论文中参考文献的序号和最后相对应的序号自动修改的方法：
1、全选待插入的参考文献，然后点击鼠标右键选择“编号”，找到“定义新编号格式”。
2、弹出定义新编号格式后，在定义新编号格式中设置参考文献编号格式后点击确定。
3、在正文中插入文献，选择上方的“插入”，在下方找到“交叉引用”，同时选择需要引用的文章，点击插入，这样编号就在文中了。
4、当文献的顺序发生变动时，word并不会自动更新引用编号，需手动操作，如果只更新单个编号，则选中该编号并点击右键选择“更新域”，编号就自动更新了。
5、直接点击键盘的“ctrl+a”全选文章，再按F9，这样就可以对文章中所有编号的引用进行更新。
你把编号选中 调成一样的字体和大小试试
这个问题很简单，你在文中第一次引用该文献时，该文献在参考文献列表中的排序是多少，比如说是第4位，那么你在后面的文中继续引用该文献时只需在上角标上标注[4]即可。也就是说对于有重复引用的情况，文中引用文献的标号不一定非要从小到大一直按顺序排列。有些学校的规定很不合规范，他要求文中文献要按顺序标号，然后在后面的参考文献中就会出现比如第7，第25，第30个文献都是同一个参考文献，其实这是不正确的，同一文献在参考文献列表中只能出现一次。
很简单的事，这个对不齐是制表符字节不一致，因为前面默认两位，到100就成3位了。
调整步骤如下：
第一步：用鼠标全选中要进行编号的参考文献，然后右击鼠标右键。
第二步：在出现的下拉菜单中找到“编号”选项，点击进入。
第三步：在“编号”选项中，找到论文对应的编号格式，并选中编号库中相应格式。
第四步：点击参考文献的编号形式[1]这种，就会自动编号如下，但是会出现如下的空格。
第五步：在选中参考文献的状态下，点击鼠标右键，弹出下列的快捷选项。
第六步：点击“调整列表缩进”，在弹出的选项卡中将“制表符”转为“空格”。
第七步：点击“确定”后，之前的空格就会消失了！
参考文献格式
1、文后参考文献不编序号，仅在文末按其重要程度或参考的先后顺序排列。
2、文后参考文献不注页码。
3、文后参考文献的著录项目及次序与注释基本相同。
（1）著录参考文献可以反映论文作者的科学态度和论文具有真实、广泛的科学依据，也反映出该论文的起点和深度。
（2）著录参考文献能方便地把论文作者的成果与前人的成果区别开来。
（3）著录参考文献能起索引作用。
（4）著录参考文献有利于节省论文篇幅。
（5）著录参考文献有助于科技情报人员进行情报研究和文摘计量学研究。
论文引用序号应该标在引文的后面的右上角。
标注方法
（1）按各篇文献在正文中出现的先后顺序用阿拉伯数字从“1”开始连续编号，并将序号置于方括号中，标注在引文或著者的右上角。
（2）同一处引用多篇文献时，应该将各篇文献的序号在方括号中全部列出，序号之间用逗号隔开。如果遇到连续的序号（包括紧挨的序号），则用半字线连接起止序号。
（3）同一文献被多次引用时，应该只编一个序号，将引文页码置于方括号后。
（4）文献作为正文句子成分出现时，其序号不应该再标以上标的形式表示，而应该与正文平排。
论文的标题排序
为了点明论文的研究对象、研究内容、研究目的，对总标题加以补充、解说，有的论文还可以加副标题。特别是一些商榷性的论文，一般都有一个副标题，如在总标题下方，添上“与××商榷”之类的副标题。
另外，为了强调论文所研究的某个侧重面，也可以加副标题。如《如何看待现阶段劳动报酬的差别——也谈按劳分配中的资产阶级权利》、《开发蛋白质资源，提高蛋白质利用效率——探讨解决吃饭问题的一种发展战略》等。
论文中参考文献引用的是国家颁布的文件或纲领政策，要用N字母表示。
根据GB3469- 83《文献类型与文献载体代码》规定，以单字母标识：
M一专 著(含古籍中的史、志论著)。
C一论文集。
N-报纸文章。
J一期刊文章。
D一学位论文。
R-研究报告。
S-标准。
P-专利。
A-专著、 论文集中的析出文献。
Z一其他未说明的文献类型。
电子文献类型以双字母作为标识：
DB一数据库。
CP一计算机程序。
EB- 电子公告。
非纸张型载体电子文献，在参考文献标识中同时标明其载体类型：
DB/OL一联机网上的数据库。
DB/MT一磁带数据库。
M/CD-光 盘图书。
CP/DK一磁 盘软件。
J/OL-网上期刊。
EB/OL一网上电子公告。
顺序编码制的具体编排方式
参考文献按照其在正文中出现的先后以阿拉伯数字连续编码，序号置于方括号内。一种文献被反复引用者，在正文中用同一序号标示。一般来说，引用一次的文献的页码（或页码范围）在文后参考文献中列出。
格式为著作的“出版年”或期刊的“年，卷（期）”等+“：页码（或页码范围）”。多次引用的文献，每处的页码或页码范围（有的刊物也将能指示引用文献位置的信息视为页码）分别列于每处参考文献的序号标注处，置于方括号后（仅列数字，不加“p”或“页”等前后文字、字符；页码范围中间的连线为半字线）并作上标。
作为正文出现的参考文献序号后需加页码或页码范围的，该页码或页码范围也要作上标。作者和编辑需要仔细核对顺序编码制下的参考文献序号，做到序号与其所指示的文献同文后参考文献列表一致。另外，参考文献页码或页码范围也要准确无误。
以上内容参考：百度百科-参考文献
百度经验：参考文献列表如何快速自动排序
自动编号+交叉引用：
1、首先，在参考文献部分输入参考文献，例如：谢希仁. 计算机网络(第5版)[M]. 北京:电子工业出版社，2008。
周自恒. Android应用开发入门[M].. 北京:人民邮电出版社，2013。
韦乐平, 光同步数字传送网, 人民邮电出版社,1997, 2。
2、选中这些参考文献，然后“开始”---->>>“段落”---->>>“编号”下拉菜单中选择文档编号样式。
3、在论文正文需要添加引用处，“插入”--->>>“交叉引用”，弹出对话框，并选择引用类型 为“编号项”和引用内容为“段落编号”，选择下面框格中的参考文献，点击插入即可。
4、将正文中的插入文献编号选中，按组合键“ctrl”+“ shift” +“+”将编号变为上标。
5、假设参考文献为:XXXXXXX。
在结尾的参考文献中相应的位置插入XXXXXXX文献，在文献1后面敲Enter即可，并输入这个参考文献。原文献2以后的参考文献编号会自动更改。
按照上面的第3步骤同样插入新文献2。此时正文中参考文献编号并未自动更改。
先ctrl+S保存下文件，选中正文的新文献2和旧文献2，然后右键“更新域”即可。
在Word文章末尾按照参考文献格式编辑好参考文献。
在正文中需要插入参考文献标注的地方，点击引用--交叉引用。
在弹出的交叉引用对话框中，选择要插入的参考文献，点击插入。此时正文中有目标参考文献的编号。
将正文中的参考文献的编号调整为合适的格式，比如上标形式，选中参考文献的编号例如[1]，然后Ctrl+D弹出字体对话框，勾选上标，确定。
参考文献序号标注步骤介绍：1、打开文档，鼠标移到标注序号的文段旁；2、找到插入一栏；3、在插入细分表中选择交叉引用；4、在引用内容栏选择段落编号；5、点击需要引用的内容编号项；6、点击插入；7、鼠标停留文段处，即出现引用标注。 扩展资料 学会标注参考文献，将会对你的论文提供很大的帮助。参考文献序号标注的具体步骤介绍：1、首先，打开文档，将鼠标移到需要标注序号的.文段旁；2、在顶部功能区找到插入；3、在插入下面的细分表中找到交叉引用；4、弹框内选择，在右侧引用内容中选择段落编号；5、点击需要引用的内容编号项；6、确定好后，点击右下角的插入；7、回看先鼠标放置的位置，就出现了引用标注。同时按下shift Ctrl = 三个键，标注会出现在文档右上角。
文内所列参考文献应限于作者直接阅读过的、最主要的、且为发表在正式出版物上的文章. 私人通信和未发表 （含待发表） 的著作及论文，一般不宜作为参考文献. 参考文献还应注重权威性和时效性. 文内标注参考文献时应按文献出现的先后顺序用阿拉伯数字连续编码，并将序号置于方括号中. 可根据具体情况分别按下述3种格式之一标注.（1） 文中已标明原始文献作者姓名时，序号标注于作者姓名右上角.例如：Vairaktaris等[7]研究表明，MMP-9-1562C/T基因多态性与口腔癌关系密切.（2） 正文未标明作者或非原始文献作者时，序号标注于引用内容的句末.例如：……在中枢神经系统中具有保护神经的作用，减少缺氧、缺血对动物脑神经元的损害[1].（3） 正文直接述及文献序号时则将之作为语句的组成部分时不用角码标注.例如：肱动脉超声检查的方法见文献[2].文中多次引用同一参考文献，只在第一次出现时编排序号 （在参考文献表中也只出现一次） , 其他处使用同一序号；如果多次引用的是同一参考文献的不同页的内容，则应参考文献表中按引用顺序一一列出页码.若某一问题使用了多篇文献说明，这时将各文献的序号在一个方括号内全部列出，中间加逗号，若遇连续序号，则在起止序号中间加“-”表示. 如：……组织型RAS激活也成为心肌肥厚、心肌纤维化、心腔扩大、心力衰竭的主要因素[1,3,9-10].（内容来源：学术堂）
一、参考文献是对期刊论文引文进行统计和分析的重要信息源之一 ，在本规范中采用 GB 7714推荐的顺序编码制编排。二、参考文献著录项目a. 主要责任者 (专著作者、论文集主编、学位申报人、专利申请人、报告撰写人、期刊文 章作者、析出文章作者)。多个责任者之间以“，”分隔，注意在本项数据中不得出现缩写点“.”。主要责任者只列姓名，其后不加“著”、“编”、“主编”、“合编”等责任说明。 b. 文献题名及版本(初版省略)。c. 文献类型及载体类型标识。d. 出版项(出版地、出版者、出版年)。e. 文献出处或电子文献的可获得地址。f. 文献起止页码。g. 文献标准编号(标准号、专利号……)。三、参考文献类型及其标识1、根据 GB 3469规定，以单字母方式标识以下各种参考文献类型：参考文献类型 专著 论文集 报纸文章 期刊文章 学位论文 报告 标准 专利 文献类型标识 M C N J D R S P 2、对于专著、论文集中的析出文献，其文献类型标识建议采用单字母“A”;对于其他未说明的文献类型，建议采用单字母“Z”。3、对于数据库 (database) 、计算机程序 (computer program) 及电子公告 (electronic bulletin board)等电子文献类型的参考文献，建议以下列双字母作为标识：电子参考文献类型 数据库 计算机程序 电子公告电子文献类型标识 DB CP EB 4、电子文献的载体类型及其标识对于非纸张型载体的电子文献，当被引用为参考文献时需要在参考文献类型标识中同时标明其载体类型。本规范建议采用双字母表示电子文献载体类型：磁带(magnetic tape)——MT，磁盘(disk)——DK，光盘(CD-ROM)——CD，联机网络(online)——OL，并以下列格式表示包括了文献载体类型的参考文献类型标识：[文献类型标识/载体类型标识]如：[DB/OL]——联机网上数据库(database online)[DB/MT]——磁带数据库(database on magnetic tape)[M/CD] ——光盘图书(monograph on CD-ROM)[CP/DK]——磁盘软件(computer program on disk)[J/OL] ——网上期刊(serial online)[EB/OL]——网上电子公告(electronic bulletin board online)以纸张为载体的传统文献在引作参考文献时不必注明其载体类型。四、文后参考文献表编排格式参考文献按在正文中出现的先后次序列表于文后;表上以 “参考文献：”(左顶格)或 “[参考文献]” (居中)作为标识;参考文献的序号左顶格，并用数字加方括号表示，如[1]、[2]、…，以与正文中的指示序号格式一致 。参照ISO 690及ISO 690-2，每一参考文献条目的最后均以“.”结束。各类参考文献条目的编排格式及示例如下：a. 专著、论文集、学位论文、报告[序号]主要责任者. 文献题名 [文献类型标识]. 出版地： 出版者，出版年. 起止页码(任选).[1]刘国钧， 陈绍业，王凤翥. 图书馆目录[M]. 北京：高等教育出版社，1957. 15-18. [2]辛希孟. 信息技术与信息服务国际研讨会论文集：A集[C]. 北京： 中国社会科学出版社， 1994. [3]张筑生. 微分半动力系统的不变集[D]. 北京：北京大学数学系数学研究所， 1983. [4]冯西桥. 核反应堆压力管道与压力容器的LBB分析[R]. 北京 ：清华大学核能技术设计研究院， . 期刊文章[序号] 主要责任者.文献题名[J]. 刊名，年，卷(期)： 起止页码.[5]何龄修. 读顾城《南明史》[J]. 中国史研究，1998，(3)：167-173. [6]金显贺，王昌长，王忠东，等. 一种用于在线检测局部放电的数字滤波技术 [J]. 清华大学学报(自然科学版)， 1993， 33(4)： . 论文集中的析出文献[序号] 析出文献主要责任者. 析出文献题名 [A]. 原文献主要责任者(任选) . 原文献题名 [C]. 出版地：出版者，出版年. 析出文献起止页码.[7]钟文发. 非线性规划在可燃毒物配置中的应用[A]. 赵玮. 运筹学的理论与应用——中国运筹学会第五届大会论文集[C]. 西安：西安电子科技大学出版社，1996. 468-471.d.报纸文章[序号] 主要责任者. 文献题名 [N]. 报纸名，出版日期 (版次).[8] 谢希德. 创造学习的新思路[N]. 人民日报，1998-12-25(10).e. 国际、国家标准 [序号] 标准编号，标准名称[S]. [9] GB/T 16159-1996，汉语拼音正词法基本规则[S].f.专利[序号] 专利所有者. 专利题名 [P]. 专利国别：专利号，出版日期.[10] 姜锡洲. 一种温热外敷药制备方案 [P]. 中国专利：881056073，1989-07-26. g.电子文献[序号] 主要责任者.电子文献题名 [电子文献及载体类型标识].电子文献的出处或可获得地址，发表或更新日期/引用日期(任选).[11] 王明亮. 关于中国学术期刊标准化数据库系统工程的进展 [12]万锦坤. 中国大学学报论文文摘(1983-1993). 英文版 [DB/CD]. 北京:中国大百科全书出版社，1996. h.各种未定义类型的文献[序号] 主要责任者.文献题名 [Z]. 出版地：出版者，出版年.五、参考文献与注释的区别参考文献是作者写作论著时所参考的文献书目，一般集中列表于文末;注释是对论著正文中某一特定内容的进一步解释或补充说明，一般排印在该页地脚 。参考文献序号用方括号标注，而注释用数字加圆圈标注(如①、580202论文检测)。
这个其实每个期刊要求是不一样的，你应该去看看你所投期刊的官方模板论文格式，里面参考文献各个类型的都有说明，不建议你到处去找所谓的标准格式，因为没有所谓的标准格式，虽然国家对学术论文参考文献格式做了规范，但是每个期刊其实也会自己增加一些规则，还是以你所投期刊为准，如果你期刊并没有提供参考文献格式，你也可以百度搜下：普刊学术中心，有很多参考文献格式模板，还有一些学习资料。
火爆推荐：如何设置论文的参考文献标注格式养成一个良好的写作习惯对您论文录用率至关重要。文章之所以要标明参考文献，是因为您文章内容中有引用他人学术成果的内容，除非您的文章完全没有引用。一篇优秀的期刊论文、会议论文或者是学位论文，其参考文献格式应符合如下要求：⑴按论文中参考文献被引用的先后次序用阿拉伯数字连续编号，将序号置于方括号内，作为上角标，并列在正文的末尾。⑵参考文献中每条项目应齐全。文献中的作者不超过三位时全部列出；超过三位时一般只列前三位，后面加“等”字或“，et al”；作者姓名之间用逗号分开；中外人名一律采用姓在前名在后的著录法。⑶参考文献类型在文献题名后用方括号加以标引，以单字母方式标志以下各种参考文献类10. 参考文献中著录格式示例①期刊[序号] 作者.题名.刊名，出版年份，卷号(期号):起页-止页②专著[序号] 作者.书名.版本(首版免注).翻译者.出版地：出版社，出版年.起页-止页③论文集[序号] 作者.题名.见(英文用In：)：主编.论文集名.出版地：出版社，出版年. 起页-止页④学位论文[序号] 作者.题名：［学位论文］(英文用［Dissertation］).保存地点：保存单位，年份⑤专利[序号] 专利申请者.题名.国别，专利文献种类，专利号.出版日期⑥技术标准[序号] 起草责任者.标准代号标准顺序号－发布年标准名称.出版地：出版社，出版年度⑦报纸文献[序号] 作者.文献题名.报纸名，出版日期（版面次序）⑧电子文献[序号] 作者.文献题名.电子文献类型标示/载体类型标示文献网址或出处，更新/引用日期11.外文参考文献的著录格式采用其文字所在国的著录格式。12.正文中的说明性注解采用随文脚注，用上标形式“①”等数字表示。13.论文的附录依次为附录1，附录2……编号。附录中的图表公式另编排序号，与正文分开
参考文献编号自动生成的方法：
参考文献自动编号选中要编号的文献，然后点击工具栏中的“编号”工具（红色标记内），即可完成编号。选中文末的参考文献，点击段落中的编号，进行自定义给数字加个中括号，选择左对齐即可对参考文献选择中文字体，然后选用英文TimeNewRoman，最终参考文献就设置好了。
书写格式
1、参考文献标注的位置。
2、参考文献标标注方法和规则。
3、参考文献标标注的格式。
2007年8月20日在清华大学召开的“综合性人文社会科学学术期刊编排规范研讨会”决定，2008年起开始部分刊物开始执行新的规范“综合性期刊文献引证技术规范”。该技术规范概括了文献引证的“注释”体例和“著者—出版年”体例。