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中华医学杂志创刊于中华医学会成立的1915年。创刊之初是中、英文双语期刊，英文刊名为NationalMedicalJournalofChina。1932年，中华医学杂志的英文部分与中国博医会的英文杂志ChinaMedicalJournal（博医会报）合并，以ChineseMedicalJournal为刊名出版；中文部分仍称中华医学杂志继续出版，并继续保留NationalMedicalJournalofChina的英文刊名，现在,在中华医学杂志的论著类文章中依然保留英文的作者姓名、通讯地址和严格的英文摘要。中国国家图书馆、中国科技信息研究所、中国医学科学院科技信息研究所、中国科学文献计量评价研究中心等国家科技信息情报部门均把中华医学杂志列为核心期刊。

历经数代人的努力，中华医学杂志形成了科学性强、权威度高、影响力大、覆盖面广的刊物特色，树立了良好的社会形象，在中国医学界享有很高的声誉。中国国家图书馆、中国科技信息研究所、中国医学科学院科技信息研究所、中国科学文献计量评价研究中心等国家科技信息情报部门均把中华医学杂志列为核心期刊。在国际上，中华医学杂志于1920年被美国 Chemical Abstract 收录，1927年起就被美国医学会 Quarterly Cumulative Index Medicus 收录，是中国最早被国外医学索引收录的中文版医学期刊； 1960年起被美国国立医学图书馆出版的 Index Medicus 收录 ,其后被该馆的联机检索系统 Medline/Pubmed 收录；1976年起被荷兰 Excepta Medica 及其数据库（ EM Base ） 收录； 2004年起被俄罗斯 Реферативный Журнал—РЖ 收录。 被国内外 35个数据库和检索系统收录，并与60多个国家和地区的相关刊物建立了长期交换关系。据《中国学术期刊综合评价数据库》的统计，中华医学杂志 90年来发表的论文在1994-2004年间被国内1367种期刊引用了29117次；被 SCI 的 345种源期刊引用了785次。 国内外数据库和检索系统MEDLINE/PubMed联机检索系统 荷兰医学文摘（ EMBASE） 美国化学文摘 (CA) 美国生物学文摘（ BA） 俄罗斯文摘杂志（ РЖ ） Article First（OCLC联机检索数据库） ARTICLE@INIST（法国科技情报研究所文摘库） 美国癌症数据库（ CancerLit） 美国毒理学文献数据库（ TOXLINE） 美国艾滋病文献数据库（ AIDSLINE） 中国科学引文数据库（ CSCD） 中国科技论文与引文数据库（ CSTPCD） 中国学术期刊综合评价数据库 (CAJCED) 中国生物医学文献数据库 (CBMdisc) 中国药学文摘（ CPA） 中国生物医学期刊引文查询系统 (CMCI) 中国学术期刊文摘 中文生物医学期刊文献数据库 (CMCC) 万方数字化期刊全文数据库 维普科技期刊全文数据库 中文科持资料目录 （医药卫生） 中文科技资料目录 （中草药） 中国生物学文摘 全国报刊索引（自然科学技术版）