文献引用将上标改为下标肯定是不对的，在参考文献标注上就没有下标的说法。你可以根据GB/T 7714—2005《文后参考文献著录规则》和老师请教。
1、文科专业“参考文献”的表述格式（1）文科专业毕业论文必须列出不少于5种以上的参考文献。该参考文献用以说明论文写作的背景资料。（2）文科专业毕业论文的参考文献置于论文正文之后，单独成页排版。（3）“参考文献”四个字用宋体小三号加黑打印，顶格。其他所列的具体参考文献转行空两格排版，用宋体小四号，不加黑。（4）参考文献的具体表述格式与上述论文注释中的格式一致，只是对于著作，不用列出页码。2、理工科专业毕业论文（设计）参考文献的表述格式（1）按照理工科学术研究的习惯，其毕业论文（设计）参考文献主要用于注明论文（设计）中所参考文献的来源。作者对论文（设计）中某观点或概念的说明，也置于参考文献中进行。统一采用尾注（文末注）的形式。（2）理工科专业毕业论文（设计）参考文献依次采用［1］、［2］、［3］……的序号。（3）理工科毕业论文（设计）参考文献各项内容的表述顺序为(下列各类参考文献的各项内容不得缺省)：a.参考专著的：作者.著作题名.出版地：出版者，出版年:页码号.b.参考期刊文章的：作者.文章题名.刊名，年，卷(期):页码号.c.参考论文集中的论文的：论文作者.论文题名.论文集主编者.论文集题名.出版地：出版者，出版年:页码号.d.参考报纸文章的：作者.文章题名.报纸名，出版日期(版次).e.参考外文版专著、期刊、论文集、报纸等：按照上述顺序用原文表述各项内容，切忌中文与外文混用。
设定好文章的目录结构后，突然发现中间要添加或者删除一个章节，添加删除容易，可是其后遗症就是后面的编号都要跟着变动。比如要删除第二章，那么原理的第三章就要改为第二章，后面的要跟着动，添加也一样，很麻烦。第二个情况就是参考文献的上标问题。硕士论文参考文献都有好几十个，一般论文会要求按照论文的引用顺序列出参考文献。如果需要添加新的参考文献，那么这些参考文献的上标号又会跟着变动。目录自动生成简单说下，将文档切换到大纲视图，然后设置你要设定成目录的文字的大纲级别。如果将大纲级别设定为1级，那么就是1级目录，一般我们会设置到3级，这样会生成1、2、3级目录。设定好后，在要插入目录的地方，点击“插入”-->“引用”-->“索引和目录”就可以了。格式在另外设置下就行了。现在来说说这两个的简单解决办法。首先都要设置成段落编号。将你要设定的一级目录设定成一级编号，二级目录设定成二级编号等等。参考文献一样，设置成段落编号。设定成段落编号有一个非常大的好处，就是插入或者删除其中的某个项目时，其后面的变好会跟着变动，所以这就解决了因添加删除中间的项目，而要同时修改后面的编号问题了。目录的更新，只需要在“大纲视图”下点击更新目录，或者在页面视图的目录上，点击右键，选择“更新域”即可。将参考文献设置成段落编号后，在需要插入参考文献引用的地方，点击“插入”-->“引用”-->“交叉引用”，找到相应参考文献的编号就可以了。然后再自己设置一下格式。还有几种方法，从网上摘录下来的。（一）采用书签、交叉引用方法：参考文献的编号和引用步骤如下：（1）在word文档末尾添加几个文献，如：[1] 杨秀章.Word 2000中文版使用速成.北京:清华大学出版社，2000[2] Peter Weverka. Diane Poremsky.中文Word 2002专家.北京:机械工业出版社，2002 注意，输入时应采用word的自动编号。如果word没有自动编号，可自己插入（这个就不用细说了...）（2）给每个文献制作成书签。如，选择“杨秀章.Word 2000中文版使用速成”，插入——书签，输入书签名（杨秀章_Word 2000中文版使用速成），然后添加。注意书签名必须以字母开头，可包含数字但不能有空格，可以用下划线字符来分隔文字，否则可能无法插入。书签名最好与文献名一致，这样在它位置变化后，你仍能识别它。（图1）（3）在需要引用文献的位置，执行插入——引用——交叉引用，类型选择书签，选择需要引用的项目，内容选择“段落编号”。至此，引用完成！（图2）在全篇文档编完后，全选，右键选择“更新域”，编号就会改变成文献的最新位置。还有一个通过插入脚注的方式引用参考文献。1． 光标移到要插入参考文献的地方，菜单中“插入”——“脚注和尾注”。（已搜索，无重复）2．对话框中选择“尾注”，编号方式选“自动编号”，所在位置建议选“节的结尾”（对论文而言）。3．如“自动编号”后不是阿拉伯数字，选右下角的“选项”，在编号格式中选中阿拉伯数字。4．确定后在该处就插入了一个上标“1”，而光标自动跳到文章最后，前面就是一个上标“1”，这就是输入第一个参考文献的地方。5．将文章最后的上标“1”的格式改成正常（记住是改格式，而不是将它删掉重新输入，否则参考文献以后就是移动的位置，这个序号也不会变），再在它后面输入所插入的参考文献（格式按杂志要求来慢慢输，好像没有什么办法简化）。6．对着参考文献前面的“1”双击，光标就回到了文章内容中插入参考文献的地方，可以继续写文章了。7．在下一个要插入参考文献的地方再次按以上方法插入尾注，就会出现一个“2”（Word已经自动为你排序了），继续输入所要插入的参考文献。8．所有文献都引用完后，你会发现在第一篇参考文献前面一条短横线（页面视图里才能看到），如果参考文献跨页了，在跨页的地方还有一条长横线，这些线无法选中，也无法删除。这是尾注的标志，但一般科技论文格式中都不能有这样的线，所以一定要把它们删除。9．切换到普通视图，菜单中“视图”——“脚注”，这时最下方出现了尾注的编辑栏。10．在尾注右边的下拉菜单中选择“尾注分隔符”，这时那条短横线出现了，选中它，删除。11．再在下拉菜单中选择“尾注延续分隔符”，这是那条长横线出现了，选中它，删除。12．切换回到页面视图，参考文献插入已经完成了。这时，无论文章如何改动，参考文献都会自动地排好序了。如果删除了，后面的参考文献也会自动消失，绝不出错。13．参考文献越多，这种方法的优势就体现的越大。在写毕业论文的时候，我就是用这个方法分节插入参考文献的，具爽！存在一个小问题：如果同一个参考文献两处被引用，只能在前一个引用的地方插入尾注，不能同时都插入。这样改动文章后，后插入的参考文献的编号不会自动改动
据学术堂了解,在学术界,准确引用是非常关键的,所以必须明确:(1)只采用可靠的相关的文献.(2)按照原著准确转录文字.(3)在参考文献目录或者参考书目列表中对文献进行准确的呈现.1.引文位置的放置(1)如果在脚注或者尾注中将一段转录文字的文献进行引用,在哪里标注释号,这取决于转录文字在句子中的哪一部分落脚.如果转录文字在句末,把注释号放在右引号后面.(2)当作者的名字在正文中与引文一起被提及的时候,将日期放在作者名字的旁边.2.调整引文(1)大写和标点在大多数学科中,可以将摘录段落的首字母的大写改为小写或者将小写故为大写,而不用说明这个改变.如果将引文嵌入自己的句式中,引文开头就要用一个小写字母.不过,如果引文是在一个完整句子的开头就用一个大写字母,如果不是在一个完整句子的开头部分,就用小写字母,在使用省略号的时候可以调整.(2)斜体可以将需要强调的词语用斜体表示,这些词语在原著中不是用斜体表示的,但是这个变化必须用italics mine(斜体是我所加)或者emphasis added(为了强调)这样的词标明,放在摘录文字之内或者放在引文信息之内.在摘录文字之内,这个标识词要放在方括号里面紧跟在斜体词语后面.在引文信息中,将这个标识词放在页码后面,前面加上一个分号.一般而言,在原本包含有斜体文字的原著段落中要避免再使用斜体字;如果斜体字的使用很必要,可以将它们用标识词italicsin original(斜体为原著所有)来区别,例如Flaubert's italics.(3)注释如果引用一个包含有上标注释号的段落但是并不要引用该注释的时候,可以省略注释号.
毕业论文要么是自动脚注，要么是手动尾注，导师常常要求是手动尾注，这就需要自己输入上标编号。你在“专家估计ipv4在2010年间将被分配完毕”后面输入[4]，然后选取[4]，按Ctrl、Shift和+号这三个键就行了。在文章结尾列参考文献的时候，另起一页，列：[1]《...[2]《...[3]《...[4]《ipv6新一代网络技术》
可以，没有必要每句都标记，关键在于重大理论和讲话必须上标，一般概念可以稍加修改为自己的观点，这也是在论文要求中体现的不要过多引用他人观点的宗旨。论文引用的文献在文中右上角上标，在论文结尾后标注文献出处，包括作者，书名，出版社，版本。
论文参考文献引用的正确格式如下：
1、单一作者：英文格式为“（作者姓氏，发表年份）”，中文格式为“（姓名全名，发表年份）”。
2、两名作者：作者姓氏必须以他们的名字在其发表文章内的顺序来排序。若两个作者都在括号内引用，名字中间需加上“&”符号，也可用“and”、“和”进行连接，取决于期刊格式。若在句首引用则使用“and”以及“和”。
3、一篇文献有三名作者及以上，则只列第一位作者，英文用“et al.”指代剩余作者，中文则使用“等”。
4、若采用数字上标式引用，较为简单。多篇文献，用逗号隔开，连续的引用则使用“-”简略。主要注意文中的数字顺序对应文末的文献顺序。
注意事项
不同期刊，不同专业，不同高校的毕业论文对格式的要求不尽相同。引用类型主要分为期刊（Journal）、书籍（Book-Chapter）、专利（Patent）、会议（Conference）和毕业论文（Thesis）等。
强烈建议使用文献管理软件，通过选择格式类型自动填充。这样能省去大量繁琐的整理文末文献格式的工作。
论文查重系统是有效制止学术不端行为的措施之一，一般适用于期刊论文和毕业论文；在防止论文抄袭的同时，在正确引用论文时也被判定为重复，那么查重系统如何判断论文是引用的呢？paperfree小编给大家讲解。 论文查重系统的原理是将你上传的文章与系统中的论文数据库进行比较，你引用的论文已经纳入论文库，因此有可能判断重复。 论文查重系统为引用比例设定了阀值，很多论文查重系统的阀值为5％。如果你的论文是1万字，你的论文连续引用500字，过多的引用查重系统会被判定为重复。 每所学校都有正确的论文格式。只有使用正确的格式，我们才能系统地识别上传论文，否则就会被判定为重复。 写论文时，适当引用其他作者的论文和专著。引用只能解释你的观点。你的论文最终需要你自己的观点和创新；所以我想提醒你不要冒险。
连续超过14个字算重，引用标明出处，引用只是引用其概念或结论，别全抄，不然就算抄袭，本科查重率超过30%不通过，自己查的话控制在10%，因为学校查或偏高
论文制度是有效遏制学术不端行为、期刊论文和毕业论文普遍适用的手段之一；在防止论文抄袭的同时，每个人在正确引用论文时，也会被识别为重复，那么查重系统是如何判定你的论文是引用的？paperfree小编给大家讲解。 论文查重系统的原理是将您上传的论文与系统内的论文数据库进行比对，从而得出论文的重复率。您引用的文章已被收录在文章库中，则可能会产生重复率。 本论文检重法对引证比例设置阀值，论文查重系统这个阀值是5％，如果你的论文是10,000字，你的论文连续引用500字，过多的引证系统就会被判定为重复。 每一所学校都有正确的论文格式，在上传论文时要用正确的格式进行系统识别，否则就会被判定重复。 各位写作论文时，适当参考其他作者的文章，并提供专文，引用只能说明您的观点，您的论文最终需要有自己的观点，并具有创新精神；因此提醒大家千万不要抱着侥幸心理。
解决这个问题的方案不止一个，我认为我想的这个方案并不能准确的解决你的问题，详细的答案还需要你自行思考。
文献引用将上标改为下标肯定是不对的，在参考文献标注上就没有下标的说法。你可以根据GB/T 7714—2005《文后参考文献著录规则》和老师请教。
论文引用序号应该标在引文的后面的右上角。
标注方法
（1）按各篇文献在正文中出现的先后顺序用阿拉伯数字从“1”开始连续编号，并将序号置于方括号中，标注在引文或著者的右上角。
（2）同一处引用多篇文献时，应该将各篇文献的序号在方括号中全部列出，序号之间用逗号隔开。如果遇到连续的序号（包括紧挨的序号），则用半字线连接起止序号。
（3）同一文献被多次引用时，应该只编一个序号，将引文页码置于方括号后。
（4）文献作为正文句子成分出现时，其序号不应该再标以上标的形式表示，而应该与正文平排。
参考文献表采用顺序编码制组织时，各篇文献应该按正文中标注的序号依次著录。各类文献的著录格式如下：
（1）专著
[序号]主要责任者．题名：其他题名信息[文献类型标志（电子文献必备，其他文献任选）]．其他责任者（任选）．版次．出版地：出版者，出版年：引文页码[引用日期（联机文献必备，其他电子文献任选）]．获取和访问路径（联机文献必备)．
（2）专著中的析出文献
[序号]析出文献主要责任者．析出文献题名[文献类型标志（电子文献必备，其他文献任选）]．析出文献其他责任者（任选）∥专著主要责任者．专著题名：其他题名信息．版次．出版地：出版者，出版年：析出文献的页码[引用日期（联机文献必备，其他电子文献任选）]．获取和访问路径（联机文献必备）。
参考资料来源：百度百科-指顺序编码制
论文在写作的过程中我们可能难免会引用到别人的观点或者是文章的某一段落，如果这些引用部分不加引用标志就会在论文查重的时候标注为抄袭。这样一来查重率就大大提高了，那么论文文献引用怎么标注呢？首先找到引用的论文文献，然后在工具栏中点击“引用”——“插入尾注”，这时可在段落的后面看到引用标志、页面下方有注释标志。点击引用栏脚注的下方“脚注和尾注”，在格式中可选择编号样式，点击“插入”即可。论文文献的引用插入好后，要在下面的注释处说明引用的是谁的哪篇文章，在后文的参考文献中也要添加该引用文献。这样就完整的添加完论文文献的标注了。论文很多情况还需要插入通讯作者的标注，操作方法和上面是一样的。但是在注释的地方需要插入通讯作者的信息即可。最后论文完成以后要记得初稿查重，查看一下查重率是否符合学校的要求以及引用部分添加的标注是否添加成功。
尾注和脚注一样，是一种对文本的补充说明。脚注一般位于页面的底部，可以作为文档某处内容的注释；尾注一般位于文档的末尾，列出引文的出处等。
尾注由两个关联的部分组成，包括注释引用标记和其对应的注释文本。用户可让Word 自动为标记编号或创建自定义的标记。 在添加、删除或移动自动编号的注释时，Word 将对注释引用标记重新编号。
1、脚注一般位于页面的底部，可以作为文档某处内容的注释;尾注一般位于文档的末尾，列出引文的出处等。
2、可用脚注对文档内容进行注释说明，而用尾注说明引用的文献。
3、脚注是解释正文中某一个词和句，不便于在正文中解释，怕影响正文的连续性，而在页脚上面插入解释。是引用的一种，它只出现在当页，而不会出现在此节的每一页。尾注与题注的形式差不多，它一般用于这句话或者段落了，出自何处。在全文尾部给予说明，与正文内容相差很远。
4、如果需要在每页下方注释的就设置成脚注，在文档末尾注释的就是尾注。如果文章很长，设置引用时就用脚注进行注释。脚注用的多，尾注用的少。参考文献一般情况下在文章的最后直接输入，不用设置成尾注，因为设置成尾注的时候，会在文章当中出现标识，所以一般不用。
知网查重怎么判断引用文献？系统会根据标记格式，以及结尾参考文献进行识别的~
1 在论文引用处标识序号。2 在序号后标注：引用论文作者姓名，引用文的标题，论文分别的刊物和著作的名称，引用文的页号，发表年月日，