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请大侠赐教:我有一株细菌,通过生理生化及16srDNA序列及PCR扩增后,已鉴定出是解淀粉芽孢杆菌,NCBI中进行序列同源性比对后,有很多同源性100%的序列,请问还有构建系统发育树的必要吗?如果要的话,就16srDNA序列,还需要什么条件?
没有一种方法能够保证一颗系统发育树一定代表了真实进化途径。 然而,有些方法可以检测系统发育树检测的可靠性。 第一,如果用不同方法构建树能得到同样的结果,这可以很好 的证明该树是可信的;第二,数据可以被重新取样(bootstrap),来检测他们统计上的重要性。
感谢参与,应助指数 +1. 貌似一般的期刊都是这么要求的,将excel的表复制到word中需要使用“复制”和“选择性粘贴”的功能,这样粘贴过来的表在word中双击可以访问源数据。. 楼主把这个要求理解为需要原始数据也可以。. 赞一下 (1人) 回复此楼. 咱也是有组织 ...
各位师兄师姐们,小妹有一个疑问,mega构建系统发育树的时候是以核酸序列为基础,还是以氨基酸序列为基础呢?两者如何选择,在哪些情况下选择核酸序列,在哪些情况下选择氨基酸序列呢?我现在遇到的情况是,具有一个基因家族的基因序列和氨基酸序列,任务是对该基因家族进行VIGS沉默。
系统发育分析中,最重要和最常见的内容为构建系统发育树。系统发育树也称为系统发生树(phylogenetic tree)、聚类树或者进化树(evolutionary tree)。以树状结构表示各个节点的进化关系,枝点可以是物种、同一物种的样本、基因等单元。 进化树中各个元素的介绍如图1所示 图1 进化树的结构示意图 ...
构建系统发育树需要注意的几个问题. 序列和片段可能会彼此相似,但是有些相似却不是因为进化关系或者生物学功能相近的缘故,序列组成特异或者含有片段重复也许是最明显的例子;再就是非 特异性序列相似。. 重要的是理解系统发育分析中的计算能力的 ...
6.系统发育树左下角的标尺表示什么?根据是否带有尺,系统发育树可分为标度树和未标度树。标度树上的标尺单位因不同算法而异,NJ树的表示遗传距离,MP树的表示性状状态变换的步骤数,ML树和BI树的每个位点上的替换数。
进化分枝图可以显示事件或类群间的进化时间,而表型分枝图则不需要时间概念。文献中,更多地是使用“系统进化树”一词来表示进化的途径,另外还有系统发育树、物种树(species...
可以使用MEGA,或者Mauve等软件在NCBI上进行blast,选择与你的基因同源性高的序列下载下来用软件做发育树(常用的软件有clustalx,mega等) .new-pmd.c-abstractbr{display:none;}更多关于期刊系统发育树也要矢量图吗的问题>>
ITOL是InteractionTreeOfLife(网址:http://itol.embl.de/)的简称,它是一个集在线展示、注释和管理进化树的交互工具。绘图过程中可以随意调整树枝、标签的颜色、形状和字体。而iTOL**的特点是...
少年易学老难成,一寸光阴不可轻-百度文库构建系统发育树需要注意的几个问题1相似与同源的区别:只有当序列是从一个祖先进化分歧而来时,它们才是同源的。2序列和片段可...
1楼:各位大佬,我最近构建系统发育树的... 2楼:你加上了吗?我的标尺那里是灰色的...
有人说生命科学的所有问题的答案都应该到进化里寻找,还有人说不懂进化的生命科学家是耍流氓。系统发育树或进化树是一种常用来表示物种宗谱亲缘关系的树状结构...
输出图形前可将鼠标移到系统发育树的区域(见图形的缩放),通过滚动鼠标转轮将分支之间的间距调整到最佳状态,必须以矢量图格式(*.eps)输出图形,以便保证图形放大...
抚慰着石头一样的沉默,无言坚心,不以物喜,不以己悲,常怀我对着心,自言自语。有些不可思议,无论你。各人有自己的无奈,只是这三言两语,是哈哈霍。当那些花儿... .new-pmd.c-abstractbr{display:none;}更多关于期刊系统发育树也要矢量图吗的问题>>
首页会员发现等你来答登录系统发育树怎么分析?关注问题写回答植物学景观树品种树木学系统发育树怎么分析?谢谢!显示全部关注者1被浏览50...
【絮语】MEGA作为一款简单易用的系统发育分析软件,近年日趋见于诸多国内外期刊,并慢慢受到大家的认可。对于系统...