cancers杂志怎么样

cancers杂志怎么样

不高。根据查询相关公开信息显示，underreview接受概率是百分之30，UnderReview的状态持续一两个月算正常。杂志（Magazine），有固定刊名，以期、卷、号或年、月为序，定期或不定期连续出版的印刷读物，根据一定的编辑方针，将众多作者的作品汇集成册出版，定期出版的，又称期刊，杂志的形成来源于罢工、罢课或战争中的宣传小册子。

生信分析 玩法上新，细胞死亡遇上肿瘤微环境

       之前给大家分享的肿瘤基因集预后玩法很多了，记得上一回说肿瘤基因集预后的内容是缺氧和免疫，浏览量和后台留言很多，今天这个思路可谓青出于蓝胜于蓝。到底是个啥，准备小板凳和瓜子，嗑上！

对思路感兴趣的 可提交意向表单定制方案   生信分析意向表

背景：

肿瘤微环境（TME）由肿瘤细胞和周围区域组成，周围区域包括血管，细胞因子，趋化因子，成纤维细胞，细胞外基质。外部刺激或治疗，在肿瘤微环境中引发了多种细胞死亡过程。由于肿瘤、基质、内皮和免疫细胞死亡活性的改变而产生的免疫反应可以显著改变肿瘤的生长轨迹。

今天分享的就是三种经典的细胞死亡途径： 自噬，细胞凋亡和坏死  对肿瘤免疫微环境的贡献。

题目

肺癌细胞死亡相关免疫基因signature

发表杂志：

cancers(IF：6.126)

部分内容谍照：

1、细胞死亡风险模型构 建cell death index (CDI)

2、分组趋化因子差异表达、功能分析

2、各细胞死亡分组免疫浸润细胞差异

3、各细胞死亡分组免疫浸润细胞差异

背景：

肿瘤微环境（TME）由肿瘤细胞和周围区域组成，周围区域包括血管，细胞因子，趋化因子，成纤维细胞，细胞外基质。外部刺激或治疗，在肿瘤微环境中引发了多种细胞死亡过程。由于肿瘤、基质、内皮和免疫细胞死亡活性的改变而产生的免疫反应可以显著改变肿瘤的生长轨迹。

今天分享的就是三种经典的细胞死亡途径： 自噬，细胞凋亡和坏死  对肿瘤免疫微环境的贡献。

题目

肺癌细胞死亡相关免疫基因signature

发表杂志：

cancers(IF：6.126)

部分内容谍照：

1、细胞死亡风险模型构 建cell death index (CDI)

2、分组趋化因子差异表达、功能分析

2、各细胞死亡分组免疫浸润细胞差异

3、各细胞死亡分组免疫浸润细胞差异

对思路感兴趣的 可提交意向表单定制方案   生信分析意向表

更多生信精彩文章，可浏览 生信人网站

非因解读 | 利用DSP技术绘制非小细胞肺癌(NSCLC)肿瘤微环境图谱

探索肿瘤微环境(TME)有助于了解潜在的肿瘤-免疫相互作用。如何在有限样本上实现高通量、高精度多组学分析已成为未来肿瘤微环境研究的重要方向，而多重免疫组化（mIHC）技术与分子条形码技术的结合将会更好地帮助科研者对TME进行深入研究。

为了深入研究肿瘤微环境对对非小细胞肺癌(NSCLC)的影响，James Monkman等科学家团队利用DSP技术，通过对NSCLC及配对正常组织中的特定空间区域进行高维度蛋白组学定量分析，描绘了NSCLC中由癌旁到基质微环境到癌组织中的蛋白表达谱变化，并在《Cancers》杂志上（IF=6.639）发表题为“High-Plex and High-Throughput Digital Spatial Profiling of Non-Small-Cell Lung Cancer（NSCLC）”的文章（图1）。 该 研究证明了DSP在数据产出、可靠性和研究实效性上的强大优势，并可作为唯一的技术策略实现大规模临床组织样本的深度微环境解析 。

研究亮点

研究团队使用DSP技术，仅用一张TMA组织芯片，从空间层面将非小细胞肺癌（NSCLC）患者的肿瘤、TME和正常相邻组织划分出来，并从免疫细胞分型、免疫激活、药物靶点和肿瘤多个模块进行多重蛋白靶点（Table 1）比较分析，得到富含空间信息、高维度的蛋白表达图谱。研究团队绘制了活检样本中的肿瘤标志物和分子表型，并展示了DSP技术对新一代病理学研究的强大优势。

研究背景

肺癌被称为头号癌症杀手，非小细胞肺癌占肺癌总数的85%。肺癌常在晚期被确诊，导致其预后很差，五年生存率低于20%。随着新兴疗法免疫检查点阻断疗法的成功应用，15-40%的患者生存期延长，因此需要更为准确的预前分子标志物来指导患者分层治疗。免疫环境（细胞类型、密度和位置以及表型和免疫细胞功能）已被用于更深入地了解肿瘤-免疫细胞相互作用，可以为免疫检查点疗法的突破提供全新的治疗线索。

传统的免疫组织化学（IHC）技术及从组织块获取基因组信息的技术无法同时满足空间信息及多重靶标的需求，并且缺乏细胞占比、异质性和深层次的空间信息，而这些对识别TME是非常重要的，同时珍贵样本，如穿刺样本的限制导致无法在有限样本上获得更多有价值的信息。

研究思路及方法

研究者以92个非小细胞肺癌样本为研究对象制成TMA芯片，运用了DSP技术，在PanCK、CD3、CD45的荧光形态学指导下，将组织划分成为肿瘤、基质TME和相邻正常组织（NAT）三个区域，共96个感兴趣区域（ROI）。该技术通过DNA探针编码偶联的抗体（包含免疫细胞分析、IO药物靶标、免疫激活状态、免疫细胞分型中的主要靶点，具体靶标见Table 1）对同一切片进行孵育，基于可视化形态学染色生成肿瘤（Pan ck+）和TME（CD45+/Pan ck-）区域。DSP通过紫外照射将特定区域的DNA编码分解下来，杂交并用nCounter系统进行计数。

ROI与病人相关信息见Table 2。研究者将用R中“ggplot2”输出和绘制原始数据，并将靶标表达值与阴性内参IgG进行比较来评估表达量，并使用“ggpubr”评估标准化校正参数之间的皮尔逊相关系数，选择了相对表达稳定的Histone H3和S6进行标准化。配对组差异表达用配对t检验和benjamini-hochberg FDR修正进行评估，未配对组差异表达用mann-whitney检验和Benjamini-Hochberg FDR矫正进行评估。同时进行非监督聚类分析，用“Survival Analysis”进行单变量Cox比例风险回归。

研究结果

一、ROI选择策略

作者共设定了96个ROI，其中45个肿瘤区域、32个TME和19个形态正常的邻近组织（具体信息见Table 2）。病理学专家根据H&E标出肿瘤区域（示例图2A,2C），与PanCK（绿色）、CD45（黄色）、CD3（绿色）和核染（蓝色）的形态学标记（示例图2B,2D）一起使用来选择肿瘤（CK+）或TME（CK-/CD3+）的感兴趣区域。其中图2B/2D左下ROI为肿瘤，右上圈选为TME，图3展示了具有代表性的成对肿瘤和免疫ROI，ROI 71、69、74和63代表肿瘤区域，而图上其余ROI分别代表配对患者的免疫区域。

二、数据质控

数据质控采用DSP自带分析系统进行。探针计数值根据各ROI内阴性对照兔（Rb）IgG和小鼠（Ms）IgG计数几何平均进行质控（图4A）。作者发现靶标数值因各自的组织类型而不同，例如正常组织ROI原始计数似乎低于其他组织，而肿瘤ROI在最低丰度的探针产生更高的计数（图4B）。在所有ROI内与IgG的均值信号比值均小于1（粉色区域）的靶标，在后续研究谨慎处理，在CD25靶标以上的55个探针中有31个被认为是可信的，可进一步分析（图4A）。

三、数据归一化策略

通过Histone H3、S6、GAPDH和IgG阴性对照探针各校正因子之间的相关性来评估ROI的数据标准化方法。研究者对管家蛋白GAPDH、Histone H3、S6和Ms/Rb IgG的平均值（图5）进行两两比较，并进行线性回归分析，管家蛋白在ROI中彼此高度相关（图5A-C），Ms和Rb IgG在ROI中彼此高度相关（R=0.92）（图5D），并且这些IgG计数的平均值与Histone H3和S6平均值显示出很强的相关性（R=0.91），表明IgG阴性对照、Histone H3和S6与基础生物学信息无关，可作为校正因子进行数据标准化（图5E)。另外，研究团队还分析了ROI面积和细胞核计数，以确定它们对DSP数据进行归一化的效用。ROI面积与其他校正因子的相关性较差（图6A-C），因此不适用于此次试验的数据归一化处理，同样可见核计数（6E，D）。最终研究者选择Histone H3/S6均值用于数据标准化以及探针量化比较。

四、数据分析

研究者先使用Ward D2层次聚类法进行聚类，发现不同组织类型内蛋白靶标似乎没有显著差异，NAT、肿瘤和TME之间的区别并不明显（图7）。使用K-means聚类进一步将ROI分组，大多数NAT分在一组（图7左），其特征是除Pan CK、EpCAM和Ki-67之外，大多数基因高表达。另一类包括TME和肿瘤（图7中），大多数蛋白质表达较低，一些ROI内Ki-67和EpCAM高表达，而第三类所有蛋白质表达相对差异较大（图7右）。

接下来研究者评估了配对和未配对患者的差异蛋白表达（图8）。有趣的是，配对的TME和NAT组（n=8）无显著差异（图8A)，配对的TME-肿瘤组(n=18)，TME区域CD27、CD3、CD4、CD44、CD45、CD45RO、CD68、CD163和VISTA高表达（同预期），而肿瘤区域Ki-67、EpCAM和cytokeratin富集（图8B)。

研究者将所有样本合并，发现无论是否配对，TME中CD34、fibronectin、IDO1、LAG3、ARG1和PTEN似乎相对于NAT下调（图8C）。而TME组与肿瘤组的比较与配对数据相似，CD3、CD45RO、VISTA和CD163在TME中表达比肿瘤高（图8D)。通过未调整的单变量Cox比例风险回归对蛋白表达和OS关联进行评估。研究人员发现，ROI（免疫TME内）的EpCAM和cytokeratin表达与更好的OS相关，而肿瘤ROI区域中CD34、CD3和ICOS的存在与更好的OS相关。

当置于多变量模型中，调整年龄、AJCC和TNM肿瘤分期变量时，在单变量模型中显著表达的蛋白表现为不显著，并且由于样本数量不足不能进行更深层次的数据分析。

文章总结

研究团队使用DSP技术，运用TMA策略，绘制了NSCLC微环境图谱，发现了一些新的分子表型，这些有可能预测患者对新疗法的反应，进而预测患者的预后情况。作者认为多重免疫组化结合高通量靶标检测的技术，与TMA联合应用，正在开创一个新的生物标记物发现领域，将会给临床病理学带来很大的改变。

重庆医学期刊14号几点出版

《重庆医学》（ISSN 1671-8348、CN 50-1097/R），半月刊，邮发代号国内78-27、国外SM6334，每期180页，每月14、28日出版。本刊由重庆市卫生健康统计信息中心和重庆市医学会主办，重庆市卫生健康委员会主管。
一、栏目：

院士论坛、专家述评、专家共识、指南解读、论著、论著·基础研究、论著·临床研究、循证医学、技术与方法、生物信息学、调查报告、智慧医疗、综述、卫生管理、医学教育、临床护理、短篇及病例报道。

二、来稿要求：
1.文稿应具有科学性、实用性，论点明确，资料可靠，文字精炼，层次清楚，数据准确，统计学处理方法正确、规范。
2.文题：20个汉字内为宜。
3.作者：应是（1）参与选题和设计，或参与资料的分析和解释者；（2）起草或修改论文中关键性理论或其他主要内容者；（3）能对编辑部的修改意见进行修改、核对，在学术上进行答辩，并最终同意该文发表者；（4）在调查和解决研究工作的准确或诚信问题时同意对研究工作的各方面负责。以上4条均需具备。署名时各作者姓名在文题下按序排列，单位名称（注明所在科室或学院）、省市及邮编罗列在姓名后，格式：周××1，叶××2，王××1，赵××3（1.重庆医科大学生化教研室 400016；2.广东医科大学解剖教研室，广东湛江 524023；3.重庆医科大学中心实验室 400016）。文稿须附第一作者简介，格式［作者简介：第一作者姓名（出生年－），职称，学历，主要从事×××研究或工作］，通信作者只列1位，另附电子邮箱。
4.摘要：专家述评、指南解读、论著、论著·基础研究、论著·临床研究、循证医学、技术与方法、生物信息学、调查报告、智慧医疗、综述栏目须附中、英文摘要。卫生管理、医学教育、临床护理栏目须附中文摘要，短篇及病例报道栏目无摘要。摘要须采用第三人称撰写，简洁明了（中文400字左右，英文500个实词左右）。
5.关键词：在摘要后附5～8个关键词，必须用全称。多个关键词之间以分号分隔。
6.字数：论著、论著·临床研究、论著·基础研究、循证医学、技术与方法、生物信息学、调查报告、智慧医疗、综述栏目总字数6 000字内，卫生管理、医学教育、临床护理、短篇及病例报道栏目总字数4 000字内为宜。
7.伦理：凡涉及人或动物的生物医学研究论文，应说明所用的试验程序是否经过伦理审查委员会（所在单位、地区或国家）评估并注明批准号。涉及患者（受试者）的应签订知情同意书。
8.中、英文缩略语：应尽量少用缩略语，以避免影响阅读的流畅性。4个及以下汉字的医学名词一般不用英文缩略语，4个以上汉字的名词可用英文缩略语代替，第一次出现英文缩略语时，须先写出中文及英文全称。中文缩略语加注在中文全称后，如再生障碍性贫血（再障）、流行性脑脊髓膜炎（流脑）。
9.统计学：执行GB/T 3358-2009《统计学词汇及符号》的有关规定。统计学符号一律采用斜体表示。同时注意：（1）均数±标准差用“x±s”表示，其中均数和标准差均用英文小写、斜体；（2）t检验的“t”用英文小写、斜体；（3）F检验的“F”用英文大写、斜体；（4）χ2检验的“χ”用希腊字母小写、斜体；（5）相关系数用“r”表示，英文小写、斜体；（6）概率用“P”表示，英文大写、斜体。
10.表和图：每幅图、表应有简明的题目。表格采用三线表（顶线、表头线、底线）；示统计学差异的符号标注使用上标形式。图不宜过大，半栏图最大宽度7.5 cm，通栏图17.0 cm，高与宽的比例5∶7左右；图采用TIF、JPG或JPEG格式，像素600 PPI以上。图片上的文字均采用Arial字体，大写字母标注于图片左下角；图的类型应与资料性质匹配。若刊用人像，应征得本人的书面同意，或遮盖其能被辨认出是何人的部分。大体标本照片在图内应有尺度标记。病理照片注明染色方法和放大倍数，且在图中加标尺。
11.参考文献：按GB/T 7714－2015《信息与文献参考文献著录规则》中的顺序编码制著录，依照其在文中出现的先后顺序用阿拉伯数字加方括号角标标出，并将序号置于方括号中，排列于文末。文献书写格式如下：

参考文献
[1]谢惠民.合理用药[M].4版.北京:人民卫生出版社,2003:355-356.
[2]SUNG H,FERLAY J,SIEGEL R L,et cancer statistics 2020:GLOBOCANestimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185countries[J].CA Cancer J Clin,2021,71(3):209-249.
专家述评、论著、论著·临床研究、论著·基础研究、循证医学、技术与方法、生物信息学、调查报告、智慧医疗、卫生管理、医学教育、临床护理、短篇及病例报道栏目引用参考文献15条以上；综述栏目25条以上（其中外文2/3以上）。所引用近3年参考文献占2/3以上。

12.数字：执行GB/T 15835－2011《出版物上数字用法》。测量数据按GB/T 8170－2008《数值修约规则及极限数值的表示和规定》有关有效数字的规定取有效位数，尽量作统计学处理。小数点前或后如等于或超过3位数字时，每3位数字为一组，组间空1/4汉字空位，如“9413.16”，应写为9 413.16；序数词和年份、页数、部队番号、仪表型号不分组。表示偏差且有单位者，数据加括号，如（60.3±0.4）mm。出现长度单位的数值相乘时，书写格式为：3 mm×4 mm×5 mm。

13.分点叙述层：参考本刊各栏目的格式或采用1、1.1、1.1.1、1.1.1.1 ……段内分叙时用（1）、（2）、（3）……。
14.计量单位：执行GB/T 3102－1993《量和单位》中有关量、单位和符号的规定及其书写规则。注意单位名称与单位符号不可混用。凡是涉及人体及动物体内的压力测定，可以使用毫米汞柱（mm Hg）或厘米水柱（cm H2O）为计量单位。
三、注意事项：

1.本刊可对来稿文字等内容进行合理修改、删减，涉及原意的修改将提请作者核实。

2.文稿所涉及的课题如获国家或部、省级以上基金资助或属攻关项目，应以脚注形式于文稿首页左下方说明，如“××基金资助项目（基金号××××）”。

3.为了确保来稿具有科学的严肃性，维护本刊的声誉和读者的利益，来稿切勿一稿多投，一旦发现将立即退稿。

4.本刊在初审和刊前对稿件进行学术不端检测，对初审复制比超过20%（包括过度引用、抄袭、自引已发表的论文或学位论文）及刊前复制比超过30%的稿件坚决予以退稿。对于带有基金项目资助的来稿，一经录用基金项目名称或编号不能随意更改、删除，否则也将视为学术不端行为。对于作者存在的一稿多投、重复发表、代写代投等学术不端行为，本刊将给予严肃处理：所缴纳的版面费作为对期刊的补偿，并出具警示函；情节严重并给本刊造成经济损失的，还将追究作者相应责任（包括但不限于通报其所在单位、3年内不发表其论文、通报相关期刊、要求经济赔偿等）。

5.投稿后须及时缴纳审稿费。稿件确认录用后须按通知数额及时缴纳版面费。稿件刊登后酌致稿酬，并赠当期杂志2册。

6.根据《著作权法》并结合本刊具体情况，投稿后3个月内未收到处理通知系仍在审阅中。作者如欲投其他期刊，请先与本刊编辑部联系。

7.稿件确认录用后，作者须上传由所有作者签字及第一作者单位盖章的《重庆医学》论文（著作）使用授权书。本刊对授权文章具有汇编权、复制权、发行权、信息网络传播权。未经本刊允许，不得再授权他人以任何形式汇编、转载、出版文章的任何部分。如需使用中国知网网络首发服务以实现提前电子出版，还须上传《重庆医学》网络首发授权书。

8.本刊辟有绿色通道，针对院士、国家重点研发计划、国家自然科学基金项目等，符合标准可快速审理，尽快刊用。

常吃辣椒能降低高血压风险，真的可以吗 ？

湖南人不怕辣，四川人辣不怕，不论是湖南菜或是四川菜，那都离不开一个辣字，但是中国并非只有这俩地区吃辣椒，遍及街头巷尾的兰州牛肉拉面，要是没有辣椒的装点，那便减少了生命，一碗陕西油泼面，并没有辣椒的参加，食不知味。

从北方到湖南，爱吃辣的地区数不胜数。

不一样的人有不同的观点，有些人认为世世代代全是吃辛辣物来的，冬季吃辣椒能够暖身，夏季吃辣椒能够促进大量出汗，吃辛辣物能够长命。也有人觉得，朝天椒对肠胃的危害很大，爱吃辣的人肠胃病发生率更高一些，此外，爱吃辣的人比较容易患上血压高，由于朝天椒具备收拢血管的作用。

若想揭开真相，何不一起来看看权威性的调查报告。

2021年7月，北京大学公共卫生学院李立明专家教授领衔的研究人员，运用中国慢性疾病回顾性分析的项目数据，此科学研究列入53916名30~79岁的群体，其中还有44.4%为高血压病患，12.3%得人一周最少吃一次辣。

却发现：女士中，与每日不要吃刺激性食物对比，每星期吃辣椒最少一次，发生高血压的风险性能降低10%；但是对于男士，每星期吃辣椒，针对血压高转变则无显著差别。

除此之外研究表明，在饮酒人群中，与从不吃辣对比，每日吃辣椒发生高血压的风险性仅减少2%。但不喝酒的人群内，每日吃辣椒则减少28%风险。

从北大的这篇文章科学研究，大家可以发现，常吃辛辣物不但不会升高血压，反倒会降低心率，朝天椒之所以能降低心率，根本原因是朝天椒里的辣椒红色素，辣椒红色素能够维持激话瞬间蛋白激酶电位差香草酸蛋白激酶1，从而使毛细血管里的皮细胞创造出一氧化氮，而一氧化氮这是受体血管平滑肌左室的信号分子，具有血管舒张，减少血压的作用。

可是科学研究也显示了，在吃辣椒这件事情上男女授受不亲，女士吃辣椒更有助于血压值稳定，针对男人而言，吃不吃辣都与血压值没啥关系。

此外一篇和辣椒相关的帖子则发表于《英国医学杂志》上，研究表明：每日吃辛辣物得人太早身亡风险会有所下降，同时还可以减少癌病、心脑血管疾病及其呼吸疾病所导致的身亡风险性。

但是，朝天椒虽然好，也不是说朝天椒就一定能吃过多，著名刊物《Cancers》刊登了的一项研究发现：辣椒红色素也会增加直肠癌风险性，特别是幽门螺旋杆菌感柒的群体。

但是适当吃辛辣物，没有必要担忧这种风险性，很多人都认为辣椒是重口味食物，其实是对辣椒的成见，有一些看上去很辣的食物，实际上更可怕的是里边的盐与植物油脂成分，而非朝天椒。