想要合理的标记引用的文献的话，可以使用PDF阅读器里面的工具，直接进行标注就好了。
我觉得可以打开pdf编辑器，那里面可以有东西来标记引用的文献，并且很好用的呢。
光标移到需要插入参考文献标注的地方。在菜单栏“插入（i）”→“引用（n）”→选择“脚注和尾注（g）”选项。于是，弹出窗口，按照下图进行各项的设置：尾注设置：这是最重要的（1）在“位置”选项中，选择“尾注（e）——节的结尾”；（2）在“格式”选项中，①选择“编号格式（n）——1，2，3，…”也就是阿拉伯数字，②自定义标记不需要填，③“起始编号（s）——1”，④“编号方式（m）——连续”（3）在“应用更改”选项中，选择“将更改应用于（p）——整篇文档”最后，点按钮“插入（i）”，便在你所选的地方插入了第一个参考文献标注。可以看到，在所选地方上角出现了一个小1。4．双击上标“1”，光标自动跳到文章最后，前面就是一个上标“1”，这就是输入第一个参考文献的地方。按照上面的步骤，在其他地方标注参考文献，可以看到系统是自动为我们进行排序的，而与我们插入的先后顺序没有关系。这样，我们便完成了第一步操作。第二部分标注格式的修改通过第一步设置的尾注，就是我们所需要的标注，是正文所插入地方上角的小数字，和文章末尾对应的小数字。其实这些都不是正确的参考文献标注格式，我们还需要动手稍作修改。下面就是讲这一内容啦：将全文所涉及的尾注都改为“[n]”的标准格式：注意是修改，而不是删除后重新输入上标！（1）给数字加中括号首先，需要强调的是，在进行这一步操作时，光标应在正文范围内，而不是最后的尾注区域。然后，在菜单栏“编辑（e）”→“查找（e）”或者通过快捷键“ctrl+f”可以打开“查找和替换”窗口。按照下图进行各项的设置在“查找内容（n）”选项中填入“^e”，表示尾注。如果以后需要查找脚注，则是搜索“^f”。在“替换为（i）”选项中填入“[^&]”。并单击右下方第一个按钮“常规（l）”展开窗口。注意下方“搜索”选项选择“全部”，其他格式要求的前方要去掉勾勾。选项全部设置好后，点击“全部替换（a）”即可完成全文参考文献标注，即尾注格式的第一部分修改。（2）尾注部分的标号从上标改为正文格式与上一步不同的是，此时光标应在尾注区域内，重新打开“查找和替代”窗口，按照下图进行各项的设置
首先选择需要的文档,点击word面板上的引用选项,再点击脚注和尾注。默认注释用的是“i”,可将其改成数字形式,点引用选项中脚注的下拉选项。
想要标记引用的文献的话可以在你的一些例如说是论文或者是其他发表文章下面所备注
其实就是把参考文献用中括号扩起来，然后选中按下ctrl+shift+=，选中的部分就会变成上标，也就引用了这个编号的参考文献，很简单的。而且你可以批量引用参考文献，比如[1-8]，这样就不用一个一个做上标了，你可以百度下：普刊学术中心，其中关于毕业论文有很多学习资料以及写作教程。
01文后以“参考文献：”(左顶格)作为标识，参考文献表按文中引用的先后顺序编码依次排列，顶格编排，编码用阿拉伯数字著录，加方括号、不用标点，后空一字，按著录要求规定依次著录，回行时与首行著录项齐平。每条文献单独排，最后均以“”结束。02文中引用的参考文献必须在正文中有标注，如[2]，[3-5]不宜写成[3][4][5]等。03题名、摘要、标题中不得标注参考文献，文末按引用顺序著录。作者一律采用姓前名后的方式著录(外文作者名应缩写)。04文献的作者，期刊名的缩写一律不加缩写点，缩写的单词要国际通用的缩写方法，不可随意缩写。05多次引用同一著者的同一文献时，在正文中标注首次引用的文献序号，并在序号的“[]”外著录引文页码。06凡是从期刊中析出的文献，应在刊名之后注明其年份、卷、期、部分号、页码。07凡是从报纸中析出的文献，应在报纸名后著录其出版日期与版次。08题名之后如有其他题名信息，包括副题名、多卷书的分卷书名、卷次、册次等，则之间用“：”隔开。
1 在论文引用处标识序号。2 在序号后标注：引用论文作者姓名，引用文的标题，论文分别的刊物和著作的名称，引用文的页号，发表年月日，
一般来说，引用一次的文献的页码（或页码范围）在文后参考文献中列出。 多次引用的文献，每处的页码或页码范围（有的刊物也将能指示引用文献位置的信息视为页码）分别列于每处参考文献的序号标注处，置于方括号后（仅列数字，不加“p”或“页”等前后文字、字符；页码范围中间的连线为半字线）并作上标。期刊类：【格式】：[序号]作者 篇名[J] 刊名,出版年份,卷号(期号):起止页码[1] 袁昊 “改革”还是“改良”——班级授课制带来的思考[J] 安徽文学,2011(11):249-专著类：【格式】[序号]作者书名[M]出版地：出版社，出版年份：起止页码[1] 覃兵课堂评价策略[M]北京：北京师范大学出版社,2009:31-学位论文：【格式】[序号]作者 篇名[D] 出版地：保存者，出版年份：起始页码[1]段燕芳 教学地图的运用对初中生构建脑中地图的影响[D] 吉林：东北师范大学,2009:1-报纸类：【格式】[序号]作者 篇名[N] 报纸名，出版日期（版次）[1] 曾居仁，汤苾 贵州出台应对气候变化方案[N] 中国气象报,2008-12-09(001)论文集：【格式】[序号]作者 篇名[C] 出版地：出版者，出版年份：起始页码[1]靳鹤龄,李明启 全球变暖趋势下青藏高原沙漠化发展趋势[A]三江源区生态保护与可持续发展高级学术研讨会论文摘要汇编[C] 西宁: 青海省人民政府、中国科学院,研究报告:【格式】[序号]作者篇名[R]出版地：出版者，出版年份：起始页码[1] 冯西桥核反应堆压力管道与压力容器的LBB分析[R]北京：清华大学核能技术设计研究院, 1997：9-专利文献： 【格式】[序号] 专利所有者．专利题名[P]．专利国别：专利号，发布日期．[1] 姜锡洲．一种温热外敷药制备方案[P]．中国专利：881056078，1983-08-12．国际、国家标准 ：【格式】[序号] 标准代号，标准名称[S]．出版地：出版者，出版年．[1] GB/T 16159—1996，汉语拼音正词法基本规则[S]．北京：中国标准出版社，1996．电子文献 :【格式】[序号] 作者．电子文献题名[文献类型/载体类型]．电子文献的出处或可获得地址, 发表或更新日期/引用日期（任选）[1] 万锦柔．中国大学学报论文文摘(1983-1993)[DB/CD]．北京：中国百科全书出版社，条例:【格式】[序号]颁布单位条例名称发布日期[1] 中华人民共和国科学技术委员会科学技术期刊管理办法[Z]1991-06-译著:【格式】主要责任者文献题名[文献类型标识]出版地：出版者，出版年起止页码(任选)（中译本前要加国别）[1] M奥康诺尔著，王耀先译．科技书刊的编译工作[M]北京：人民教育出版社，56参考来源：CSDN博主「love666666shen」
我觉得可以打开pdf编辑器，那里面可以有东西来标记引用的文献，并且很好用的呢。
采用书签、交叉引用方法：参考文献的编号和引用步骤如下：（1）在word文档末尾添加几个文献，如：[1] 杨秀章Word 2000中文版使用速成北京:清华大学出版社，2000[2] Peter W Diane P中文Word 2002专家北京:机械工业出版社，2002 注意，输入时应采用word的自动编号。如果word没有自动编号，可自己插入（这个就不用细说了）（2）给每个文献制作成书签。如，选择“杨秀章Word 2000中文版使用速成”，插入——书签，输入书签名（杨秀章_Word 2000中文版使用速成），然后添加。注意书签名必须以字母开头，可包含数字但不能有空格，可以用下划线字符来分隔文字，否则可能无法插入。书签名最好与文献名一致，这样在它位置变化后，你仍能识别它。（3）在需要引用文献的位置，执行插入——引用——交叉引用，类型选择书签，选择需要引用的项目，内容选择“段落编号”。至此，引用完成！
01文后以“参考文献：”(左顶格)作为标识，参考文献表按文中引用的先后顺序编码依次排列，顶格编排，编码用阿拉伯数字著录，加方括号、不用标点，后空一字，按著录要求规定依次著录，回行时与首行著录项齐平。每条文献单独排，最后均以“”结束。02文中引用的参考文献必须在正文中有标注，如[2]，[3-5]不宜写成[3][4][5]等。03题名、摘要、标题中不得标注参考文献，文末按引用顺序著录。作者一律采用姓前名后的方式著录(外文作者名应缩写)。04文献的作者，期刊名的缩写一律不加缩写点，缩写的单词要国际通用的缩写方法，不可随意缩写。05多次引用同一著者的同一文献时，在正文中标注首次引用的文献序号，并在序号的“[]”外著录引文页码。06凡是从期刊中析出的文献，应在刊名之后注明其年份、卷、期、部分号、页码。07凡是从报纸中析出的文献，应在报纸名后著录其出版日期与版次。08题名之后如有其他题名信息，包括副题名、多卷书的分卷书名、卷次、册次等，则之间用“：”隔开。
项目编号，或是编号，还有多级列表可自由选用，在段落设置里
打开word2010 点击开始菜单，然后找到段落，上面有个编号，点开右边向下箭头后会 看到定义编号格式，如下图，然后把编号格式1改成[1]，然后确定就可以了
不多的话就直接手动加吧
在word文件里，怎么设置论文的引用？
采用书签、交叉引用方法：参考文献的编号和引用步骤如下：（1）在word文档末尾添加几个文献，如：[1] 杨秀章Word 2000中文版使用速成北京:清华大学出版社，2000[2] Peter W Diane P中文Word 2002专家北京:机械工业出版社，2002 注意，输入时应采用word的自动编号。如果word没有自动编号，可自己插入（这个就不用细说了）（2）给每个文献制作成书签。如，选择“杨秀章Word 2000中文版使用速成”，插入——书签，输入书签名（杨秀章_Word 2000中文版使用速成），然后添加。注意书签名必须以字母开头，可包含数字但不能有空格，可以用下划线字符来分隔文字，否则可能无法插入。书签名最好与文献名一致，这样在它位置变化后，你仍能识别它。（3）在需要引用文献的位置，执行插入——引用——交叉引用，类型选择书签，选择需要引用的项目，内容选择“段落编号”。至此，引用完成！
光标移到需要插入参考文献标注的地方。在菜单栏“插入（i）”→“引用（n）”→选择“脚注和尾注（g）”选项。于是，弹出窗口，按照下图进行各项的设置：尾注设置：这是最重要的（1）在“位置”选项中，选择“尾注（e）——节的结尾”；（2）在“格式”选项中，①选择“编号格式（n）——1，2，3，…”也就是阿拉伯数字，②自定义标记不需要填，③“起始编号（s）——1”，④“编号方式（m）——连续”（3）在“应用更改”选项中，选择“将更改应用于（p）——整篇文档”最后，点按钮“插入（i）”，便在你所选的地方插入了第一个参考文献标注。可以看到，在所选地方上角出现了一个小1。4．双击上标“1”，光标自动跳到文章最后，前面就是一个上标“1”，这就是输入第一个参考文献的地方。按照上面的步骤，在其他地方标注参考文献，可以看到系统是自动为我们进行排序的，而与我们插入的先后顺序没有关系。这样，我们便完成了第一步操作。第二部分标注格式的修改通过第一步设置的尾注，就是我们所需要的标注，是正文所插入地方上角的小数字，和文章末尾对应的小数字。其实这些都不是正确的参考文献标注格式，我们还需要动手稍作修改。下面就是讲这一内容啦：将全文所涉及的尾注都改为“[n]”的标准格式：注意是修改，而不是删除后重新输入上标！（1）给数字加中括号首先，需要强调的是，在进行这一步操作时，光标应在正文范围内，而不是最后的尾注区域。然后，在菜单栏“编辑（e）”→“查找（e）”或者通过快捷键“ctrl+f”可以打开“查找和替换”窗口。按照下图进行各项的设置在“查找内容（n）”选项中填入“^e”，表示尾注。如果以后需要查找脚注，则是搜索“^f”。在“替换为（i）”选项中填入“[^&]”。并单击右下方第一个按钮“常规（l）”展开窗口。注意下方“搜索”选项选择“全部”，其他格式要求的前方要去掉勾勾。选项全部设置好后，点击“全部替换（a）”即可完成全文参考文献标注，即尾注格式的第一部分修改。（2）尾注部分的标号从上标改为正文格式与上一步不同的是，此时光标应在尾注区域内，重新打开“查找和替代”窗口，按照下图进行各项的设置
在word文件里，怎么设置论文的引用？