论文通讯作者杨庆勇介绍,该研究通过整合4个已发表的方法,开发出高性能的大片段InDel鉴定工具IndelEnsembler,并将其应用于由1047个拟南芥品系构成的自然群体中,通过全基因组关联分析(GWAS)鉴定到与重要性状相关的、新的大片段InDel。
3)Indel在编码区间比碱基置换对基因功能的影响大得多,从而更易被自然选择所淘汰,使保守区间的突变率降低。换句话说,自然选择很大程度上是通过对Indel的选择而实现的,自发突变率的高低很大程度上是自然选择的结果。
在此基础上,鉴定了245个水稻品种124个InDel标记的基因型遗传多样性并进行了聚类分析,结果表明,水稻材料间存在明显的群体结构,基本反映了不同品种间的亲缘关系。.水稻功能性InDel标记的筛选与应用,不仅为品种纯度和真实性鉴定、遗传多样性分析提供了新方法...
论文查重开题分析单篇购买文献互助用户中心基于甘蓝型油菜基因组重测序开发InDel标记来自知网喜欢0阅读量:191作者:岳晓鹏展开摘要:近年来,随着高通量测序技术的发展,分子标记开发技术也得到了迅猛地发展.利用高通量技术...
NGS中IndelRealignment模块性能优化方法的设计与实现.张雷.【摘要】:高通量测序技术的发展推动了人类基因信息的相关研究,其中插入/缺失(Indel)的分析和检测是该研究的一项重要组成部分。.由于以Indel检测为基础的宏基因组学、全基因组关联分析及遗传疾病...
论文查重优惠论文查重开题分析单篇购买文献互助用户中心花生种质资源基于InDel标记的遗传多样性...3.24对InDel引物在54份资源品种间的PIC的变幅为0.0364(InDel-028)~0.9030(InDel-001),Shannon's(Ⅰ)变幅为0.0922(InDel-028)~2.447(InDel-001),其中...
ThevalidatedINDELmarkerswerealsotestedin12othersoybeancultivars.Thenumberofpolymorphismsinthepairwisecomparisonsof14soybeancultivarsvariedfrom27to165.TotesttheutilityoftheseINDELmarkers,theywereusedtoperformgeneticmappingofacrinklyleafmutant,andtheCRINKLYLEAFlocuswassuccessfullymappedtoa360kbregiononchromosome7.
该Indel-35中45bp片段编码的15个氨基酸残基含有一个丝裂原活化蛋白激酶(MPK)保守的磷酸化基序。研究发现,ZmMPK8作为低温的负调控因子与ZmRR1HapB互作并且磷酸化位于Indel-35中的Ser15,促进其通过26S蛋白酶体途径降解。...
image.png.通常利用二代测序数据检测单核苷酸多态性(SNP)和插入缺失(InDels)变异的基本流程是.1测序数据与参考基因组比对获得sam、bam格式数据.2samtools、GATK、freebayes等软件利用bam格式文件获得vcf格式文件.3snpeff对vcf格式文件进行注释.4vcf格式文件转换成...
使用INDEL和ORFS分别发现TFL1和FRIGIDA和拟南芥的抽薹时间显著关联(Songet.al.,2018,PlosGenetics,Figure3)该研究首次系统的报道了使用indel和基因功能进行GWAS分析的技术路线。宋宝兴认为这一技术在农作物的GWAS分析中将具有
InDel是指在近缘种或同一物种不同个体之间基因组同一位点的序列发生不同大小核苷酸片段的插入或缺失(insertion-deletion),是同源序列比对产生空位(gap)的现象.In...
法医DNA分型经历了三代遗传标记的研究,短串联重复序列(shorttandemrepeat,STR)作为比较成熟的工具已被广泛运用于法医生物学鉴定中.进一步对人类基因组的探索,...
学位论文>基础科学人类基因组indel与结构变异的检测和分析方法的研究姜玥高通量测序技术的不断发展促进了人类基因组的研究,其中indel与结构变异的检测与分析是一项重要的内...
【摘要】:本研究以4对极端高低乳蛋白率和乳脂率育种值的中国荷斯坦公牛为研究对象,利用Illumina重测序技术鉴定奶牛全基因组indel位点并获得乳成分高低组间差异indels;通过整...
InDel用于中国人群个体识别的法医学研究论文目录中文摘要第1-9页英文摘要第9-11页前言第11-13页第一部分InDel基因座的筛选第13-18页1材料第13页·DNA样本第1...
师大云端图书馆有关'InDel'的文章
84科学中国人2009年第5期——记南京大学生命科学学院田大成教授理论的提f}j科学开靖就是假设——具格尔语2008年9月4日出版的《自然》杂志上刊登了由我国科学家...
【摘要】:目的:利用插入-缺失多态性(Insertion-DeletionPolymorphism,InDel)遗传标记,建立一套适用于中国人群个体识别鉴定的复合扩增体系,并对插入—缺失多态性遗传标记应用于法医DNA常见现场检...
2005年起,他们用生物信息技术对人、黑猩猩、恒河猴、小鼠、果蝇、水稻和酿酒酵母等不同类别生物的基因组序列进行了比对分析。研究后发现,DNA的插入/缺失(Indel)... .new-pmd.c-abstractbr{display:none;}更多关于indel论文的问题>>
论文查重开题分析单篇购买文献互助用户中心InDel分子标记及其在水稻研究中的应用来自知网喜欢0阅读量:105作者:刘丹,孙玉友,魏才强,解忠,李...