两者的内容不同:学术论文期刊是在某一学术课题具有的新的科学研究成果或创新见解和知识的科学记录,毕业论文(graduation study)是专科及以上学历教育为对本专业学生集中进行科学研究训练而要求学生在毕业前撰写的论文。两者的主体不同,毕业论文是学生写的,期刊论文是科学研究人员,包括学生写的。两者的时间不同,毕业论文的时间安排在修业的最后一学年(学期)进行,但是学术期刊论文没有限制时间。毕业论文目的在于培养学生的科学研究能力;加强综合运用所学知识、理论和技能解决实际问题的训练
简单点讲：由个人或者团队编写学术论文 -----之后被发布到相应期刊上----被更多人多看到-----当其他人需要发表类似的文章的时候，需要采用您的观点的时候 就需要提供参考文献，也就是您已经发表出去的这篇文章。所以三者就类似 一个金字塔 不断的去扩大自己相关行业的知识面。
学术论文：你的稿子期刊：你的稿子要刊登的地方文献：你稿子中部分知识信息的来源由“文献”综合你自己的知识理论产生了“学术论文”，最后发表在“期刊”上，就是这样相辅相成的三角恋关系（笑）。
首先你要写一篇文章，需要参考引用别人的观点，然后发表在期刊上。
学术论文：你的稿子期刊：你的稿子要刊登的地方文献：你稿子中部分知识信息的来源由“文献”综合你自己的知识理论产生了“学术论文”，最后发表在“期刊”上，就是这样相辅相成的三角恋关系（笑）。
两者的内容不同:学术论文期刊是在某一学术课题具有的新的科学研究成果或创新见解和知识的科学记录,毕业论文(graduation study)是专科及以上学历教育为对本专业学生集中进行科学研究训练而要求学生在毕业前撰写的论文。两者的主体不同,毕业论文是学生写的,期刊论文是科学研究人员,包括学生写的。两者的时间不同,毕业论文的时间安排在修业的最后一学年(学期)进行,但是学术期刊论文没有限制时间。毕业论文目的在于培养学生的科学研究能力;加强综合运用所学知识、理论和技能解决实际问题的训练
期刊跟论文的区别，期刊是指定期出版的刊物，论文是指专业方面的文章。论文可以发表在期刊上。
期刊论文正式出版的期刊上所刊载的学术论文。写作期刊论文的目的是为了交流。因此，我们需要用简洁明了的语言表达论文的核心思想。写出的论文应该能够被人们理解，即使那些不了解相关专业的人也能理解论文想解决什么样的问题，使用的方法以及得出了什么结论。补充以下应当注意的俩点：
这个你看它发表到那个地方了，如果发表到期刊就是期刊［J］，如果是作者著作的内容就是著作［M］。
首先 论著是书，不是论文。发表在国家核心期刊上只能是论文。
从表面上看，没多大区别．尤其是医学方面的期刊，这两者连编辑都很难区分清楚． “论著”指的是“议论性著作”(《辞海))“带有研究性著作”(《汉语大词典扔;“论议和 著述，后来对议论性著作也称论著”(《辞源扔。而对“论文”的解释则是“讨论、研究某种问题的 文章，’(《汉语大词典》;“学术论文是较为系统地和专门讨论、研究某些学问的文章”(((写作教 程》，华东师范大学出版社出版);“科学论文应该论述一些重要的实验性的理论性的或观测性 的新知识，或者一些已知原理在实际应用中的进展情况”(((怎样写作科学论文)),美M·奥康纳 等著)。从以上这些对“论著”
full paper 也就是一般意义上的论文，篇幅较长，且内容充实，包括自己所提出的idea和详细的计算流程等。有的期刊paper的长度可达8000字，理工科一般一个完整的PAPAER要包括Title, abstract, key words, introduction, metohd and techniques, results, disscussion ,conclusion, ackonwledgement, reference 以及补充材料 supplement等等。其中还有很多图，表甚至有部分视频软件，能够较为完整的表述作者的想法。letter 是论文的微缩版，更为凝练，但是在不同领域letter 所占据的地位不同，有些letter实际上更为具有影响力，就像paper中的review有更高的引用次数和影响因子。一般篇幅2-4页，3000字左右（供参考，不同期刊要求不一样）。在letter中最重要的就是在有限篇幅中突出你的idea，其实也是一种功底的体现。SCI和NATURE也有letter，有些人认为letter不算SCI，实际上只要被SCI检索都算的。格式也比较随意。
学术期刊是正式公开出版的，论文集往往是内部交流用，很少正式出版。有些论文集也可以作为一本书或期刊的增刊正式出版。期刊按刊载内容可以分为：新闻类期刊、科普类期刊、休闲类期刊、知识类期刊、学术性期刊学术期刊应该是以刊载学术研究性论文或学术讨论性论文为主的期刊。
就是会议征收的文章结集出版。