我也遇到过这个问题，还没没有最好的解决方法。只是在在所有参考文献搞定后，那个需要连着参考文献就不用交叉应用啦，直接输入[1-3]。
嗯，这几天我也在做论文，找了些资料，和楼上回答的一样，你可以这样做，是挺麻烦的，不过你也可以按我后面的经验来做，觉得简单点 论文格式要求参考文献在正文之后，参考文献后还有发表论文情况说明、附录和致谢，而Word的尾注要么在文档的结尾，要么在“节”的结尾，这两种都不符合我们的要求。 解决的方法似乎有点笨拙。首先删除尾注文本中所有的编号（我们不需要它，因为它的格式不对），然后选中所有尾注文本（参考文献说明文本），点“插入｜书签”，命名为“参考文献文本”，添加到书签中。这样就把所有的参考文献文本做成了书签。在正文后新建一页，标题为“参考文献”，并设置好格式。光标移到标题下，选“插入｜交叉引用”，“引用类型”为“书签”，点“参考文献文本”后插入，这样就把参考文献文本复制了一份。选中刚刚插入的文本，按格式要求修改字体字号等，并用项目编号进行自动编号。 到这里，我们离完美还差一点点。打印文档时，尾注页同样会打印出来，而这几页是我们不需要的。当然，可以通过设置打印页码范围的方法不打印最后几页。这里有另外一种方法，如果你想多学一点东西，请接着往下看。 选中所有的尾注文本，点“格式｜字体”，改为“隐藏文字”，切换到普通视图，选择“视图｜脚注”，此时所有的尾注出现在窗口的下端，在“尾注”下拉列表框中选择“尾注分割符”，将默认的横线删除。同样的方法删除“尾注延续分割符”和“尾注延续标记”。删除页眉和页脚（包括分隔线），选择“视图｜页眉和页脚”，首先删除文字，然后点击页眉页脚工具栏的“页面设置”按钮，在弹出的对话框上点“边框”，在“页面边框”选项卡，边框设置为“无”，应用范围为“本节”；“边框”选项卡的边框设置为“无”，应用范围为“段落”。切换到“页脚”，删除页码。选择“工具｜选项”，在“打印”选项卡里确认不打印隐藏文字（Word默认）。 好了，试着打印一下尾注所在的页，是不是白纸？！或者按我的办法，大同小异，感觉不添加书签会方便些：先将参考文献部分复制粘贴到一个新word中，你会发现，中括号的序号全部没有了或者变成1了，这时需要按你原来的，手动改为（上面那个方法也得手动改序号），然后按原论文中参考文献格式，刷一下。然后把这部分再复制到论文后面就可以了。接下来，把论文中原来的参考文献，全部选中，字体——隐藏，即可。 这样参考文献后面就可以插入分页符了，接下来，像附录、致谢、简历每个各占几页。最后一起生成目录
我是这样解决的,不用插入尾注的方法,用插入上标的方法,插入[1][2][3],然后在文档的参考文献那里可以自己随便定义格式
插入- 引用 -脚注和尾注 - 自定义标记- 符号- 依次选择 [ 1 ]
编写论文时，如何在word中标注参考文献？
一、参考文献著录格式 1 、期刊作者．题名〔J〕．刊名，出版年，卷(期)∶起止页码 2、 专著作者．书名〔M〕．版本(第一版不著录)．出版地∶出版者，出版年∶起止页码 3、 论文集作者．题名〔C〕．编者．论文集名，出版地∶出版者，出版年∶起止页码 4 、学位论文作者．题名〔D〕．保存地点．保存单位．年份 5 、专利文献题名〔P〕．国别．专利文献种类．专利号．出版日期 6、 标准编号．标准名称〔S〕 7、 报纸作者．题名〔N〕．报纸名．出版日期(版次) 8 、报告作者．题名〔R〕．保存地点．年份 9 、电子文献作者．题名〔电子文献及载体类型标识〕．文献出处，日期 二、文献类型及其标识 1、根据GB3469 规定，各类常用文献标识如下： ①期刊〔J〕 ②专著〔M〕 ③论文集〔C〕 ④学位论文〔D〕 ⑤专利〔P〕 ⑥标准〔S〕 ⑦报纸〔N〕 ⑧技术报告〔R〕 2、电子文献载体类型用双字母标识，具体如下： ①磁带〔MT〕 ②磁盘〔DK〕 ③光盘〔CD〕 ④联机网络〔OL〕 3、电子文献载体类型的参考文献类型标识方法为：〔文献类型标识/载体类型标识〕。例如： ①联机网上数据库〔DB/OL〕 ②磁带数据库〔DB/MT〕 ③光盘图书〔M/CD〕 ④磁盘软件〔CP/DK〕 ⑤网上期刊〔J/OL〕 ⑥网上电子公告〔EB/OL〕 三、举例 1、期刊论文 〔1〕周庆荣，张泽廷，朱美文，等．固体溶质在含夹带剂超临界流体中的溶解度〔J〕．化工学报，1995(3)：317—323 〔2〕Dobbs J M, Wong J M Modification of supercritical fluid phasebehavior using polor coselvent〔J〕 Ind Eng Chem Res, 1987,26:56 〔3〕刘仲能，金文清合成医药中间体4-甲基咪唑的研究〔J〕精细化工，2002(2)：103-105 〔4〕 Mesquita A C, Mori M N, Vieira J M, et al ． Vinyl acetate polymerization by ionizing radiation〔J〕．Radiation Physics and Chemistry,2002, 63:465 2、专著 〔1〕蒋挺大．亮聚糖〔M〕．北京：化学工业出版社，2001．127 〔2〕Kortun G． Reflectance Spectroscopy〔M〕． New York: Spring-Verlag,1969 3、论文集 〔1〕郭宏，王熊，刘宗林．膜分离技术在大豆分离蛋白生产中综合利用的研究〔C〕．//余立新．第三届全国膜和膜过程学术报告会议论文集．北京：高教出版社，1999．421-425 〔2〕Eiben A E, vander Hauw J K．Solving 3-SAT with adaptive genetic algorithms 〔C〕．//Proc 4th IEEE Conf Evolutionary Computation．Piscataway: IEEE Press, 1997．81-86 4、学位论文 〔1〕陈金梅．氟石膏生产早强快硬水泥的试验研究（D）．西安：西安建筑科学大学，2000 〔 2 〕 Chrisstoffels L A J ． Carrier-facilitated transport as a mechanistic tool in supramolecular chemistry〔D〕．The Netherland：Twente University．1988 5、专利文献 〔1〕Hasegawa, Toshiyuki, Yoshida,et al．Paper Coating composition〔P〕．EP 0634524．1995-01-18 〔 2 〕 仲前昌夫， 佐藤寿昭． 感光性树脂〔 P 〕． 日本， 特开平09-26667．1997-01-28 〔3〕Yamaguchi K, Hayashi A．Plant growth promotor and productionthereof 〔P〕．Jpn, Jp1290606． 1999-11-22 〔4〕厦门大学．二烷氨基乙醇羧酸酯的制备方法〔P〕．中国发明专利，CN1073429．1993-06-23 6、技术标准文献 〔1〕ISO 1210-1982，塑料——小试样接触火焰法测定塑料燃烧性〔S〕 〔2〕GB 2410-80，透明塑料透光率及雾度实验方法〔S〕 7、报纸 〔1〕陈志平．减灾设计研究新动态〔N〕．科技日报，1997-12-12(5) 8、报告 〔1〕中国机械工程学会．密相气力输送技术〔R〕．北京：1996 9、电子文献 〔1〕万锦柔．中国大学学报论文文摘(1983-1993)〔DB/CD〕．北京：中国百科全书出版社，1996
选中要标记的文字，点击引用中的插入尾注，然后在尾注里面输入参考文献就可以了。方法如下：1、打开文档，在文档里面选择需要标记的文字。2、然后点击文档上面的引用菜单。3、在引用的选项里面选择插入尾注。4、然后光标就会自动跳到尾注的地方。5、在这里输入参考文献。6、这样就可以看到已经成功标注参考文献了。注意事项：这是word 2009版本的操作方法，其他版本的操作方法也可以参考。
在尾注和脚注自定义标记里填写上[1] [2][3] 确定即可
其实就是把参考文献用中括号扩起来，然后选中按下ctrl+shift+=，选中的部分就会变成上标，也就引用了这个编号的参考文献，很简单的。而且你可以批量引用参考文献，比如[1-8]，这样就不用一个一个做上标了，你可以百度下：普刊学术中心，其中关于毕业论文有很多学习资料以及写作教程。
参考文献标注[1]的办法：打开要标注参考文献的word文档，用鼠标点在需要添加标注的位置。点击引用——脚注和尾注。勾选尾注，格式勾选方括号样式应用更改设置为整篇文档，设置好之后点击插入即可。参考文献是文章或著作等写作过程中参考过的文献。按照GB/T 7714-2015《信息与文献参考文献著录规则》的定义，文后参考文献是指：为撰写或编辑论文和著作而引用的有关文献信息资源。根据《中国学术期刊（光盘版）检索与评价数据规范（试行）》和《中国高等学校社会科学学报编排规范（修订版）》的要求。
项目编号，或是编号，还有多级列表可自由选用，在段落设置里
项目编号，或是编号，还有多级列表可自由选用，在段落设置里
自动设置word编号为[1] [2] [3]的方法：选择要加入编号的文本段落，格式/项目符号和编号/编号/自定义，编号格式默认为“”，你在修改为“[]”，就OK了。系统默认有缩进，如果你的参考文献一行放不下，又不希望在下一行缩进，一般的论文格式规范好象都是如此，就把制表位和缩进值都设为0。
论文如何正确标注参考文献，word中怎么标注参考文献
采用书签、交叉引用方法：参考文献的编号和引用步骤如下：（1）在word文档末尾添加几个文献，如：[1] 杨秀章Word 2000中文版使用速成北京:清华大学出版社，2000[2] Peter W Diane P中文Word 2002专家北京:机械工业出版社，2002 注意，输入时应采用word的自动编号。如果word没有自动编号，可自己插入（这个就不用细说了）（2）给每个文献制作成书签。如，选择“杨秀章Word 2000中文版使用速成”，插入——书签，输入书签名（杨秀章_Word 2000中文版使用速成），然后添加。注意书签名必须以字母开头，可包含数字但不能有空格，可以用下划线字符来分隔文字，否则可能无法插入。书签名最好与文献名一致，这样在它位置变化后，你仍能识别它。（3）在需要引用文献的位置，执行插入——引用——交叉引用，类型选择书签，选择需要引用的项目，内容选择“段落编号”。至此，引用完成！
方法/步骤光标移到要加入参考文献标注的地方菜单中“插入”——“引用”——“脚注和尾注”如图设置 确定后在该处就插入了一个上标“1”，而光标自动跳到文章最后，前面就是一个上标“1”，这就是输入第一个参考文献的地方重复上面的步骤，加入其它参考文献标注修改样式为[1] [2]在全文中，查找(Ctrl+F)——高级——特殊字符——尾注标记（它会自动显示^e）——替换为[^&]注意：光标移到第一个标记处，即1处，再进行查找，替换删除参考文献前面一条短横线 切换到普通视图，菜单中 “视图”——“普通”——“脚注”——尾注的编辑栏在尾注右边的下拉菜单中选择“尾注分隔符”，这时那条短横线出现了，选中它，删除。再在下拉菜单中选择“尾注延续分隔符”，这是那条长横线出现了，选中它，删除。切换回到页面视图，参考文献插入已经完成
其实就是把参考文献用中括号扩起来，然后选中按下ctrl+shift+=，选中的部分就会变成上标，也就引用了这个编号的参考文献，很简单的。而且你可以批量引用参考文献，比如[1-8]，这样就不用一个一个做上标了，你可以百度下：普刊学术中心，其中关于毕业论文有很多学习资料以及写作教程。