区别在于权威性和质量的好坏。一区期刊是影响因子最高，学术价值最高，影响力最大的期刊，四区期刊就是四个区中影响因子最低的一类刊物。SCI分为几区，看影响因子大小，是国外比较成熟的科学论文评价体系，也在我们国内普遍采用。SCI即《科学引文索引》(Science Citation Index），是由美国科学信息研究所（Institute for Scientific Information 简称ISI）创建的，收录文献的作者、题目、源期刊、摘要、关键词，不仅可以从文献引证的角度评估文章的学术价值，还可以迅速方便地组建研究课题的参考文献网络。
一区刊是指各类期刊三年平均影响因子的前5%; 二区刊是指各类期刊三年平均影响因子的前6%—20%; 三区刊是指各类期刊三年平均影响因子的前21%—50%。sci几区中，影响力从高到低依次是一区、二区、三区和四区，投稿一区的sci论文，含金量最高，难度也最大。好的文章，可以挑战高分区，而相对一般的文章，考虑低分区，即作者要根据文章的实际情况量力而行。另外，sci期刊录用文章起点是很高的，若连四区的sci都不达标，那说明文章还达不到发表sci的标准。作者要不提高写作文章的质量，要不找更低级别的期刊投稿发表。
sci一区是国际顶级期刊,一区刊是指各类期刊三年平均影响因子的前百分之五,相当于体育界的国际冠军,代表发表者的科研水平达到了本专业中的最高水平。 sci是当代世界最为重要的大型数据库,被列在国际六大著名检索系统之首。它不仅是重要的检索工具书,也是科学研究成果评价的一项重要依据。
区期刊不论是jcr分区的一区，还是中科院的一区，只要是一区期刊，都是国际上知名的学术期刊，这部分期刊发表难度是非常大的，也不是任何人都可以发表的，对于普通作者来说，是非常困难的，且不说文章难写，对作者身份职务可能都会有一定门槛，一区期刊是不适合不同作者发表的，一般能发表一区的都是一些专家学者、知名大学教授、或者一些在本专业内有一定影响力的科研工作者。 二区期刊仅次于一区期刊，二区sci期刊国内作者发表的就相对多一些了，目前国内一些标准中明确要求发表二区及以上期刊，所以二区是很多国内作者的首选，二区期刊发表难度略小，但也要看具体的学科和具体的期刊，一般的规律是二区期刊较一区期刊容易一些。 三区四区期刊的发表难度就会更低一些，但三区四区期刊在国内有些许争议，就是因为上述我们提到的硬性要求，有些单位和高校是不认可二区以下的刊物的，因此，很多作者会认为三区四区刊物不值得发表，没有发表价值，其实对于大多数普通作者来说，只要能发表sci论文就已经实属不易了，国内也有很多单位只要是sci论文就认可，对分区，没有过多要求，这种情况下三区四区期刊也是可以发表的。
按照美国信息研究所每年公布的JCR期刊影响因子分区情况，将SCI收录同一学科中的期刊按影响因子从高到低进行排序。学科影响因子前5%的期刊为An1区期刊，学科影响因子前20%为An2区期刊，学科影响因子前50%的3区为An3区期刊；学科影响因子后50%的为An4区期刊；EI收录核心期刊源为An5区期刊，在以上分区中所对应的’期刊上发表的论文分别称为An1类、An2类、An3类、An4类和An5类的论文。
按照美国信息研究所每年公布的JCR期刊影响因子分区情况，将SCI收录同一学科中的期刊按影响因子从高到低进行排序。学科影响因子前5%的期刊为An1区期刊,学科影响因子前20% 为An2区期刊，学科影响因子前50%的3区为An3区期刊；学科影响因子后50%的为An4区期刊；EI收录核心期刊源为An5区期刊，在以上分区中所对应的期刊上发表的论文分别称为An1类、An2类、An3类、An4类和An5类的论文。