本文首发于“解螺旋”微信公众号转载请注明:解螺旋·临床医生科研成长平台今天教大家用蛋白质组学文章,从技术上轻松灌水博士毕业神刊oncotarget(发文章除了自身水平外,也看很多其他的的方面,懂的都懂)。在正…
在此希望能够更多地分享一些自己的经验,为各位老师的蛋白质组学研究之路提供有益的帮助。今天就与大家来聊一聊关于蛋白质组后续验证的常规套路。通常在实际情况中碰到最多的问题是:如果蛋白质组数据,没有进行验证,到底影响不影响发文章?
一文带你了解蛋白质组学机制研究的思路.之前本号汇总了LncRNA研究的一些基本方法和套路。.其实,LncRNA的研究是可以举一反三,融会贯通在其他的组学研究中,比如:蛋白质组学的研究,也可以通过测序检测等技术,寻找差异表达显著的蛋白,然后进行机制...
蛋白质组学课程论文.doc,蛋白质组学关键技术研究进展摘要:蛋白质组学是对蛋白质特别是其结构和功能的大规模研究,是在90年代初期,由MarcWikins和学者们首先提出的新名词。蛋白质组的研究不仅能为生命活动规律提供物质基础,也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。
前言之前本来打算根据自己对蛋白质组学数据分析的经验和理解写一系列相关教程出来供复习参考,没想到在网上查到别人已经做过了,而且笔记相当全面,从样本处理到质谱仪原理再到数据分析等等都有提及,虽然是2016-2017年的课程,但内容并未过时,对我自己也大有益处。
真正意义上的蛋白质组学论文出现在CNS主刊主要是近几年的CPTAC(ClinicalProteomicTumorAnalysisConsortium,临床蛋白质组分析协作组)的一系列关于结直肠癌、乳腺癌和卵巢癌的蛋白基因组学研究论文【1,2,3】。
抛开一些大牛实验室的高精尖蛋白组学研究,一般影响因子3-5分的蛋白质组学文章的套路还是挺简单的。.常见分组包括:突变组VS野生组、健康组VS患病组、不同发育时期或不同疾病发展阶段或不同用药组的组别比较。.将选取的样品用iTRAQ等方法进行蛋白定性与...
继续一篇关于蛋白质组学的论文.从下面6点进行论述:1.表达蛋白质组学——双向电泳2.比较蛋白质组学——材料间的比较3.差异蛋白质的鉴定——质谱分析4.差异蛋白质的基因鉴定——信息学分析5.差异蛋白质的定位——亚细...从下面6点进行论述:.1.表达蛋白质...
原名:AGoldenAgeforWorkingwithPublicProteomicsData.译名:蛋白质组学数据共享和再分析的黄金时间.期刊:TrendsinBiochemicalSciences.IF:16.630.发表时间:2017年.通信作者:LennartMartens.通信作者单位:MedicalBiotechnologyCenter,VIB,Ghent,Belgium.
周新文高级工程师:长期从事生物质谱相关的蛋白质组学应用研究,复旦大学生物医学研究院质谱技术平台副主任,作为主要参与人连续获得上海市公共研发平台“上海市重大疾病蛋白质组学专业技术平台能力提升项目”,发表SCI论文20余篇。
实验设计:为揭示高分级浆液性癌(HGSC)和子宫内膜样癌(EC)两种最常见的组织类型之间的差异,研究者采用新鲜冷冻的组织(HGSC,n=10;EC,n=10)进行了labelfree定...
今天,我们一起来看看蛋白质组学机制研究的套路。1.蛋白质常用定量检测方法首先,介绍一下蛋白质检测的常用方法,有小伙伴可能会说不就是WesternBlot、ELISA等实验吗?的确,说到蛋...
这种模式是以常见的临床样本如血液、尿液、脑脊液等为研究对象,首先通过TMT、Labelfree等定量蛋白质组学技术对这些样本中全蛋白组或修饰蛋白组进行鉴定和定量,...
译文:样本+iTRAQ+WB。这是最简单粗暴但有效的蛋白质组学研究套路,在临床样本中用iTRAQ找到差异蛋白,经过最基本的数据分析后,进行WB或IHC的验证,发在诸如:Proteomics、ProteomeSci、...
新一代、革命性的蛋白质组技术DIA,相比传统的蛋白质组技术(shotgun,Labelfree、iTRAQ或TMT等)以及4D蛋白质组学,具有覆盖度高、重现性高、定量准确性高(可以达到与MRM/PRM相近的水...
上一次说了蛋白质组学top-down的技术路线(从蛋白质层面进行分离),点击这里查看。今天盛师傅继续带来top-down的两篇文章,均选自各所在领域的顶级期刊。看一下顶级期刊的蛋白质组学文...
近些年来,蛋白质组学领域研究接连取得重大突破,研究成果屡次发表于CNS、Nature、Blood等顶级期刊。“临床大样本”接连落地,“大数据分析”的进步也推动着蛋白质组学的蓬勃发展。诸...
要研究蛋白之间的相互作用,我们要怎么找到目的蛋白呢,需要解决什么问题呢?如何来开展实验呢?面对这一连串的发问,千万不要惊慌,恰巧今天这里就有一篇套路文章,我们来一起看看这蛋白间...
近两年国内外多个大牛课题采用蛋白质组+磷酸化蛋白质组联合分析策略在高水平杂志上发表了相关研究论文,为我们进行系统生物学研究提供了很好的思路。蛋白质磷酸化修饰是指在磷酸化激...
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