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文章发表的测序结果怎么表示

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文章发表的测序结果怎么表示

如果太多,就选择你要进行具体分析的放到论文里面,可以采用纸张横向。

为了更好地理解Hi-C数据,在此我们简要介绍下基于illumina平台的二代测序文库。 在标准的二代文库中,DNA片段通过末端补平加A,再添加adapters。此时reads的两侧各带发卡结构P5/P7的测序接头,为了获取足够上机的DNA文库,通常还需要进行一轮扩增,扩增后的文库两端各带一种测序接头。 在pool DNA到芯片上时,文库片段首先anneal在芯片的测序接头上,然后用DNA聚合酶进行扩增,DNA生长在芯片上;经过25-28轮的扩增,每条reads被扩增至数以千计的拷贝,利用添加可逆的终止子来检测碱基的组成。通过150轮添加可逆终止子并采集信号即可完成测序。 由于DNA聚合酶的自身的偏性,GC含量相对合适的片段及小片段更容易在芯片生长阶段得到富集。小片段(<150nt)在测序过程中,由于两端各读取150个碱基,就极可能将DNA插入片段读通,从而这部分的DNA就可能被检测到adapter污染。 Hi-C标准文库是标准的Chimera结构,在将两端序列进行比对到基因组上时,理论上两侧pair ends可以分别比对到基因组的两个座位。由于DNA在碎片化过程中,剪切是随机的,因此酶切位点末端补平形成的junction fragment很可能分布在一侧的reads中,常规的比对分析是很难处理chimera的。在HiC-Pro和HiCUP软件中,他们会去识别理论的junction  fragment。如HiC-Pro在比对时先进行Global Mapping,后将unmapping的reads用junction fragment序列进行识别并切割,再进行local mapping,最终将数据进行合并。 在实际比对中,即使采用两步比对方式,仍有可能是只有一端序列能比对到基因组中,另外一端无法识别到基因组中,这种情况我们将其归类为Singleton。它产生的原因可能有①adapter污染(先前数据没进行过滤);②另一侧数据质量较差,多数为N的区域;③DNA片段被降解或酶切反应产生星号活性。同时片段过短,150碱基已经读通了生物素标记的位点,但是该位点不是正常的junction fragment。在植物样本中,singleton较为常见,可能与细胞壁破碎不完全,部分细胞质成分进入到反应体系影响酶切有关。 有些植物的基因组存在大量的重复序列,如玉米中85%的序列被认为是重复序列。这对要求两端都要唯一比对的Hi-C而言是巨大的挑战,一旦有一段比对到两个或两个以上的位点,该reads就将被归类到Multiple mapped reads中。 如果在比对过程中,global mapping 和 local mapping均无法将序列识别到特定的位点,这种序列会被归类到Unmapped reads。它可能产生的原因是基因组的组装完整度较差,基因组中存在大量的gap无法识别,被填充为NNNNN。另一个原因是酶切片段较碎,多个酶切片段连接在一起,无法识别到特定座位。 如果两侧数据都能比对到基因组的数据会被统一认为是Unique mapped reads,此时对于动物基因组,unique mapped reads 占测序量(clean reads)50%以上应是可接受的范围。对于植物样本,尤其是重复序列较多的样本,unique mapped reads 比例可能会急剧降低。 在获取unique mapped reads后,要进行进一步过滤,以识别真正有效的interaction reads。 根据Hi-C实验的基本原理PLA(proximity ligation assay)可发现,空间上相互靠近的片段更有机会被连接在一起。因此只有两个来源不同的片段连接在一起才会被认为是标准的文库片段。而这片段是指利用限制性内切酶酶切的Fragments,即唯有两个片段能分别比对到两个不同的酶切片段上,且实际片段(observe)符合理论的片段大小,在分析是才会将其归类到valid pairs中。 因此在分析过程中会将部分无效的数据进行过滤,首先是如果两个片段原本通过一个酶切位点连接在一起,在Hi-C文库中如果该片段即使酶切后添加生物素仍然连接在一起,该片段会被归类到Re-ligation reads中;而如果两个的reads比对到同一个fragment,但是方向相反,则该reads会被认为是首尾相连形成了Self-circle ;如果pair end 同时比对到一个酶切片段上,则该片段会被认为是Dangling ends;如果有一个发现是adapter污染,该reads会被认为是Adapter polluted;如果两侧的end均能比对到基因组的两个酶切片段中,但是观测到的片段大小与理论的片段大小不一致,则该片段会认为是错误连接而被归类为Dumped reads;只有比对到两个酶切片段且片段的理论值等于实际值的reads,才会被认为是Valid pair reads。 Dangling ends 主要来源于两部分,①经DNA连接酶连接反应后,携带生物素的DNA片段末端并未形成嵌合片段,在末端生物素切割的(klenow)时又未将末端的生物素去除,从而进入到最终的文库中;②磁珠洗脱步骤未完全将非特异性结合的DNA洗脱下来。有文章报道,只有将Dangling Ends的比例控制在10-45%以下才会被认为是成功的Hi-C文库 Dump的主要原因在于酶的星号活性导致切割位点不在经典的位点,这有可能是酶切时间过长或反应体系中盐离子浓度和种类不合适导致的;另外一个原因是片段被DNA外切酶降解,使得片段的大小发生了改变。 获得了interaction reads后,要去除文库中完全一样的reads,因为这部分可能是由于PCR扩增导致的Duplication,去除Duplication后,Valid pairs数据可用于后续的滑bin统计分析了。 对于植物样本,尤其是大基因组的植物样本,其unique mapped的比例可能较低,此时为了达到足够的数据量,需要提高测序深度;然而如果对于人、鼠等动物样本,如果unique mapped ratio较低则可能是实验原因。

为何要弄序列上去?这个可以附在文中,没必要计较多少吧,上下一致美观即可记得可以都附在文章最后额。。。附图。。。这个可以跟测序公司要额,,,都是A4纸的报告 也可以自己打 一张一张的 它自己就排好了

论文发表结果怎么查

在官网的检索栏进行作者文献检索,检索自己的姓名即可查询自己已经发表的文章。

中国期刊网提供CNKI源数据库、外文类、工业类滚闷磨、农业类、医药卫生类、罩穗经济类和教育类多种数据库。其中综合性数据库为中国期刊全文数据库、中国博士学位论文数据库、中大斗国优秀硕士学位论文全文数据库、中国重要报纸全文数据库和中国重要会议文论全文数据库。

中国知网(原中国期刊网)是综合性的大型数据库,包含中国期刊全文数据库、中国优秀博硕士学位论文全文数据库、中国重要会议论文全文数据库、中国重要报纸全文数据库、中国统计年鉴数据库、中国精品文艺作品期刊文献库。

中国法律知识资源总库多个数据库,覆盖的学科范围包括:数理科学、化学化工和能源与材料、工业技术、农业、医药卫生、文史哲、经济政治与法律、教育与社会科学、电子技术与信息科学等。

数据库检索方法:

进入中国知网后,首先选择数据库,可以选择一个数据库进行单库检索,也可以选择跨库检索同时检索多个数据库。如果仅仅查一个库,用单库进行检索。

快速检索:

检索字段包括题名、主题、关键词、摘要、作者、第一作者、作者单位、来源、全文、参考文献和基金。匹配有精确和模糊两种方式,精确检索指检索结果中含有与检索词完全匹配的词语;模糊检索指检索结果包含检索词或检索词中的词素。具体检索应用中,可以先限定检索字段、检索时间范围、匹配方式,然后输入检索词,选择检索的数据库,快速检索界面。

一般一般情况下的话我觉得个人发表论文的如果说想先查询的话这个可以直接入淑女的论文的名字或者是淑女的名字就可以建议你来查询

进入中华人民共和国新闻出版总署网站,点击在线查询,再点击新闻机构查询,在输入期刊名称点击确定。国家新闻出版总署官方网站:首先,你需要在网站右边找到:在线查询→新闻机构查询,然后会出现一个对话框。接下来你要做的是,在媒体名称输入期刊名称(不加书名号),媒体类别选择:期刊。这样下来之后,就可以点击搜索查询了。无论是什么期刊都可以这样查询。只要是正规期刊在新闻出版总署的网站上都可查询到否则即为假刊。国家新闻出版总署是不能查询论文的,只能查询期刊真假,如果不知道如何辨别期刊真假,那么可以登录国家新闻出版总署官网,上面会有详细的期刊信息比如CN刊号等等,如果查不到,那么就是假刊,也有可能是电子刊,而要求稍微严格的单位,评定职称时,电子刊是无效的。作者们发表论文的期刊属于学术期刊,如果要查询首先还是知网,其次是万方,这两个是比较全的论文数据网,淘淘论文建议,选择发表的期刊,都得是在这两个网站能查到的,这样才能确保作者是发到了真正的刊物上,而不是增刊、假刊或者套刊上。法律依据《刑法》第217条个人犯侵犯著作权罪,处3年以下有期徒刑或者拘役,并处或者单处罚金;违法所得数额巨大或者有其他特别严重情节的,处3年以上7年以下有期徒刑,并处罚金。“违法所得数额巨大”和“有其他特别严重情节,见《关于办理侵犯知识产权刑事案件具体应用法律若干问题的解释》第5条第2款的规定。《刑法》第220条单位犯侵犯著作权罪,对单位判处罚金,并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员,依照个人犯该罪的规定处罚。按《关于办理侵犯知识产权刑事案件具体应用法律若干问题的解释》第15条之规定,单位犯本罪的按相应个人犯罪的定罪量刑标准的3倍定罪量刑。

很多小伙伴不知道论文发表以后怎么在网上查询,下面一起来看看具体步骤。

材料/工具

中国知网

方法

已发表论文查重的结果怎么看

1、搜索“中国学位学术不端文献检测系统-CNK查重入口”。

2、选择“选择查重系统”。

3、以“本科学位论文查重”为例。然后点击“立即查询”。

4、选择“立即查询”。

5、根据提示输入相关的信息。

6、选择“属性分类”以本科论文为例子。

7、选择“毕业论文的word文档”上传。选择支付方式,输入手机号码,然后点击“提交检查”就可以了。

扩展资料

中国知网查重报告单是以网页形式mht(或PDF,PDF还是mht,系统随机)呈现的。

mht文件可以运用浏览器打开

报告初稿系统有1-2份;定稿系统有四份,这四份查重报告分别从4个角度来呈现查重结果

1)全文对照报告单:全文的重复内容和相似来源出处对照;

2)全文对照和全文引文就是平常我们用来修改论文重复率时候运用的。全文标明引文即全文重复会标红,并且有引用文献列表,可以看到我们查重的全文内容;

3)去除本人发表文献:是你之前在发表投稿过论文,被系统收录了,这时候如果再引用之前的论文内容,就可以根据你的名字(作者)排除这些重复的内容;

在知网查重报告中,标黄色的文字代表这段话被判断为“引用”,标红色的文字代表这段话被判断为“涉嫌剽窃”。论文中的表格内容数据是可以识别的。如果表格的内容有很大的重复度,那么可以把表格截图保存,再放到论文中去。在知网查重进行中,检测系统只能识别文字部分,论文中的图片、word域代码、math...知网检测系统对论文的分节是以“章”作为判断分节的。封面、摘要、绪论、第一章、第二章、等等.

查重后,知网会出pdf文件。下载后;查重率还有重复内容会有标红

知网查重结果解读方式

一、 中国知网查重报告单以网页形式mht(或PDF,PDF还是mht,系统随机)呈现

mht文件可以运用浏览器打开,知网查重报告通常有四份,如下所示:

1、全文对照报告单:全文的重复内容和相似来源出处对照;

2、全文对照和全文引文:就是平常用来修改论文重复率时候运用的,全文标明引文即全文重复内容会标红,并且有引用文献列表,可以看到查重的全文内容;

3、去除本人发表文献:自己发表投稿过的论文被系统收录了,此时如果再引用之前的论文内容,就可以根据自己的名字(作者)排除这些重复的内容;

4、简洁报告:一般用来做打印。

二、中国知网查重报告单上面有很多数据,一般就是查看总文字复制比,也就是论文重复率。

①总文字复制比就是重复率,抄袭率,相似度;

②去除引用文献复制比就是去除引用文献后的结果;

③去除本人已发表文献复制比就是去除和本人重复后的结果(值得说明的是如果没有发表过论文,那这个数值和总文字复制比是一致的!);

④单篇最大文字复制比就是和本论文相似度最高的文章和本论文的重复率及文章名称。

sci文章发表程序

如何发表sci论文呢?有以下几个步骤:

1、论文写作

发表sci论文论文写作非一日之功。前期要阅读大量文献,并将阅读文献做一个小记,这样不会出现读完后一点儿印象都没有。更重要的是为以后的参考文献选用打下良好基础。因为你引用参考文献时要有针对性,不能乱引用。比如说你在Cell中读到1985年Blackburn  E H女士与其博士后Greider CW发现了端粒。那么你就记录一下,用到的时候很方便。

阅读了大量论文,试验也做的差不多的时候。需要着手写论文了。写作论文时一定要集中时间写。在写作时不一定非要从Abstract写到Acknowledgement。你可以最后写方法与致谢,但是摘要一定字斟句酌,摘要是一篇文章的高度概括。大家在搜集信息时一般看看文章的摘要就知道这篇文章是否适合自己去阅读。文章的摘要需全面体现开展该项研究的意义的深度g概括。试验图片一定要清晰,否则审稿人会让你重新进行一次试验的。说句不负责任的话,你可以拼错一个单词,但是图片不可以出现模糊或不清晰这种情况。讨论就是对结果的意义进行进一步探究。SCI期刊的讨论不像国内期刊最后的讨论那样写的天马行空,就事论事、简洁是讨论写作的基本原则。

2、论文定位

稿件分为综述性文章与实验性文章。发表sci论文投稿时首先对自己的论文有一个准确的定位,这就需要阅读大量的文献,掌握目前该领域研究到了什么状态,研究的热点是什么。你的工作对当前研究有什么意义。期刊是读者交流的主渠道,很多科学家在从事类似研究,有很多未解决问题困扰着他们,如果你的研究能对这些困扰提出一个论据,哪怕是一个细小分支。你的这篇论文也可以投一篇IF较高的期刊。

3、选定期刊

稿件定位后,就开始选择期刊了。发表sci论文选期刊怎么选?在Google上搜索?那真是海底捞针了!我推荐大家每人拥有近3-5年的影响因子表格。一般期刊的影响因子的变动不大,在Excel表格内将采用IF升序或降序的方法排列。

4、在线投稿

现在Elsevier、Springer、Wiley这些数据库等均采用在线投稿的模式,所以发表sci论文投稿者需对投稿系统有所了解。第一次投稿由于不熟悉投稿界面,经常会出现一些意想不到的问题,这个多操作几次就熟练了。后续的交流主要是通过邮箱进行,所以邮箱一定是常用邮箱。这个很重要。

5、文章审理

发表sci论文一般情况下,投稿一周内会收到期刊编辑的邮件,会告知你的稿件已经给了审稿人。文章审理工作就此开始了。审稿人对你的论文进行评述,然后将意见反馈给期刊编辑,后者将意见反馈给你。

6、论文接收

收后就是移交版权(你将出版权出让给期刊)。这时候官方的互动就不是你的事儿了,导师会跟那边交流。需要你的他自然会去找你。版权出让,拿到接收函后过一阵子期刊排版,会给你一份稿件让你校对,看是否有错误。没错误那里就准备发表sci论文了。之后你就等着期刊在线刊登吧。

发表 SCI 论文是科研工作者的一个重要目标和成就,以下是一些可能有用的步骤和方法:

1、研究选题和设计实验。选择一个合适的研究选题和设计实验方案是发表 SCI 论文的第一步。需要了解前人的研究成果和进展,提出新的研究问题和思路,并设计合适的实验方案来解决问题。

2、进行实验和数据分析。实验过程需要遵循科学规范和方法,收集充分的数据,并进行合理的统计和分析,得出可靠的结论和科学发现。

3、撰写和投稿论文。撰写 SCI 论文需要遵循期刊的要求和格式,包括标题、摘要、正文、参考文献等部分,同时需要严格遵守学术道德和规范,保证论文的科学性和可靠性。投稿前需要选择合适的期刊,了解期刊的要求和流程,并按照期刊的投稿系统进行投稿。

4、与编辑和审稿人进行交流和修改。一般情况下,期刊的编辑和审稿人会对论文进行评审和修改意见。作者需要认真阅读和回应审稿人的意见,并进行合适的修改和改进,以提高论文的质量和可接受性。

5、审查和发表论文。经过审稿人和期刊编辑的审查和修改后,如果论文被接受,作者需要按照期刊的要求进行最终的修改和审查,并在期刊上发表论文

流程一、SCI论文写作首先,写作前的准备。写作一篇高水准的SCI论文,建立在课题研究基础之上,没有真实可靠的实验数据,无法得出高水准的实验结果,就无法彰显自己的科研水平。其次,撰写SCI论文内容。流程二、SCI论文完稿后进行修改、润色一篇让审稿人看不懂的SCI论文,哪怕自认为研究成果价值多么高,也是失败的,被录用的几率为零。为了保证SCI内容没有语法错误、没有错别字,通俗易懂,符合投稿期刊的录用要求,当SCI文章初次写完后要找多人来审阅查看,反复修改后定终稿。

流程三、SCI论文投稿投稿时,先要确认投稿是最终版本,图片清晰,coverletter中的主编名字拼对等等,再进行稿件上传。上传成功后要对生成的PDF文件进行认真检查,确认无误后点击确认,即投稿完成。

流程四、修改或拒稿应对策略投稿初审后的结果:拒稿、修稿和录用。对于拒稿,你要查看是什么原因,如果是误判,想办法申请再次审稿的机会,如果不是误判,看看是否有机会投稿其他期刊。对于修稿,你必须要严格按照审稿意见进行修改,否则再次投稿,被录用的几率还是很低。对于直接录用,只有高质量的作品才有可能,非常少见。流程五、最后准备投稿录用后,期刊那边可能还需要作者做些事情或提交材料,作者要及时的查看邮件,进行及时的回复,以便SCI论文能够赶上期刊最新一期见刊。

uc怎么发表文章

在uc头条上发表帖子的操作方法和步骤如下:

1、首先,直接在UC头条上打开相应的官方网站窗口,找到“写文章”选项并进入,如下图所示。

2、其次,完成上述步骤后,会弹出一个新页面,需要根据实际情况编写相关内容,如下图所示。

3、接着,完成上述步骤后,请单击“去提交”按钮,如下图所示。

4、最后,完成上述步骤后,系统将提示“信息已成功发布”,如下图所示。这样,就完成了。

现在的虎牙怎么管理的,直播人,都不处理的吗?,以后谁还敢在虎牙。

1、首先打开手机微信。

2、接下来需要打开公众号。

3、接下来需要你要去关注:大鱼号。关注好后打开。

4、接下来需要点击:入驻链接。

5、接下来需要输入账号:登录。

6、进入到大鱼号平台后,在左侧导航栏创作中找到写文章。并点击。

7、在页面中输入标题和正文,标题最少需要五个字。

8、接下来填写文章作者的名称,选择封面图,可以选择一张或者三张。

9、上面的信息填写完成后,就可以点击发布了,可以选择现在发布也可以选择定时发布。

使用“大鱼号”官网发布。

1、浏览器搜索“大鱼号”找到官网。

2、进入后进行注册。

3、按自身实际情况填写入驻类型。没有邀请码选择普通入驻。

4、填写详细资料。

5、提交后跳转到主页面,待审核通过后点击“写文章”,便可写作发表。

扩展资料:

UC浏览器(UC Browser)是UC Mobile Limited在2004年8月开发的一款软件,分uc手机浏览器和uc浏览器电脑版。UC浏览器是全球使用量最大的第三方手机浏览器,截止至2016年,UC浏览器月活用户突破了4亿,季活用户超过6亿。

UC浏览器是阿里巴巴移动事业部旗下核心产品。根据全球知名的网络流量监测机构StatCounter发布的最新数据所示,UC浏览器已占据全球市场份额的(移动浏览器月度PV份额),全面超越苹果safari成为了全球第二大浏览器。

UC是何小鹏和梁捷于2004年在广州创立,2014年6月并入阿里巴巴,成为阿里巴巴移动事业群的核心部分,并将该事业群总部落地广州  。

2015年, UC头条发布,标志着UC浏览器开启了第三代浏览器的新浪潮。从信息入口工具到内容分发平台,基于大数据实现精准推荐,让信息更精准连接到人,融入信息流式交互体验,为用户提供个性化阅读体验。

参考资料:百度百科-UC浏览器

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