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南京医科大学学报(社会科学版)已收入《高等学校文科学报文摘》和中国学术期刊(光盘版)全文检索系统。
南京医科大学学报(自然科学版)是中国综合医药卫生类核心期刊,2001年进入国家期刊方阵,为国家科技部确定的中国科技论文统计源期刊,是经国家药监局批准的可发布综合
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中国医学类:北京中医药大学学报、辽宁中医杂志、南京中医药大学学报(自然科学版)、时珍国医国药、新中医、针刺研究、中草药、中成药、中国实验方剂学杂志、中国天然药物
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