全转录组怎么做毕业论文

研究主要指具体的研究方法、手段和工具。每一课题都要有相应的研究方法，一般可以采取综合的方法，或者以一种方法为主，其它方法为辅。这样有利于收集多方面的信息，可以得到可靠的结论。下面介绍课题中常用的几种研究方法。 一、行动研究法 1、行动研究是由社会情境（包括教育情境）的参与者为提高对所从事的社会的或教育实践的理性认识，为加深对实践活动及其背景的理解所进行的反思研究。行动研究的核心是自我反思的螺旋式行进过程，包括计划行动观察反思几个步骤 。 2、行动研究有这样两个鲜明的特点： （1）以提高行动质量、改进实际工作、解决现实问题为首要目标 。 （2）主要研究人员就是实践者，强调研究过程与行动相结合， 行动研究法可采 取这些步骤： a.选择问题 即对学校在教育、教学上存在的问题进行调查分析，对问题作出归纳、分类，形成一定时期内要通过研究解决的问题。教师从众多的问题中概括出具有普遍性和研究价值的问题，通过讨论和交流，初步形成各年级或各门学科以及各人的主要问题，形成一个时期学校需要重点解决的问题群。 b.理论探讨即从教育理论中有针对性地选取最合适的内容，为解决筛选出的问题提供理论指导和操作规范，从而保证行动研究的正确性。如有专业人员参与，则专家要根据教师选出的问题，寻找与问题相关的理论，有针对性地向教师介绍，让教师了解与问题相关的教育理论，通过组织教师学习、讨论，教师结合自己的教育教学实践进一步从中选出适合自己需要的教育理论。 c.实施和反思 即教师按照计划、行动、观察和反思的顺序，创造性地运用自己已经选择的、有针对性的教育理论，解决具体教育教学问题，改善教育教学工作，并对实践的结果作出总结和反思。行动研究的目标是在实施和反思这一阶段实现的，它是行动研究的关键阶段。这一环节需要教师撰写开展行动研究、总结实践经验的论文，为继续开展行动研究提供参考。 二、观察法 是指研究者通过感官和辅助仪器，有目的、有计划地对处于自然情境下的客观事物进行系统感知观察的一种科学研究方法。 1、观察法的分类 ： （1）按照观察的情境条件来分，可以分为自然情境中的观察与实验室观察 ； （2）按观察者是否直接参与被观察者所从事的活动，可分为参与式观察与非参与式观察 。 （3）按观察实施的方法，可分为结构式观察与非结构式观察。 结构式观察预设有明确的目标、所要观察的问题以及大致范围，有较详细的观察计划、步骤以及合理设计的可控性观察，能获得翔实的材料，并能对观察资料进行定量分析和对比研究。 2、观察法的步骤： （1）明确观察的目的和意义（在观察中要了解什么，情况，搜集哪些方面的事实材料），确定观察对象、时间、地点、内容和方法。 （2）搜集有关观察对象的文献资料，对所要观察的条件有一个一般的认识。 （3）编制观察提纲。对观察内容进行明确分类，并确定观察的重点。 （4）实施观察。该步要做到有计划、有步骤、全面而系统地观察。 （5）记录并收集资料。 （6）分析资料，得出结论。 3、观察法的记录 （1）实地笔记，专门记录观察者看到和听到的事实性内容； （2）个人笔记，用来记录观察者个人在实地观察时的感受和想法； （3）方法笔记，记录观察者所使用的具体方法及其作用； （4）理论笔记，用于记录观察者对观察资料进行的初步理论分析。 三、调查法 调查法是指在教育过程中研究者凭借一定的手段或方法对一些教育现象或事实进行考察，通过对收集到的各种事实资料的分析处理，进而得出结论的一种研究方法。 四、文献法 通过查阅文献资料了解、证明所要研究对象的方法。

转录组数据在论文里要放的序列有：原始序列、清洗后的序列、拼接后的序列。1、原始序列：包括测序平台产生的原始序列数据，可以存放在公共数据库中，如NCBISRA，ENA等。需要提供测序的ID号、库名、测序平台、测序长度等信息。2、清洗后的序列：清洗后的序列文件，包括去除接头序列、低质量序列、低复杂度序列等处理的结果。需要提供序列清洗的方法、参数、清洗后的序列长度、数量等信息。3、拼接后的序列：使用拼接工具对原始序列进行拼接，需要提供拼接后的序列文件，包括拼接率、平均长度、N50等统计信息。

目前都需要递交原始序列，转录组有两部分数据要递交，首先是拼接的转录组序列，一般递交到tsa上，另一个是fastq的原始测序数据，一般递交到sra上。前两年还有论文只提交tsa不递交原始数据，目前发表的论文基本都要提交。这也是便于其他人可以完全重复你的实验和数据分析的必要要求。