如果你的参考文献格式正确那么系统会自动识别并且剔除不参与正文查重。参考文献标红就说明你的格式有误。系统把你的参考文献当正文来对比查重了。
如果是paperpass、维普、turnitin之类的系统，检测步骤是“在网页粘贴全文内容”，报告上参考文献显示重复这种情况，几乎改不了，认栽吧... 或者可以调换下参考文献顺序，比如把[1]和[2]文献对换，[3]和[4]文献对换，依此类推。这样有几率逃过查重，不过这样的坏处是和原文引用处就不对应了，不过说句实话...没人在意是不是对应...如果是知网，参考文献标红是完全可以避免的。因为知网检测是上传整篇文档，知网系统会识别格式的，参考文献重复了只能证明你格式错误！
先贴上网络到处流传的设置方法，大家先做个初步自查：（参考来源：《知网查重如何正确标明引用》）
1. 有明显的“参考文献”标记，参考文献4个字独占一行，下面是各个参考文献条目；
2. 每个参考文献有明显的标号，标号可以是以下任意一种：【Num】、[Num]、(Num)；
3. 标号可以是Word自动生成也可以手工书写；
4. 标号内不要添加标点符号，例如：不要[Num.]或(Num、)等；
5. 每个参考文献中最好有时间信息或者URL或《》书目信息；
6. 一条参考文献内及在此条参考文献没有结束时不要有手动换行或者回车符（即顺其自然，满行后会自动换行，请勿人为！）
嗯，总结得很好，但上图还是重复了怎么回事？因为没有提到一些更加重要的潜规则：
1.“参考文献”四个字设置为标题格式。
2.所有标点必须是英文格式，例如,.()[]。书名号《》基本可以直接删除
3.不要出现年月日，直接删掉即可。例如2015年5月 改为
4.文献内容的顺序要正确。正确格式：[1]张庆洪,何清方.机动车辆保险[M].北京:机械工业出版社,2016,65.作者与作者之间是逗号，作者列完后是句号，记得是英文标点！
接着是参考文章标题→文章类型→期刊/出版社→出版年份→页码（期刊需要）其中文章类型期刊[J]，图书[M]，硕士论文[D]。
当然，知网查重时只会在意你格式对不对，而不会智能到识别你是否标错了J/M/D或作者/题目之类的细节。做到以上这些，参考文献不会再重复。该文“知网查重时参考文献被标红怎么办”由学术不端网总结，仅供那些参考文献按照网络的一些知网检测系统识别标准撰写后一样还是被知网查重标红的同学去参考，希望对同学们有所帮助，同学们可以多尝试总结。参考实践过程中一切问题本作者概不负责哦，继续探索中.....
以学校判定为准。
毕业论文的格式是要按照学校的规定来写的，最后论文是交给学校来进行查重检测的。学校规定什么格式，论文就要以什么格式来完成。能否顺利的毕业，能否顺利的拿到毕业证书，这些都是由学校决定的，学校是以毕业论文来做判断的。
国内权威论文检测机构主要有三家:Gocheck维普、知网CNKI、万方。论文查重也被称为论文检测，主要是指查询论文内容的重复率，目的在于应对学位论文学术不端和学术论文抄袭复制。论文检测查重率，即论文查重字数占总字数的百分比。
如果参考文献格式不正确，知网查重检测系统就无法正确的识别出参考文献来，那么这个时候参考文献就会当做论文的正文部分来参与对比查重，此时参考文献大部分都会被标红。
因为参考文献是在学术研究过程中，对某一著作或论文的整体的参考或借鉴，征引过的文献在注释中已注明，不再出现于文后参考文献中。按照字面的意思，参考文献是文章或著作等写作过程中参考过的文献。
参考资料来源：百度百科-查重
参考资料来源：凤凰网-@所有大学生，毕业论文查重更严了！有学校“查重率”已降至8%
维普论文未检测有多种原因。1、首先文档命名格式不正确，用户需要修改文档格式为姓名加学号加论文题目。2、参考文献格式错误，维普只能识别半角英文状态下输入文献标注格式，并且标注格式一定要正确。
维普系统的参考文献有提示原因如下：1、维普论文参考文献格式有错误，系统会自动识别并且的论文就不会显示出来，是系统把参考文献当正文来对比查重。2、文档命名格式不正确，用户需要修改文档格式为姓名加学号加论文题目。
1 是的，维普有时会提示次数不足。2 这可能是因为你的账户购买的检索次数已经用完了，或者你的账户类型不支持无限制检索次数。3 如果需要继续使用维普检索，可以考虑购买更多次数或者升级账户类型。同时，也可以尝试使用其他数据库或者搜索引擎进行文献检索。
联系维普的客服人员进行处理。维普论文系统停止审查是由于系统维护或升级，也可能是出现了技术问题，需要恢复审查功能，可以通过官方渠道联系维普客服反馈问题，获取相应的解决方案。在平时使用维普论文系统时，及时备份自己撰写的文章，以免出现数据丢失等问题。
是学校不能提交还是哪里呢？如果要用维普查论文，高校论文查重网有和学校的系统，可以替换。
维普论文未检测有多种原因。1、首先文档命名格式不正确，用户需要修改文档格式为姓名加学号加论文题目。2、参考文献格式错误，维普只能识别半角英文状态下输入文献标注格式，并且标注格式一定要正确。
可能就是因为：1、提交的维普查重论文文档格式不符合查重系统的要求，查重系统无法解析。2、维普查重论文字数超过查重系统的限制，解析失败。3、提交的维普查重论文类型和查重系统入口不符，导致无法识别。4、维普查重论文查重系统的程序故障。5、需要你把维普查重时标红的部分进行修改后再查重，然后提交即可。
维普论文显示检测失败不算是提交成功了，是提交失败了，需要修改后重新提交检测。维普论文检测系统，由重庆泛语科技有限公司自主研发，采用先进的海量论文动态语义跨域识别加指纹比对技术，通过运用云检测服务部署使其能够快捷、稳定、准确地检测到文章中存在的抄袭和不当引用现象，实现了对学术不端行为的检测服务。系统主要包括已发表文献检测、论文检测、自建比对库管理等功能，可快速准确地检测出论文中不当引用、过度引用甚至是抄袭、伪造、篡改等学术不端行为，可自动生成检测报告，并支持PDF、网页等浏览格式。详细的检测报告通过不同颜色标注相似片段、引用片段、专业用语，形象直观地显示相似内容比对、相似文献汇总、引用片段出处、总相似比、引用率、复写率和自写率等重要指标，为教育机构、科研单位、各级论文评审单位和发表单位提供了论文原创性和新颖性评价的重要依据。经过不断发展和努力，已经在众多行业和部门得到了广泛使用，受到了用户的高度评价。
维普论文未检测有多种原因。1、首先文档命名格式不正确，用户需要修改文档格式为姓名加学号加论文题目。2、参考文献格式错误，维普只能识别半角英文状态下输入文献标注格式，并且标注格式一定要正确。
有可能是文件格式有问题，排版有问题！
记住查重编号，过一会重新找查重报告，可能是最近查论文的笔比较多系统慢
文档有问题。或者加密。系统没有钥匙。。。
我也查快一小时了还没出来，上次一下子就出来了，上次是因为重复率非常高，这次全是自己写的，难道，自己写的难查？