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论文中的脚注不会查重的，查重主要是针对论文的正文部分。
很多网站都可以做论文查重，但是学校一般只认可权威的知网查重。知网查重的算法一般会检测论文的目录，可以分章检测。然后就会检测论文的摘要以及正文等内容的重复度。
根据权威网站的查重算法，可以知道系统是没有检测图片和公式。一方面这些资料计算机不好进行比对，另一方面论文侧重于文字的检测。这对大多数学生来说是个好消息。
扩展资料：
1、反抄袭软件检测到13个相同的字，就以为是相似，所以连续相似的，不要超过13个字；
2、尽量用同义词代替，例如：损坏=毁坏；渠道=途径；原理=根本思绪；不可见=躲藏；优点特别突出=优势尽显无疑。
3、改动句子的主动语态，比方：数字水印为多媒体数据文件在认证、防伪、防窜改、保证数据平安和完好性等方面提供了有效的技术手腕。=在多媒体制品的认证、防伪、防修改和传送平安以及完好性保证方面，能够采用数字水印的检测作为有力的检测手腕。
参考资料来源：百度百科-查重
chensilong812
脚注不算查重范围。
1、知网查重的方式和其他查重系统是不一样的，知网查重是提交word或者是pdf源文档，意思就是说对论文的格式是可以识别的，如果论文的脚注是按照标准的格式引用的，系统是可以识别到然后在报告里列出来，这个部分的内容是不会计算到正文里面的重复率，但如果格式有问题系统识别不出来的是脚注尾注就会被当成正文查重，重复率就会倍计算到总文字的复制比。
2、无论学术期刊论文还是毕业论文都会有脚注，一般若提交的论文是word版本，且脚注的标注是根据学校要求的格式来进行标注的，在90%的情况下，知网都可以正确的识别出脚注，而且不会被当作论文的正文而被标红。
一般脚注的标注位置是比较关键的，要加在标点符号的前面，无论是句话还是引号，其脚注都要加在标点符号的前面，那么这部分内容就不会被标红或者标黄，注意仅供参考。
3、若提交的论文是pdf格式，那对于大部分pdf文件的脚注来看，有部分知网都不能正确的进行识别，而且还会把脚注的内容当成正文的内容来进行查重而会被标红。但随着知网对pdf文件的识别能力逐渐增强，在以后知网查重系统也可以对pdf的脚注内容进行识别，为了杜绝脚注被标红的不合理现象。
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