前几期小编给大家介绍了几篇利用GEO数据库、TCGA数据库发表的SCI论文:如:1:AnintegratedlncRNA,microRNAandmRNAsignaturetoimproveprognosispredictionofcolorectalcancer,该文采用TCGA数据库中结直肠癌及癌旁组织的mRNA,lncRNA,miRNA进行差异表达,获得显著变化的分子,用于构建生存分析模型,获得疾病风险...
咱们从一篇已经发表的SCI论文来开始实用GEO数据库挖掘。文章之前介绍过,传送门如下这一系列的内容只有一个目的:帮助知友从零开始,学会使用GEO数据库的SCI写作。文章methods中GEO的描述Microarraydatasets
GEO数据库全称GENEEXPRESSIONOMNIBUS,是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。它创建于2000年,收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据,也就是说只要是目前已经发表的论文,论…
什么,你感兴趣的GEO数据集没有关联到原始文献出处.一般来说,想挖掘GEO数据库的公共数据集,最后发表时候都要引用该数据集的原始文献。.一个GSE数据集会关联到一个原始文献,比如:.可以看到其关联的文章是:SimultaneousmiRNAandmRNAtranscriptomeprofilingof...
GEO比较大的缺点就是没有什么临床数据,限制了数据挖掘的高度。.下面,我们就看看一篇GEO数据挖掘的文章做了什么内容:.1、差异分析.2、GO富集分析.3、KEGG分析.4、蛋白互作网络分析.一篇文章只需要这么多东西,非常简单,这样的文章也能发表两点几分的...
后者GEO数据库全称是GeneExpressionOmnibusdatabase,是由美国NCBI创建并维护的基因表达数据库。它创建于2000年,论文中涉及到的基因表达检测的数据几乎都提交到了这个数据库。GEO除了二代测序数据,还包含芯片测序、单细胞测序数据,样本数据
纯生信SCI论文写上这几句话可以减少很多麻烦.基本90%以上纯生信数据挖掘类文章都离不开这两个数据库,第一个就是GEO数据库,第二个就是TCGA数据库,这两个都是免费的公共数据库,用户可以免费进行下载数据分析整理并且发表相关文章。.我们下载相关数据...
不同的GSE数据集有不同的临床信息,不同的分组技巧.最近,我发现学徒在学习GEO数据挖掘的过程中,遇到了第一个也是至关重要的一个难题就是对下载后的数据集进行合适的分组,因为只有对样本进行合适的分组,才有可能得到我们想要的信息。.但是不同的GSE...
原标题:一文解决GEO芯片数据分析80%的工作!.建议收藏!.大家好,我是阿琛。.今天来给大家介绍一个新的专题内容---GEO数据库的使用方法。.烹饪需要食材,分析需要数据。.数据出发,整个研究的第一步就是数据的下载。.对于大部分的研究者而言,拿公开...
GEO数据库论文2型糖尿病论文肥胖癌症基因差异表达论文单核苷酸多态性论文版权申明:目录由用户sean6**提供,51papers仅收录目录,作者需要删除这篇论文目录请点击这里。
1、首先GEO数据库是个什么鬼呢?GEO数据库全称GENEEXPRESSIONOMNIBUS,是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。它创建于2000年,收录了世界各国研究机构提交的...
后者GEO数据库全称GeneExpressionOmnibusdatabase,是由美国NCBI创建并维护的基因表达数据库。它创建于2000年,论文中涉及到的基因表达检测的数据几乎都提交到...
什么是GEO数据库?如果你想申请基金或发表科研论文但苦于没有经费做测序或者没有条件做实验的话那么GEO数据库一定是您的首选GEO数据库能用来干啥?通过挖掘GEO数据库可...
咱们从一篇已经发表的SCI论文来开始实用GEO数据库挖掘。文章之前介绍过,传送门如下不做实验纯生信三分SCI文章详解(1)8赞同·1评论文章这一系列的内容只有一个目的:帮助...
第一步:利用公共数据进行筛选biomarker(Discoveryphase)首先,作者利用GEO数据库当中关于CRC的4个miRNA表达芯片数据,寻找患病样品和正常样品中差异表达的miRNA,通过取交集初步筛选...
什么是GEO数据库?如果你想申请基金或发表科研论文但苦于没有经费做测序或者没有条件做实验的话那么GEO数据库一定是您的首选GEO数据库能用来干啥?通过挖掘GEO数据库可以找到所...
INFORMATIONTECHNOLOGY信息化建设基于GeoEast的解释项目数据库研究与设计摘要:论文从解释项目库的定义说起,阐述了解释项目库分类的技术路线,针对实现解释...
GEO数据库全称GENEEXPRESSIONOMNIBUS,是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。它创建于2000年,收录了世界各国研究机构提交的高通量基因...
前几期小编给大家介绍了几篇利用GEO数据库、TCGA数据库发表的SCI论文:如:1:AnintegratedlncRNA,microRNAandmRNAsignaturetoimproveprognosispredict...
山西医科大学硕士学位论文基于GEO数据库的差异表达基因分析系统的构建中文摘要人类基因组计划的完成以及生物信息学等学科的快速发展,使得基因组学逐渐从基因测序揭示生...