中科院期刊分区依据也是基于一个期刊的影响因子，具体方法：根据13个大类学科，分别将各大类的SCI期刊由3年平均影响因子划分为1区(最高区)、2区、3区和4区四个等级。中科院分区的1区到4区的期刊数量不等，呈金字塔状分布。前5%为该类1区、6%～20% 为2区、21%～50%为3区，其余为4区。 除大类分区以外，中科院也参照汤森路透JCR 分区一样，把期刊分为176个具体学科，就是指的小类学科。 参照大类同样的算法对小类学科区分 3 4区 于是这就出现了前面讲的问题，一本期刊按中科院分区标准，在大类分区和小类分区不一致的情况。
化学一区:《ACCOUNTS CHEM RES》， 《ADV CATAL》，《ADV INORG CHEM》，《ADV ORGANOMET CHEM》， 《ADV PHYS ORG CHEM》，《ADV POLYM SCI》，《ALDRICHIM ACTA》， 《ANGEW CHEM INT EDIT》，《 ANNU REV PHYS CHEM》，《 CATAL REV》，《 CHEM REV》， 《CHEM SOC REV》，《 J PHYS CHEM REF DATA》，《 J AM CHEM SOC》，《PROG INORG CHEM》，《 SURF SCI REP》，《 TOP CURR CHEM》化学二区: 《ANAL CHEM》，《 CHEM COMMUN》，《ELECTROPHORESIS》，《INORG CHEM》，《J CHROMATOGR A》，《 J ORG CHEM》，《 J PHYS CHEM B》，《 LANGMUIR》，《 MACROMOLECULES》，《ORG LETT》，《ORGANOMETALLICS》
SCI期刊分为一区、二区、三区、四区。一区与、二区是国际期刊级别比较高的，三区与四区就相对要级别低些。
无论是哪一类分区，sci期刊都是划分为四个区，都是按照影响因子高低进行的划分，影响因子由一区至四区递减，一区最高，四区最低，所以，sci期刊中一区期刊学术价值和影响力是最大的，四区期刊在sci期刊中就是综合实力最弱的期刊。 对于作者来说，期刊分区越高，期刊的发表难度越大，一区期刊必然比四区期刊难以发表，一般普通作者很难发表一区期刊，能发表二区期刊对于国内作者来说就已经实属不易了，三区四区相对容易一些，但也只是相对于一区二区期刊，即便是四区期刊，也比国内核心期刊的发表难度高出不少。
GoingPub 最新SCI期刊查询及分析系统（2018-2019年）整理了最新SCI收录的详细信息，分属领域，研究方向，中科院SCI期刊分区等。可在这查 /journal/
将所有SCI期刊按影响因子排序，前5%是一区，前20%是二区一般SCI论文分四个区，一区都是国际顶级期刊，二区次之，
按学科分类的
一二三区是对期刊的分区。中国科学院文献情报中心按照期刊的影响因子，投稿难易程度和影响力分为1-4区。一区为顶级期刊，在自然科学领域有Nature，Science，Cell三大顶刊。
中科院自己划的。先是按学科，再按影响因子排列划分。SCI是美国《科学引文索引》的英文简称，[1]其全称为：Science Citation Index,，创刊于1961年，它是根据现代情报学家加菲尔德(Engene Garfield) 1953年提出的引文思想而创立的。时至今日加菲尔德仍是SCI主编之一。SCI是由ISI( Institute for Scientific Information I)美国科学情报所出版。现为双月刊。ISI除了出版SCI外，还有联机型据SCISEARCH。ISTP(Index to Scientific &Technical Proceeding)也由其出版。SCI是一部国际性索引，包括有：自然科学、生物、医学、农业、技术和行为科学等，主要侧重基础科学。所选用的刊物来源于94个类、40多个国家、50多种文字，这些国家主要有美国、英国、荷兰、德国、俄罗斯、法国、日本、加拿大等，也收录一定数量的中国刊物。SCI索引对科技工作者查阅最新文献、跟踪国际学术前沿、科研立项以及在具体的课题研究时及时了解国际动态都有很大帮助。