ChIA-PET数据分析及数据库网站构建.【摘要】：染色质远程交互在转录调控中发挥着重要作用。.2002年起,染色质构象捕获技术(3C)及其衍生方法不断发展,该方法用于揭示DNA与DNA之间的空间位置关系。.基于配对末端标签测序的染色质交互分析技术(ChIA-PET)将3C与ChIP...
ChIAPoP:anewtoolforChIA-PETdataanalysis.ChromatinInteractionAnalysisbyPaired-EndTagSequencing(ChIA-PET)isapopularassaymethodforstudyinggenome-widechromatininteractionsmediatedbyaproteinofinterest.ThemaingoalofChIA-PETdataanalysisistodetectinteractionsbetweenDNAregions.
文中详细说明了如何安装ChIAPETToolV3并用它来分析公共的ChIA-PET数据集。目前,也有很多其他的ChIA-PET数据分析工具,本文在相同的机器环境下用不同的工具去分析处理相同的公共数据集,并将结果做了系统的比较。...
Nowwiththeadvanceofthesequencingtechnology,asinglereadcancoverthewholeDNAfragmentconstructsinChIA-PET,whichisabout78bplong.OnewaytoapplytheChIA-PETTooltothesinglereadsistodividethereadsintopaired-endreadsaftersequencing.Aquestioninthiswayishowtodividethesinglereadsintopaired-endreads.
目录:生物信息|标签:染色质构象捕获,3C,4C,5C,HiC,ChIA-PET,ChIP-loop|发表时间:Apr15,2016整理一下这几种技术的原理和数据分析流程。3C染色质构象捕获（3C）技术是用福尔马林瞬时固定细胞核染色质，用过量的限制性内切酶酶切消化染色质-蛋白质交联物，在DNA浓度极低而连接酶浓度极高的...
推荐几个出论文的好方向！！202110月1篇09月1篇08月2篇07月5篇06月5篇05月9篇04月9篇03月12篇02月6篇01月13篇2020年182篇2019年348篇2018年311篇目录目录分类专栏…
图4.增强子-启动子相互作用在特定组织三维基因组学能在全基因组范围内揭示某一基因转录调控的一般规律，在此基础上进一步明确特定基因转录过程中所需的调控元件，以及同其它不同基因间的相互协作关系，这为单一基因功能和分子作用机制的研究提供了崭新的途径(Fig．
JADESIGNBuildingBetterAppsandApplets.PeterCoadObjectInternational,Inc.oipc@oi1-919-772-9350fax-9389directline-7734directfax-8916JADESIGNBuildingBetterAppsAppletsVersionDate:Jan.AgendaPurposegaininsightsbetterdesignAgendaComposition,RatherthanInheritance.
10-19JHepatol（IF=25）|重大进展！兰州大学祁小龙团队使用硬度和血小板计数进行失代偿风险分层10-19为了文章引用，杂志社也是拼了！每引用文章1次，奖励人民币39元10-19利用单细胞空间转录组发5分以上的SCI10-19被论文毁掉的中国研究生！
植物三维基因组学研究技术李兴旺教授和李国亮教授课题组致力于三维基因组学和表观基因组学研究。前期，课题组与合作者以人类细胞系和动物细胞为研究材料，先后开发了Long-readChI...
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论文查重开题分析单篇购买文献互助用户中心AdvancesincomputationalChIA-PETdataanalysis来自Springer喜欢0阅读量:29作者:HChao,GLi,DMNadhir,C...
真核细胞核中的染色质通过折叠成高度复杂、动态的高级结构,调控细胞中DNA转录、复制、损伤修复等重要功能。因此,探索染色质的空间构象对了解真核细胞中的这些功能非常必要。近年来,...
染色质在细胞核中折叠成高度复杂的三维结构,并且在细胞分化、增殖等过程中被动态调控。染色质构象捕获技术如5C、Hi-C和ChIA-PET可以捕捉基因组范围的高分辨...
3)比较不同组织或者物种之间的染色体3D构型;4)将Hi-C数据转换为虚拟4C(virtual4C),从而可以更方便地查看特定位点和染色体上其他位置的相互作用;5)可视化基于染色质免疫共沉淀结合...