你把编号选中 调成一样的字体和大小试试
如图，文中的[01]、[02]、【03】等即为顺序编码~~
很简单的事，这个对不齐是制表符字节不一致，因为前面默认两位，到100就成3位了。想对齐很简单，选中你的参考文献，然后点击右键，有个调整列表缩进，点开，点开以后文本缩进你调大，调到1CM，后面还有个编号之后，勾选制表位添加位置，然后也调到一公分就可以了。
打开word2010 点击开始菜单，然后找到段落，上面有个编号，点开右边向下箭头后会 看到定义编号格式，如下图，然后把编号格式1改成[1]，然后确定就可以了
论文中参考文献的序号修改时，最后相对应的序号可以使用尾注法自动修改。方法如下（以Word2003为例）：1、把光标移动到插入参考文献的位置，菜单中点击“插入”-“引用”-“脚注和尾注”。2、在对话框中选择“尾注”，编号方式选择“自动编号”，所在位置建议选择“节的结尾”。3、如果“自动编号”后面不是阿拉伯数字，就选右下角的“选项”，在编号格式中选中阿拉伯数字。4、确定后就在该处就插入一个上标“1”，光标自动跳到文章最后，前面就是一个标“1”，这就是输入第一个参考文献的地方。5、把文章最后的上标“1”的格式改成正常，再在它后面输入所插入的参考文献。6．对着参考文献前面的“1”双击，光标就可以回到文章内容中插入参考文献的地方，然后就可以继续写文章。7、在标号的外面输入方括号，调整格式为上标,复制包括方括号在内的标号，如：[1]。在下一个需要插入参考文献的地方粘帖刚才复制的[1]，就会出现一个“[2]”，但后面的参考文献信息与第一条是相同的，删除重新输入第二条参考文献的内容就行，记住不能将编号删除。8、所有文献都引用完后，会发现在第一篇参考文献前面有一条短横线（页面视图里能看到），如果参考文献跨页了，在跨页的地方还会有一条长横线，这些线不能选中，也无法删除。这是尾注的标志。9、切换到普通视图，菜单中“视图”-“脚注”，这时最下方可以看见尾注的编辑栏。10、在尾注右边的下拉菜单中选择“尾注分隔符”，这时那条短横线可以呢出现，选中-删除。11、再在下拉菜单中选择“尾注延续分隔符”，这是那条长横线出现了，选中-删除。12、切换回到页面视图，参考文献插入已经完成。这时，无论文章如何改动，参考文献都会自动地排好序了。
自动编号选不了。如果不喜欢，可以点击工具栏上的自动编号按钮，去掉自动编号，然后手工录入编号。
因为那些序号是word程序自动生成的，所以没办法选中，但是可以取消序号，自己输入序号，就可以选中了。
毕业论文调整格式之尾注法引用参考文献 (1)
我觉得是你前面那个十的符号有问题，明显的和9不一样大，试试改一下
选中后右击选择“调整列表缩进”中的“制表之后”下拉菜单，选择“不特别标注”后确定即可。
把编号后的空格删去，按tab键代替。每一排都如此
你自己 复制的 或者 按了空格！！！手动删了 即可
字母代表所引用的文献的类型，如［J]代表所引用的这篇文献来自期刊。标准编号．标准名称〔S〕。常见的参考文献字母所表示的类型有：1、期刊论文类一般格式如下：作者论文名称[J]期刊名称,发表年份(第几期):页码注意：一般而言，参考文献里的标点符号用的是英文状态下输入的标点符号。输完汉字要切换到英文状态，再输入相应的标点符号。示例：沈延生村政的兴衰与重建[J]战略与管理,1998(6):1-2、学位论文类一般格式如下：作者论文名称[D]毕业院校所在城市:毕业院校,论文提交年份:页码示例：刘杨同人小说的著作权问题研究[D]重庆:西南政法大学,2012:12-3、书籍著作类一般格式如下：作者著作名称[M]出版社所在城市:出版社名称,出版年份:页码示例：金太军村治治理与权力结构[M]广州:广州人民出版社,2008:参考文献著录格式1、期刊作者．题名〔J〕．刊名，出版年，卷（期）∶起止页码2、专著作者．书名〔M〕．版本（第一版不著录）．出版地∶出版者，出版年∶起止页码3、论文集作者．题名〔C〕．编者．论文集名，出版地∶出版者，出版年∶起止页码引用的文献，每处的页码或页码范围（有的刊物也将能指示引用文献位置的信息视为页码）分别列于每处参考文献的序号标注处，置于方括号后；作为正文出现的参考文献序号后需加页码或页码范围的，该页码或页码范围也要作上标。作者和编辑需要仔细核对顺序编码制下的参考文献序号，做到序号与其所指示的文献同文后参考文献列表一致。另外，参考文献页码或页码范围也要准确无误。
参考文献是对期刊论文引文进行统计和分析的重要信息源之一M专著（含古籍中的史、志论著） MonographJ期刊文章JournalC论文集CollectionN报纸文章NewsD学位论文DegreeP专利PatentS标准StandardDB/OL——联机网上的数据库N/OL——联网上的报纸J/OL——网上期刊拓展资料：文献标识码一般不需要作者标注，而是由期刊专职人员根据文章内容划分的。因医学期刊有时很难绝对区分各类文献的差异，所以不同时期期刊同样文章格式的标志码有所不同，这与编辑人员对上述规范的理解程度不同有一定的关系；同一种期刊同类文章的标志码也有不同，这与文章的篇幅及论述的详尽程度有关。如同一期的《临床内科杂志》中，病例报告有的标注为B，有的标注为D。总之，目前文献标识码还存在一定的问题，还有待进一步的规范和统一。参考资料：百度百科——文献标识码
M是专著 D是学位论文 P是专利 J是期刊 S是标准
作者在前，书名中间，年份在后。 根据GB3469-83《文献类型与文献载体代码》规定，以单字母标识： M——专著（含古籍中的史、志论著） C——论文集 N——报纸文章 J——期刊文章 D——学位论文 R——研究报告 S——标准 P——专利 A——专著、论文集中的析出文献 Z——其他未说明的文献类型 电子文献类型以双字母作为标识： DB——数据库 CP——计算机程序 EB——电子公告 非纸张型载体电子文献，在参考文献标识中同时标明其载体类型： DB/OL——联机网上的数据库 DB/MT——磁带数据库 M/CD——光盘图书 CP/DK——磁盘软件 J/OL——网上期刊 EB/OL——网上电子公告 一、参考文献著录格式 1 、期刊作者．题名〔J〕．刊名，出版年，卷(期)∶起止页码 2、 专著作者．书名〔M〕．版本(第一版不著录)．出版地∶出版者，出版年∶起止页码 3、 论文集作者．题名〔C〕．编者．论文集名，出版地∶出版者，出版年∶起止页码 4 、学位论文作者．题名〔D〕．保存地点．保存单位．年份 5 、专利文献题名〔P〕．国别．专利文献种类．专利号．出版日期 6、 标准编号．标准名称〔S〕 7、 报纸作者．题名〔N〕．报纸名．出版日期(版次) 8 、报告作者．题名〔R〕．保存地点．年份 9 、电子文献作者．题名〔电子文献及载体类型标识〕．文献出处，日期 二、文献类型及其标识 1、根据GB3469 规定，各类常用文献标识如下： ①期刊〔J〕 ②专著〔M〕 ③论文集〔C〕 ④学位论文〔D〕 ⑤专利〔P〕 ⑥标准〔S〕 ⑦报纸〔N〕 ⑧技术报告〔R〕
1 期刊论文类一般格式如下：作者论文名称[J]期刊名称,发表年份(第几期):页码注意：一般而言，参考文献里的标点符号用的是英文状态下输入的标点符号。输完汉字要切换到英文状态，再输入相应的标点符号。示例：沈延生村政的兴衰与重建[J]战略与管理,1998(6):1-徐勇,吴记峰重达自治：连接传承的尝试与困境——以广东省云浮和清远的探索为例[J]探索与争鸣,2014(4):50-吴毅,贺雪峰,罗兴佐,等村治研究的路径与主体[J]开放时代,2005(4):82-2 学位论文类一般格式如下：作者论文名称[D]毕业院校所在城市:毕业院校,论文提交年份:页码示例：刘杨同人小说的著作权问题研究[D]重庆:西南政法大学,2012:12-3 书籍著作类一般格式如下：作者著作名称[M]出版社所在城市:出版社名称,出版年份:页码示例：金太军村治治理与权力结构[M]广州:广州人民出版社,2008:如果是合著，即有多名作者，其作者的书写格式与期刊多名作者的书写格式相同。4 报纸类一般格式如下：作者文章名称[N]报纸名称,发行日期(版面)示例：胡祖六“一带一路”战略给河南定位精确[N]大河报,2015-3-30(5)以上是这几日指导过程中出现最多的几个参考文献类型，当然参考文献的种类不止这四种。我查阅了一些期刊，个人认为《许昌学院学报》的参考文献格式比较标准规范，我们可以拿来参考一下（可以从知网查询）。当然具体到个人毕业论文参考文献的格式，最终还是以指导教师的建议为准。