要挖掘TCGA数据库来发SCI文章的,先推荐5篇TCGA方面的参考文献给你.2020-01-0212:13.来源:中国医学博士联络站.原标题:要挖掘TCGA数据库来发SCI文章的,先推荐5篇TCGA方面的参考文献给你.医药加金牌讲师宋博士:推荐5篇TCGA方面的参考文献!.用于您参考目前3-5分...
前几期小编给大家介绍了几篇利用GEO数据库、TCGA数据库发表的SCI论文:如:1:AnintegratedlncRNA,microRNAandmRNAsignaturetoimproveprognosispredictionofcolorectalcancer,该文采用TCGA数据库中结直肠癌及癌旁组织的mRNA,lncRNA,miRNA进行差异表达,获得显著变化的分子,用于构建生存分析模型,获得疾病风险...
1,由于时间关系,没有细录,如您对TCGA和SEER数据库如何获取、如何分析及如何写文章感兴趣可参加我们5月16-17日的课程;他将从临床应用视角介绍癌症公共数据库TCGA、SEER的基本情况、数据…
TheCancerImmunomeAtlas:免疫图谱数据库.2019-12-18.2019-12-1823:43:14.阅读9930.免疫疗法在多种恶性的临床治疗上取得了显著效果,然而还是存在大部分对于免疫疗法没有响应的问题。.为了更好的理解和免疫细胞相互作用,科学家对来自TCGA和...
纯生信SCI论文写上这几句话可以减少很多麻烦.基本90%以上纯生信数据挖掘类文章都离不开这两个数据库,第一个就是GEO数据库,第二个就是TCGA数据库,这两个都是免费的公共数据库,用户可以免费进行下载数据分析整理并且发表相关文章。.我们下载相关数据...
给你tcga数据库过万病人的原始测序数据你可以做什么.最近有两年前的学生过来寻求合作,让我想想给我tcga数据库过万病人的原始测序数据,我可以做什么方法学的创新。.我想把这个问题抛给粉丝:.假设给你tcga数据库过万病人的原始测序数据你可以做什么...
最近做了跟TCGA相关的项目,借此机会也认识了zeroing说的作者,参考了他的两篇文章:TCGA数据库的利用(一)——数据下载!TCGA数据库的利用(二)——数据处理!但在实际的操作中,也发现了第二篇文章中的一些小问题,因此将其转载到公众号后稍加改进,但是基因注释这部分中,第…
使用TCGA数据库获取和正常配对组织的基因数据及miRNA数据。得到3个正常样本和304个CESC样本。分别做临床分析、mRNA差异分析、lncRNA差异分析、miRNA差异分析、生存分析、ceRNA调控网络构建。
TCGA数据下载示例1.•在Files界面进行选择,它包括DataCategory,DataType,ExprimentalStrategy,WorkflowType等。.选择如下图:.TCGA数据下载示例2.•Cases和Files都选择好了之后,点击“Manifest”下载相应的.manifest文件.TCGA数据下载示例3.•下载选择这批Cases的clinical信息...
基于TCGA数据库的甲状腺癌相关miRNA和基因表达谱的分析及临床相关性的研究.甲状腺癌在世界范围内是发病率增长最快的恶性。.1973-2002年间,美国甲状腺癌的发病率增长了2.4倍,而且在过去十年内仍在上升[1]。.发病率迅速增长的原因可部分归因于超声...
医药加金牌讲师宋博士:推荐5篇TCGA方面的参考文献!用于您参考目前3-5分左右的利用TCGA数据库发文章的模式。获得上面5篇参考文章的方法:长按二维码,发送:TCGA要点预览全国TCGA,GEO...
下面我们就以肝癌为例,着重介绍TCGA数据库及利用TCGA数据库现有的数据深入挖掘寻找肝癌发生的关键基因。TCGA数据及功能组织处理1.癌症病人自愿捐赠组织及正常组织样本...
TCGA数据库是一个由国家癌症研究所(NationalCancerInstitute)和美国人类基因组研究所(NationalHumanGenomeResearchInstitute)共同监督的一个项目。使用对样本的高通量基因...
公共数据库挖掘呀!众所周知,TCGA和GEO是最著名的两大公共数据库,前者主要存储高通量(二代测序)数据的样本数据,后者GEO数据库全称GeneExpressionOmnibus...
TCGA对于做研究的小伙伴来说,TCGA数据库有大名不可不谓如雷贯耳。其中收录了超过11000位、...
11、通过其他数据集进行验证。作者不仅利用好多套GEO的来验证预后,还结合该课题组之前的lncRNA数据来验证差异表达。这样分析下来,是不是觉得5分也不是很难呢,赶快行动起来吧!许多...
文章里面的TCGA数据使用及下载,cbioportal数据库、KEGG数据库等,以及做差异表达基因分析、差异化分析、基因突变类型/数量/对应样本名称分析、突变热图分析...
如何利用TCGA数据库实现医学数据共享李瑞华1,田国祥2,郭晓娟3,李豹4,?280?中国循证心血管医学杂志2019年3月第11卷第3期ChinJEvidBasedCardiovascMed...
现在做生物信息学分析发SCI文章非常火,我们检索了下这两年5分以上的杂志发表数据挖掘为主的文章已经有不下80篇了,其中Oncotarget占了不少,这些文章主要以GEO和T...
方法从TCGA数据库中下载肝癌组织和正常肝组织的RNASeq数据以及临床数据和预后数据,分析ALAS1mRNA在肝癌组织和正常肝组织中的表达差异以及肝癌中ALAS1...