大局已明，群体性过度恐慌是最大的病毒
解筱文
中国的事情，怕就怕走极端，群体性忽左忽右。老祖宗的大智慧告诉我们，不偏不倚，恰到好处，方可长盛不衰。新冠肺炎初期，疾控部门和地方政府隐情不实报，大事化小，以常规手段“冷处理”，向外传达的信息是 “人不传人”“可防可控”，结果事与愿违，造成后患，损失巨大，拖累全民买单。
而当疫情真相大白后，又急剧转到另一个极端。凡是涉及该病毒对人产生影响的可能被不断抛出，诸如眼睛结膜传播、粪口传播、人与人15秒可传染、气溶胶传播、潜伏期最长可达24天、病毒不怕炎热湿润天气等等观点，一些观点缺乏实证性数据支撑或为极小概率的可能。
也许很多观点的出发点都是好的，但是在今天这样异常发达的新媒体时代，这些新闻信息的极速扩散和聚合，让相当一部分群众心生恐慌。虽然一些观点也被后来辟谣，但受制于之前“人不传人”误导，很多人还是“宁可信其有”。这个时期，比病毒更可怕的其实是群体性过度恐慌。过度恐慌究其根本，其实是我们对此不知底细的恐惧。
当然，生命至上，每一个鲜活的生命都应该得到珍爱，不在灾难中的个体，很难体会到患者被病魔的折磨，很难体会到医护等一线人员的艰辛努力。对于他们，特别是患者，一定会有恐慌，特别是面对死亡的恐惧。但是，更多远离灾难发生地的个体，除了报以悲悯和同情，而无能为力之时，就应该更好的求生，心向美好，看到更多希望。
让我们看一组组数据分析，这些数据的背后都是鲜活的生命，将此类比，虽有悖我们的情感，但是可以让更多的生者，以更加理性的心态面对，积极消融恐慌，科学坦然应对，主动参与抗击。
截至2月14日16时30分，全国感染新冠肺炎累计确诊病例63940人，死亡病例1381人，全国确诊病死率为2.16%；武汉累计确诊病例35991人，死亡病例1016人，病死率2.82%；湖北省确诊病例51986人，死亡病例1318人，病死率2.54%；外省市区，确诊病例人数排第二的广东省，累计确诊1261人，死亡病例2人，病死率0.16%,北京市累计确诊病例372人，死亡病例3人，病死率0.08%。作为新冠肺炎发病原点城市，武汉市截至2019年末，户籍人口及流动人口共计1400多万人。按照累计确诊病例35991人计算，确诊概率2.5‰，病死率7.3/十万。如果将由武汉发病而非武汉确诊就医人数统计在内（非武汉地区确诊和死亡的人数以50%计），确诊率2.86‰，病死率1.35/十万。而2018年，武汉市自然死亡人口4.79万人，死亡率5.51‰。远离武汉的北京市，2018年末常住人口 2154.2 万人，全年人口死亡率 5.58‰，1998至2017年的20年间，一直在5‰左右。从中可见，新冠肺炎被确诊的概率、病死概率远低于自然死亡率。
再根据国家卫健委法定传染病疫情数据，2018年全国（不含香港、澳门特别行政区和台湾地区）共报告法定传染病发病7770749例，死亡23377人。其中，呼吸道传染病发病死亡3163人，血源及性传播传染病死亡19332人。也就是当年呼吸道传染病年死亡人数超过目前的新冠肺炎死亡人数，并且艾滋病等血源性传播传染病死亡人数远高于呼吸道传染病发病人数。
实事求是地讲，新冠肺炎确实存在难治疗、难防控，但是不代表不能防控和不能治疗。我认为，它一定有其规律，必然遵循我们已知的三个基本科学常识，即：随距递减原则、能量有限原则、能量守恒定律。如果这个病毒传播超越这三条常识，那么人类现在的科学认知恐怕要彻底颠覆！
第一，随距递减。该病毒作为一种物质，它的传播会随着离传播源的距离越来越远而逐渐递减。也就是我们现在所做的各种隔离措施，拉大或阻断病毒传播距离。从地域看，原发地产生的患者，其病毒携带能量和传播力肯定远高于第二次及第三次等传播者，病毒能量总体处于层层衰减状态。这也就是在同条件下，源发患者病重，而二次传播患者较轻的缘故。这也就是专家所讲的，抗击的最后，病毒不断衰减，越来越弱，变成流感，最终人体适应性增强。看到这里，可能有人会说，该病毒在传播中产生新的种种变异，若与其他物质结合，产生更大威力的病毒，我们怎么办？我想说，如果说该病毒是自然进化而来的，那么它距离上一次类似影响的“非典”才17年，这样的概率就又一次发生在中国，已经令人称奇了，如果在传播中还能短时期再变异成更厉害的病毒，那么不是某些人类有问题，就是大自然已经对这个星球失望了。
第二，能量有限。对于患者个体而言，无论是病毒“超级个体”，还是“普通携带者”，其携带的病毒总量有大小，但是一定是有限的，所散发传播的病毒量是一定的，绝不可能是无限度的。中国疾控中心、北京微生物流行病研究所等机构学者对截至1月26日30个省的8866例病例进行分析，日前发表的研究论文《2019年中国新型冠状病毒感染的流行病学和临床特征》中表明，新冠病毒（SARS-CoV-2）的基本传染数R0估值为3.77（基本传染数R0指的是在流行病学上，在没有外力介入，同时所有人都没有免疫力下降情况下，一个感染到某种传染病的人会把疾病传染给其他多少个人的平均数）。对于社会大众，如果不能正确理性认知把握，当看到诸如媒体报道，某商场确诊一名患者，数千名群众居家隔离等消息，难免不引起更大恐慌。
第三，能量守恒。病毒作为一种物质，它必然既不会凭空产生，也不会凭空消失，只能从一个载体传递给另一个载体，而且能量形式可以互相转换。无论西医，还是中医，或者中西医结合治疗方案，就新冠肺炎的病毒这种物质而言，其本身并不能消失，而是物质形态和能量形态的转换。病急处，西医主杀毒；病缓处，中医主调养转换。最终，不管是人工病毒，还是自然进化病毒，都要被人体适应，包容转换，和平相处。所以，一味地杀毒，并不是源头和系统治病和抗击。从发病源头的武汉和广州等医院的治疗效果看，中医为主，中西医结合的治疗方案更佳。这对于治愈二次以上传播患者，以及其他地域非重症患者，中医将可以更大发挥优势，这意味着在实质性西医治疗药物以及疫苗未问世之时，我们可以用自己的看家本领预防和治疗新冠病毒肺炎，以护佑更多人的健康，或许将探索出更多可能。
从上可见，我们无疑就没有更多理由过度恐慌。其实，群体性过度恐慌比新冠肺炎病毒更为可怕。因为恐慌，新闻发布中，官员数据反复出错、专家口误，这样必然影响决策；因为恐慌，社区人员，丢下送医的患者，让其在寒夜里不知所措，这样必然伤害群众感情；因为恐慌，加剧防控矛盾，造成人群对立，并且一些群众缺乏科学常识，如有人酒精消毒不慎，引发火灾等等，这样必然造成不必要的次生灾难和社会矛盾。
从公开的数据预判抗击新冠肺炎的周期，迎来拐点，全面制胜，绝非短期可以实现，在这个过程中，更多的人需要强大的心理和决胜的定力，做好持久抗击准备。
截至2月14日16时30分，全国感染新冠肺炎的确诊人数是63943人，较昨日增加3698人；疑似病例10109人，较昨日增加2450人，治愈病例6928人，较昨日增加1282人。按照2月14日以来数据保守估算，从现在开始即使每天平均治愈出院2000人，最快治愈存量患者，最少需要27.8天时间，假设这27.8天内，每天确认患者平均又新增1000人。那么，还需要13.9天，这一共则需要41.7天。假设41.7天后，再基本无疫情上报。那么，从现在算起，最快全面打赢阻击战，应该是3月底，当然这是理想状态，也是极为乐观的期望。参考与之相似的“非典”，曾持续大半年才全面搞定，而新冠肺炎从目前看，危害影响远大于“非典”，折中考虑，也应该在4月底或5月初。
虽然抗击新冠肺炎疫情的周期较长，但是就在2月13日三件大事，值得我们注意，也预示着正迎来曙光。
2月13日早上发布的疫情数据中，湖北新增新冠肺炎病例14840例，其中新增“临床诊断病例13332例”。也就是湖北地区将新冠肺炎病例定义为实验室确诊或临床诊断确诊，这可以让病源集中地的更多感染者得到及时有效的隔离救治，防止了不必要的扩散，最重要的是盘清了患者底数。
2月13日上午，湖北省、武汉市两级党委一把手同时被调整，新的地方主要领导力量及时到位，这表明上面对疫情局势已有充分把握，对打赢疫情防控阻击战意志更加坚定。
2月13日晚，中国生物宣布已完成对部分康复者血浆的采集工作，成功制备出用于临床治疗的特免血浆。目前用康复者特异血浆临床治疗11例危重病人，治疗效果显著。这也就意味着，更多的新冠肺炎重症患者病情有望由重转轻，病死率进一步降低。
所以，综上所述，我们应该具有科学的判断和认知，战略上藐视，战术上重视，减少广大人民群众无谓恐慌。持续保持冷静、理性的心态，积极主动作为，坚持“两条腿”走路，注重科学防范，有序复工复产，尽可能降低疫情对经济的影响，争取早日全力歼灭。
因为，集体性的过度恐慌会加重全社会的焦虑，放大病毒的狡猾和可怕，让事情变得更糟糕。
解筱文：战略学者。主评时政、商业、铁路、文化。
石正丽在武汉担任中国科学院武汉病毒研究所新发传染病研究中心主任。
苟利国家生死以，岂因祸福避趋之。这句话是子产在饱受争议之时说出来的。在2020年新冠疫情肆虐之时，武汉也出现了一位像子产这样的人物。因为一些谣言她饱受争议，可是，她并没有放弃自己的责任，反而继续奋斗在一线，为新冠疫情的防控工作作出了突出的贡献。
2021年，国家为了表彰她突出的贡献，奉上了“中国科学院先进工作者”的荣誉，而这个人就是石正丽。
1，“不让须眉”石正丽
1964年，石正丽出生在河南西峡，从小她学习就比较优秀，后来考上了武汉大学遗传学专业。大学毕业之后，石正丽选择继续深造，经过了几年的努力，她又拿到了中国科学院武汉病毒研究的硕士研究生文凭。
从武汉研究所毕业后，石正丽便留在了这里工作，一干就是21年。那一年，石正丽从病毒研究所最基层的“实习人员”做起，随后又做到了助理研究员、副研究人员。
工作期间，石正丽尽职尽责，与此同时她也没有放弃自己对知识的追求。1996年，她曾到法国蒙彼利埃第二大学病毒学专业修博士学位，最终以优异的成绩拿到了博士学位。
2000年，石正丽在武汉病毒研究所已经工作了十年，她通过自己的努力成为了武汉病毒研究所分子病毒研究室的主任。在此后的十几年中，石正丽一直在带领着她的团队为“国家新发传染病防控”做研究，通过不懈的努力，他们在蝙蝠身上有了重大的发现。
随后，石正丽及其团队将研究对象放到了“蝙蝠携带的病毒”上，在这个领域获得了一系列重要的科学发现，为我国的传染病防控事业做出了突出的贡献。为了表彰石正丽的贡献，国家给她颁发了自然科学二等奖，这样的荣誉在国内很有“含金量”。然而，这样一个默默付出的人，却在2020年遭到了谣言的困扰。
2，谣言的可怕
2020年，新冠病毒开始肆虐全球。当年2月份，石正丽发表了一篇与新冠病毒有关的论文，论文的大致意思是：“新冠病毒的来源可能与蝙蝠有关系”。后来，一些“有心人”搜索到了石正丽五年前发布的一篇文章《一个类似SARS的蝙蝠冠状病毒群显示了人类出现的可能性》。
在这之后，“武汉病毒研究所实验室泄露病毒”的谣言便肆虐开来，印度学者就曾在bioRxiv杂志上发过文章表达自己的质疑。对此，石正丽发文称：“新冠是大自然的一种惩罚，与我们实验室没有任何的关系，我敢用生命打包票，造谣的人请闭上你们的嘴巴。”
病毒这种东西的可怕想必很多人都清楚，虽然石正丽已经发文澄清了，但是相信她的人却非常少。因此，三人成虎之下，石正丽被送上了舆论的风口浪尖之上，备受网友的猜测和质疑。
当时，甚至有传言称：“石正丽已经准备在外逃，她将会带着她的家人和近千份文件向美国方面求助”。网络谣言有多可怕，不言而喻！面对着这些铺天盖地的谣言，石正丽二度在微博上发文澄清：“不管遇到什么样的困难，我都不会叛逃，我相信一定会有水落石出的那一天。”
在那段时间里，石正丽及其研究所可谓是饱受质疑，然而他们并没有放下自己的责任，多说不如多做！新冠疫情肆虐时期，石正丽多次前往华南海鲜市场调查，为的就是能够取到样本做研究，以求尽快找到新冠疫情的解决办法。
当时，石正丽面对媒体的采访表示：“这阵好了一点，前一阵把我们骂死了，因为我们所做的点与他们的所想的点不在一条线上，所以很容易产生误解。”“有时候并不是我们不愿意解释，而是我们所说的每一句话都要有数据研究作为基础，没有这些东西我们不能乱说，之前发出那样的言论也是情急之下说的。”对于之前的各种谣言，她依然心有余悸：“我已经领教了，我现在害怕。”
3，守得云开见月明
随着事情的推移，新冠疫情得到了暂时的控制，真相也逐渐浮出了水面。彼时，世界卫生组织的研究表明：“新冠病毒的确与武汉研究所无关，它们的来源是自然界。”
终于，世卫组织还了武汉研究所一个清白。不过，对于这些东西石正丽并没有表现出太多的在意，她依然在夜以继日地奋战，带领着她的团队争取在最短的时间内完成各种实验检测任务。
经过了上百天的奋战，石正丽及其团队终于取得了重大性突破，随后又积极参与到了疫苗研制、试剂研制的工作中去了。2021年1月份，武汉研究所、我国疾控中心、医科院率先向世界卫生组织递交了各种关于新冠病毒的资料，让这个成果实现了全球共享，为全世界新冠疫情的防控工作做出了重大的贡献！
守得云开见月明：
回想2020年新冠疫情肆虐之初，石正丽饱受很多人的质疑，甚至有人还造谣她要叛国，如今正如她所说的那样：“守得云开见月明”。
为了表彰石正丽在新冠疫情上做出的突出贡献，2021年，在中科院举行的年度总结大会上，研究员石正丽荣获“中国科学院先进工作者”称号。纵览石正丽在病毒防控方面的研究，她的成绩可用“硕果累累”来形容：900多个国家级项目、国际杂志上发表过近200篇论文……在病毒领域方面，石正丽是一个非常权威的专家，在国际上也享有盛誉，这个称号绝对是实至名归的，也是对她过去一年工作的高度认可。
正如一句话所说的那样：“那有什么岁月静好，只是有人在为你负重前行罢了”。感谢我们拥有像石正丽这样的研究人员，他们承受了不该承受的东西，可是却没有忘记自己的责任，值得尊重！
以上内容参考：百度百科-石正丽
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伴随着科技日新月异的发展推动着社会在不断的进步,人们的生活水平也逐渐提高，所有的事物都是有两面性的。计算机带给我们带来方便的同时,也给我们带来了安全问题。下面是我为大家整理的有关计算机病毒论文，供大家参考。
计算机这一科技产品目前在我们的生活中无处不在，在人们的生产生活中，计算机为我们带来了许多的便利，提升了人们生产生活水平，也使得科技改变生活这件事情被演绎的越来越精彩。随着计算机的广泛应用，对于计算机应用中存在的问题我们也应进行更为深刻的分析，提出有效的措施，降低这种问题出现的概率，提升计算机应用的可靠性。在计算机的广泛应用过程中，出现了计算机网路中毒这一现象，这种现象的存在，对于计算机的使用者而言，轻则引起无法使用计算机，重则会导致重要资讯丢失，带来经济方面的损失。计算机网路中毒问题成为了制约计算机网路资讯科技发展的重要因素，因此，对于计算机网路病毒的危害研究，目前已经得到人们的广泛重视，人们已经不断的对计算机网路病毒的传播和发展建立模型研究，通过建立科学有效的模型对计算机网路病毒的传播和发展进行研究，从中找出控制这些计算机网路病毒传播和发展的措施，从而提升计算机系统抵御网路病毒侵害，为广大网民营造一个安全高效的计算机网路环境。
一、计算机病毒的特征
***一***非授权性
正常的计算机程式，除去系统关键程式，其他部分都是由使用者进行主动的呼叫，然后在计算机上提供软硬体的支援，直到使用者完成操作，所以这些正常的程式是与使用者的主观意愿相符合的，是可见并透明的，而对于计算机病毒而言，病毒首先是一种隐蔽性的程式，使用者在使用计算机时，对其是不知情的，当用户使用那些被感染的正常程式时，这些病毒就得到了计算机的优先控制权，病毒进行的有关操作普通使用者也是无法知晓的，更不可能预料其执行的结果。
***二***破坏性
计算机病毒作为一种影响使用者使用计算机的程式，其破坏性是不言而喻的。这种病毒不仅会对正常程式进行感染，而且在严重的情况下，还会破坏计算机的硬体，这是一种恶性的破坏软体。在计算机病毒作用的过程中，首先是攻击计算机的整个系统，最先被破坏的就是计算机系统。计算机系统一旦被破坏，使用者的其他操作都是无法实现的。
二、计算机病毒网路传播模型稳定性
计算机病毒网路的传播模型多种多样，笔者结合自身工作经历，只对计算机病毒的网路传播模型———SIR模型进行介绍，并对其稳定性进行研究。SIR模型的英文全称为Susceptible-Infected-Removed，这是对SIS模型的一种改进，SIR模型将网路中的节点分为三种状态，分别定义为易感染状态***S表示***和感染状态***I***状态，还有免疫状态***R***表示，新增加的节点R具有抗病毒的能力。因此，这种模型相对于传统的SIS模型而言，解决了其中的不足，也对其中存在的病毒感染进行了避免，而且阻碍了病毒的继续扩散。图一即为病毒模型图。
三、计算机病毒网路传播的控制
对于计算机病毒在网路中的传播，我们应依据病毒传播的网路环境以及病毒的种类分别进行考虑。一般而言，对于区域网的病毒传播控制，我们主要是做好计算机终端的保护工作。如安装安全管理软体;对于广域网的病毒传播控制，我们主要是做好对区域网病毒入侵情况进行合理有效的监控，从前端防止病毒对于广域网的入侵;对于***病毒传播的控制，我们确保不随意点选不明邮件，防止个人终端受到***病毒的入侵。
总结：
网路技术的飞速发展，促进了计算机在社会各方面的广泛应用，不过随着计算机的广泛应用，计算机病毒网路传播的安全问题也凸显出来。本文对计算机网路病毒传播的模型进行研究，然后提出控制措施，希望在入侵者技术水平不断提高的同时，相关人士能积极思考研究，促进计算机病毒防护安全技术的发展，能有效应对威胁计算机网路安全的不法活动，提升我国计算机网路使用的安全性。
0引言
如今，资讯网际网路的软硬技术快速发展和应用越来越广，计算机病毒的危害也越来越严重。而日益氾滥的计算机病毒问题已成为全球资讯保安的最严重威胁之一。同时因为加密和变形病毒等新型计算机病毒的出现，使得过去传统的特征扫描法等反毒方式不再有效，研究新的反病毒方法已刻不容缓。广大的网路安全专家和计算机使用者对新型计算机病毒十分担忧，目前计算机反病毒的技术也在不断更新和提高中，却未能改变反病毒技术落后和被动的局面。我们从网际网路上的几款新型计算机病毒采用的技术和呈现的特点，可以看得出计算机病毒的攻击和传播方式随着网路技术的发展和普及发生了翻天覆地的变化。目前计算机病毒的传播途径呈现多样化，比如可以隐蔽附在邮件传播、档案传播、图片传播或视讯传播等中，并随时可能造成各种危害。
1目前计算机病毒发展的趋势
随着计算机软体和网路技术的发展，资讯化时代的病毒又具有许多新的特点，传播方式和功能也呈现多样化，危害性更严重。计算机病毒的发展趋势主要体现为：许多病毒已经不再只利用一个漏洞来传播病毒，而是通过两个或两个以上的系统漏洞和应用软体漏洞综合利用来实现传播;部分病毒的功能有类似于黑客程式，当病毒入侵计算机系统后能够控制并窃取其中的计算机资讯，甚至进行远端操控;有些病毒除了有传播速度快和变种多的特点，还发展到能主动利用***等方式进行传播。通过以上新型计算机病毒呈现出来的发展趋势和许多的新特征，可以了解到网路和电脑保安的形势依然十分严峻。
2计算机病毒的检测技术
笔者运用统计学习理论，对新计算机病毒的自动检测技术进行了研究，获得了一些成果，下面来简单介绍几个方面的研究成果。
2.1利用整合神经网路作为模式识别器的病毒静态检测方法
根据Bagging演算法得出IG-Bagging整合方法。IG-Bagging方法利用资讯增益的特征选择技术引入到整合神经网路中，并通过扰动训练资料及输入属性，放大个体网路的差异度。实验结果表明，IG-Bagging方法的泛化能力比Bagging方法更强，与AttributeBagging方法差不多，而效率大大优于AttributeBagging方法。
2.2利用模糊识别技术的病毒动态检测方法
该检测系统利用符合某些特征域上的模糊集来区别是正常程式，还是病毒程式，一般使用“择近原则”来进行特征分类。通过利用这种新型模糊智慧学习技术，该系统检测准确率达到90%以上。
2.3利用API函式呼叫短序为特征空间的自动检测方法
受到正常程式的API呼叫序列有区域性连续性的启发，可以利用API函式呼叫短序为特征空间研究病毒自动检测方法。在模拟检测试验中，这种应用可以在检测条件不足的情况下，保证有较高的检测准确率，这在病毒库中缺少大量样本特征的情况下仍然可行。测验表明利用支援向量机的病毒动态检测模可能有效地识别正常和病毒程式，只需少量的病毒样本资料做训练，就能得到较高的检测精准确率。因为检测过程中提取的是程式的行为资讯，所以能有效地检测到采用了加密、迷惑化和动态库载入技术等新型计算机病毒。
2.4利用D-S证据理论的病毒动态与静态相融合的新检测方法
向量机作为成员分类器时，该检测系统研究支援病毒的动态行为，再把概率神经网路作为成员分类器，此时为病毒的静态行为建模，再利用D-S证据理论将各成员分类器的检测结果融合。利用D-S证据理论进行资讯融合的关键就是证据信度值的确定。在对实际问题建模中，类之间的距离越大，可分性越强，分类效果越好，因此得出了利用类间距离测度的证据信度分配新病毒检测方法。实验测试表明该方法对未知和变形病毒的检测都很有效，且效能优于常用的商用反病毒工具软体。
2.5多重朴素贝叶斯演算法的病毒动态的检测系统
该检测系统在测试中先对目标程式的行为进行实时监控，然后获得目标程式在与作业系统资讯互动过程中所涉及到的API函式相关资讯的特征并输入检测器，最后检测器对样本集进行识别后就能对该可疑程式进行自动检测和防毒，该法可以有效地检测当前越来越流行的变形病毒。3结语新型未知计算机病毒发展和变种速度惊人，而计算机病毒的预防和检测方法不可能十全十美，出现一些新型的计算机病毒能够突破计算机防御系统而感染系统的现象不可避免，故反计算机病毒工作始终面临巨大的挑战，需要不断研究新的计算机病毒检测方法来应对。
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日本东京大学Umeharu Ohto和日本京都大学Norimichi Nomura团队共同合作近期取得重要工作进展。他们研究发现胆汁酸转运蛋白NTCP的结构对乙型肝炎病毒进入至关重要。该项研究成果2022年5月17日在线发表于《自然》杂志上。 在这里，研究人员报告了人类、牛和大鼠NTCPs在apo状态下的低温电子显微镜（cryo-EM）结构，它揭示了跨膜隧道的存在和底物的可能运输途径。 此外，人类NTCP在LHBs的肉豆蔻酰化preS1结构域存在下的低温电镜结构以及突变和运输试验分析表明了一种结合模式，即preS1和底物竞争NTCP中细胞外通道的开口。重要的是，preS1域相互作用分析能够对人类NTCP中自然发生的HBV不敏感突变进行机理解释。综上所述，他们的研究结果为HBV识别和哺乳动物NTCPs对钠依赖性胆汁酸易位的机制的理解提供了结构框架。 据介绍，慢性乙型肝炎病毒 (HBV) 感染在全球影响超过2.9亿人，是肝硬化和肝细胞癌的主要原因，估计每年导致82万人死亡。HBV感染的建立需要病毒包膜糖蛋白L(LHBs)与宿主进入受体钠-牛磺胆酸共转运多肽(NTCP)之间的分子相互作用，NTCP是一种从血液到肝细胞的钠依赖性胆汁酸转运蛋白。然而，目前对于病毒-转运蛋白相互作用分子基础尚不清楚。 Source: 美国加州大学Arash Komeili研究小组在研究中取得进展。他们发现不同基因簇诱导细菌铁小体细胞器的形成。2022年5月18日出版的《自然》发表了这项成果。 在本研究中，研究人员发现一个与铁结合的隔室，在此命名为“铁小体”，是之前在厌氧细菌磁性脱硫弧菌中发现的。使用蛋白质组学方法，研究人员鉴定了三种铁小体相关(Fez)蛋白，它们在D. magneticus中参与形成铁小体。Fez蛋白由特定的操纵子编码，包括FezB，FezB是在系统发育和代谢不同的细菌和古细菌中发现的P1B-6-ATP酶。研究人员揭示了另外两种细菌物种，Rhodopseudomonas palustris和Shewanella putrefaciens，通过其六基因fez操纵子产生铁小体。 此外，研究发现fez操纵子还可以在外来宿主中形成铁小体。使用S. putrefaciens作为模型，研究表明铁小体可能在厌氧适应铁饥饿中发挥作用。总体而言，该工作发现铁小体可能是一类新的铁储存细胞器，并为研究它们在多种微生物中的形成和结构奠定了基础。 据了解，细胞内铁稳态对于机体至关重要，通过严格调节铁的输入、流出、储存和代谢来维持铁稳态。最常见的铁储存模式使用蛋白质隔室，例如铁蛋白和相关蛋白质。尽管发现了脂质结合的铁隔室，但它们的形成和功能基础仍然未知。 Source: 美国德克萨斯大学西南医学中心Peter M Douglas研究组发现小G蛋白香叶酰化可监测细胞内脂质稳态。2022年5月18日出版的《自然》杂志发表了这项成果。 他们描述了一种在秀丽隐杆线虫中进行细胞内脂质监测的机制，该机制涉及核激素受体 NHR-49 的转录失活，其通过与小 G 蛋白 RAB-11.1 结合的香叶基香叶酯结合到内吞囊泡进行胞质隔离。由脂质消耗引起的有缺陷的从头类异戊二烯合成限制了 RAB-11.1 香叶基香叶酰化，这促进了 NHR-49 的核易位和 rab-11.2 转录的激活，以增强转运蛋白在质膜上的驻留。因此，他们鉴定了一种细胞可感知的关键脂质，及与其相连 G 蛋白和核受体，它们的动态相互作用使细胞能够感知由于脂质消耗引起的代谢需求，并通过增加营养吸收和脂质代谢来做出反应。 据悉，脂质稳态失衡会对健康产生有害影响。然而，细胞如何感知由于脂质消耗导致的代谢需求并通过增加营养吸收做出反应仍不清楚。 Source: 英国牛津大学Sebastian M. Shimeld研究组探明Hmx基因保留确定了脊椎动物颅神经节的起源。2022年5月18日出版的《自然》杂志发表了该项成果。 他们表明同源盒转录因子 Hmx 是脊椎动物感觉神经节发育的组成成分，并且在小肠绦虫中，Hmx 是驱动双极尾神经元分化程序所必要且充分的，这些细胞以前被认为是神经嵴的同源物。使用绦虫和七鳃鳗转基因，他们证明了茎-脊椎动物谱系中，一个独特的、串联重复的增强子对调节的 Hmx 表达。他们还在绦虫中展示了明显强大的脊椎动物 Hmx 增强子功能，表明上游调控网络的深度保留跨越了脊椎动物的进化起源。这些实验证明了绦虫和脊椎动物 Hmx 之间的调节和功能保护，并指出双极尾神经元是颅感觉神经节的同源物。 研究人员表示，脊椎动物的进化起源包括与掠夺性生活方式的获得相关的感官处理方面的创新。脊椎动物通过由颅感觉神经节服务的感觉系统感知外部刺激，其神经元主要来自颅基板；然而，由于活体谱系之间的解剖学差异以及细胞类型和结构之间的同源性分配困难，阻碍了对基板和颅感觉神经节进化起源的理解。 Source: 美国斯坦福大学Anthony E. Oro团队近期取得重要工作进展。他们研究发现Gibbin中胚层调节模式上皮细胞的发育。该项研究成果2022年5月18日在线发表于《自然》杂志上。 在这里，研究人员鉴定了由Xia-Gibbs AT-hook DNA-binding-motif-containing 1（AHDC1）疾病基因编码的蛋白质Gibbin，它是早期上皮形态发生的关键调节因子。他们发现增强子或启动子结合的Gibbin与数十种序列特异性锌指转录因子和甲基-CpG 结合蛋白相互作用，以调节中胚层基因的表达。Gibbin的缺失导致GATA3依赖性中胚层基因的DNA甲基化增加，导致发育中的真皮和表皮细胞类型之间的信号通路的缺失。 值得注意的是，Gibbin突变的人类胚胎干细胞衍生的皮肤类器官缺乏真皮成熟，导致表达p63的基底细胞具有缺陷的角质形成细胞分层。体内嵌合CRISPR小鼠突变体揭示了一系列Gibbin依赖性发育模式缺陷，这些缺陷影响了反映患者表型的颅面结构、腹壁闭合和表皮分层。他们的结果表明，在Xia–Gibbs和相关综合征中看到的模式表型源于基因特异性 DNA甲基化决定而导致的异常中胚层成熟。 据介绍，在人类发育过程中正确的外胚层模式需要先前确定的转录因子，如GATA3和p63，以及来自区域中胚层的位置信号。然而，外胚层和中胚层因子对稳定基因表达和谱系定型的机制仍不清楚。 Source: 美国纪念斯隆-凯特琳癌症中心Vinod P. Balachandran等研究人员合作发现，新抗原质量可预测胰腺癌幸存者的免疫编辑。相关论文于2022年5月19日在线发表在《自然》杂志上。 研究人员表示，癌症免疫编辑是癌症的一个标志，它预示着淋巴细胞会杀死更多的免疫原性癌细胞，使免疫原性较低的克隆体在群体中占主导地位。虽然在小鼠身上得到证实，但免疫编辑是否在人类癌症中自然发生仍不清楚。 为了解决这个问题，研究人员调查了70个人类胰腺癌在10年内是如何演变的。研究人员发现，尽管有更多的时间积累突变，但罕见的胰腺癌长期幸存者在原发肿瘤中具有更强的T细胞活性，其复发肿瘤的遗传异质性较低，免疫原性突变（新抗原）较少。为了量化免疫编辑是否是这些观察结果的基础，研究人员通过两个特征来推断了新抗原是否具有免疫原性（高质量），这基于新抗原与已知抗原相似性的"非自体性"，以及基于新抗原与野生型肽相比不同地结合到MHC或激活T细胞所需的抗原性距离的"自体性"。利用这些特征，研究人员估计癌症克隆的适应性是T细胞识别高质量新抗原的总成本被致癌突变的收益所抵消。 通过这个模型，研究人员预测了肿瘤的克隆进化，并发现胰腺癌的长期幸存者会发展出具有较少高质量新抗原的复发性肿瘤。因此，研究人员展示了人类免疫系统自然编辑新抗原的证据。此外，研究人员提出了一个模型来预测免疫压力是如何诱导癌细胞群随时间演变的。更广泛地说，这些研究结果表明，免疫系统从根本上监督宿主的基因变化来抑制癌症。 Source: 美国斯坦福大学Mark J. Schnitzer、Sadegh Ebrahimi等研究人员合作揭示感觉皮质编码和区域间通信的新兴可靠性。2022年5月19日，国际知名学术期刊《自然》在线发表了这一成果。 研究人员对小鼠执行视觉辨别任务的8个新皮层区域的神经元活动同时进行了5天的成像，产生了超过21000个神经元的纵向记录。分析显示，整个新皮层的事件序列从静止状态开始，到感知的早期阶段，并通过任务反应的形成。在静止状态下，新皮层有一种功能连接模式，通过共享活动共变的区域组来识别。在感觉刺激开始后约200毫秒内，这种连接重新排列，不同区域共享共变和任务相关信息。 在这个短暂的状态中（大约持续300毫秒），区域间的感觉数据传输和感觉编码的冗余都达到了顶峰，反映了任务相关神经元之间相关波动的短暂增加。刺激开始后约0.5秒，视觉表征达到一个更稳定的形式，其结构对单个细胞反应中突出的、逐日的变化是强大的。在刺激出现约1秒后，一个全局波动模式传达了小鼠对每个受检区域即将作出的反应，并与携带感觉数据的模式正交。 总的来说，新皮层通过在感知开始时感觉编码冗余的短暂提升、对细胞变异性稳健的神经群体编码以及广泛的区域间波动模式来支持感觉性能，这些模式以不干扰的渠道传递感觉数据和任务反应。 据了解，可靠的感觉辨别必须来自高保真的神经表征和脑区之间的交流。然而，新皮层感觉处理如何克服神经元感觉反应的巨大变异性仍未确定。 Source: 近日，美国斯坦福大学Jesse M. Engreitz及其团队的最新研究揭示人类增强子和启动子序列的相容性规则。相关论文于2022年5月20日在线发表在《自然》杂志上。 研究人员设计了一种名为ExP STARR-seq（增强子x启动子自转录活性调节区测序）的高通量报告试验，并应用它来研究人类K562细胞中1000个增强子和1000个启动子序列的组合相容性。研究人员确定了增强子-启动子兼容性的简单规则：大多数增强子以类似的数量激活所有启动子，内在的增强子和启动子的活动以倍数结合来决定RNA输出（R2=0.82）。 此外，有两类增强子和启动子显示出微妙的偏好效应。管家基因的启动子含有GABPA和YY1等因子的内置激活模体，这降低了启动子对远端增强子的反应性。表达不一的基因的启动子缺乏这些模体，对增强子表现出更强的反应性。总之，这种对增强子-启动子兼容性的系统评估表明，在人类基因组中，有一个由增强子和启动子类型调整的乘法模型来控制基因转录。 据了解，人类基因组中的基因调控是由远端增强子控制的，它能激活附近特定的启动子。这种特异性的一个模型是，启动子可能对某些增强子有序列编码的偏好，例如由相互作用的转录因子组或辅助因子介导。这种"生化兼容性"模型已被个别人类启动子的观察和果蝇的全基因组测量所支持。然而，人类增强子和启动子内在兼容的程度还没有得到系统的测量，它们的活动如何结合起来控制RNA的表达仍不清楚。 Source: 美国华盛顿大学医学院David J. Pagliarini和美国摩根里奇研究所Joshua J. Coon共同合作，近期取得重要工作进展。他们通过深度多组学分析来确定线粒体蛋白的功能。该项研究成果2022年5月25日在线发表于《自然》杂志上。 在这里，为了建立更完整的人类线粒体蛋白功能纲要，研究人员使用基于质谱的多组学分析方法分析了200多个CRISPR介导的HAP1敲除细胞系。这项工作产生了大约 830 万个不同的生物分子测量值，提供了对线粒体扰动的细胞反应的深入调查，并为蛋白质功能的机制研究奠定了基础。在这些数据的指导下，他们发现PIGY 游开放阅读框（PYURF）是一种S-腺苷甲硫氨酸依赖性甲基转移酶伴侣，它支持复合物I组装和辅酶Q生物合成，并且在以前未解决的多系统线粒体疾病中被破坏。 研究人员进一步将推定的锌转运蛋白SLC30A9与线粒体核糖体和OxPhos完整性联系起来，并将RAB5IF确定为第二个含有导致脑面胸腔发育不良的致病变异的基因。他们的数据可以通过交互式在线MITOMICS.app资源进行探索，表明许多其他孤儿线粒体蛋白的生物学作用仍然缺乏强大的功能表征，并定义了线粒体功能障碍的丰富细胞特征，可以支持线粒体疾病的基因诊断。 据了解，线粒体是真核生物新陈代谢和生物能学的中心。近几十年来的开创性努力已经确定了这些细胞器的核心蛋白成分，并将它们的功能障碍与150多种不同的疾病联系起来。尽管如此，数以百计的线粒体蛋白仍缺乏明确的功能，约40%的线粒体疾病的潜在遗传基础仍未得到解决。 Source: 美国加州大学洛杉矶分校Alcino J. Silva和Miou Zhou研究组合作揭示，C-C 趋化因子受体 5 (CCR5)可关闭记忆链接的时间窗口。相关论文发表在2022年5月25日出版的《自然》杂志上。 他们展示了CCR5（一种免疫受体，众所周知是 HIV 感染的共同受体）的表达延迟（12-24 小时）增加在环境记忆形成后决定时间窗口的持续时间，以便将该记忆与后续记忆关联或链接。小鼠背侧 CA1 神经元中 CCR5 的这种延迟表达导致神经元兴奋性降低，进而负调节神经元记忆分配，从而减少背侧 CA1 记忆集合之间的重叠。降低这种重叠会影响一个记忆触发另一个记忆的召回能力，因此关闭记忆链接的时间窗口。 他们的研究结果还表明，与年龄相关的 CCR5 及其配体 CCL5 的神经元表达增加会导致老年小鼠的记忆连接受损，这可以通过 Ccr5 敲除和美国食品和药物管理局（FDA）批准的药物逆转。抑制这种受体具有临床意义。总而言之，这里报道的研究结果提供了对塑造记忆链接时间窗口的分子和细胞机制的见解。 据介绍，现实世界的记忆是在特定的环境下形成的，通常不是孤立地获得或回忆的。时间是记忆组织中的一个关键变量，因为时间接近的事件更有可能有意义地关联，而间隔较长的事件则不是。大脑如何区分时间上不同的事件尚不清楚。 Source: 德国海德堡大学Rohini Kuner研究组发现错误连接和终末器官靶向异常可引起神经性疼痛。2022年5月25日出版的《自然》杂志在线发表了这项成果。 研究人员在神经损伤后超过10个月的时间里，以纵向和非侵入性地方式对基因标记的纤维群进行成像，这些纤维群在皮肤周围感知有害刺激（伤害感受器）和轻柔触摸（低阈值传入），同时跟踪这些小鼠与疼痛相关的行为。完全去神经支配的皮肤区域最初失去感觉，逐渐恢复正常敏感性，并在受伤几个月后出现明显的异常性疼痛和对轻触的厌恶。这种神经再支配引起的神经性疼痛与伤害感受器有关，这些伤害感受器延伸到去神经支配的区域，精确地再现神经支配的初始模式，由血管引导，在皮肤中显示出不规则的终端连接，并降低了模拟低阈值传入的激活阈值。 相比之下，低阈值传入神经（通常在损伤后完整神经区域中介导触觉以及异常性疼痛）没有重新建立神经支配，导致仅具有伤害感受器的迈斯纳小体等触觉末端器官受异常神经支配。敲除与伤害感受器有关的基因完全消除了神经再支配异常性疼痛。因此，该研究结果揭示了一种慢性神经性疼痛的发生机制，这种疼痛是由结构可塑性、异常末端连接和神经再支配过程中伤害感受器受损造成的，并为在临床观察到的对病人产生沉重负担的矛盾感觉提供了机制框架。 据了解，神经损伤会导致慢性疼痛和对轻柔触摸的过度敏感（异常性疼痛）以及受伤和未受伤神经聚集区域的感觉丧失。改善这些混合和矛盾症状的机制尚不清楚。 Source: 星形胶质细胞在不同疾病中的反应性转录调控不同，这一成果由美国加州大学Michael V. Sofroniew、Joshua E. Burda研究组经过不懈努力而取得。2022年5月25日出版的《自然》杂志发表了这项成果。 研究人员通过将生物学和信息学分析（包括RNA测序、蛋白质检测、转座酶可及染色质测定与高通量测序(ATAC-seq)和条件基因缺失）相结合的方法来预测转录调节因子，这些调节因子调控了超过12,000个与小鼠和人不同中枢神经系统疾病中星形胶质细胞反应有关的差异表达基因(DEGs)。与星形胶质细胞反应相关的DEG在疾病中表现出明显的异质性。转录调节因子也具有疾病特异性差异，但研究人员发现了一个在这两个物种多种疾病中常见的由61个转录调节因子组成的核心组。实验表明，DEG多样性是由不同转录调节因子与特定细胞内环境之间相互作用决定的。 值得注意的是，相同反应性转录调节因子可以调节不同疾病中显著不同的DEG队列。转录调节因子对DNA结合基序的可及性变化在不同疾病之间存在明显差异；对DEG变化至关重要的调控可能需要多个反应性转录调节因子。通过调节反应性，转录调节因子可以显著改变疾病结果，并可以将其作为治疗靶点。该研究提供了与疾病相关反应性星形胶质细胞DEG及可搜索的预测转录调节因子资源。该研究结果表明，与星形胶质细胞反应性相关的转录变化是高度异质的，并且可通过特定于细胞内环境的转录调节因子组合产生大量潜在的DEG。 据悉，星形胶质细胞对中枢神经系统疾病和损伤作出反应，反应性变化会影响疾病进展。这些变化包括DEGs，然而对DEGs背景多样性和调控知之甚少。 Source: 近日，以色列魏茨曼科学研究所Karina Yaniv、Rudra N. Das等研究人员合作发现，淋巴管转分化可产生专门的血管。相关论文于2022年5月25日在线发表在《自然》杂志上。 研究人员利用斑马鱼臀鳍的循环成像和系谱追踪，从早期发育到成年，发现了一种通过淋巴管内皮细胞（LECs）的转分化形成专门血管的机制。此外，研究人员证明了从淋巴与血液内皮细胞（EC）衍生出的臀鳍血管在成年生物体中的功能差异，揭示了细胞本体和功能之间的联系。研究人员进一步利用单细胞RNA测序分析来描述了转分化过程中涉及的不同细胞群和过渡状态。 最后，结果表明，与正常发育相似，在臀鳍再生过程中，血管从淋巴管中重新衍生出来，表明成年鱼的LEC保留了生成血液EC的效力和可塑性。总的来说，这项研究强调了通过LEC转分化形成血管的先天机制，并为EC的细胞个体发生和功能之间的联系提供了体内证据。 据了解，细胞的谱系和发育轨迹是决定细胞身份的关键因素。在血管系统中，血液和淋巴管的EC通过分化和特化来满足每个器官的独特生理需求。虽然淋巴管被证明来自多种细胞来源，但LEC不知道会产生其他细胞类型。 Source: 德国马克斯·普朗克免疫生物学和表观遗传学研究所Thomas Boehm、Dominic Grün等研究人员合作揭示两种双潜能胸腺上皮细胞祖先类型的发育动态。相关论文于2022年5月25日在线发表于国际学术期刊《自然》。 研究人员结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和一个新的基于CRISPR-Cas9的细胞条形码系统，在小鼠中确定胸腺上皮细胞随时间变化的质和量。这种双重方法使研究人员能够确定两个主要的祖先群体：一个早期双潜能祖先类型偏向皮质上皮，一个产后双潜能祖先群体偏向髓质上皮。研究人员进一步证明，连续提供Fgf7的自分泌导致胸腺微环境的持续扩张，而不会耗尽上皮祖细胞池，这表明有一种策略可以调节胸腺造血活动的程度。 据介绍，胸腺中的T细胞发育对细胞免疫至关重要，并取决于器官型的胸腺上皮微环境。与其他器官相比，胸腺的大小和细胞组成是异常动态的，例如在发育的早期阶段快速生长和高T细胞输出，随后随着年龄的增长，胸腺上皮细胞的功能逐渐丧失，初始T细胞的产量减少。scRNA-seq发现了年轻和年老的成年小鼠胸腺上皮细胞的意外异质性；然而，推定的产前和产后上皮祖细胞的身份和发育动态仍未得到解决。 Source: 美国西奈山伊坎医学院Filip K. Swirski、Wolfram C. Poller等研究人员合作发现，大脑运动和恐惧回路在急性应激期间调节白细胞。2022年5月30日，《自然》杂志在线发表了这项成果。 研究人员发现，在小鼠急性应激期间，不同的大脑区域塑造了白细胞的分布和整个身体的功能。利用光遗传学和化学遗传学，研究人员证明运动回路通过骨骼肌来源的吸引中性粒细胞的趋化因子诱导中性粒细胞从骨髓快速动员到周围组织。相反，室旁下丘脑通过直接的、细胞内的糖皮质激素信号控制单核细胞和淋巴细胞从二级淋巴器官和血液向骨髓排出。这些压力诱导的、反方向的、全群体的白细胞转移与疾病易感性的改变有关。 一方面，急性应激通过重塑中性粒细胞并引导它们被招募到损伤部位来改变先天免疫力。另一方面，促肾上腺素释放激素（CRH）神经元介导的白细胞转移可防止获得自身免疫，但会损害对SARS-CoV-2和流感感染的免疫力。总的来说，这些数据显示，在心理压力期间，不同的大脑区域会不同地、迅速地调整白细胞景观，从而校准免疫系统对身体威胁的反应能力。 据了解，神经系统和免疫系统有着错综复杂的联系。尽管人们知道心理压力可以调节免疫功能，但将大脑中的压力网络与外周白细胞联系起来的机制途径仍然不为人知。 Source:
反向遗传学 被认为是一种不可或缺的工具，它彻底改变了我们对病毒发病机制和疫苗开发的认识。大型的RNA病毒基因组，如冠状病毒基因组，由于基因组较大且不稳定，很难在大肠杆菌宿主中克隆和操作。 两位通讯作者均来自瑞士的University of Bern Transformation-Associated Recombination cloning TAR克隆 基因组DNA片段和过量的TAR载体在去除细胞壁的酵母细胞中进行混合。每个载体中都含有对目的基因特异的两段序列（标为蓝色和红色）以及酵母的筛选标记HIS3和CEN6（淡蓝色原点）。由于载体过量，酵母细胞便会将DNA片段全部接受。根据具体情况又可分为三类：1）未分到基因组DNA的；2）分到基因组DNA但未被整合到TAR载体上的；3）分到基因组DNA且通过自身同源重组被整合到TAR载体上的。显然我们是只需要第三种情况的阳性克隆，怎么把其它两种过滤掉呢？答案是进行电泳。 下图是对上述过程的简化示意： 2010年5月20日，J. Craig Venter Institute在美国 Science 杂志上报道了首例人造细胞的诞生。向山羊支原体 Mycoplasma capricolum 细胞中转入人工合成的蕈状支原体 Mycoplasma mycoides 的基因组而来，产生的人造细胞表现出的是蕈状支原体的生命特性。利用该平台，研究人员在拿到合成DNA片段后一周内，对新冠病毒进行了基因组改造和病毒拯救。研究团队于1月14日向试剂公司下单，以化学合成方式得到上述14个DNA片段，并在2月4日拿到其中的12个含片段载体（有pUC57、pUC19、pUC57mini和PCC1-His3）。其中片段5 和7 未获得，原因不详。研究团队最终通过对一位来自慕尼黑患者的新冠病毒样本（BetaCoV/Germany/BavPat/2020）进行RT-PCR 扩增，获得了第5和第7个片段。 利用TAR 克隆，研究人员获得了6 组正确组装的新冠病毒构建体的分子克隆。随后用酵母的同源重组系统依据末端重复的序列将这些DNA 序列拼到一起。获得完整的病毒序列后，用T7 RNA 聚合酶将其通过脱落转录，得到病毒RNA，将该RNA 用电穿孔技术导入到非洲绿猴肾细胞（VeroE6 cell）中，使其感染。将用于培养绿猴肾细胞（~2d），含释放出的病毒颗粒的上清液注入到别的培养基中，发现可以感染别的细胞，说明新构建的酵母合成平台可以拯救病毒。 同理，作者团队在鼠肝炎病毒A59（MHV-A59）和MERS-CoV进行病毒拯救的测试，发现效果依旧很好，测试的克隆中正确组装了病毒基因组的YAC均可达到90％，这表明病毒在酵母中的组装效率相当之高。 TAR 克隆系统的一个最重要的优点就是可以先对全基因组进行设计，通过对小的具有重复序列的片段的合成，进而再依靠酵母的同源重组系统进行片段的正确组装，极大的降低了合成的难度，也大幅提高了合成的效率。无需得到变异毒株的临床样本，通过对病毒变异的分析，可以合成构建出该变异毒株的基因组片段，再通过酵母平台进行重建与拯救。论文中还提到对局部片段的重新设计，以测试改变前后对病毒的影响。 总的来说，这一方法即利用酵母人工染色体在酵母体内将合成的SARS-CoV-2的DNA片段进行体外重组，获得全长cDNA克隆。再将cDNA体外转录为RNA，利用电穿孔将病毒RNA转染进哺乳动物细胞，实现病毒拯救。 化学合成的基因组DNA所产生的SARS-CoV-2可以绕开病毒分离物的来源限制，而且还可以对单个基因进行遗传修饰和功能表征。 对于这一篇论文，我起初有许多地方不明白。 首先是病毒的基因组合成，理论上讲，比病毒更高级的生物基因组，并不是没有人合成出来过，因此这篇论文的技术可以说是降维打击了，那为什么还可以发表在顶级杂志 Nature 上呢？ 从时间线上进行分析，我们可以得知，1月11日病毒序列正式被公布（据我所知应该是中国CDC发布的），但是国外第一个提取出病毒毒株的时间却是到了2月26日，与序列的公布整整相差1个多月。我们也可以知道这次的Pandemic，一个多月可以新增多少感染者和死亡者，时间就是生命啊！而作者在序列公布后的第3天便下出了订单，在ICTV正式公布新冠病毒名称的第2天便得到了拯救完成的病毒。可以想象，如果以后没有可能及时得到病毒的毒株，我们可以直接根据序列得到病毒的毒株， 这是本篇文章最大的亮点之一，即在此类形势下给人一种研究病毒的范式。 第二个亮点，可以关注到作者不仅做了SARS-CoV-2，还做了MHV和MARS-CoV。看不明白的话给个提示：这三种病毒都是冠状病毒科（Coronaviridae ）的！此外，作者在表格中还列出未实现拯救的人呼吸道合胞病毒（hRSV-B）、寨卡病毒（ZIKA virus）和流感病毒（HCoV）。这意味着作者想 通过对一系列冠状病毒的拯救验证来说明这一平台广泛的适用性 ，将难缠的冠状病毒，乃至其他病毒的毒株获取难度降低。这或许对科学界是件好事，但是可能也是件坏事吧… Craig Ventor；冠状病毒亚基因组； 《COVID-19全景综述》，为一张大图，涉及基本信息，免疫学过程等内容， 很震撼且 非 常华丽 ！在 公众号“炫亦”回复“cv”即可获得云盘链接！ [1] Thao, et al. Nature , 2020. [2] Natalay Kouprina & Vladimir Larionov. Nat Protocol , 2008. [3] Daniel G. Gibson, et al. Science , 2010. [4] 孙明伟, 李寅, 高福. 生物工程学报 , 2010.
如今新冠病毒疫情愈发严重，已经在全球范围内进行传播，不少国家都已经开始意识到疫情的严重性。在最初的时候，因为新冠病毒在武汉大规模爆发，所以不少人自然而然的就认为，新冠病毒的源头是在武汉地区。但是随着现在研究的深入，大家却发现，或许新冠病毒确实是在武汉爆发，但是源头不一定是在武汉地区。台湾一档关于追踪新冠病毒源头的节目，一下子在网络上传播开来，这档节目详细的讲述了自己的追踪过程，并且得出的结论是病毒的源头或许来源于美国。而他们进行这样判断也不是毫无根据的，主要的依据来源是一篇中国科学院西双版纳热带植物园、华南农业大学和北京脑科中心发布的论文。论文中提到了，他们在美国发现了单倍型H38的病毒样品，而单倍型意思也很简单，就是决定同一性状的基因组合。这篇论文收集了四大洲12个国家超过九十多种新冠病毒的基因数据，这些数据中一共找到了将近六十种单倍型。而我武汉地区的华南海鲜市场中找到的单倍型只有一份单倍型H3，并不是初代单倍型H1。所以他们萌生了武汉或许并不是疫情发源的想法。新冠病毒源头来源于美国？随后再次研究发现，初代单倍型H1在美国的病例中找到，所以有人开始怀疑，是不是美国才是疫情的发源地。对此上海市新冠肺炎医疗救治专家组组长张文宏也提供了自己的一个思路，不能就这样么简单的盖棺定论，我们在找发源地的时候，也要注意时间顺序，并且也要找到病毒在进化树上面的位置。这次病毒的基因结构相当的复杂，所以我们并不能得出，这次疫情的爆发源头来源于美国，根据目前的研究情况来看，大批量数据表明，新冠病毒的源头是不是华南海鲜市场还有待商榷，但是大概率是来源于武汉地区。早前我们做的调查中，没有找到初代单倍型，可能是因为我们在进行样品采集的时候，只选择了几家定点医院，也或许是采集的时间也比较晚，基因数据已经发生了更迭。如今新冠病毒的源头到底在哪里还是一个谜，我们还不能给出一个确切的回复，世界卫生组织，现在也已经加入研究的行列之中，希望可以早日破解新冠病毒的秘密，早日结束这次疫情。
随着新冠肺炎疫情的全球大流行，有关该病毒的起源问题已经成为世界性的争议话题。因为该病症的首发地在我国武汉，所以西方国家便把矛头指向了我国，甚至将该病毒的源头定位为武汉p4国家病毒研究所。我国社会大众认为此次病毒的源头来自于美国，及理由是：早前美国出现了一次造成大量死亡病例的“流感”，怀疑这次“流感”实际就是新冠病毒肺炎，只是说法不同而已。而在去年10月举行的湖北世界军运会上，有5位美国运动员染病，怀疑美国有可能是故意定点投毒，或是无意携带病毒，导致该疾病在武汉大流行。我国社会大众的这一认知心理，对国内社会来说确实起了很好的正能量作用，导致前期疫情通报信息不畅而积聚的民愤迅速转移，把对武汉高层或是更高层的愤怒情绪，立刻转移到美国头上，让全国老百姓“停止内战，一致对外”，对社会的稳定安定起了不小的作用。但笔者认为，此次疫情的全球大爆发，靠猜测和臆度谁是发生的源头都是不科学的，既没有理由将起源强加给中国，也没有理由将这笔账算到美国头上。至于为什么不能由中国或是武汉承担责任，已经有过大量的分析，这里不再赘述。为什么不能算到美国头上，本人谈几点肤浅的看法。一、从传播的人群来看，不会局限于武汉。病毒是一种特殊的生物体，它必须依附于动物的体细胞才能生存繁殖，若离开这些依附体，会在短期里死亡灭绝。实验室保存的病毒都需要特殊的仪器设备，作为美国的军人运动员不可能通过某种载体将病毒带到中国，这在入境时就有严格的检查，可能性几乎为零。至于说他们身体携带病毒，那也没有这种可能。因为若身体带毒，那么与他们同机的服务员，军运会上的800多名运动员，运动场上的工作人员，他们居住的旅社，甚至包括10万名观众都有可能是近距离接触着。那么军运会散后，病毒就有可能迅速在世界各地蔓延，不可能局限于武汉。二、从传播的时间点来看，应该更早爆发。武汉军运会于去年10月27日结束，按病毒潜伏期最长14天计算，最迟应该 在11月10日出现病例，在11月中、下旬就大面积爆发了。但我国武汉出现首例病例为12月8日，相隔时间40多天，病例的潜伏期不可能这么久。再者，若美国军人携带病毒，那么他们自身就应该配有解药，否则他们作为第一代传播者就必死无疑。假设他们真正具备这种解药，那么该病毒绝不能再次在美国大流行，从现在美国的疫情大流行情况看，那种可能几乎没有。三、美国的价值观不允许人为播毒。美国是个利益至上的资本主义国家，他们会尽一切努力，想尽一切办法来打压与他们有政治、经济、军事竞争力的国际对手，以达到长期称霸世界的目的，这一点是不容否定的。不管是军事手段打击阿富汗、伊拉克、利比亚，还是用无人机定点清除伊朗最高指挥官等，都是为了达到这个目的。但他们的做法也是有原则的，就是打击对方的军事目标和清除政治人物时，尽量避免伤及平民百姓。至于战争造成人道主义灾难那又另当别论。西方国家对于希特勒式的大量屠杀平民的反人类罪行，自上而下都是切齿痛恨的，这也是他们的价值观所在。对于这一点，我们要有客观上的认同，不能因为带有政治偏见而妄加指责他们。建立在这种价值观之上的美国，上至总统、政党负责人，下至普通的军人、百姓都不可能做出大量投毒，伤及无辜的灭绝人性的举动来。四、美国的政治制度也不允许这种卑劣的行径存在。美国是个老牌的资本主义国家，也是一个老牌的民主国家。美国的政治制度，简言之就是“三权分立，多党执政”。这个“三权”就是指立法权、行政权和司法权。美国的立法权在国会，国会由众议院和参议院组成。众议院400多个席位，将名额按照人口的多少分配各州，由各州的老百姓普选产生。参议院共100个席位，每州两个席位平均分配，也由老百姓普选产生，美国国会的职权是制定法律、通过法案、监督总统依法行政等。美国的行政权由总统行使，总统既是国家元首也是政府首脑，还是美国陆海空三军总司令，权力很大。美国总统由全民普选产生的选举人团投票产生，实际是全民普选产生。总统每届任期四年，累计任职不得超过两届。国会三分之二的议员支持可以罢免总统。美国的最高司法机关是联邦法院，联邦法院独立行使审判权，不受其他机关、团体的干涉。美国的多党执政实际上是由民主党和共和党两党竞选的总统和议员执政治理国家两党相互监督制约，以保证依法行政。上面说这些话的意思是作为美国的行政长官和行政机构，不可能下令投毒，因为他们没有必要冒着这个风险去做这个事，这等于为自己将来的身败名裂或是坐穿牢底埋单。他们是聪明人，决不做这种蠢事。他们不可能像独裁国家的领导人那样，终身身居大位，最多八年任期做满，就是一介平民。五、美国的舆论监督制约着政治人物的行动。美国全国所有的新闻机构，包括电视台、报社、网络都是民间的、独立的。就是《华尔街日报》《纽约时报》也好，《哥伦比亚广播公司》也好，都是民间的企业，只有一个面向全世界广播的《美国之音》才由国会拨款，可以算上国家的，但美国之音不准对国内广播。因为美国的宪法规定，美国政府和政党不准办新闻媒体，这样做的目的是让政府、政党能充分地接受独立新闻媒体的监督，避免政府和政党刻意宣传自己。这些独立的新闻机构可以与美国总统唱对台戏，不会受到打压，只要遵守美国法律，不违背客观真实性原则，谁的负面新闻都可以发。在这种强有力的舆论监督之下，哪一位政治人物若干出“投毒”这种灭绝人性的勾张来，其后果可想而知。综上所述，美国故意投毒的可能性基本没有，这并不是为美国洗白，而是没有客观可能。新冠病毒的源头在哪里，有待于科学家的积极努力。
新冠病毒存在动物传人，人传人的传播链条。不吃动物肉可以阻断动物传人。从这个角度看，新冠病毒的源头是吃肉恶习。
新冠的源头到底在哪儿？新冠病毒源头到底在哪？种种铁证浮出水面，胡搅蛮缠的国家闭嘴了据环球网报道，新冠的溯源工作是一个非常复杂的问题，到目前为止关于新冠的起源，各国这么多专家研究了这么久，但是依旧没有一个明确的答复。但是专家目前同样有了一些研究成果，新冠病毒源头到底在哪？种种铁证浮出水面，胡搅蛮缠的国家闭嘴了。世卫曾经警告过，现在有部分国家罔顾疫情实际，将病毒当做了一个进行整治攻击的武器。同时还散播了了有关新冠起源的谣言，这种行为应该立刻被禁止。科学家最新的研究成果，却让新冠的起源变得更加扑朔迷离。多个国家的专家在对自己国家在去年的留存水样进行检测之后，得到了一个惊人的发现。巴西专家在对去年11月的水样进行检测之后，发现了新冠病毒的反应。而这个时间要远早于世界上第一个新冠患者的确诊时间。估计一开始的时候巴西专家也不太相信自己的发现，所以他们在进行多次的重复检测之后，才终于确认了自己的结论。而于此同时西班牙、意大利等国家的专家，也对自己国家去年的水样进行了检测。西班牙甚至在去年3月份的水样中，检测出了新冠的反应。这些国家的检测结果，都要远早于新冠第一例患者的发现时间。这是不是表明，新冠其实很早就在人类社会中传播。因为新冠病毒有着很强的变异性，只不过之前产生的一些变异，对人类并没有什么影响。而英国专家针对这个现象，也给出了自己的观点。专家表示新冠和中国并没有什么关系，更大的可能是新冠其实早就在人类社会中蛰伏，只不过是在等待合适的条件而已。因为现在在全球的很多地方，在去年的时候就存在着新冠病毒。而且部分国家之间的距离非常遥远，很难想象一个病毒是如何段时间内传播这么远。所以很有可能新冠病毒只不过是今年才被人们发现，事实上在各地已经存在了很长时间。专家表示现在世界上没有任何一个国家研究出了非典病毒，但是为什么现在世界上除了在一些病毒实验室中，根本看不见非典的身影？但是非典就是消失了，所以新冠也是同理。之前地球上的环境并不适合其传播，只不过是世界正好符合了一个契机，才正好释放出了病毒。同时意大利的专家在多个废水样本，也检测出了新冠反应。所以新冠的传播途径很可能并不止体液传播，通过水源传播也是非常有可能的。现在英国专家正在努力探索病毒到底是通过什么样的一个途径传播的，因为他们发现在食品包装行业和肉类加工行业中，经常会出现新冠病毒的踪迹。同时在一些比较污浊、潮湿的环境，也很容易检测出新冠的反应。在接受采访的时候，世卫的官员表示，现在他们已经组建了一个专门的团队，对新冠的起源进行调查。因为有关新冠是否起源于动物，什么时候可以传播人、为什么在特定环境下新冠浓度非常高，都是等待各国专家共同探索的问题。既然有如此多的国家确认，新冠在去年就已经出现，那么美国在中国身上扣得大帽子，也终于被事实给洗刷了。只不过这次美国没有了甩锅的对象，又该如何解释自己现在国内的疫情呢。现在美国的确诊高达354万，之前有一天更是一天暴增7万多确诊病例。不过现在美国的领导层心思估计都在大选上，对疫情的应对态度想必会进一步下滑。这样的美国，很难想象还有什么办法能够挽救目前的公共卫生危局。可能只有等到疫苗开发出来之后吧，不过按照目前的进度，疫苗最快还要半年才能问世，不知道特朗普政府怎么度过这段时间。
近期，媒体和社交平台上又流传着有关新冠病毒起源的一些猜测，诸如“新冠病毒人造论”“新冠病毒起源于实验室”等。然而，国际权威机构及多数病毒学、免疫学领域学者均表示，这些猜测缺乏科学支持，迄今为止所有证据都表明新冠病毒并非人为制造。首先，现有科学证据已表明新冠病毒的特征是人为操作不可能达到的，只能是自然进化的产物。美国斯克里普斯研究所等机构参与的国际团队3月17日在英国《自然·医学》杂志上报告说，他们分析比对包括新冠病毒在内的多种冠状病毒基因组数据认为，新冠病毒刺突蛋白的受体结合域与人体细胞的“血管紧张素转化酶2（ACE2）”受体结合效率之高，是人类基因工程所无法达到的。此外，新冠病毒独有的分子架构也排除了它是实验室合成的可能，因为人们找不到一个类似的已知病毒分子架构来构建这种新病毒。“通过将（新冠病毒）基因组序列数据与（其他）已知的冠状病毒毒株相比较，我们可以确定新冠病毒起源于自然过程。”领衔研究的斯克里普斯研究所副教授克里斯蒂安·安德森在一份公报中说。其次，新冠病毒某些进化特征并非独有，科研人员在自然界可以找到相似进化事件，也进一步支持了它起源于自然的结论。中国科学院武汉病毒研究所等机构研究人员3月发布的一篇预印本论文说，新冠病毒刺突蛋白两个蛋白质亚基S1和S2之间的裂解位点有多个氨基酸插入，他们从云南蝙蝠体内所获冠状病毒毒株的S1和S2亚基之间也存在类似插入，这表明自然界完全可能出现此类插入。第三，科学家已在野生动物体内找到了与新冠病毒十分接近的冠状病毒毒株，表明这类病毒存在自然界宿主。迄今已知的与新冠病毒亲缘关系最近的冠状病毒是从云南蝙蝠体内分离的RaTG13毒株，与新冠病毒基因组序列一致性达96%；此外有研究显示，穿山甲携带的冠状病毒与新冠病毒亲缘关系也比较相近，尤其是在帮助病毒入侵细胞的刺突蛋白受体结合域上与新冠病毒相似度高达97.4%，表明穿山甲可能参与了新冠病毒的进化与传播。参与前述国际研究团队的澳大利亚悉尼大学病毒学研究人员爱德华·霍姆斯日前发表声明说，冠状病毒通常存在于野生动物中，并经常“跃迁”到新的宿主身上，这是对新冠病毒起源最可能的解释。他说，野生动物中冠状病毒的数量、多样性和进化情况均支持新冠病毒是自然进化产物的观点，确定新冠病毒的确切来源需要对自然界中的动物进行大规模采样检测。此外，认为新冠病毒源于实验室的理由也很牵强。法国发展研究所热带病毒学专家埃里克·勒鲁瓦说，法国病毒学家、诺贝尔奖得主吕克·蒙塔尼耶等人认为新冠病毒源于实验室的理由是，新冠病毒基因组的某些片段与艾滋病病毒基因组的片段一样，但实际上某种病毒与其他病毒携有同样的微小基因片段很常见，因为基因组非常庞大。勒鲁瓦介绍，他们通过特定算法对比新冠病毒与其他病毒的基因组后发现，如果所关注的基因片段越微小，就越会发现新冠病毒与关系很远的病毒携有相似的片段。世界卫生组织发言人法德拉·沙伊卜21日说，世卫组织目前正与两种“大流行”斗争，分别是新冠疫情大流行和“虚假信息大流行”。多名专家也强调，要警惕“新冠病毒人造论”“新冠病毒起源于实验室”等谬论背后的政治目的。法国免疫学家、新冠疫情科学委员会负责人让-弗朗索瓦·德尔弗雷西表示，新冠病毒源自实验室的假设是“一种不属于真正科学范畴的阴谋论观点”。澳大利亚乐卓博大学流行病学副教授哈桑·瓦利指出，有些人出于政治目的利用有关谣言，“我们必须小心，不要给谣言生存空间”。俄罗斯联邦消费者权益保护和公益监督局下属“帕斯捷尔”流行病与微生物学科研所副所长亚历山大·谢苗诺夫认为，有些人声称新冠病毒源自人工制造“是为了掩盖其卫生系统的无能或抵御疫情方面的过错”，这类说法实际上欲盖弥彰。
蝙蝠体内有一种特殊的抗病毒免疫系统，是蝙蝠能够抵御很多病毒。其次蝙蝠的新陈代谢能力非常旺盛，它们会很快修复身体被病毒感染所带来的损伤。
☞十分详细的参考资料
非典起因是来自于云南省一处洞穴的菊头蝠。
2002年末，广东省出现多例类似肺炎的病例，即严重急性呼吸综合征（SARS）。2003年，SARS在全球范围内传播并感染了数千人，全球进入紧急状态。科学家鉴定出罪魁祸首为一株冠状病毒，并在广东牲禽市场上所销售的果子狸中发现了基因类似的病毒。
之后的调查显示，大量SARS相关冠状病毒在中国的菊头蝠中传播，这表明致命毒株可能源自这些蝙蝠，再通过果子狸传播到人类身上。但是，在关键基因上（允许病毒接近并感染细胞的蛋白质），人类版病毒和蝙蝠版病毒存在差异，导致上述设想令人存疑。
为了解决这桩“悬案”，武汉病毒研究所的石正丽和崔杰对全国各地的大量菊头蝠进行取样。2011年起，石正丽研究团队对云南省一处洞穴的菊头蝠种群开展了为期5年的SARS样冠状病毒长期监测，共进行了10次样品采集，在64份蝙蝠粪便粒和肛拭子样品中检测到了SARS样冠状病毒RNA。
研究显示，流行于这一洞穴的蝙蝠SARS样冠状病毒高度多样，可分为两大簇，其中一簇在RBD区更接近SARS病毒，不存在大部分SARS样冠状病毒所出现的缺失。
重要的是，SARS冠状病毒的全部基因组组分都可以在这个SARS样冠状病毒的天然基因库中找到。通过进一步的重组分析，研究人员推测：SARS冠状病毒的直接祖先可能通过这些蝙蝠SARS样冠状病毒的祖先株之间发生的一系列重组事件而产生。
扩展资料：
非典对中国的影响
1、中国大陆多间大学的正常教学进度被打乱，北京市的中小学全面停课，不过6月举行的全国高考并没有延后举行。全国很多省市都实行了中小学全面停课，很多地区改变了以往的考试执行顺序以适应特殊时期。
如北京采用了等分数揭晓后再填报志愿的顺序，而导致出现了严重的“扎堆”现象，从而导致了复读人数的大幅上升，但另一方面，则保证了北京大学、清华大学的招生。北京的北方交通大学（现名北京交通大学）是最著名的隔离大学。
2、SARS高峰时期，中国各级党政机关显示了惊人的动员力量，深入到农村基层社区。这时以村为单位的传统社会力量发挥了作用：所有外村人员不得进村，本村在外打工返乡人员也被挡在村外，直到观察期满才能回村。
3、多场体育比赛和热身赛被取消、更换主办地或者推迟，2003年中国足球甲A联赛甚至因严重推迟出现11月雪战的情况。
4、SARS疫情结束，中央政府宣布大幅度增加卫生防疫经费投入，在全国建设各级疾病预防控制中心，特别是增加了对农村地区的经费投入。
参考资料来源：人民网-非典病毒源于云南？