爱思晴儿
大家好,本周给大家分享的是2022年最近发表在PNAS上关于 通过GWAS分析重症肌无力遗传风险位点的识别 相关的一篇文章。
文章题目: Identification of genetic risk loci and prioritization of genes and pathways for myasthenia gravis:a genome-wide association study (重症肌无力遗传风险位点的识别及基因和途径的优先排序:全基因组关联分析)
期刊: Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS)
影响因子: 2020_IF = ; 中科大类: 综合性期刊 1区; 中科小类: 综合性期刊 1区; JCR分区: Q1
发文单位: 马里兰州贝塞斯达国家老龄研究所神经遗传学实验室神经肌肉疾病研究室和意大利都灵大学等14家单位。
摘要: 重症肌无力是一种慢性自身免疫性疾病,以自身抗体介导的神经肌肉接头信号传导干扰为特征。作者进行了一项全基因组关联分析(GWAS),涉及1873名被诊断为乙酰胆碱受体抗体阳性的重症肌无力患者和36370名健康人,以确定疾病相关的遗传风险位点。在英国生物银行的一个独立队列中尝试重复发现的基因座。作者还利用骨骼肌、全血和胫神经的表达数据进行了全转录组关联分析(TWAS),以测试疾病相关多态性对基因表达的影响。作者在编码乙酰胆碱受体亚单位的基因中发现了两种信号,乙酰胆碱受体亚单位是自身抗体最常见的抗原靶点:正常骨骼肌中胆碱能受体烟碱α1亚单位( CHRNA1 )基因内的GWAS信号和与胆碱能受体烟碱β1亚单位( CHRNB1 )基因的TWAS关联。在10p14和11q21上发现了另外两个基因座,并确认了先前在 PTPN22 、 HLA-DQA1/HLA-B 和 TNFRSF11A 上的关联信号。亚组分析表明,早发和晚发病例具有不同的遗传风险因素。遗传相关分析证实了重症肌无力与其他自身免疫性疾病之间的遗传联系,如甲状腺功能减退、类风湿关节炎、多发性硬化和1型糖尿病。最后,作者应用优先指数分析来确定潜在的可药物基因/蛋白质和途径。这项研究深入了解了重症肌无力的遗传结构,并证明编码乙酰胆碱受体亚单位的基因座内的遗传因素会导致其发病。
本研究中作者进行了一项全基因组关联研究(GWAS)和一项全转录组关联研究(TWAS),以确定与疾病病因学有关的遗传风险和候选基因(图1)。这项工作将样本量进行扩大,增加了检测与重症肌无力相关的遗传风险因素的能力。然后,作者利用遗传数据来识别与重症肌无力相关的疾病,并对可能成为疾病修饰治疗目标的基因和途径进行优先排序。
图1. 分析流程。流程图概述了本研究中进行的分析。
作者对1873例重症肌无力患者和36370名健康人进行GWAS分析。作者重点关注了乙酰胆碱受体抗体阳性病例,因为这些抗体在~90%的全身性重症肌无力患者中发现。除了先前报道的PTPN22、HLA-DQA1/HLA-B和TNFRSF11A中的信号外,作者还观察到染色体、10p14和11q21上的关联信号(图2A)。由于已知重症肌无力存在年龄依赖性遗传异质性,作者分别对早发病例和晚发病例进行GWAS分析。和之前对重症肌无力进行的GWAS研究一样,作者发现这些人群的遗传结构存在明显差异(图2 B和C)。
图2. 重症肌无力的GWAS。顶部(A)、中部(B)和底部(C)面板分别显示了整个队列(n=1873例重症肌无力病例和36370名健康个体)、早发病例队列(n=595例病例和2718名对照者)和晚发病例队列(n=1278例病例和33652名对照者)的GWAS结果。
接着作者对重症肌无力进行TWAS分析以确定与疾病发病机制相关的其他基因。这种分析方法将基因型和表达量与表型性状相关联,以确定与该性状相关的基因表达的顺式遗传成分。该方法确定了六个基因,它们的差异表达与组织间重症肌无力风险显著相关(图3)。
图3. 重症肌无力的TWAS。
最后作者使用优先级指数方法进行了靶点优先级分析,以深入了解重症肌无力的相关途径,并确定潜在的药物靶点。该分析将来自GWAS的遗传信息与功能基因组数据和免疫相关注释数据相结合,以指定最相关的基因(图4A)。对优先级指数得分最高的前1%基因的富集分析确定了一组与适应性免疫反应、免疫系统中的细胞因子信号和受体酪氨酸激酶信号有关的富集途径(图4B)。
图4. 基于优先级指数和药物可用量的重症肌无力免疫靶点的优先级。(A)基于使用优先指数生成的基因预测矩阵的常染色体基因的评分。(B)富集分析显示了免疫和信号转导模块中的优先目标路径。
总之该研究涉及1873名患者和36370名健康个体,是一项广泛的重症肌无力全基因组关联研究。通过GWAS和TWAS确定了编码乙酰胆碱受体亚单位的两个信号,即 CHRNA1 和 CHRNB1 ,识别这些基因证实了利用遗传学来识别作为自身抗体抗原靶标的蛋白质的潜在效用。该研究为重症肌无力病理生理学的遗传结构提供了更广泛的见解。
文中所有图片均来自 Identification of genetic risk loci and prioritization of genes and pathways for myasthenia gravis: a genome-wide association study
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文章链接地址:
参考文献:
Chia R, Saez-Atienzar S, Murphy N, et al. Identification of genetic risk loci and prioritization of genes and pathways for myasthenia gravis: a genome-wide association study[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2022, 119(5).
深夜地黄昏
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首先是饮食禁忌:
既然类风湿关节炎是一个炎症反应, 避免或少食具备诱发炎症反应的食物,如:肥肉、高动物脂肪、高胆固醇食物、甜食、巧克力、干酪、奶糖、酒、黑咖啡、浓茶等, 因其易刺激相关炎性介质或通路,引起关节疼痛、肿胀。
2017年发表在风湿病权威期刊《Arthritis Care & Research》上的一篇文章指出 甜点和含糖苏打水与类风湿症状加重相关 [3]。另外,来自美国的研究小组称, 过高的盐摄入量可能是引发自体免疫疾病的一个风险因素 [4], 这个提示我们要做到清淡饮食,跟重口味say goodbye。 其次,鉴于该病是一个慢性疾病,长期服药是一个必然手段,病人脾胃常常会受到损害,这时坚硬、生冷、滋腻、辛辣的食物我们就要慎重了, 养病先养胃(记得黄闰月教授科普的乾隆八珍糕吗?稍微调整下就是健脾补肾祛湿的最佳食疗品) 。
饮食适宜篇:
总体原则是辨证施膳,饮食定时、适量。不能饥饱失常、暴饮暴食,选择高蛋白、高维生素和易消化的食物,保证营养全面、合理 [5]。个体化膳食亦即中医讲的辨证施膳,根据患者证型来指导日常膳食,类风湿性关节炎简单可分为[6]:寒湿痹阻证,湿热痹阻证,肝肾阴虚证,气血亏虚证。
寒湿痹阻证 ,表现为肢体关节冷痛、肿胀或重着,局部皮色不红,触之不热,晨僵,关节屈伸不利,遇寒痛剧,得热痛减,局部畏寒怕风;或口淡不渴,恶风寒,阴雨天加重,肢体沉重,肌肤麻木不仁;舌质淡或淡红,苔薄白或白腻,脉弦紧或沉紧或浮缓。 此型患者可食用较温热性的食物,如鸡、猪、牛、羊、葱、姜、桂皮、药酒及西红柿、橘柑、黄瓜、木耳、干果(记得黄闰月教授科普的仙灵脾酒吗?)。
湿热痹阻证 ,四肢关节或肌肉局部红肿,重着,疼痛如燎,局部肤温升高,下肢关节尤甚,晨僵,活动受限,或关节积液,屈伸不利,或伴发热,口苦口黏,口渴不欲饮;或恶风发热,有汗不解,心烦口渴,便干溲黄,舌红,苔黄腻或燥,脉滑数或弦滑。 此型患者饮食以清热疏利食品为主,如苦瓜、丝瓜、冬瓜、苋菜、米仁粥、薏苡仁、绿豆、萝卜、芹菜、生梨、豆卷等。
肝肾阴虚证, 病久关节肿胀疼痛或酸痛,局部关节灼热疼痛,屈伸不利,形瘦骨立,腰膝酸软,头晕耳鸣,盗汗,失眠,舌红少苔,脉细数。 此型患者宜多食补益的食材,如:甲鱼肉、鸡肉、鹅肉、猪肉、牛肉、羊骨髓、胡桃、淡水鱼、芝麻等(瞧!虽然鹅肉是老百姓俗称的“发物”,但不是所有类风湿病友都不能吃哦:-)肝肾阴虚型患者就可以啊)。
气虚亏虚证 ,表现为关节疼痛,肿胀僵硬,麻木不仁,行动不利,面色淡白,心悸,自汗,神疲乏力,舌淡苔薄白,脉细弱。此型患者补益气血时应注意不应过于滋腻,影响脾胃功能。如: 各种动物肉、肝脏,桂圆、当归、熟地黄、红枣、枸杞。
类风湿性关节炎患者体内免疫处于紊乱状态,往往对有些药物或食物比正常人反应更为敏感,故有些病人甚至能清楚地说出吃哪些食物后关节疼痛会明显加重。这样的食物应该"忌口"。 所以我们在日常的调养方面显得尤为主要,在坚持药物治疗的同时,根据自身及季节特点,调节饮食习惯,也是辅助治疗的好方法。
精准医疗+个体化膳食指导,树立战胜疾病的信心,提高生活质量。
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参考文献:
[3]Tedeschi SK et al. Diet and Rheumatoid Arthritis Symptoms: Survey Results From a Rheumatoid Arthritis Registry. Arthritis Care Res (Hoboken). 2017 Feb 19.
[4]刘石磊. 高盐饮食或引发自体免疫疾病[J]. 发明与创新(综合 科技 ),2013,(04):50.
[5]徐志锐,林昌松. 饮食起居话类风湿性关节炎[J]. 中国民间疗法,2009,(05):64.
[6]王少萍,郭学兰,康卫红. 类风湿性关节炎辨证施护[J]. 四川中医,2010,(11):115-116.
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