寻找致癌基因:基因表达数据的双聚类.基于基因表达数据寻找致癌基因,尝试癌症的早期诊断和基因治疗是系统生物学领域的一个经典问题.实际上,许多基因仅仅是在某些类型的中异常表达(高表达或者低表达),而在其它类型的疾病中不异常表达,因此...
背景描述.DSML来自论文"DeepSubspaceMutualLearningForCancerSubtypesPrediction"，其采用深度神经网络同时学习单个组学数据和整体多组学数据中的子空间结构，从而通过对多级、单级和部分级组学数据进行聚类来预测癌症亚型。.过去，癌症被认为是单一类型的疾病...
该数据集来自南斯拉夫卢布尔雅那大学医疗中心研究所，由M.Zwitter与M.Soklic二者提供，感谢。该数据集可在UCI数据库中找到。该数据库是加州大学欧文分校提出的用于机器学习的数据库，是一个常用的标准测试数据集。该数据集有2大类，9个属性，共286个实例。
提出了一种基于改进的遗传算法的癌症特征基因选择方法,对基本遗传算法的交叉和变异操作加以改进,利用改进后的遗传算法对基因微阵列数据进行特征选择。使用支持向量机对基因子集进行留一交叉验证。实验结果表明,改进后的遗传算法比基本遗传算法在选择特征基因时具有明显的优势。
数据来源：UCI数据库是加州大学欧文分校(UniversityofCaliforniaIrvine)提出的用于机器学习的数据库，这个数据库目前共有335个数据集，其数目还在不断增加。这里用到的是威斯康星州临床科学中心的关于乳腺癌肿…
基于基因表达数据寻找致癌基因,尝试癌症的早期诊断和基因治疗是系统生物学领域的一个经典问题.实际上,许多基因仅仅是在某些类型的中异常表达(高表达或者低表达),而在其它类型的疾病中不异常表达,因此探测基因-的高度相关结构对于癌症病理学的研究有重要意义.
我们先来介绍一下癌症基因组里的clonal和subclonal的概念。.癌症里的clonal演化概念由Nowell1976年在Science里提出来的（Science.1976Oct1;194(4260):23-8.），他假设人体的某个体细胞发生突变后经历了数个clonal扩增（演化）过程，最终这个含突变的体细胞集群就演化成了...
本篇博客主要是关于用attractorlandscape对疾病分析及其逆向应用——药物研发的一个总结，主要基于5篇论文，3篇KAIST的2015-2017的分析结直肠癌的论文，一篇Regan的应用型论文及一篇有关attractorlandscape用于药物发现的2019年的综述。
博客首页-文章-博客-正文文献解读丨纯生信分析没搞头了？多组学分析告诉你怎么发22分...此外，miR-486-5p和miR-451a在miRNA聚类3中丰富，而cluster-4中miR-142、miR-150、miR-21、miR-29b、miR-146b和miR-155表达较高。而在亚型1中，定位...
这是100篇重要的自然语言处理（NLP）论文的列表，认真研究该领域的学生和研究人员可能应该了解和阅读。此列表由MasatoHagiwara编制。
随着基因芯片技术、高通量测序技术的发展以及癌症基因组谱图计划(TCGA)的完成让我们有了丰富的癌症基因组数据。再构建一个基于基因组数据的癌症亚型发现研究的分析框架(基因组数据...
<前一篇癌症相关论文导读:中草药有效延长癌总生存期:病例系列后一篇>癌症相关文献导读:通过尿液DNA化分析检测宫颈癌新浪BLOG意见反馈留言板电...
癌症是由多种类型的基因组变异导致的疾病,因此,综合多种类型的变异能够更全面地分析变异对癌症免疫的影响。本文利用深度学习建模的方法对两种癌症基因组变异数据进行聚类,并...
欢迎转载,转载请注明:本文出自Bin的专栏blog.csdn.net/xbinworld。这是一个比较新的聚类方法(文章中没看见作者对其取名,在这里我姑且称该方法为localdensityclustering,LDC),在聚...
按:这是刘同庆先生积三十多年对癌症研究探索的宝贵心得和经验而撰写的一篇极为重要的论文。在这篇医学论文中,刘同庆在国际医学界率先提出了“机体缺铜、细胞乏氧...
本文引入基因调控网络分析,将基因调控网络集成到多基因组融合聚类过程中,提出基于miRNA-TF-mRNA基因调控网络加权相似性融合算法,集成基因组表达数据和基因调控网络信息实现对...
该文介绍一种基于概率子空间的集成学习新框架,用于癌症数据分析。论文主要存在以下不足之处:1.科技论文的摘要应采用第三人称,不要使用“本文”等作为摘要陈述...
本文提出了一种基于高斯混合模型的谱聚类算法识别癌症分子亚型,解析癌症的高度异质性,有效地区分具有不同预后效果的多类病患。利用癌症多组学数据作为训练集样本,构建癌症分...
由来自欧洲,亚洲,澳大利亚,北美等多处组成的国际研究组:癌症基因-环境联合研究协会(CollaborativeOncologicalGene-environmentStudy,COGS)公布了关于癌症的重大突破性成果,这些...
面对这种触目惊心的数据,说不担心那是假的,所以昨天我查阅了知网的数十篇论文,终于发现了近年来我国癌症发病的两大趋势,一起分享给大家。一、癌症发病,愈发年轻化据统计,不少癌症...