转录干扰机制。

3 . 转录后调控

LncRNA在转录后水平可与mNRA形成双链RNA复合物，以掩盖mRNA的主要顺式作用元件，从而调控基因表达。例如，lncRNA-Zeb2（即Sip1）能够和HOX位点转录的mRNA的一个内含子的5’端剪切位点形成双链，从而防止该内含子被剪切。该区域含有对于Zeb2蛋白表达所必须的核糖体结合位点，Zeb2通过这种方式能够提高Zeb2蛋白的表达量。这一例子说明lncRNA可以指导mRNA亚型的选择性剪接。

另外，lncRNA的复性（退火）具有靶向作用，使蛋白受体复合物能够识别正义链mRNA转录本。这一租用类似于RNA诱导的沉默复合物（RISC）通过siRNA靶向作用于mRNA。来自于互补转录本甚至是lncRNA的双链RNA，结合延长的内部发夹结构,能够被加工成内源性siRNA以使基因表达沉默。

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