生物信息学我有来头
哪个专业的博士大论文都不好完成,需要好几个创新点的。但是以我做生信的经验,生信方向只要有系统的做,就很容易完成大论文。有系统的做是你一直做一个方向,用不同的方法研究一个内容,而不是一会研究蛋白质一会研究RNA这样跳来跳去的。
生信分析论文写法如下:
这次我们来讲解的这边文献是 2019-10-12 发表的 OTT 杂志上的一篇生信加少量实验验证的文章。实话实说,目前对于生信最最最基本的,如果没有实验验证还是不好发文章的。所以一般都会加一些实验验证的。
这个文章的主要流程是个这样的:这里我们就基于文童的材料方法来说一下具体的内容:公共数据获取:当中关于公共数据获取部分提到了这些东西。使用了 GEO 数据库来进行候选数据筛选。
这 GEO 里面找到了三个芯片,其中描述了这三个芯片的平台。差异表达分析:作者使用了 GEO2R 来进行数据的筛选。富集分析:接着作者对差异表达的基因进行了富集分析,其中包括 GO 分析和 KEGG 分析。
作者使用的富集分析的软件是 DAVID,这个软件我们也吐槽过说,更新不及时,是很好用,所以推荐是 WebSestalt 富集分析软件,或者 clusterprofiler。蛋白相互作用分析:5TCGA 数据库验证再往下作者做的其实是 TCGA 的数据库验证,但是在材料方法里面没写。我们可以在结果当中具体的过程。
对于肿瘤研究,现在如果只是用 GEO 数据集分析,不用 TCGA 再看一下的话,都觉得不好意思,所以一般的肿瘤研究可能都会用到 TCGA 的验证的。其目的也就类似于多加了一个数据集来增加结果准确性。但是对于 TCGA 有些肿瘤正常样本很少。分析的结果可能偏差更大。文章使用的 GEPIA 的数据库。这个数据库对于查询 TCGA 表达结果还是很好用的,简单上手。
核心基因甲基化相关分析:在核心基因选择之后,利用了 TCGA 的甲基化数据MEXPRESS 来查看基因的田基化水平有没有变化。由于版本的更新。现在的这个数据库的 版本的结果会比之前的更加详细一些。
最好是多收集点生物信息方面的资料,题目可以写生物信息的发展历程,等等
最好先阅读几篇相应文章和相今似的论文,比如你的课题是油菜,你可以搜有关其他物种如小麦的。根据论文写作步骤制定实验计划。要练习使用一些常用软件,如NCBI,GenBank,在用时最好先下载安装有道词典,因为是英文网站,不容易懂,专业名词也太多!不要怕,万事开头难!好好准备,入了门就好了!
人类和动物的生存与植物有密切的关系。①人必须依靠植物提供氧气,只有植物才能制造氧气。如果说一个人几天不吃饭、几天不喝水且有一息尚存的话,几分钟就可能性命难保,氧气可是人生%方-案范'文库整-理#命活动的第一需要呀!一个成年人每天呼吸约2万多次,吸入氧气千克,呼出二氧化碳千克。②动物与植物的呼吸,物质的燃烧,也都要消耗氧气,释放二氧化碳。这样一来,空气中的氧气不就一天天增加么?不!天地间之所以没有产生过这种危机,就是因为植物既是天然氧气“制造厂”,又是二氧化碳的“广阔市场”。③有人做过统计,1公顷阔叶林,在生长季节每天能制造氧气750千克,吃掉二氧化碳1000千克。所以算起来,只要有10万平方米的林木,就可以供给一个人氧气的需要量,并把呼出的二氧化碳吸收掉。因为有植物源源不断地补充氧气,空气中的氧气才能保持基本恒定。相反,如果没有植物,地球上的氧气只要500年左右的时间既可以用完。所以,人类和动物能够维持生命,活动时所需要的氧气,必须归功于绿色植物。植物与我们人类和动物的生命有着相当密切的关系。学研究是一种创造性的劳动,要有作者个人的见解和主张.论文写不写得出,关键在研究上.二制定研究计划写作论文的基...稿,加注其中,搜集资料,占有资料是计划中的重点
一、写作基本结构
(1)前言:阐述研究的目的,说明为什么做这个研究?
(2)材料与方法:细致表达怎么做这个研究?
(3)结果与分析:通过研究获得了哪些证据?这些证据说明了什么问题?
(4)讨论:通过研究得出了什么结论?结论有什么价值?
二、写作结构技巧
(1)结合自身知识能力,选择自己擅长的论文课题
(2)搜集和分析文献资料,明确生物论文的研究的内容
(3)拟定论文提纲,确立基本论点和分论点
(4)论文写作注重论述语言,把握好章节篇幅。
微生物技术在城市生活垃圾处理中的应用 摘要:本文结合堆肥化、卫生填埋两种现行的城市生活垃圾处理工艺,主要介绍了城市生活垃圾生物处理过程中的微生物种群,以及通过分析开发出的新的微生物技术,指出了应用于城市生活垃圾处理的高效的微生物技术的研究方向。 关键词:城市生活垃圾 微生物 强化微生物处理技术 基因工程 ; 随着城市化进程在全球范围的加速,城市化带来的污染和人类聚居状况恶化等问题,已成为世界各国共同关心的问题。城市生活垃圾(Municipal solid waste, 简称MSW)是在城市日常生活及为城市生活提供服务的活动中产生的固体废弃物,是城市环境的主要污染物之一。目前,城市生活垃圾处理处置的方法主要包括卫生填埋(Sanitary landfill)、堆肥化(Composting)、焚烧(Incineration)三种,其中前两种处理方式均属于生物处理技术。具体来说,MSW生物处理技术就是城市生活垃圾中固有的或外添加的微生物,在一定控制条件下,进行一系列的生物化学反应,使得MSW中的不稳定的有机物代谢后释放能量或转化为新的细胞物质,从而MSW逐步达稳定化的一个生化过程。 1. 城市生活垃圾生物处理中主要的微生物。。。
生物类的,医学类的期刊都可以发啊
生物信息学PLoS计算生物学BMC生物信息学三个比较有名的和专门的生物信息学期刊。一些知名的,但没有具体的生物信息学,只是很多bioinfo被发送到了上面。核酸研究基因组生物学基因组研究BMC基因组学BMC系统生物学BMC结构生物学蛋白结构,功能和生物信息学。分子系统生物学片刻我能想到的也有几个。有很多不太出名的(影响因子)未列出
生物信息学PLoS计算生物学 BMC生物信息学三个比较有名的和专门的生物信息学期刊。一些知名的,但没有具体的生物信息学,只是很多bioinfo被发送到了上面。 核酸研究基因组生物学基因组研究 BMC基因组学 BMC系统生物学 BMC结构生物学蛋白结构,功能和生物信息学。 分子系统生物学片刻我能想到的也有几个。有很多不太出名的(影响因子)未列出
bioinformatics
生信结合实验算专著。根据查询相关信息,论著的定义是从广义角度来讲在该文章要在该领域起到开拓作用,或者论文本身开拓了一个新领域,从而对人类文明起到促进作用的就可以叫论著,生信结合实验就是一格新领域的研究,很多杂志社都可接收生信结合实验类文章,属于专著。
在线生信加组化不属于论著的。生信文章不单属那类文体,因为生信文章的表达方式比较多,我们不论把它归属于论著类文章。要具体看了内容才能给进行归类。
只要找对问题和解决方法就不难:
问题:
第一,近几年有非常多的生信分析类文章,导致“通货”膨胀了。
第二,做数据分析,需要明白相关性和因果性的区别。
第三,大量生信分析类文章结论简单,可靠性很低。
第四,很多作者不愿意或者没有条件对生信分析结论进行验证。
解决方法:
首先,对于生信的分析不要流于表面,要找到重要的问题.
其次,提高编程和生信分析的技能,从多角度多数据作出更全面的分析。
第三,尽可能地对结果或者预测进行实验验证,或者与有条件的实验室进行合作。
第四,除了采用公共数据集,对于在医院的小伙伴,可以产生自己的一些数据。
看研究方向了,不一定非得实验,但是高分文章肯定有实验成分
任何没有实验依据的结论,只能称作猜想
不一定,看你个人,如果你分析够牛逼一样发大文章,但是建议还是做实验吧,基本功一定要有的,你做的是哪个方向的?