林木育种研究论文

林木育种研究论文

参加工作已来，，已发表论文37篇，其中16篇为SCI收录论文。参与王明庥院士主编的《林木遗传育种》一书的撰写，该书获国家科委优秀科技图书一等奖。文章发表在Science、Nature、Plant Journal、New Phytologist、Plant Physiology、Genome Research、Heredity、Tree Genetics & Genomes、PloS ONE、遗传、Molecular Breeding等国际国内主流期刊 。 Ye, Qiaolin Ye, Ning; Yin, Tongming : Enhanced multi-weight vector projection support vector machine ,Pattern Recognition Letters, v 42, n 1, p 91-100, June 1, 2014 Neighbors' distribution property and sample reduction for support vector machines, APPLIED SOFT COMPUTING,2014,V16:201-209 Boundary detection and sample reduction for one-class Support Vector Machines,NEUROCOMPUTING, V123:166-173 Muchero, W., M. M. Sewell, et al. (2013). Genome Anchored QTLs for Biomass Productivity in Hybrid Populus Grown under Contrasting Environments. PLoS One 8(1). Li, S., T. Shi, et al. (2013). Methods for breaking the dormancy of eastern redbud (Cercis canadensis) seeds. Seed Science and Technology 41(1): 27-35. Wan, Z. B., Y. R. Li, et al. (2013). Melampsora larici-populina, the main rust pathogen, causes loss in biomass production of black cottonwood plantations in the south of China. Phytoparasitica 41(3): 337-344. Liu, J. J., T. M. Yin, et al. (2013). Transcriptome Analysis of the Differentially Expressed Genes in the Male and Female Shrub Willows (Salix suchowensis). PLoS One 8(4) Marker-aided selection 1 of polyploid poplars Bioenergy Res，EI SCI 2013 Discovey and experimental analysis of microsatellites in an oil woody plant Cameallia chekinagoleosa. Plant Syst Evol,correspondence SCI 2013 Identification of quantitative trait loci and candidate genes for cadmium tolerance in Populus TREE PHYSIOLOGY SCI 2012, 32 (5): 626-638 The obscure events contributing to the evolution of an incipient sex chromosome in Populus: a retrospective working hypothesis Tree Genetics & Genomes SCI (2012) 8:559–571 Genome-wide detection of genetic loci triggering uneven descending of gametes from a natural hybrid pine Tree Genetics & Genomes，通讯 SCI 2012,DOI 10.1007/s11295-012-0524-5 基于Otsu算法的木材缺陷图像分割 计算机与数字工程 2012,276: 116-118 杨树锈菌表达序列微卫星分析及EST-SSR标记开发 东北林业大学学报 2012,40:76-80 油茶基因组微卫星特征分析 南京林业大学学报 2012,36:47-50 环境条件和播后覆土对水杉种子出苗率的影响 中南林业科技大学学报 2012,32:26-30 林木遗传育种基础研究热点述评，林业科学，2012,48:150-154 林业科学 2012,48:150-154 基于改进的Affinity Propagation聚类的木材缺陷识别 工 程 数 学 学 报 2012， 49：600-606 Establish the ideal statistical model tracking the Dynamic growth rhythm for progeny in a full-sib family of Salix xuzhouenesis 4th International Conference on Pulping, Papermaking and Biotechnology, ISTP 2012,Nanjing China DETECTION AND FUNCTIONAL ANALYSES OF MICROSATELLITES IN CODING SEQUENCES OF PINES 4th International Conference on Pulping, Papermaking and Biotechnology, ISTP 2012,Nanjing China Yin, T., X. Zhang, et al. (2010). Differential detection of genetic Loci underlying stem and root lignin content in Populus. PLoS One 5(11): e14021. Li, S., Y. Chen, et al. (2010).Potential chromosomal introgression barriers revealed by linkage analysis in a hybrid of Pinus massoniana and P. hwangshanensis. BMC Plant Biol 10: 37. Compare gene densities between chromosomes that share large duplicated segments and survey gene coverage by ESTs in polar genome. Genomics and applied biology 通讯作者 2010，29(3) 桉树EST序列中微卫星含量及相关特征分析 植物学报通讯作者 国内 2010，45（3） Characterization of microsatellites in the coding regions of the Populus genome Molecular Breeding通讯作者 SCI DOI: 10.1007/s11032-010-9413-5 Bioinformatics-Based Identification of Candidate Genes from QTLs Associated with Cell Wall Traits in Populus Bioenergy Res SCI 2010，DOI 10.1007/s12155-009-9060-z Characteristics of microsatellites in the transcript sequences of the Laccaria bicolor genome Journal of Microbiology and Applied Biotechnology通讯作者 SCI 2010, 20（3） 林木基因组和功能基因克隆研究进展与展望 遗传 国内 2010, 32(7) An Improved Approach for Mapping Quantitative Trait Loci in a Pseudo-Testcross: Revisiting a Poplar Mapping Study. Bioinformatics and Biology Insights 国外 SCI 2010:4 BoxCox转换对数量性状基因座位分析的影响及其应用 南京林业大学学报. 国内 2010，34（3） 黄山松不同生理生化指标随海拔高度变化趋势研究 东北林业大学学报通讯作者 国内 2010,38（6） Microsatellite primers resource developed from the mapped sequence scaffolds of Nisqually-1 genome New Phytologist SCI 2009, 181 A microarray-based genotyping and genetic mapping approach for highly heterozygous outcrossing species enables localization of a large fraction of the unassembled Populus trichocarpa genome sequence Plant Journal SCI (2009) 58 Detection of quantitative trait loci influencing growth trajectories of adventitious roots in Populus using functional mapping Tree Genetics & Genomes 国外 SCI (2009) 5 A genetic linkage map for the ectomycorrhizal fungus New Phytologist 国外 SCI (2008) 180 Comparative Analysis of F-Box Proteins in Arabidopsis, Poplar and Rice Suggests Differential Proteolytic Pathway Mediated through F-Box Protein between Woody Perennial and Herbaceous Annual Plants Plant Physiology SCI 2008,148 Genome structure and emerging evidence of an incipient sex chromosome in Populus Genome Research SCI 18: 422-430, 2008. A physical map of the highly heterozygous Populus genome: integration with the genome sequence and genetic map Plant Journal SCI 50(6):1063-78, 2007 A dense linkage map of hybrid cottonwood (Populus fremontii_P. angustifolia) contributes to long-term ecological research and comparison mapping in a model forest tree Heredity SCI (2008) 100 Map and Analysis of Microsatellites in Genome of Populus: the First Sequenced Perennial Plant SCIENCE IN CHINA SERIES C-LIFE SCIENCES通讯作者 SCI 50(5), 690-699, 2007 植物细胞壁伸展蛋白研究述评 林业科学，通讯作者 国内 2010，46：144-152 The Bioenergy Science Center (BESC) and Overcoming Recalcitrance of Populus to Biofuel Production. IN VITRO CELLULAR & DEVELOPMENTAL BIOLOGY-ANIMAL 国外 SCI 2010, 46:48 - 杨树微卫星序列对基因表达频率影响及表达序列中微卫星特征分析 南京林业大学学报，通讯 国内 2011，35:11-14 松树、杨树及桉树表达基因序列微卫星比对分析 基因组与应用生物学，通讯作者 国内 2011，30：103-109 The genome of black cottonwood, Populus trichocarpa (Torr. & Gray ex Brayshaw) SCIENCE 国外 SCI 313: 1596-1604, 2006- The genome sequence of the basidiomycete fungus Laccaria bicolor provides insightsinto the mycorrhizal symbiosis Nature SCI 452:88-93, 2008 - Phenotypic variation in growth and biomass distribution for two advanced-generation pedigrees of hybrid poplar(Populus spp.) CANADIAN JOURNAL OF FOREST RESEARCH 国外 SCI 35 (8): 1779-1789 AUG,2005 Mapping the Rust Resistant Loci MXC3 and MER in P. trichocarpa and Assessing the Intermarker Linkage Disequilibrium in MXC3 Region NEW PHYTOLOGIST 国外 SCI 164 (1): 95-105 OCT 2004 Large-scale Heterospecific Segregation Distortion in Populus Revealed by a dense Genetic Map THEORETICAL AND APPLIED GENETICS 国外 SCI 109 (3): 451-463 AUG 2004 Characterization of Microsatellites Revealed by Genomic Sequencing of Populus trichocarpa CAN. J. FOR. RES. SCI 34(1): 85-93 (2004) A likelihood approach for mapping growth trajectories using dominant markers in a phase-unknown full-sib family THEOR APPL GENET 国外 SCI 108 (4): 699-705 FEB2004 马尾松表达序列标签多态性初步分析 林业科学 40(6):176-180. Nov 2004 Nearly complete genetic maps of Pinus sylvestris L. (Scots pine) constructed by AFLP marker analysis in a full-sib family THEOR APPL GENET 国外 SCI 106 (6): 1075-1083 APR 2003 利用分子标记技术对林木近缘种进行遗传鉴别的研究 林业科学 国内 39(3): 130-135, 2003 Analysis of genetic structure of natural populations of Castanopsis fargesii by RAPDs ACTA BOT SIN 国内 SCI 44 (11): 1321- 1326 NOV 2002 Molecular linkage maps of the Populus genome GENOME 国外 SCI 45 (3): 541-555 JUN 2002 Preliminary interspecific genetic maps of the Populus genome constructed from RAPD markers GENOME 国外 SCI 44 (4): 602-609 AUG 2001 Host effect on genetic variation of Marssonina brunnea pathogenic to poplars THEOR APPL GENET 国外 SCI 100 (3-4): 614-620 FEB 2000 History and progress of the genomics studies in the model system of perennial plant species ACTA PHYTOTAXONOMICA SINICA 国内 SCI 42 (5): 464-479 SEP 2004 Quantitative trait loci for growth trajectories in Populus GENET RES 国外 SCI 81 (1): 51-64 FEB 2003 A logistic mixture model for characterizing genetic determinants causing differentiation in growth trajectories GENET RES 国外 SCI 79 (3): 235-245 JUN 2002 用SSR研究栲树群体遗传结构 植物学报 国内 SCI 43（4）：409-412，2001

李悦的发表论文

贾彩凤. 李悦. 瞿超.木本植物体细胞胚胎发生技术中国生物工程杂志 2004年03期贾彩凤; 李悦; 张榕;. 2006. 华山松成熟胚的器官发生研究初探 . 北京林业大学学报. 28 (4): 100-105李悦; 瞿超; 续九如;2005.中国大陆林木遗传育种学科1949—2003年的研究历程 . 北京林业大学学报. 27 (1) 79-87李悦, 张春晓. 2000.油松无性和有性繁殖材料的比较, 北京林业大学学报,22(1):12-19李悦,张春晓.1998.油松育种系统多群体同工酶变异研究.面向21世纪的中国生物多样性保护——第三届全国生物多样性保护与持续利用研讨会论文集,秦采风、李悦、牛正田等.油松种子园无性系配子贡献研究.北京林业大学报,2000, 22（1）p20～24王艳青、蒋湘宁、李悦.盐胁迫对刺槐不同组织及细胞离子吸收和分配的变化. 北京林业大学学报,2001,23（1）18～23于冬梅、续九如、李悦.非正态分布性状的遗传力估算方法研究. 北京林业大学学报，2000，22（1）p25～28张冬梅、李悦、沈熙环等.油松改良系统中三种群体交配体系.北京林业大学学报，2000，22（5）p13～18张冬梅. 沈熙环. 张华新. 李悦..油松种子园交配系统的时空变化研究 林业科学 2004年01期张冬梅、李悦、沈熙环等.去劣疏伐对油松种子园交配体系及遗传多样性影响的研究.植物生态学报（2001年9）Li Yue & Shen Xihuan. 1994. Mating compatibility and paternal contribution of clones in polycross of Pinus tabulaeformis Carr. Asia-Pacific Symposium on Forest Genetics Improvement, IUFRO S 02.02.00, Beijing,Li Yue & Shen Xihuan. 1994. Re-selection of clones and seed orchard roguing of Pinus tabulaeformis Carr. Asia-Pacific Symposium on Forest Genetics Improvement, IUFRO S 02.02.00, Beijing,Shen Xihuan & Li yue. 1994. Genetic improvement progress and breeding strategy for Pinus tabulaeformis Carr. Asia-Pacific Symposium on Forest Genetics Improvement, IUFRO S 02.02.00, Beijing,Yuan, Shuyan; Hu Qing; Chen Xuemei; Li Yue. 2002. Effects of jasmonic acid on salt tolerance of suspension-cultured Populus euphratica cells. Journal of Beijing Forestry University, 24 (3): 66-69Mao J-F, Li Y, Liu Y-J, Liu H, Wang X-R. 2007. The fitness of Pinus densata as revealed through cone analysis. Journal of Plant Ecology 31, 291-299 (in Chinese, with English abstract).Mao J-F, Li Y, Wang X-R. 2009. Empirical assessment of the reproductive fitness components of the hybrid pine Pinus densata on the Tibetan Plateau. Evolutionary Ecology 23, 447-462.

林木遗传育种的研究方向

1、 森林遗传学森林树木不同性状在群体、个体、细胞及分子水平上的遗传变异规律和进化机制，为森林资源的保存、经营及林木的遗传改良提供理论基础。2、 林木遗传改良林木改良的策略和程序，制定育种方案，引种、选择育种、杂交育种（包括产量、品质、抗性和适应性育种等）理论与方法，以及林木良种繁育途径和方法。3、 林业生物技术利用基因工程、细胞工程、发酵工程和酶工程等生物技术，对林木进行遗传改良或对林木良种进行高效繁育。

2021-01-27林木全基因组关联分析（GWAS)研究进展与展望

1、林木目标改良性状多为数量性状，受全基因组水平多基因位点联合控制，其遗传变异效应可分为基因的加性和显性效应、基因-基因的上位性效应以及基因-环境的互作效应等。先前基于家系群体的数量性状位点定位分析方法的应用，在林木复杂性状遗传解析方面取得了显著进展。

2、但由于林木家系作图大多基于F1, F2或BC1等低世代杂交群体, 遗传变异丰富度较低和染色体重组事件有限, 导致QTL作图分辨率低且其遗传效应往往被高估。

3、基于自然群体或种质资源群体的关联遗传学(association genetics)策略的提出, 为解析数量性状的遗传基础提供了新的途径。

4、关联分析又称连锁不平衡（linkage disequilibrium，LD）作图，可以直接利用自然群体中丰富的表型和基因组变异来确定控制数量性状的目标基因。特别是多年生林木群体在适应复杂多变的自然环境过程中产生了丰富的表型变异和DNA序列变异，是开展关联作图研究的理想材料。

5、根据遗传变异来源, 关联作图可分为基于候选基因(candidate gene-based association study)和基于全基因组(genome-wide association study, GWAS)的两种分析方法。

6、随着NGS的发展，基于全基因组重测序(whole genome resequencing)和简化基因组测序(reduced-representation genome sequencing, RRGS)技术确定了海量的覆盖全基因组水平的SNP变异位点, 显著推动了林木GWAS策略的广泛应用。此外, 第二代测序技术也促进了全基因组范围内插入缺失(insertion/deletion, InDel)、拷贝数变异(copy number variation, CNV)等标记位点的开发与应用, 弥补了仅考虑SNP导致的数量性状“丢失遗传力”。

1、全基因组关联分析(GWAS)是一种复杂性状功能定位的正向遗传学分析策略, 可直接利用群体内所有个体全基因组水平上的等位遗传变异和表型变异的相关性分析, 鉴定与目标性状显著连锁的等位变异位点,进而分析等位基因型对表型的遗传效应, 在植物数量性状遗传结构解析中取得了丰硕成果。

2、LD水平决定了GWAS的解析精度, 是开展GWAS研究的理论基础, 它代表了基因组中两个等位基因非随机组合的程度, 主要产生于群体进化过程中的突变和重组事件, 也会受到群体大小、异交率、选择强度与遗传漂变等其他因素的影响。一般来说, 林木群体内LD在500~2000 bp内已衰退至不明显。遗传漂变可导致毛果杨(Populus tricho�carpa)自然群体的基因组区域LD衰退范围达到3~6 kb,而且在着丝粒区及基因密度较低的染色体区段, LD衰退距离更远。林木进化过程主要受到自然选择的作用, 与受到强烈人工驯化的一年生作物相比，多年生林木的LD水平相对较低， 因此, 当一个与性状显著关联的遗传标记一旦被发现和验证, 则该标记与功能位点物理距离很近甚至是功能变异基因本身, 上述研究对于未来林木分子辅助育种提供了重要的理论指导。

        林木关联分析的研究主要针对木材品质和产量等重要的经济性状，以及物候相关的适应性性状。

       由于GWAS在复杂性状遗传基础研究中的优势,其在动植物遗传学研究中的应用越来越广泛, 新的软件和方法也不断被开发, 功能和算法也各不相同, 但多数是以 一般线性模型(general linear model, GLM) 和 混合线性模型(mixed linear model, MLM) 为基础。

      一般线性模型 以 群体结构矩阵(population structure, Q) 或 主成分分析(principal component analysis, PCA)矩阵 为协变量, 提高计算精度。

     混合线性模型 联合利用 Q矩阵 和 亲缘关系(kin-ship, K)矩阵 或者联合利用 PCA矩阵 和 K矩阵 为协变量开展关联作图分析。

GWAS研究主要的软件及其功能特点如下表：

TASSEL、PLINK、EMMAX软件是林木中应用比较广泛的单标记GWAS分析软件。

a 、TASSEL软件功能较为全面, 但计算效率较低。

b 、PLIKN软件在数据管理和群体结构评价方面较为简单、高效, 但是其关联结果质量相对较差。

c 、EMMAX软件用到了运算速度较快的有效混合模型关联分析算法, 在对大样本数据处理上具有更高的效率。

上述三款软件主要应用于单标记位点的GWAS研究工作，确定的都是宜穿效应较为显著的单标记位点，在林木数量性状受到的多基因多位点联合控制。因此, 开发使用多位点GWAS关联模型进行遗传效应分析, 可以检测更多的联合遗传位点, 进而更清晰地剖析出目标性状的基因组遗传结构。

例如，mrMLM软件可以将SNP效应视为随机效应并利用多位点随机效应的MLM模型进行GWAS分析, 该模型有效提升了目标性状基因组遗传结构的解析精度。随着测序技术和组学技术的发展,大量的SNPs, InDels与CNVs标记等被广泛应用于林木复杂性状的遗传效应解析。因此, 开发适用于不同群体类型、不同标记类型、不同表型层次的GWAS软件,将会极大地推动林木复杂性状研究进展。

GWAS策略与多组学技术的结合已广泛应用于数量性状遗传解析。 GWAS联合多组学解析策略不仅可以提高筛选候选基因的准确性, 还可揭示复杂性状形成的分子遗传调控机制。

近年来, 研究人员利用GWAS策略在动植物数量性状研究中鉴定了大量关键位点, 但是这些显著关联位点, 仅能解释部分表型变异, “ 丢失遗传力” 问题依然是当前数量遗传学研究的难点。因此，如图所示，本文从高通量表型组学、不同变异类型的遗传效应、加性与非加性联合解析策略等方面探讨, 为系统解析林木复杂性状, 解决“丢失遗传力”问题提供重要的策略指导。

基因型(genotype)、表型(phenotype)、环境(envir�onment)三者构成了GWAS研究的支撑要素。

林木群体内基因组内存在大量稀有等位变异位点, 这些位点独立起作用时对群体性状变异贡献率较低, 其遗传效应在种质资源或天然群体大的群体背景下难以被发现，而且通过建立林木多世代回交群体来改变稀有等位位点的频率是难以实现的。

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青海省农林科学院的研究机构

青海省农林科学院作物育种栽培研究所是集青海省五大农作物品种选育和栽培技术研究的综合农业科研所，也是全省最大的农业专业技术研究所，建所历史已达50余年。主要开展农作物遗传资源、农作物育种和栽培技术研究以及科技成果的转化。设有小麦研究室、马铃薯研究室、青稞研究室、蚕豆研究室、豌豆研究室、品种资源研究室、旱作农业研究室、成果转化研究室、农业部植物新品种测试（西宁）分中心等9个专业研究室（中心）；青海省马铃薯遗传育种重点实验室、青海省青稞遗传育种重点实验室、青海省农产品加工重点实验室等3个省级重点实验室。现有在职人员45人，其中：高级职称的科技人员19人（其中正高职称的6人、副高职称的13人）、中级职称14人、初级职称的9人、其他人员3人。有博士研究生1人、硕士研究生15人、大学本科17人、其他12人。享受国务院政府津贴专家2人，青海省级优秀专家1人，青海省级优秀专业人才1人。2004—2009年间作物所曾先后5次荣获青海省农林科学院先进集体称号，5次荣获青海省农林科学院先进党支部称号，4次荣获青海大学先进基层党组织称号；2008年荣获青海省创建学习型组织“标兵班组”称号；2009年获青海省政府颁发的“青海省模范集体”称号。2006年在全国农业科研机构“研究、开发能力”综合评估中，青海省农林科学院作物育种栽培研究所居青海省35个研究所首位。多年累计取得国家和省级科研成果175项，有33项成果获得各级奖励。其中获全国科学大会奖2项、国家科技进步二等奖1项、青海省科技进步奖25项，其它奖励5项。其中“十五”以来我所培育农作物新品种29个，获奖成果8项，其中：国家科技进步二等奖1项，青海省科技进步一等奖1项，青海省科技进步二等奖5项，农业部丰收计划奖三等奖1项。 “十五”以来累计获得国家和省级科研成果40项，有12项成果获得各级奖励，其中国家科技进步二等奖1项，青海省科技进步奖9项（一等奖2项、二等奖4项、三等奖1项、四等奖2项），其它奖励3项，这些科研成果尤其是一些优秀科研成果如小麦品种 “青春38”、“青春39”、“青春40”；蚕豆品种“青海9号”、“青海10号”、“青海11号”、“青海12号”、“青海13号”；豌豆品种“草原12号”、“草原24”、“草原25号”等系列新品种；马铃薯品种“青薯168”、“青薯2号”、“青薯6号”等系列新品种；青稞品种“昆仑164”、“昆仑12号”、“昆仑13号”等，这些成果的取得和推广应用，在我省农业发展的各个阶段都发挥了直接的推动作用，取得了显著的经济效益和社会效益。2004——2008年间，青海省农林科学院作物所农业科技事业取得丰硕成果，重大农业技术研发取得突破性进展。农业科技自主创新步伐加快，农业基础研究、高新技术研究、重大关键技术攻关取得积极进展。2004年青薯2号马铃薯获得国家科技进步二等奖，这是青海省农林科学院历史上第一个自主知识产权所获得的国家级奖项；同年草原276豌豆新品种获青海省科技进步二等奖；2006年青海10号蚕豆新品种获青海省科技进步二等奖；2010年青海11号蚕豆新品种获青海省科技进步二等奖；2004—2010年获得各类省部级科研成果20项。作物所农业科技进步贡献率已超过60%。农业科技进步的丰硕成果，有力促进了粮食增产、农业增效和农民增收，有力推动了现代农业和社会主义新农村建设。 青海省农林科学院生物技术研究所成立于1995年，是青海省从事马铃薯、球茎花卉及野生植物资源研究与开发的主要科研单位之一，下设植物病毒检测中心、分子生物学实验室、马铃薯高山实验站、抗旱生理研究室、植物脱毒技术研究室、科管科及开发科。生物所主要从事马铃薯育种、植物茎尖脱毒、植物组织培养、工厂化生产脱毒植株苗、植物病毒检测、植物蛋白质分析等研究工作。现有各种大、中型实验设备40多台（套），价值人民币1200多万元。主要有大型超净工作台、大型高压消毒锅、超低温冰箱、冷冻高速离心机、荧光显微镜、全自动紫外分光光度计、96孔自动洗涤机、ELISA读数仪及面积1300平方米的全自动温室等。现有职工16人，其中研究员2人，副研究员8人，助理研究员5人。研究所主要从事马铃薯育种、马铃薯脱毒、种薯生产、病毒检测、盐湖微生物研究等工作，实施完成省、部、国家级农业研发项目27项，获得省科技成果4项，其中科技成果“马铃薯脱毒与繁育技术研究”荣获2007年度青海省科学技术进步一等奖。引进和培育马铃薯新品种3个，其中抗旱、优质、高产新品种青薯9号申请国家品种权保护并通过国家级品种审定。申请国家专利1项。1992年“马铃薯茎尖分生组织培养的研究”项目，获省科技进步三等奖；1996年实施欧盟援助“青海马铃薯发展项目”，从国外引进先进仪器设备60多台套，组建了“青海省马铃薯脱毒中心实验室”；2003年完成了农业部种子工程项目“青海省马铃薯脱毒中心建设”，现已达到年繁殖脱毒试管苗达120万株，年生产微型薯250万粒的能力；建立有县级原原种繁殖基地300亩；高山原种繁殖基地2000亩，可年生产优质脱毒马铃薯种薯约4000吨。另外，经过多年的努力，在2007年选育出抗旱优质马铃薯新品种青薯9号，该品种的推广，将大大改善我省马铃薯的品种结构，进一步提高我省马铃薯的产量及品质，从而促进西部地区马铃薯产业向高产、优质、专业化的方向发展。现正实施的项目有农业部跨越计划“抗旱优质马铃薯新品种青薯9号试验与示范”、农业部行业专项子专题“马铃薯旱作节水栽培技术研究与集成示范”、星火计划项目“青藏高原脱毒马铃薯种薯标准化服务和技术开发”、省科技厅“马铃薯茎尖超低温保存技术研究”及“大蒜脱毒技术研究及应用”等项目，另外研究所所长为农业部马铃薯现代农业产业技术体系岗位专家。2008-2011年度到位科研经费1200多万元，为研究所的发展提供了有力的保障。研究所通过项目的顺利实施，为青海省的马铃薯脱毒种薯产业化发展奠定了坚实的基础，使青海省的马铃薯生产水平更上了一个台阶，为山区农民脱贫致富创造了良好的条件；同时，也使青海省在马铃薯品种选育、茎尖分生组织培养、脱毒鉴定、脱毒苗快繁、原原种生产、种薯基地建设和新品种推广等方面，积累了大量的经验和技术成果，使青海省在马铃薯种质资源研究及脱毒马铃薯种薯生产技术水平达到国内领先。同时，为了进一步研究开发青藏高原特有的植物资源，研究所在紧紧抓住脱毒马铃薯这个优势产业的基础上，不断开拓新的研究开发领域，开始着力研究高原野生植物资源的开发与利用。生物技术研究所机构设置 所设科室 科室工作内容 负责人 植物病毒检测中心 病毒检测与质量认证 周 云 分子生物学实验室 基因工程技术研究 杨永智 马铃薯高山实验室 原种繁殖、资源鉴定 叶广继 抗旱生理研究室 植物抗旱机理研究 王 舰 植物脱毒技术研究室 脱毒技术研究及利用 蒋福祯 科管科 科研项目组织与管理 周 云 开发科 品种示范推广、种薯销售 贾 豪 科研团队：团队人员共19人，其中研究员2人、副研究员7人、博士学历2人、硕士学历6人，博士生导师1人、“新世纪百千万人才工程”国家级人选1人、国务院政府特殊津贴获得者2人。实验室主任和学术带头人：杜德志，男，研究员，博士生导师，现任国家油菜改良青海省春油菜分中心主任、中国作物学会油料作物专业委员会常务理事、油菜学组副组长，《中国农业科学》和《西北农业学报》编委；主要从事春油菜品质育种和杂种优势利用研究，先后主持培育出了高产优质甘蓝型杂交油菜品种7个（青杂1～7号），这些高产优质的油菜杂交种累计推广面积约1900万亩，种植区累计增收约18亿元，并从根本上改善了种植区农民食用油的品质，其中青杂1号和青杂2号先后获得了青海省科学技术进步奖一等奖。荣获首届青海省科学技术重大贡献奖、全国优秀农业科技工作者、全国先进工作者、全国杰出专业技术人才、西部开发突出贡献奖、“新世纪百千万人才工程”国家级人选等荣誉称号，享受国务院特殊津贴。研发条件：拥有品质分析、小孢子培养、分子生物学和细胞遗传学共4个专业实验室，实验室总面积超过了300m，有科研试验地30亩、活动网室10亩、温室384m、晒场1000m、种子仓库495m、挂藏室400m，拥有国内最大的杂交油菜制种基地，年制种面积近1万亩。研究成果：建立了成熟的小孢子培养技术体系，并广泛应用于育种亲本的快速创建和遗传群体构建；建立了SSR、AFLP和SRAP三种分子标记技术体系，应用这些技术开展了油菜育种资源遗传多样性评价、品种指纹图谱构建、杂交种纯度快速鉴定，优良性状的分子标记开发或基因定位等研究；利用白菜型油菜与甘蓝进行杂交人工合成了一批甘蓝型油菜资源，利用甘蓝型油菜与白菜型油菜种间杂交选育出了一批新型特早熟甘蓝型油菜资源，拓宽了甘蓝型春油菜的遗传基础；先后培育出了高产优质甘蓝型油菜杂交种7个，其中青杂2号是春油菜区主栽品种，年种植面积超过100万亩；早熟品种青杂3号比青油241增产40%左右，基本替代了白菜型油菜青油241，是青海、甘肃两省海拔2750-2900米的油菜主栽品种；青杂5号连续两年（2008-2009）被农业部定为全国油菜主导品种之一，年种植面积超过100万亩；青杂6号2008年通过国家审定，比对照青杂2号增产10%左右，适合在整个春油菜区种植；早熟品种青杂7号2009年通过省级审定，比对照青杂3号增产7%左右，适合在青海省海拔2750 -2950米的油菜产区种植。对外交流与人才培养：与中国农业科学院油料作物研究所、华中农业大学等著名油菜研究单位在科研、品种选育与推广、研究生培养等领域进行了广泛的交流与合作；近五年发表学术论文29篇，其中核心期刊以上论文15篇；已培养了硕士研究生30余人，现有在读博士研究生25余人、硕士研究生34余人。 一、基本情况青海省农林科学院园艺所是青海省园艺科研的核心单位，主要开展蔬菜种质创建、新品种选育、设施高效栽培技术、蔬菜安全生产，以及蔬菜遗传多样性和生理生化研究，是青海省蔬菜遗传与生理重点实验室、国家大宗蔬菜技术体系西宁综合试验站、青海省蔬菜产业技术体系、青海省园艺品种中间试验站的依托单位。下设育种研究室、栽培与生理生化研究室、菊芋研究开发中心、种质资源研究室等专业科室。现有在编职工18名，专业技术人员15名，其中，正高职称2人，副高职称3人，中级职称8人。硕士学历8人。青海省优秀专业技术人才1人。现有试验基地120亩，日光节能温室22栋，塑料大棚5座，晒场800 m，办公室200 m；实验室450m，并配备有相关的仪器设备。二、工作情况简介园艺研究所立足青海高原的气候和资源特点，在蔬菜品种选育、保护地设施建设及配套栽培技术研究以及蔬菜安全生产及科技成果的示范、推广和培训等方面发挥了重要作用。2000年以来，园艺所共承担国家、省部及其它各类科研课题65项，取得省级科研成果37项，发表论文108篇，选育蔬菜新品种7个，获得省级科技进步奖二等奖1项、市级科技进步奖二等奖1项。通过多年的技术积累和人才储备，我所各项蔬菜科研工作已经进入了高速发展时期，成为我省蔬菜科研的先头军，引领全省的蔬菜科研不断进步，为青海省蔬菜产业发展提供坚实的技术支撑。三、现有技术基础1、种质资源及品种选育已经建成青海省蔬菜种质资源库，收集保存22个科，35个种类，共3500余份蔬菜资源，其中包括辣椒资源600余份，西葫芦500余份，菊芋300余份，葱60余份，甘蓝40余份。应用系统选育、有性杂交、辐射诱变等技术开展蔬菜新品种选育工作，审定青线椒1号、2号线辣椒品种，青芋1号、2号、3号菊芋品种，大通鸡腿葱品种，青甘1号甘蓝品种等蔬菜新品种7个。正在向西葫芦、菜豆、大白菜等蔬菜育种拓展。相关分子育种工作也已起步。2、蔬菜高效栽培技术针对青海省冬季低温而持续时间长、气候冷凉、环境洁净等特点，开展蔬菜高效栽培技术和安全生产技术研究。开展有机生态型蔬菜无土栽培技术研究，优化筛选主栽蔬菜的基质配方，制定相关技术标准；针对青海省辣椒、黄瓜、番茄等设施蔬菜以及线辣椒、大蒜等特色露地蔬菜，开展蔬菜标准化安全生产技术研究和推广应用，形成安全高效的蔬菜生产技术；引进黄瓜、番茄、辣椒等蔬菜新品种50余个，开展蔬菜新品种丰产性、适应性等方面的筛选试验与示范，为青海省的蔬菜品种更新换代提供技术依据。3、菊芋技术研发青海省农林科学院是国内首家系统开展菊芋研究的单位，主要开展菊芋种质资源收集、新品种选育、生长发育规律、栽培技术、栽培生理等方面的研究。截至目前，已收集、引进和创建菊芋种质资源400余份，创立了国内最大的菊芋种质资源库；选育青芋1号、2号、3号、4号菊芋新品种4个，其中青芋2号菊芋已经成为我国菊芋的主栽品种，并建立起国家级菊芋标准化示范区；取得研究成果12项，达到国内领先水平；编制菊芋地方标准8项，发表学术论文32篇。开展的菊芋新品种选育、配套栽培技术、菊芋抗旱生理、果聚糖代谢机理等方面的研究处于国内领先水平；正在开展菊芋植物DUS测试技术研究，初步筛选出了可用的菊芋DUS测试性状和标准样本，同时建立了稳定可靠的菊芋ISSR-PCR反应体系，为菊芋种质资源遗传多样性研究奠定了基础。四、科技成果转化与示范依靠国家大宗蔬菜产业技术体系西宁综合试验站以及青海省蔬菜产业技术体系，已经建成蔬菜产业技术转移中心1个，下设育种、植保、土肥、栽培、设施设备等5个功能室；另外在乐都、平安、互助、湟中和大通县建立了产业技术推广中心。已形成具有省级专家与骨干技术人员16名、县级专家与基层技术人员100名，连接示范户20000户的高效示范推广体系；建立起以新品种选育、新品种引进筛选、栽培技术研究、新型设施设备展示示范、新技术引进熟化为主要功能的京青合作蔬菜试验示范基地，引进示范各类蔬菜新品种，接待省内外专家参观指导，培训农民和各类科技人员；同时，在黄河谷地地区的贵德县建立以蔬菜良种繁育技术试验为主要功能的基地50亩，主要开展辣椒、甘蓝、西葫芦、菠菜、萝卜等蔬菜种子的繁育与制种技术研究；在海西州德令哈市开始着手建立非耕地蔬菜生产示范基地。五、学科建设本学科为青海大学重点学科作物遗传育种学科三个重点专业方向之一，2010年获批建立“青海大学高原蔬菜遗传与生理科研创新团队”，2011年获批建立“青海大学园艺作物遗传育种与栽培生理教学科研团队”。同时，园艺所承担着青海大学作物遗传育种及作物栽培与耕作学硕士研究生的培养任务，截至2012年5月，已经培养遗传育种硕士研究生4名，在读硕士研究生9名（包括作物栽培硕士生2名）。实验室还为青海大学农学系、生科系本科生提供毕业论文研究实习条件，每年协助培养本科生3-4名。 青海省农林科学院植物保护研究所创建于1955年，是专业从事农作物有害生物研究与防治的社会公益性省级科学研究机构。现有在职工18人，其中科研人员17人，财务人员1人。在科研人员中，有研究员3人、副研究员5人、高级实验师1人、助理研究员6人、研究实习员2人。全所设植物病害研究室、农业昆虫研究室、杂草科学研究室、作物抗性鉴定中心、生物防治研究室和农药研究室6个研究室（中心）和管理科共7个部门。1990年以来我所共承担国家 、省(部)级攻关课题,国际合作项目及其它来源研究课题36余项，课题登记成果20余项，其中国际先进国内领先水平1项、国内领先水平2项、国内先进水平6项。《青海省地方标准》登记成果19项。获奖成果11项，其中国家科技进步二等奖1项、国家科技进步三等奖1项、农业部二等奖一项、省部级一等奖1项、省科技进步三等奖3项、省科技进步四等奖1项。其它获国家科技进步特等奖1项，厅、局级科技进步一、二、三等奖各1项。发表学术论文360余篇，其中在国际刊物上发表20余篇，获省级优秀学术论文奖17篇。编写著作一部。青海省农林科学院植保所还是农药部农药检定所指定农药登记田间药效试验认证单位。 一．基本情况青海省农林科学院土壤肥料研究所是全省土壤资源、土地利用、肥料研究、测试分析、耕作制度、土壤微生物和食用菌以及农化科技服务的专业研究机构。建所五十多年来，共承担各类研究、开发项目百余项，其中获奖成果20余项，发表论文300余篇，出版专著10余部。主要成果有青海土壤图勘察绘制，柴达木盆地盐碱地改良，荒漠灌区快速经济培肥技术及其理论研究，灌区退耕撂荒地复苏利用技术研究，化肥经济施用技术研究，配方施肥技术研究和成果开发示范推广，温暖灌区轮作与复种制度研究以及土壤薄层整段标本制作等科研成果。农作物专用复混肥研究与开发、土壤微生物利用研究、中-加项目土壤养分资源及平衡施肥技术研究和食用菌种引选及栽培技术研究这些成果已成为农业增产增效主要措施，也为青海省农业发展、科研教学提供了重要参考。经过五十多年发展，已基本形成科研队伍素质较高，设备条件比较先进，学科较齐全的专业研究单位。现全所在职人员28人，其中高级7人，中级12人，初级7人。具有专业研究室6个，即土壤资源环境、肥料施用、农业微生物、农产品加工、分析测试和食用菌研发。全所现有实验室8个，仪器设备89台（件），可承担土壤、肥料、植物等的物理、化学、生理生化以及水质、有害物质的分析，同时还开展了土壤微生物利用研究、抗生菌剂筛选、菌肥研制、土地资源开发利用、肥料使用技术和耕作制度等方面的研究。二．“十五”以来科研工作及成果经全所人员积极努力，多渠道争取科研，主要项目有“中国—加拿大合作项目土壤养分资源管理及平衡施肥技术研究”，“全国肥料长期定位检测”，“全国叶面肥效协作网”，青海省科技厅“湟水流域农田主要土壤类型微生物调查”，“海南洲共和盆地塔拉滩生态治理工程前期调研”，“龙羊峡库区移民区农田盐碱危害及治理”，“新型肥料磁化肥肥效测定”，“三江源生态工程治理”。引进国外技术合作项目“氮素循环损失及对环境影响的研究”。为了使科研成果转化为生产力，全所重视科技开发，主要项目有农作物高效复混专用肥示范推广，全元有机生物肥研制生产和生物菌肥、叶面肥推广。农业微生物利用研究与开发，在生物菌剂防治土传病害、根瘤菌应用、微生物肥料研制和食用菌高效栽培等方面取得较快进展和效益。通过与国内外协作，拓宽了工作领域，科研项目的实施范围扩大，研究工作逐步深入，科技开发突出了本专业优势，获得了一定的经济效益。取得的成果有参与中国农科院土肥所项目“农田土壤钾素状况及钾肥效应研究”，获国家科技进步二等奖，“高效食用菌双孢菇引种示范”获农业部丰收计划三等奖，承担省科学基金项目“高原富钾地区钾素效应研究”、“农作物高效缓释专用肥研究”通过省级成果鉴定，引进强效叶面肥“施丰乐”进行室内、田间多点试验示范，测定增产效果，通过省级评审，申报省主管部门进行产品登记。承担“香日德—巴隆地区农业开发项目前期调研和现场勘察工作”，提供土壤、水质分析结果4000余样次，完成了种植业可行性研究报告，“中国—加拿大钾肥合作项目”已工作14年，研究内容扩充，资助额度增加。科研成果转化和科技开发工作，以研制和生产农作物高效复混专用肥为主，与化肥企业合作，通过测土分析，设计施肥方案，组织企业生产提供产品为用户服务，专用肥料具有较强针对性，增产显著，基层反映较好。引进示范推广叶面肥施丰乐、高乐、根施微肥、富万钾等均有明显促进作用，可大量提供生产使用。 青海省林业科学研究所始建于1957年，是具高原特色的林业专业研究所。青海省林业科学研究所积极进行内部机构改革，调整专业学科结构以适应西部大开发战略和生态环境建设需要，形成了集科研、生产、经营为一体的运行机制，成为高原林业科研与生产建设不可缺少的科技力量。青海省林业科学研究所立足于青海高原生态治理和经济建设需要,以开展林木育种、森林培育、生态环境保护、森林经营、荒漠化治理、森林资源开发利用、城市绿化为主要研究方向，取得了一系列研究成果，为青海地区的生态建设和经济发展作出了突出贡献。自上世纪八十年代以来，共取得研究成果56项，其中获各类科技奖33项，发表论文400余篇，出版《青海省木本植物志》、《青海次生林经营》、《西宁小蛾类图鉴》等专著10余部。所内设有林木育种、森林培育、森林资源保护与利用、荒漠化治理、城市林业五个研究室和林业公司。现有职工23人，其中科技工作人员20人，其中正高职称3人，副高职称5人，中级职称10人，初级职称3人，技术人员多具有本科以上学历。青海省林业科学研究所各研究室简介一、林木育种研究室主要研究方向为林木育种、引种、树种驯化。分类选育三江源地区、柴达木地区、东部旱区以及城市绿化的造林树种，进一步加强抗逆性灌木和观赏树木的引种驯化及规模繁育工作，积极寻求生态、观赏和经济多用途树种，开拓林木利用方向，为高原林业生态和林业经济建设提供物质基础。二、森林培育研究室主要研究方向为高寒区森林培育、森林生态网络体系建设、生态工程技术。以高寒区森林培育为重点，开展高原森林生态网络体系建设、天然林保护工程、退耕还林工程和脆弱生态区的植被恢复相关技术的研究。研究分析高原森林生态环境演替的规律和机制，高原森林生态环境的变化对生态系统功能和生物多样性的影响，提出高原森林资源的培育和促进森林生态功能发挥的主要措施，为高原森林资源的培育和森林生态功能的发挥提供技术和理论依据。三、森林资源保护与利用研究室主要研究方向为森林保护、森林经营、高原特色植物资源开发。以经济林、食用菌、中藏药及野生植物资源为主要研究对象，开展相关应用基础研究和保护性的开发技术研究。同时以保护森林资源，维护森林生态系统平衡，治理本区域重大森林病虫危害及抵御外来有害生物入侵，巩固绿化造林成果为总体目标，开展相关应用研究和应用基础研究。四、荒漠化治理研究室主要研究方向为土地荒漠化治理、防护林体系建设、沙区资源保护与开发。重点研究高寒区土地荒漠化机理与发展趋势，荒漠化防治、高寒湿地保护及重建、高寒沙区植物多样性保护及沙区新型产业技术开发。五、城市林业研究室主要研究方向为高原城市林业体系、园林绿化树种资源开发与利用、园林绿化新技术以及绿化工程咨询、设计与施工 青藏高原野生植物资源研究所，成立于2001年9月，是从事青藏高原野生植物资源研究与开发利用的专业研究所。现有高级专业技术职称研究人员7人，中级4人，其他人员2名，其中硕士学历5人。专业涉及植物学、微生物、林学、园艺等，研究所下设“植物资源利用研究室”和“食用菌研究室”2个研究室，建有“天然产物实验室”和“微生物实验室”2个实验室。研究所“十一五”期间承担多项国家科技部、国家自然科学基金委、青海省科技厅、青海省发改委等部门下达的科研项目。现已在荒漠资源植物种质资源选择利用、野生植物化学成分研究与开发利用、野生灌木引种驯化、高原城镇园林绿化树种的引选与栽培、高原特色野生食用菌驯化、珍稀食用菌引种栽培及食用菌规模化生产等领域开展了研究工作，并取得了阶段性成果。