图3-1 图3-2 表3-1
专业论文来说，应该是2，需要标注章节小节。硕士毕业论文属于比较专业的论文了，最好用2来标注。
不应该混编，图3-1
论文里的图和表，名称写在上面，注释写在下面，这是惯例。没你说的这种情况。