我要做一些MD计算，用VMD看了分子构型后，想把它存成图片格式传出来。我记得步骤是：在图形界面下，打开File->Render->StartRendering，但之后VMD自动打开了一个文件夹，而文件夹里又什么也没出现，就结束了，不知道是怎么回事，想跟各位...
VMD小白一枚，需要导出pdb文件，然后再导入MS。不得不说，还是习惯MS的界面。发现问题是，所有的原子都没有原子质量。原因在于，VMD导出的pdb格式将Occupancy都设为了0.00（倒数第二列）。不影响导入MS，导入后将所有原子的
[交流]在VMD中如何把分子构型存成图片格式我要做一些MD计算，用VMD看了分子构型后，想把它存成图片格式传出来。我记得步骤是：在图形界面下，打开File->Render->StartRendering，但之后VMD自动打开了一个文件夹，而文件夹里又什么也没出现，就结束了，不知道是怎么回事，想跟各位交流一下，谢谢。
本文仅对变分模态分解（VMD）的原理简单介绍和重点介绍模型的应用。1、VMD原理2、VMD应用实战变分模态分解（VMD）前言一、VMD[^1]是什么？基本概念求解步骤二、python实现引入vmdpy库变分模态分解（VMD）-Python代码三、补充EMD库--pyemdEMD与VMD区别尝试后继续补充前言在信号处理中，变分模态分解是...
我对mol2格式的文件不熟悉，不知道他里面有什么特殊的数据，我仅对你的标题“将pdb文件批量转换为mol2格式文件”，予以回复：楼主稍微学习一下VMD，即可，把你的PDB格式的文件导入到VMD中保存成mol2格式的数据即可：比如我有100个pdb
1、在使用VMD的TOPO工具中，如何将两个XX.pdb分子和起来作为LAMMPS的输入data呢？2、假设存在两个part.pdb文件，我们想将它和起来。step1：TKconsole在VMD的命令窗口TKconsole中输入；
使用VMD渲染高分辨率图片的步骤如下：.VMDMain中选择File----Render,然后选择Tachyon作为渲染器，然后点击StartRendering会在VMD的目录中生成vmdscene.dat文件（里面包含了绘制图像所需要的信息）.Windows下使用xxx.bat文件进行将vmdscene.dat中的数据绘制成图片，bat文件中需要...
论文投稿时，期刊对分辨率都有要求，有时还需要连同(a)(b)(c)等编号的多幅图片一幅图片，并达到分辨率的要求，如300dpi，下面介绍如何使用word和pdf来得到要求的图片。
浅谈VMD(变分模态分解)新的自适应信号处理方法，对非平稳、非线性信号具有良好处理效果。文章说明因为最近论文需要用到VMD，所以看了几篇关于VMD的论文，VMD在2014年提出，所以其论文比较新，而且知网上的论文都是基于VMD的应用，里面的原理都是从VMD原文摘抄，不太好理解，我也看了VMD这篇...
ChemDraw画图，采用什么格式画图比较清晰，输出图片格式呢？本人要在化学进展文，ChemDraw画图不清晰被导师批评，请问采用什么画图模式画出的图比较清晰，输出的格式呢。我输出的是tif格式。IMG_20130506_230648-1.jpg返回小木虫查看更多
"/usr/local/lib/vmd/tachyon_LINUXAMD64"-aasamples24%s-res38401750-formatTARGA-o%s.tga-numthreads6这里你可能要根据需要改一下tachyon_LINUXAMD64的路径。祝大家玩得开心~...
VMD中怎么保存成可视化文件方便下次打开，在原有基础上修改？我在保存时点了savevisualizationstate保...
我要做一些MD计算,用VMD看了分子构型后,想把它存成图片格式传出来。我记得步骤是:在图形界面下,打开File->Render->StartRendering,但之后VMD自动打开了一个文件夹,而文件夹里又什么...
我需要把有很多frame的pdb数据文件保存成多个只有一个frame的pdb文件，即1.pdb,2.pdb,3.pdb,...保...
VMD工作原理步骤步骤VMD是通过迭代搜寻变分模型(具体怎么搜寻,请亲们自己看,我主要讲他的大概)最优解,来确定我们所知的模态uk(t)及其对应的中心频率ωk和带...
安装VideoMach,然后打开选择FileàOpenMediaFiles,导入刚才VMD下存储图像的工作目录中的第一帧,然后会跳出一个选项,问你是不是要打开这一些列的图像,确定就可...
安装VideoMach,然后打开选择FileàOpenMediaFiles,导入刚才VMD下存储图像的工作目录中的第一帧,然后会跳出一个选项,问你是不是要打开这一些列的图像,确定就可...
tachyon_WIN32.exevmdscene.dat-aasamples24-mediumshade-trans_vmd-res1024768-formatBMP-ovmdscene.bmp双击运行此bat文件就重新渲染得到了vmdscene.bmp。Tachyon命令...
-使用VESTA打开cif格式(通常分子会显示到盒子外边,为了清楚显示盒子边界处的情况),如果此时直接保存为xyz文件的话,则显示的所有原子都被记录在xyz文件中,那么...
"C:\SOFT\VMD\tachyon_WIN32.exe"vmdscene.dat-aasamples100-mediumshade-trans_vmd-res1024742-formatBMP-oFigure.bmp"C:\SOFT\VMD\tachyon_WIN32.exe"是我windows系统...