儿童白血病小柯论文

“小柯”是一个科学新闻写作机器人，由中国科学报社联合北京大学高水平科研团队研发而成，旨在帮助科学家以中文方式快速获取全球高水平英文论文发布的最新科研进展。《自然》● 科学家揭示肝硬化细胞水平发病机制英国爱丁堡大学炎症研究中心N. C. Henderson和P. Ramachandran研究组合作发现在单细胞水平上肝硬化的纤维化生态位。相关论文2019年10月9日在线发表于《自然》。为了获得细胞水平的直接相关的发病机制，并为治疗设计提供依据，他们分析了超过100,000个人类单细胞的转录组，从而得出了健康和肝硬化人类肝脏中存在的非实质细胞类型的分子定义。他们发现了一种新型的与疤痕相关的TREM2+CD9+巨噬细胞亚群，该亚群在肝纤维化中扩展，从循环单核细胞分化，并且具有促纤维化作用。他们还定义了新型ACKR1+和PLVAP+内皮细胞，它们在肝硬化中扩展，在形态构造上受疤痕限制并增强白细胞的转运。新型疤痕相关巨噬细胞，内皮细胞与PDGFRα+胶原生成间充质细胞之间相互作用的多谱系配体-受体模型揭示了包括TNFRSF12A，PDGFR和NOTCH信号传导在内的几种促纤维化途径的疤痕内活性。他们的工作在单细胞水平上剖析了未曾被预料的人体器官纤维化的细胞和分子基础，并提供了发现肝硬化合理治疗目标所需的概念框架。据悉，目前尚无有效的抗肝纤维化疗法治疗肝硬化，肝硬化是全世界的主要杀手。相关论文信息：● 研究解码胎儿肝脏造血功能剑桥大学Sam Behjati、Elisa Laurenti、Sarah A. Teichmann 和英国纽卡斯尔大学Muzlifah Haniffa研究组合作解码了人类胎儿肝脏造血功能。 这一研究成果在线发表在2019年10月9号的《自然》上。研究人员对约140,000个肝脏和74,000个皮肤以及肾脏和卵黄囊细胞进行单细胞转录组测序，确定了人类血液和免疫细胞在发育过程中的组成。研究者从造血干细胞和多能祖细胞推断分化轨迹，并评估组织微环境对血液和免疫细胞发育的影响。研究揭示了胎儿皮肤中的生理性红细胞生成以及卵黄囊中肥大细胞，自然杀伤细胞和先天性淋巴样细胞前体的存在。研究还证明了在妊娠过程中胎儿肝脏的造血成分发生了变化，其远离了主要的类红细胞，同时伴随着HSC / MPPs分化潜能的平行变化，研究人员并对此进行了功能验证。该研究揭示的胎儿肝脏造血综合图谱为研究儿科血液和免疫疾病提供了蓝图，并为HSC / MPP的治疗潜力提供了参考。研究人员表示，胎儿肝脏中的决定性造血作用支持造血干细胞和多能祖细胞的自我更新和分化，但其在人类中的作用仍然不清楚。相关论文信息：● 新发现可作为黑色素瘤潜在疗法美国西雅图福瑞德·哈金森癌症中心Robert K. Bradley小组和纽约纪念斯隆-凯特琳癌症中心Omar Abdel-Wahab小组合作，发现了癌症中剪接体内非典型BAF复合物的破坏，并基于这一机制提出了对待一类肿瘤恶化的治疗方法。 这一研究成果在线发表在2019年10月9日的《自然》上。研究人员结合泛癌剪接分析与阳性富集CRISPR筛选来优化促进肿瘤发生的拼接改变。研究团队报告说，多样的SF3B1突变集中在对BRD9的抑制上，BRD9是最近描述的非典型BAF染色质重塑复合体的核心组成部分，该复合体也包含GLTSCR1和GLTSCR1L57。突变体SF3B1识别BRD9内的异常的、深内含子分支点，从而诱导内源性逆转录病毒元件衍生的毒性外显子的包被和随后BRD9 mRNA的降解。BRD9的清除引起了CTCF相关基因座上非经典BAF的减少，并促进了黑色素瘤的发生。BRD9是葡萄膜黑色素瘤中一种强有力的抑制剂，利用反义寡核苷酸或CRISPR介导诱变在SF3B1变异细胞中纠正BRD9 的错剪接可以抑制肿瘤增长。据悉，SF3B1是癌症中最常见的突变RNA剪接因子，但对SF3B1突变促进恶性肿瘤的机制了解甚少。相关论文信息：● 癌症中U1剪接体RNA发生高频突变加拿大多伦多大学Lincoln D. Stein研究组研究显示，U1剪接体RNA在多种癌症中发生突变。该项研究成果在线发表于2019年10月9日的《自然》。他们报告了在几种肿瘤类型中，U1 snRNA的第三个碱基处高频出现的Agt;C体细胞突变。 U1的主要功能是通过碱基配对识别5C突变与肝细胞癌的酗酒和慢性淋巴细胞性白血病的侵袭性IGHV基因未突变亚型相关。U1突变还可以使CLL患者独立接受不良预后。他们的研究证明了剪接体RNA中最早的非编码驱动程序之一，揭示了癌症中异常剪接的新机制，可能代表了新的治疗靶标。他们的发现还表明，驱动程序的发现应扩展到更广泛的基因组区域。据悉，癌症是由称为驱动因子的基因组改变引起的。已知有数百种编码基因的驱动程序，但尽管进行了深入的搜索，但迄今为止仅发现了少数非编码驱动程序。最近注意力已经转移到改变的RNA剪接在癌症中的作用。尽管仅在蛋白质编码剪接因子）中发现了导致多种转录类型的异常剪接的驱动子突变，但仍在多种癌症类型中得到了证实。相比之下，由于表征非编码癌症驱动程序的综合挑战和snRNA基因的重复性，对剪接体非编码成分，一系列小核RNA的癌症相关改变的研究很少。相关论文信息：● 非编码RNA突变可引起Shh型髓母细胞瘤近日，加拿大病童医院Michael D. Taylor研究组发现复发性非编码的U1-snRNA突变驱动Shh型母细胞瘤的隐性剪接。2019年10月9日，国际知名学术期刊《自然》在线发表了这一成果。研究人员报道了约50％的Sonic hedgehog型髓母细胞瘤中U1剪接体小核RNA的高度复发性热点突变，该突变在其他髓母细胞瘤亚型中均不存在。在其他36种其他肿瘤类型的2442例癌症中，发现此U1-snRNA热点突变小于％。婴儿Shh-MB基本上不存在这种突变，这种突变发生在97％的成年人和25％的青少年中。U1-snRNA突变发生在5剪接位点结合区域，并且snRNA突变型肿瘤显著破坏RNA剪接，并带有过量的5隐性剪接事件。突变的U1-snRNA介导的可变剪接使肿瘤抑制基因失活，并激活癌基因，这是治疗的新靶点，并造成了癌症中非蛋白质编码基因的高度复发性和组织特异性突变。据介绍，癌症中的复发性体细胞单核苷酸变异很大程度上局限于蛋白质编码基因，在大多数儿童癌症中很少见。相关论文信息：《英国医学杂志》● 非酒精性脂肪肝与急性心肌梗死和卒中发病风险的相关性荷兰鹿特丹伊拉斯谟大学医学中心Naveed Sattar研究小组的一项最新研究分析了非酒精性脂肪性肝病与急性心肌梗死和卒中的发病风险的相关性。相关论文2019年10月8日在线发表于《英国医学杂志》。研究组搜集了2015年12月31日前四个欧洲国家基于人口的电子基础卫生数据库，其中意大利1542672人，荷兰2225925人，西班牙5488397人，英国12695046人。对120795名确诊为NAFLD或非酒精性脂肪性肝炎的患者平均随访了年。在校正年龄和吸烟因素后，与匹配的对照组相比，NAFLD或NASH患者的AMI风险比为，卒中的综合风险比为。而在风险因素数据更为完整的组别中，在校正收缩压、2型糖尿病、总胆固醇水平、他汀类药物使用和高血压等因素后，NAFLD或NASH患者的AMI的风险比为，卒中的风险比为。总之，对1770万例患者进行常规护理，在排除心血管危险因素后，NAFLD的诊断与AMI或卒中风险无关。NAFLD患者的成人心血管风险评估很重要，但无需以特殊方式进行。相关论文信息：● 中国科学家系统评价非小细胞肺癌一线治疗的疗效广州医科大学附属第一医院何建行教授研究组对晚期表皮生长因子受体突变的非小细胞肺癌一线治疗的疗效和安全性进行了系统评价和网络荟萃分析。这一研究成果于2019年10月7日在线发表于《英国医学杂志》。研究组在PubMed、Embase、Cochrane中央对照试验注册中心和等知名数据库中检索2019年5月20日之前符合标准的文献。入选研究均比较了晚期EGFR突变NSCLC患者一线治疗中两种以上的疗法，且至少报告以下临床结果指标之一：无进展生存、总生存、客观缓解率和3级及以上不良反应。18项符合条件的试验包括4628例患者和12种治疗方法：EGFR酪氨酸激酶抑制剂，基于培美曲塞的化疗，培美曲塞游离化疗以及联合治疗。与吉非替尼+培美曲塞化疗的疗效相当，奥希替尼显示出最有利的无进展生存期，显著优于达克替尼、阿法替尼、厄洛替尼、吉非替尼、埃克替尼、培美曲塞为基础的化疗、培美曲塞游离化疗、阿法替尼+西妥昔单抗和吉非替尼+培美曲塞。奥希替尼和吉非替尼联合以培美曲塞为基础的化疗在提供最佳总体生存效益方面也大致相当。但联合治疗引起的毒性更大，尤其是厄洛替尼+贝伐单抗，易导致3级以上的严重不良事件。不同的EGFR-TKIs显示出不同毒性谱。两种最常见的EGFR突变类型的亚组分析表明，在外显子19缺失的患者中，奥希替尼与最佳无进展生存相关，而在Leu858Arg突变患者中，吉非替尼+培美曲塞化疗与最佳无进展生存相关。总之，与其他一线治疗相比，奥希替尼和吉非替尼+培美曲塞化疗可显著提高晚期EGFR突变的NSCLC患者的无进展生存期和总生存期。对于外显子19缺失和Leu858Arg突变的患者，奥希替尼和吉非替尼+培美曲塞化疗的无进展生存最优。相关论文信息：● 慢性阻塞性肺病患者预后预测模型的系统评价希腊约阿尼纳大学医学院Evangelos Evangelou研究团队系统分析和批判评价了慢性阻塞性肺病患者预后的预测模型。这一研究成果于2019年10月4日在线发表于《英国医学杂志》。研究组系统搜索了228篇符合条件的文献，描述了408个预后模型的开发，38个模型的外部验证，以及20个针对COPD以外疾病预后模型的验证。408个预后模型建立于三个临床环境：239个针对门诊患者，155个针对住院患者，14个针对急诊患者。这408个预后模型中，最普遍的终点是死亡率、COPD急性加重和再次住院的风险。总体来说，最常用的预测因素是年龄、一秒用力呼气量、性别、体重指数和吸烟。在408个预后模型中，100个得到了内部验证，91个检测了校准开发模型。286个模型无法展示，只有56个模型可通过完整方程式展示。C统计模型可对311个模型进行判别。38个模型进行了外部验证，但其中只有12个由一个完全独立的团队进行验证。只有7个预后模型的总体偏倚风险较低。总之，该研究对COPD患者预后预测模型进行了详细的描绘和评估，发现它们的开发过程存在一些方法上的缺陷，且外部验证率较低。未来的研究应着眼于通过更新和外部验证来对现有的这些模型进行改进，并在临床实践中对它们的安全性、临床有效性和成本效益进行评估。相关论文信息：合作事宜：投稿事宜：王者之心2点击试玩

“小柯”是一个科学新闻写作机器人，由中国科学报社联合北京大学高水平科研团队研发而成，旨在帮助科学家以中文方式快速获取全球高水平英文论文发布的最新科研进展。《自然—免疫学》● 科学家综述新的免疫抑制受体及其配体美国匹兹堡大学医学院Dario A. A. Vignali研究组撰写综述文章，阐述了PD-1、PD-L1和CTLA-4以外的抑制受体和配体。2019年10月14日的《自然—免疫学》在线发表了这篇综述文章。文章说，尽管针对抑制受体CTLA-4、PD-1或PD-L1的免疫疗法已在癌症方面取得了实质性的临床进展，但仍有相当一部分患者对治疗没有效果。靶向新型IR-配体途径结合当前的免疫疗法可改善临床疗效。新的临床免疫疗法靶向T细胞表达的IR以及B7家族中的抑制性配体，尽管其中许多靶标具有复杂的生物学和不清楚的作用机制。在靶向这些IR方面仅取得了很少的临床效果，当前的免疫治疗设计可能不是最佳的。这篇综述涵盖了靶向新型IR-配体途径的生物学及其免疫疗法的当前临床状况，无论是单一疗法还是与PD-1或其配体PD-L1的抗体联用。对这些靶标的基础生物学的进一步了解对于开发有效的癌症免疫疗法至关重要。相关论文信息：● 研究发现小肠淋巴集结调节免疫相关反应美国哈佛医学院Michael C. Carroll和基因泰克公司Shannon J. Turley团队，合作发现了通过小肠淋巴集结基质的机械诱导调节淋巴细胞迁移和粘膜抗体反应。该研究于2019年10月14日在线发表于《自然—免疫学》。研究团队报告说小肠PP包含专门的导管系统，该系统引导吸收的液流通过肠道上皮。值得注意的是，PP 纤维母细胞网状细胞通过机械敏感离子通道Piezo1对导管流体的流动作出了响应。在表达CCL19的基质上，Piezo1的流体流动中断或遗传缺陷导致血管周FRC和相关的高内皮小静脉发生明显的结构改变。反过来，这会削弱淋巴细胞进入PP和黏膜抗体反应的启动。这些结果确定了导管介导的流体流动在维持PP动态平衡和粘膜免疫中的关键作用。据悉，FRC及其专门的胶原纤维称为“导管”，形成支持淋巴组织的基本结构单元。在淋巴结中，导管可将组织液和小分子从传入淋巴管传输到淋巴结实质中。但是，导管功能的免疫学作用仍然不清楚。相关论文信息：● 多重内源基因激活增强抗肿瘤免疫美国耶鲁大学医学院Sidi Chen课题组研究发现，CRISPRa对内源性基因的多重激活可产生有效的抗肿瘤免疫。2019年10月14日，《自然—免疫学》在线发表了这项成果。研究人员创建了多重激活内源性基因的免疫疗法，这是一种新形式的免疫疗法，可通过肿瘤中内源性基因的多重激活来引发抗肿瘤免疫力。研究者利用CRISPR的激活直接增强内源基因的原位表达，增强了肿瘤抗原的表达，从而导致了显著的抗肿瘤免疫反应。将其作为基于细胞的疫苗接种策略，在预防和治疗肿瘤方面均显示出功效。利用腺病毒表达 CRISPRa文库可引发针对多种癌症类型的强大抗肿瘤免疫。针对突变基因的靶向集可在局部和远处根除大部分已建立的肿瘤。这种治疗方式导致肿瘤微环境的改变，其特征在于增强的T细胞浸润和抗肿瘤免疫反应。多重内源基因激活是一种通用且高度可扩展的策略，可引发针对癌症的有效免疫反应，这不同于现有的癌症疗法。据介绍，免疫疗法改变了癌症的治疗方法。然而，当前的免疫治疗方式面临各种限制。相关论文信息：《自然—生物技术》● 研究揭示细胞转录组与染色质可及性图谱美国加州大学圣地亚哥分校Kun Zhang小组利用高通量测序方法，揭示了同一细胞中转录组和染色质可及性图谱。这一研究成果2019年10月14日在线发表在《自然—生物技术》上。研究人员利用基于液滴的单核染色质可及性和mRNA表达测序的手段进行大规模测序，这种方法可以将细胞的转录组与其可利用的染色质连接起来。具体而言，在许多平行液滴中，Tn5转座酶在通透性细胞核中捕获了可及的位点，利于同一细胞中mRNA分子和DNA条形码的标记。为了证明SNARE-seq的实用性，研究者构建了新生和成年小鼠大脑皮层5081和10309个细胞的连接概况。研究人员重建了主要和稀有细胞类型的转录组和表观遗传图谱，揭示了对于低丰度细胞来说谱系特异性的可及位点，并在神经发育过程中将启动子可及性与转录水平联系起来。据悉，单细胞RNA测序可以揭示细胞的转录状态，但对于开放或可进入染色质区域相关的上游调节环境知之甚少。相同细胞内可及染色质和RNA的联合分析将使转录调控与其输出相匹配。相关论文信息：● 科学家优化预测HLA呈递抗原的算法美国斯坦福大学Ash A. Alizadeh研究组通过整合深度学习方法，预测 II类HLA对抗原的呈递。该项研究成果在线发表于2019年10月14日的《自然—生物技术》。研究人员描述了MARIA，一种多模态递归神经网络，用于在许多感兴趣的基因中预测特定情况下II类白细胞抗原呈递抗原的可能性等位基因。除了进行体外结合测试外，还利用质谱对MARIA鉴定的HLA结合肽段进行了序列分析，以及抗原基因的表达水平和蛋白酶切割位点的标记。因为它利用了这些多样化的训练数据和改进的机器学习框架，所以MARIA优于现有的验证数据集中的方法。在独立的癌症新抗原研究中，具有较高MARIA评分的肽更有可能引起强烈的CD4 + T细胞反应。因此可以利用MARIA鉴定多种癌症和自身免疫性疾病中的免疫原性表位。据悉，准确预测人II类白细胞抗原对抗原呈递对于疫苗研发和癌症免疫治疗具有重要价值。目前，体外结合训练数据的计算方法受到训练数据不足和算法约束的限制。相关论文信息：● 新技术可准确预测HLA-II表位瑞士洛桑大学David Gfeller和Michal Bassani-Sternberg等研究人员，合作开发出可用于准确预测II型人类白细胞抗原分子表位的新技术。该项研究成果在线发表在2019年10月14日的《自然—生物技术》上。研究人员将无偏倚质谱技术与模体逆卷积算法相结合，来描绘和分析从HLA-II分子洗脱的总共99265种独特的肽。然后，研究人员用这些数据训练了抗原决定簇预测算法，并改进了对病原体和与肿瘤相关的II类新表位的预测。据介绍，HLA-II所呈现的表位的预测准确性有限，这限制了疫苗和治疗设计。相关论文信息：《自然—方法学》● 科学家研发新型脂质代谢追踪技术德国莱茵范伦威弗尔·波恩大学Philipp Leyendecker小组报道了一项新型技术，可用于脂质代谢的复杂性追踪和单细胞追踪。相关论文2019年10月14日在线发表在《自然—方法学》上。使用点击化学质谱仪报告分子策略，研究人员为炔烃标记的脂质开发了一种特定的、高度敏感且稳定的示踪方法。该方法使得能够进行样品多路复用，从而改善了样品比较。研究人员通过对肝细胞甘油脂代谢的时间分辨分析，以及对120个标记脂质种类的平行定量监测来证明了这一点。其超高的灵敏度能够对脂肪酸掺入中性和膜脂中进行单细胞分析。这些结果证明了脂质稳态在单细胞水平上的稳健性。据悉，细胞脂质代谢是一个复杂的网络过程，包括数十种酶、多个细胞器和一千多种脂质。在这个网络中追踪代谢反应是一项重大的技术和科学挑战。相关论文信息：● 机器学习助力光敏通道蛋白工程化设计机器学习指导的光敏感通道蛋白工程化使微创光学遗传学成为可能，这一成果由美国加州理工学院Frances H. Arnold和Viviana Gradinaru等研究人员合作取得。相关论文2019年10月14日在线发表于《自然—方法学》。研究人员设计了光门控光敏感通道蛋白，其电流强度和光敏感性可实现微创神经元回路的研究。当前应用于哺乳动物大脑的ChR工具需要进行颅内手术，以进行转基因递送和植入光缆，从而产生少量组织的光依赖性激活。为了在不需要侵入性植入的情况下促进扩展的光遗传学，研究人员的工程方法利用了大量的ChR变体文献来训练用于设计高性能ChR的统计模型。通过在102个具有功能特征的ChR有限实验集上训练的高斯过程模型，研究人员设计了具有高光敏性的高光电流ChR。其中的三个ChRger1_3可通过全身性转基因递送实现神经系统的光遗传学激活。ChRger2无需光纤植入即可实现光诱导的神经元兴奋，也就是说，该视蛋白能够进行经颅光遗传学。相关论文信息：● 新型荧光蛋白可用于超分辨率光镜-电镜关联显微镜成像中国科学院生物物理研究所徐涛院士课题组与徐平勇课题组合作，报道了可用于超分辨率光镜-电镜关联显微镜成像的新型荧光蛋白mEosEM。2019年10月14日，国际学术期刊《自然—方法学》在线发表了该研究成果。研究人员报道了一种光可控荧光蛋白mEosEM，它可以在四氧化锇处理和Epon包埋后的样品中保留荧光，从而改善SR-CLEM的使用。据介绍，超分辨率相关光电子显微镜是在细胞超微结构的背景下，以纳米级成像特定分子的强大方法。Epon环氧树脂包埋为SR-CLEM提供了优势，包括超微结构保护和高质量切片。但是，Epon包埋消除了大多数荧光蛋白的荧光。相关论文信息：合作事宜：.cn投稿事宜：.cn王者之心2点击试玩