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论文正文和综述的参考文献分开排序的步骤如下：
1、插入分节符。
（1）首先，在word文稿中用Endnote插入参考文献（如下图，插入了5篇参考文献）。
（2）在需要分成两部分的中间位置插入分节符（如下图，想要在文献3后面将内容分成两部分，就在文献3后面位置插入分节符），按照此步骤进行操作：将光标放在文献3后面——插入分节符。
（3）如下图就是插入分节符之后的效果。
2、设置参考文献style。
（1）打开Endnote，找到目标参考文献style（以Numbered格式为例），对此格式进行编辑：Edit——Output Styles——Edit “Numbered”。
（2）点击左侧“Sections”，选中右侧“Creat a bibliography for each section”。
（3）对修改好的参考文献style进行重命名和保存。
3、在word中进行设置。
（1）在word中选择刚才修改的Endnote参考文献格式（Numbered Copy 1）。
（2）即可得到两部分参考文献，且都是从1开始编号的。
这样不管后续再怎么删减或者添加参考文献，也不用害怕编号乱了，毕竟写一篇毕论插入上百篇参考文献，手动修改编号也是一个大工程。
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