1、首先，我们先来看看参考文献为什么会出现对不齐的情况。一般情况下，在编排参考文献的时候，我们都会采用Word的自动编号功能。2、但是，直接用自动编号添加的序号，后面默认会有一个间隔。而很多时候，这个间隔是不需要的。所以，我们要在调整列表缩进里面把间隔去除，这里选择不特别标注即可。3、虽然间隔是消除了，但是就会出现参考文献上下对不齐的情况。这时候，前面的空白部分是无法通过删除键去除的。下面我们就来看看怎么解决这一问题。
设置中括号和序号对齐，按住“alt键”，把个位数字的序号和中括号都选中，右键单击，选择“字体”。在字体选项框中，点击“字符间距”标签，把间距设置为“加宽”，值是可以调的，调到中括号和序号都对齐就行。然后，按住“alt键”，全选参考文献内容，右键单击调出字体选项框，把字符间距统一调整为“标准”即可。 参考文献标准格式是指为了撰写论文而引用已经发表的文献的格式，根据参考资料类型可分为专著[M]，会议论文集[C]，报纸文章[N]，期刊文章[J]，学位论文[D]，报告[R]，标准[S]，专利[P]，论文集中的析出文献[A]，杂志[G]。
在英文较多的段落里，当设置了两端对齐或分散对齐时，当遇到较长的单词不能放到上一行时（距离：比如一行可以放48个字母，而在输入40个字母和空格后，后面跟着了一个10个字母的单词，那么这个单词就无法放在这一行，单词又不可以拆分到两行中<通过设置可以拆分，但不符合书写习惯>，就只能移动到下一行去，那么本行就只有40个字母），上一行就会自动将单词间距拉大，所以你的问题不是格式的问题，是因为你的单词“conformationally”太长了。
选中你要对齐的文献，按快捷键Ctrl+H,在“查找内容”中，敲一下空格，在“替换为”中什么也不做，“搜索选项”选择“向下”，点击“全部替换”；如果弹出一个格子问“是否搜索其余部分”，选“否”
如果是手动设置的参考文献，可以设置[10]以后参考文献的悬挂缩进，设置为2.3字符或2.5字符即可
参考文献自动编号，与后面文字之间默认有个制表符。1-9条时，默认制表位能够容纳序号，所以后面没有多少空白，而到第十条时两位数字比一位数字多占地，默认的制表位不足以容纳序号，则自动按下一默认制表位对齐，这样就造成之间的空白过大。选中所有文献，在标尺上自己设置一个制表位，略比序号10稍稍靠后，能容纳双位数字序号即可，则前面九条空白加大，后面10以上空白减小，就能对齐了。
论文中参考文献引用的是国家颁布的文件或纲领政策，要用N字母表示。
根据GB3469- 83《文献类型与文献载体代码》规定，以单字母标识：
M一专 著(含古籍中的史、志论著)。
C一论文集。
N-报纸文章。
J一期刊文章。
D一学位论文。
R-研究报告。
S-标准。
P-专利。
A-专著、 论文集中的析出文献。
Z一其他未说明的文献类型。
电子文献类型以双字母作为标识：
DB一数据库。
CP一计算机程序。
EB- 电子公告。
非纸张型载体电子文献，在参考文献标识中同时标明其载体类型：
DB/OL一联机网上的数据库。
DB/MT一磁带数据库。
M/CD-光 盘图书。
CP/DK一磁 盘软件。
J/OL-网上期刊。
EB/OL一网上电子公告。
顺序编码制的具体编排方式
参考文献按照其在正文中出现的先后以阿拉伯数字连续编码，序号置于方括号内。一种文献被反复引用者，在正文中用同一序号标示。一般来说，引用一次的文献的页码（或页码范围）在文后参考文献中列出。
格式为著作的“出版年”或期刊的“年，卷（期）”等+“：页码（或页码范围）”。多次引用的文献，每处的页码或页码范围（有的刊物也将能指示引用文献位置的信息视为页码）分别列于每处参考文献的序号标注处，置于方括号后（仅列数字，不加“p”或“页”等前后文字、字符；页码范围中间的连线为半字线）并作上标。
作为正文出现的参考文献序号后需加页码或页码范围的，该页码或页码范围也要作上标。作者和编辑需要仔细核对顺序编码制下的参考文献序号，做到序号与其所指示的文献同文后参考文献列表一致。另外，参考文献页码或页码范围也要准确无误。
以上内容参考：百度百科-参考文献
参考文献格式设置。
电脑：win10
系统：64位系统
软件：WPS Office 2016
1、打开需要添加文献格式的Word，将鼠标光标移到文献前。
2、点击上方编号图标选项，点击定义新编号格式选项。
3、选择1，2，3的编号样式，在编号格式下方方框中输入【1】选项。
4、对齐方式根据自己的实际需要设置，点击确定选项即可设置成功。
很简单的事，这个对不齐是制表符字节不一致，因为前面默认两位，到100就成3位了。
调整步骤如下：
第一步：用鼠标全选中要进行编号的参考文献，然后右击鼠标右键。
第二步：在出现的下拉菜单中找到“编号”选项，点击进入。
第三步：在“编号”选项中，找到论文对应的编号格式，并选中编号库中相应格式。
第四步：点击参考文献的编号形式[1]这种，就会自动编号如下，但是会出现如下的空格。
第五步：在选中参考文献的状态下，点击鼠标右键，弹出下列的快捷选项。
第六步：点击“调整列表缩进”，在弹出的选项卡中将“制表符”转为“空格”。
第七步：点击“确定”后，之前的空格就会消失了！
让参考文献前边的中括号序号对齐的方法如下：
准备材料：WPS文字/word
1、首先将参考文献排好顺序，这里不需要输入编号。
2、选中参考文献。
3、在菜单栏选择开始——编号，由于WPS没有方括号的编号，所以这里需要自定义。选择编号右侧的倒三角。
4、点击自定义编号，选择自定义列表，按下图选择，点击自定义。
5、需要修改两个地方，编号格式与编号样式。如下图修改格式。点击确定后段落就被编号了。下面就是设置首行缩进。
6、右击设置段落——特殊格式——首行缩进，2字符。
7、完成。
1、首先使用WPS软件打开毕业论文文档，进入到编辑区域。
2、然后在页尾另起一行，输入“参考文献”后回车，使光标在第二行，输入参考文献名称。
3、接着点击鼠标右键，找到“项目符号和编号”，单击进入。
4、在弹出的“项目符号和编号”弹出框中，选择一个喜欢的编号。
5、选择好编号后，最后点击确定即可。
设置中括号和序号对齐，按住“alt键”，把个位数字的序号和中括号都选中，右键单击，选择“字体”。在字体选项框中，点击“字符间距”标签，把间距设置为“加宽”，值是可以调的，调到中括号和序号都对齐就行。然后，按住“alt键”，全选参考文献内容，右键单击调出字体选项框，把字符间距统一调整为“标准”即可。 参考文献标准格式是指为了撰写论文而引用已经发表的文献的格式，根据参考资料类型可分为专著[M]，会议论文集[C]，报纸文章[N]，期刊文章[J]，学位论文[D]，报告[R]，标准[S]，专利[P]，论文集中的析出文献[A]，杂志[G]。