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1. 验证发现的lncRNA是真实存在的. · 可以通过提取RNA做sanger测序验证;. · 可以通过probe qPCR,不仅可以对序列进行验证还可以同时检测lncRNA的表达水平,一举两得哦!. (具体原理戳这里:做完RNA-seq,怎么做验证实验?. ). 2. 验证lncRNA表达水平存在差异. 与差异 ...
一、LncRNA测序研究山羊骨骼肌发育 发表期刊:《BMC Genomics》 影响因子:3.867 研究背景:山羊发育过程中,有关骨骼肌lncRNA的研究很少。 研究思路:取4个不同发育时间、3个生物学重复的肌肉,进行链特异性RNA-Seq建库,生信分析lncRNA数量
研究lncRNA?. 发5分文章的套路送给你!. 之前小编介绍了一篇研究lncRNA的发表在science上的文章,后台有小伙伴吐槽“science太遥远,还是让我发个5分文章先!. ”. 5分文章难吗?. 掌握好套路,其实也没那么难。. 今天小编就以一篇今年5月23日发表在Cell Death and ...
不用多组学也能发文章?. 转录组测序“套路王”. 随着NGS的普及,RNA-seq成为科学研究的基础手段,RNA作为中心法则中承上启下的一环在揭示生物学问题方面发挥着关键作用,相关研究成果也呈现井喷式爆发趋势。. 2018年安诺基因RNA方向合作发表文章12+,累计 ...
双组学揭示lncRNA调节机制可发10+期刊,so easy!,免费查看详细内容。 今天我跟大家分享一篇高分文献,结果发表在中科院一区的杂志Genome Research( IF 11.093 ) 上,标题为“ Panoramic transcriptome analysis and functional screening of long noncoding RNAs in mouse spermatogenesis ”。
lncRNA测序分析过程总览 今天由小编大致带你解读一下lncRNA分析的全过程。基于RNA-seq的lncRNA预测流程主要包括三大步:文库的制备及测序、转录组重建、lncRNA识别与分析。让我们一步一步来看看吧。01、文库的制备及测序 当样品检测 …
最近小编在阅读文献时发现这么一类文章,与我们知道的传统转录组测序不一样,不单单是研究了mRNA的表达水平,还涉及到了非编码RNA(例如lncRNA,miRNA,circRNA),而这些数据仅仅是一次测序就可以全部获得。. 这就是我们今天要分享的主角“全转录组测序 ...
下面我们通过两篇基迪奥项目文章,看看别人如何研究lncRNA的表达模式。一、LncRNA测序研究山羊骨骼肌发育发表期刊:《BMCGenomics》影响因子:3.867研究背景:山羊发育过程中,有关...
杂志:CellStemCell,February7,2019关键词:singlecelllncRNA,H19,HSC摘要这篇文章通过对该实验室16年发表的造血干细胞单细胞(HSC)测序数据的进一步挖掘,筛选出了6个影响...
找到这个lncRNA的ID号,输入到noncode网站或者ENSEMBL看看有没有记录这个lncRNA,有得就是,没有的可能...
回答:建库实现lncRNA建库基于核糖体除富集miRNA比较般通割胶少建库实现两种类型RNA建库
长链非编码RNA(longnon-codingRNA)是一类长度大于200bp,不编码蛋白的RNA,广泛存在于生物体内。lncRNA测序可选择采用去除rRNA或DSN真核生物全转录组建库的方法...
下面我们通过两篇基迪奥项目文章,看看别人如何研究lncRNA的表达模式。一、LncRNA测序研究山羊骨骼肌发育发表期刊:《BMCGenomics》影响因子:3.867研究背景:山羊发育过程中,有关...
该文章是2020年1月南京医科大学附属第一医院的研究团队发表在MolecularCancer(IF=10.68)杂志上的,文章标题为“TEAD4modulatedLncRNAMNX1-AS1contributestogastriccancerpro...
结合两篇系统性研究lncRNA的经典案例,从分子机制研究及肿瘤基础研究两方面,与大家聊聊lncRNA测序及后期验证该怎么做。1、分子机制研究lncMyoD通过阻碍IMP2介...
在第一部分实验中,作者发现炎性细胞因子刺激下lncRNANKILA表达上调,我们在”(策略篇)环环相扣:高分文章机制研究的秘诀“和“(策略篇)反馈回路:基金和文章装逼利...
下面我们通过两篇基迪奥项目文章,看看别人如何研究lncRNA的表达模式。一、LncRNA测序研究山羊骨骼肌发育发表期刊:《BMCGenomics》影响因子:3.867研究背景:山羊发育过程中,有关...