生物医学论文图鉴

查阅下载医学文献的网站：

1、万方医学网：网拥有220多种中文独家医学期刊全文、1000多种中文医学期刊全文、4100多种国外医学期刊文摘（全文以电子邮件原文传递方式获得，核心期刊全部收齐）。

2、中华医学期刊全文数据库：中华医学会系列杂志是国内外医药卫生界数量最多、影响最大、权威性最强的医学期刊系列，是我国广大医药卫生科技人员不可缺少的重要信息源。中华医学期刊全文数据库支持用户一站式检索到中华医学会系列杂志的全部资源，获得更全面、准确、随时更新的检索结果，数据库收录中华医学会出版的中文医学核心期刊189种。此外，中华医学会杂志社倾力打造了“中华医学知识库”，包括精选指南库、视频库、科研与写作库、名师讲堂、临床诊疗知识库、全科教育库和医学人文库7个子库。

3、中国生物医学文献数据库（CBM）：学科涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学以及中药学等生物医学领域的各个方面，是目前国内医学文献的重要检索工具。

4、中国知网：国内最大的知识库，覆盖学科全面。

5、文献党下载器（）：主要服务于科研人员的文献下载需求。整合汇集海量中外文献数据库，涉及学科全面，资源庞大。中外各科文献基本都可以查找下载到，包括sci-hub和谷歌学术下载不了的文献。适合没有数据库权限的人群。

6、PubMed： 是一个免费的搜寻引擎，提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要的数据库。它的数据库来源为MEDLINE。其核心主题为医学，但亦包括其他与医学相关的领域，像是护理学或者其他健康学科。PubMed 的资讯并不包括期刊论文的全文，但可能提供指向全文提供者（付费或免费）的链接。

7、sciencedirect爱思唯尔（Elsevier）：是医学与其他科学文献出版社之一。爱思唯尔出版2500余种期刊，包括《柳叶刀》 、《四面体》、《细胞》。39000多种电子书籍以及诸多经典参考书如《格雷氏解剖学》等。

8、Embase：是爱思唯尔（Elsevier）推出的针对生物医学和药理学领域信息所提供的基于网络的数据检索服务。内容涉及药学、临床医学、基础医学、预防医学、法医学和生物医学工程等。除了可以检索丰富的医学文献外，还支持药物和疾病检索。

9、OVID平台：包涵生物医学的数据库有临床各科专著及教科书、循证医学、MEDLINE、EMBASE以及医学期刊全文数据库等。提供60多个出版商出版的科学、技术及医学期刊1 000多种，与LWW、Adis等公司属于姊妹公司。

10、The Cochrane Library(考克兰图书馆)：是the Cochrane Collaboration 的主要产品，汇集了关于医疗保健治疗和干预有效性的研究。它是循证医学的黄金标准，并且提供有关最新医疗的最客观信息。

11、ClinicalKey临床精钥：是信息分析公司爱思唯尔（Elsevier）推出的一个临床决策支持工具，帮助医生快速获取准确、简洁、世界前沿的循证医学知识。ClinicalKey拥有全球最大的医学信息资源库，涵盖所有医学专科。

12、UpToDate临床顾问数据库：是用于协助临床医生进行诊疗上的判断、决策的循证医学数据库。UpToDate覆盖了常见的 25 个临床专科，涵盖了诊疗全流程和全生命周期的绝大多数疾病及其相关问题，除了核心的临床专题外，UpToDate还提供多平台访问、智能搜索、图表导出生成PPT、重要更新、诊疗实践更新、患者教育、计算器和药物专论等多项功能。

13、Karger医学电子期刊：是由瑞士Karger出版社出版，每年出版约80余种高质量的学术期刊，大部分以英文出版，内容涵盖了整个生物医学领域，包括传统医学以及最新的医学热门课题。

14、Web of Science：是获取全球学术信息的重要数据库，它收录了全球13000多种权威的、高影响力的学术期刊，内容涵盖自然科学、工程技术、生物医学、社会科学、艺术与人文等领域。

15、公共科学图书馆（PLOS）：是一家由众多诺贝尔奖得主和慈善机构支持的非赢利性学术组织，旨在推广世界各地的科学和医学领域的最新研究成果。

16、世界顶尖医学杂志的前四名：《柳叶刀》（The Lancet）、NEJM（新英格兰医学期刊）、JAMA 美国医学会杂志（The Journal of the American Medical Association）、BMJ《英国医学期刊》

17、世界四大名刊：《细胞》(Cell)、《自然》(Nature)、《科学》(Science)、《美国科学院院报》(PNAS)

18、谷歌学术：检索外文文献常用网站，包括了世界上绝大部分出版的学术期刊， 可广泛搜索学术文献。谷歌学术涵盖学科全面，可了解有关某一领域的学术文献；了解某一作者的著述，并提供书目信息（引用时必需的图书出版信息或期刊论文的刊名、刊期信息）。部分文献可直接下载。

19、Wiley：成立于1807年，是全球最大的学术出版商之一，有1600多种经同行评审的学术期刊，20000本电子图书，170多种在线参考工具书，580多种在线参考书，19种生物学、生命科学和生物医学的实验室指南（Current Protocols），17种化学、光谱和循证医学数据库（Cochrane Library）。

随着计算技术和生物技术的进步,当前生物医学文献正在以前所 未有的速度增长。这些文献中蕴含着最新的研究进展和丰富的生物医学知识,对于生物医学研究者具有重要意义。然而数以千万计的文献使得研究者追踪和整理自己 需要的知识和信息变得越来越困难。文本挖掘技术可以解决这一问题,帮助生物医学研究者提高从文献中获取知识和信息的效率。因此针对生物医学文献的文本挖掘 研究具有重要的应用价值。判别式模型是一类直接利用特征来预测目标变量的发生概率的机器学习模型,本文中主要用到的判别式模型有最大熵模型和条件随机域模 型。相对于产生式模型,判别式模型降低了特征之间的独立性假设的要求,并且与很多文本挖掘任务的需求相一致,因而更有可能取得好的效果。本文主要研究如何 利用判别式模型来解决生物医学文献挖掘中的问题。具体地,我们研究了生物医学文本挖掘中的三个任务:生物医学名实体识别、生物医学实体规范化以及生物医学 语义关系抽取。在这3任务中,第二个任务是第一个任务在语义处理上的延伸,前两个任务是第三个任务的基础。本文的主要内容包含以下4个方面。生物医学名实 体识别的目标是确定一个给定的文本集合内的某一类型的实体的名字的所有实例,它是进行深层次文本挖掘的必要步骤之一。本文在考察了生物医学领域实体识别的 特点和难点,分析了目前已有的生物医学实体识别方法的优缺点的基础上,提出了利用条件随机域模型结合丰富特征集来进行生物医学实体识别的方法。这些特征包 括:构词法特征、上下文特征和句法特征。其中,浅层句法特征是首次被引入到条件随机域模型中,同时用来进行实体的边界检测和类别判断。实验表明,这一特征 可以有效地提高名实体识别的效果。有监督的机器学习方法需要大规模的标注语料。大量的电子文献使得在生物医学领域获取未标记的语料已相当容易,但是对语料 进行标注仍然是一件昂贵的工作。针对在生物医学名实体识别中有监督学习所需的大规模训练语料比较难以获取的问题,本文提出了基于最大熵模型的协同训练的半 监督学习方法。该方法可以利用大量的未标注语料来提高在较少的标注语料的基础上学习到的分类器的名实体识别性能。为了进一步提高半监督学习的效果,本文将 主动学习引入到半监督学习的过程中。实验表明,基于最大熵模型的协同训练方法可以有效地提高初始分类器的识别性能。灵活的生物医学实体命名方式使得生物医 学实体具有严重的歧义。这已成为对生物医学文献进行深层自动文本挖掘的主要障碍之一。生物医学实体规范化的提出就是为了解决这一问题。生物医学实体规范化 就是把生物医学文献中表达同一概念的不同变体映射到统一的概念标识符。本文提出了一种用于生物医学实体规范化的多层歧义消解框架。实体规范化过程中不同阶 段有不同的歧义情形,在本文提出的框架中,针对这些情形采用了有针对性的解决策略,包括:基于词典的实体名字检测,基于机器学习方法的候选选择以及基于知 识的歧义消解。在BioCreAtIvE2006基因名字规范化任务的测试集上的实验表明本文提出的框架可以有效地解决规范化过程中的各种歧义。生物医学 语义关系抽取是生物医学文本挖掘的主要研究内容之一,是从无结构的生物医学文献中抽取出生物医学知识的重要手段。在实际应用中,生物医学语义关系的定义有 宽泛和具体之分。本文将宽泛定义和具体定义的生物医学语义关系抽取分别看作二分类和多分类问题,提出基于最大熵模型的生物医学语义关系抽取的方法。针对不 区分类别的蛋白质相互作用这种宽泛定义的关系抽取,提出了一种基于最大熵的二阶段蛋白质相互作用关系抽取方法。针对多类别的蛋白质相互作用这种具体定义的 关系抽取,提出使用最大熵模型结合词特征的抽取方法,该方法在一个具有10种蛋白质相互作用类别的数据集上取得了的总体精确率。同样的方法应用 到疾病与治疗方式关系抽取任务中,也取得了很好的实验结果。此外,本文还通过理论分析和实验对比,从理论和实践两个方面说明了判别式模型比产生式模型更适 合生物医学语义关系抽取问题。参考文献 [1] 王浩畅,赵铁军. 生物医学文本挖掘技术的研究与进展[J]. 中文信息学报. 2008(03) [2] 于中华,陈蓉,胡俊锋,陈源. 基于加权投票K—近邻法的生物医学缩略语消歧[J]. 中文信息学报. 2008(02) [3] 龙军,殷建平,祝恩,赵文涛. 主动学习研究综述[J]. 计算机研究与发展. 2008(S1)

戊戌数据包含了美国上市药品数据库，欧盟上市药品库，美国橙皮书数据库，ClinicalTrials数据库，欧盟HMA上市药品库，日本橙皮书数据库，日本上市药品库等，有中文，英文，日文检索。

很多，以下是经常用的全文数据库，pubmed大部分没全文：1、OVID2、EBSCO3、proquest4、scicnedirect5、springer6、wiely......

国际医学文献数据库检索网站

Medline——世界上最著名的医学文献检索系统之一

AIDS  Databases——有关艾滋病的临床实验、药物研制以及相关文献数据库

CANCERLIT——癌症数据库(National Cancer Institute)

CHID online——综合卫生信息数据库，提供有关卫生、卫生教育资源的题录、文摘等信息

——向医患人员提供的临床实验信息数据库

DIRLINE——收集美国约17,000个政府机构、研究机构、公司、学术机构等信息

药物信息库——包含有9,000余种美国处方与非处方药物信息

HSTAT——包括有健康指南、评价、和消费者指南信息的全文数据库

NCCAM Resources——补充和替代医学资源

Dietary Supplements——提供维生素、矿物质、植物等信息

畸形、智力迟缓数据库——提供先天畸形、智力发育迟缓信息

LOCATORplus——杂志、书籍和视听教材目录数据库

Chemical Abstract——覆盖化学、化工、医学、生物学、环境、食品等多学科的科技文献系统

Dialog 联机检索系统——世界上最大的文献检索系统

Biomedicine——荷兰医学文摘，世界权威性的医药文献数据库。

RHO——生殖健康展望，由William H .Gates 基金会的基金资助

Out Look——有关生殖健康的论题，由 PATH 出版，联合国人口基金资助，可免费索取

医药信息网——有药品数据库、疾病数据库、新药数据库、医药市场等主要数据库

MEDLINE  Search——最权威的生物医学文献数据库，可获取全球范围内的4300种期刊的文献

Consensus  Statements——提供对医生、患者有重要意义的有争议医学问题一致性见解

Cancer net Database——综合癌症信息数据库

Rare Diseases Database——罕见疾病临床研究数据库

Visible Human Project——可视人计划数据库

TOXNET  Databases——毒理学数据库，将有关毒理和有害物质信息分为八个文档

FDA——最新的有关食品、药物、生物制剂、美容品、医学装置等通过、调整等信息

Guideline  Clearinghouse——提供临床医疗指南，汇总美国各权威协会和学术机构制定的各种指南性文件

Women's Health & Environment——妇女卫生与健康研究信息数据库

Rehabilitation Information——康复信息数据库

INFOTRIEVE——可通过WEB浏览器查找医学文献

CLINIWEB——医学信息检索系统，帮助医生从WEB上查询有用的医学信息

Health A to  Z——一个功能强大的INTERNET医学信息资源搜索器

Medguide——收录了网上大部分生物医学资源，支持多词逻辑检索

achoo——INTERNET医学信息资源搜索

MedAll List——是哈佛大学收集医药网点的列表，有大量网上医学院校和图书馆的联接

MedExplorer——检索方法简便，主要提供有关医学新闻及杂志的信息

MEL health resources——将INTERNET上的医药信息按学科分类进行整理，提供关键词查找

Medical Virtual library——是一个分布式的资源系统，提供关键词查找，并有按字序排列的列表

BiomedNet——由美国多家机构联合建立，收集网页1万余个

Medscape——面向临床医师和其他医疗卫生专业人员的交互式的商用Web站点

Medical Matrix——有分类检索和关键词检索两种检索方式。还提供免费Mailing lists

Doctor's  Guide——向医生和患者提供信息和服务，特色服务是新闻和会议消息

美国化学文摘社——世界最大、最强化学信息库,1300万条摘要、1650万种物质

美国专利数据库——提供美国专利目录和摘要数据库,免费查找专利名称、摘要等信息

天然产物数据库——提供75年以来活性天然产物，通过电子邮件申请帮助查询

IBM 专利服务器——提供美国专利局26年来的专利摘要，免费摘要、付费定购拷贝件

Science 科学——世界订户最多综合性科学刊物，这是我国引进的电子版

PharmInfoNet——医药信息网，提供药品、疾病、新药数据库；医学专题综述、医药市场等

Nature  Medicine——自然杂志出版生物医学论文，提供1996年以来各期目录及摘要

The  Lancet  柳叶刀——始于1823年著名医学杂志，提供大量全文，全部免费阅读')

美国国家健康研究所——联邦政府生物医学研究中心，世界上著名的生物医学研究中心

HealthGate数据公司——提供免费Medline查询，最新研究信息，帮助临床治疗、生物医学研究及教育

生物医学文献数据库——中国医科院信息研究所研制，综合性生物医学数据库，国内权威

美国医学协会出版物——美国医学协会出版，新闻、文摘或全文，包括以下部分。内科学文卷、皮肤病文卷、外科学文卷、眼科学文卷、美国医学会志、美国医学新闻、神经病学文卷、妇女健康杂志、家庭医疗文卷、普通精神病学文卷、耳鼻喉、头颈外科、儿科及青春期医学

British  Medical Journal——英国医学杂志

Medical Conference——医学会议库，4500多条会议信息，每日更新

NIST Webbook and Chemistry Webbook——美国国家标准与技术研究所数据集，免费查询5000多种化合物的红外光谱，8000多种化合物质谱等等。

New England  Journal of Medicine——报道医学重要研究成果的周刊，提供全部过刊信息及现刊的论文摘要

国内医学文献数据库检索网站

中国科技信息资源共享网络——涵盖中国生物医学文献数据库（CBM）、美国MEDLINE数据库

中国科学引文数据库——集多种功能为一体的综合性文献数据库

中国科学引文索引数据库——收集我国出版315种重要期刊，91-94年13万篇论文及45万引文摘要。

中医中药数据库——中国科学院科学数据库提供

中国中医药文献检索中心——由中国中医研究院信息中心制作，提供中医药方面的Web界面文献检索服务

金纬达海峡信息数据库检索——包括动态信息、科技类、综合类以及台湾系列信息等六十五个数据库

万方数据医学期刊——由中国科技信息研究所制作，收录了近百种医学期刊的电子版，免费使用

医管论文(台湾医院协会)——收有台大医学院,阳明医学院,高雄医学院,中国医药学院论文若干

中国专利数据库——中国知识产权局研制，提供85年专利法实施后批准的专利，收集我国出版315种重要期刊，91-94年13万篇论文及45万引文摘要

中医药期刊文献数据库——收集我国出版315种重要期刊，91-94年13万篇论文及45万引文摘要

海峡信息数据库检索——中文网上科技文献检索

中国医学信息网络——栏目有中国卫生事业，中国生物医学文献数据库，中医学院，协和医科大，医学信息网，亚洲桥，Internet信息查询

中国卫生事业——有卫生事业概况、中国生物医学文献数据库、中国医学科学院、医学信息网络、医药卫生机构等栏目

中国生物医学文献数据库——收录了1982年以来近千种中国生物医学期刊以及会议论文的文献题录