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而通过对SNP的检测，则分别检测到53260和56117个SNP位点。总之，文中描述的这套分析研究转录组的方法，将有助于新基因的发现，并得到不同样品间差异表达的基因，从而研究疾病与相关差硕士学位论文摘要异表达基因之间的联系。
转录组数据的共表达分析和扩展应用.陈鑫.【摘要】：基因组学和转录组学技术的快速发展,使生物信息学的研究进入了大数据时代。.这些组学数据的大量产生,在帮助我们解决生物学问题的同时,也产生了许多需要解决的问题。.其中一项最主要的问题是:如何...
1.常用的基因表达的标准化方法.•现在常用的基因定量方法包括：RPM,RPKM,FPKM,TPM。.•这些表达量的主要区别是：通过不同的标准化方法为转录本丰度提供一个.数值表示，以便于后续差异分析。.•标准化的主要目的是去除测序数据的技术偏差：测序深度和...
2.转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读3.转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，提升你的文章档次，学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析4.转录组数据
[10]棉花PTS2受体基因（GhPex7）的克隆及表达分析[J].李德谋,肖月华,罗明,侯磊,罗小英,罗克明,裴炎.遗传学报.2003(09)博士论文[1]基于转录组和miRNA测序的细叶百合鳞茎休眠解除的分子机理[D].苏小霞.东北林业大学2018硕士论文
癌症基因组和转录组测序数据分析方.椰枣果实发育及两种水生生物的转录.外显子捕获测序在家族高胆固醇血症.基于新一代测序技术的三种髓系血液.应用第二代高通量测序技术研究哺乳.利用SOLiD测序技术鉴定和分析家蚕的.应用全基因组关联分析定位高度...
通过fpkm值分析unigene表达量,发现大多数基因fpkm值在0.1-100之间,且三个样本间重复性较好。同样将这三个样本的转录组数据提交到ncbisra数据库中,获得了相应的登录号:k1(srr3183379)…
杨树干旱响应转录组测序分析.【摘要】：干旱是限制杨树生长及产量增长的重要因素,大多数杨树抗旱能力较弱。.小叶杨(P.simonii)在我国分布广并具有耐低温、耐干旱等特点,是进行抗旱机制研究较为理想的材料,美洲黑杨‘I-69’杨(P.deltoides)也是我国较为重要...
”论文共同通讯作者李兴旺说，因此，一个整合了水稻多元表观基因组数据的数据库，将极大地方便研究人员查询和分析水稻的表观遗传信息，促进...
硕士博士毕业论文—Myostatin基因编辑牛肌肉转录组学分析及相关circRNA对牛成肌细胞作用机制研究摘要第1-15页Abstract第15-19页第一章引言第19-33页1.1骨骼肌生长发育第19页
总之,文中描述的这套分析研究转录组的方法,将有助于新基因的发现,并得到不同样品间差异表达的基因,从而研究疾病与相关差硕士学位论文摘要异表达基因之间的...
1转录组2高通量测序3转录组数据分析4差异表达基因分析5.ppt,超几何分布:Fisher精确检验:Pathway分析对实验结果有提示的作用,通过差异基因的Pathway分析,可以...
基于转录组测序数据的基因共表达网络研究洪胜君【摘要】:研究基因表达的变化是揭示疾病发生发展机制的一个重要手段。近年来,转录组测序(RNA-seq)作为测定全转录组表达水平...
通过有效地转录组数据分析,让研究人员可以对基因的功能和生物通路的组成有更进一步的了解。作者基于以上的问题,在博士期间以转录组数据为主要研究方向,在生物信息领域进行了...
内容提示:後旦大学博士学位论文学校代码:10246学号:09110700087基于转录组测序数据的基因共表达网络研究院系:生命科学学院专业:生物信息学姓名:洪胜君...
现在做转录组测序,看看差异基因,做做富集分析,再讨论下差异基因功能与自己研究性状或处理之间的关系,最后加简单的qPCR验证,这样的数据发SCI影响因子越来越低了。必须增加新的分析内容...
手头上有转录组的数据，想通过这个数据查找某个基因的RPKM值，由这个值来大概的推断基因的表达量，求...
2、2转录组数据质控分析通过Illumina平台对‘京欣3号西瓜、‘甜王西瓜果肉样本测序(表1),使用SeqPrep和Sickle软件对原始测序数据进行质控,使用TopHat2和HISA...
【摘要】:本研究对前期获得的家蚕中肠组织转录组数据进行进一步生物信息学分析,利用Cufflinks软件对MappedReads进行组装,并与参考基因组注释信息进行比对,共发掘新基因788个...