之前本来打算根据自己对蛋白质组学数据分析的经验和理解写一系列相关教程出来供复习参考,没想到在网上查到别人已经做过了,而且笔记相当全面,从样本处理到质谱仪原理再到数据分析等等都有提及,虽然是2016-2017年的课程,但内容并未过时,对我自己也大有益处。虽然其中一些内容有重复,但我也不想再进行整理了。因为笔记链接只有微信稿,担心后期会失效,所以这里只是简单地拷贝过来,以供复习之用。
1. 蛋白质组学研究方法概述(上) 1. 蛋白质组学研究方法概述(下) 2. 蛋白质组学样品前处理(1) 2. 蛋白质组学样品前处理(2) 2. 蛋白质组学样品前处理(3) 2. 蛋白质组学样品前处理(4) 3. 蛋白质谱的原理及使用(1) 3. 蛋白质谱的原理及使用(2) 3. 蛋白质谱的原理及使用(3) 3. 蛋白质谱的原理及使用(4) 4. 蛋白质组学数据分析基础(1) 4. 蛋白质组学数据分析基础(2) 4. 蛋白质组学数据分析基础(3)
库鑫 博士,2007年毕业于华中科技大学同济医学院,获学士学位。同年9月被保送至中科院上海药物研究所并于2010年取得硕士学位。2010年10月至2014年6月在德国慕尼黑工业大学(Technische Universität München)生物分析与蛋白质组学研究所(Prof. Bernhard Kuster)攻读博士学位,专业方向为基于串联质谱的蛋白质组学在肿瘤药物研究中的应用。库鑫在博士期间发展了基于定量质谱的化学蛋白组学方法用于近生理条件下激酶小分子药物脱靶效应的研究,相关结果发表于J Prot Res, J Prot等杂志上。现任职于上海交通大学系统生物医学研究院,研究方向:肿瘤相关生物标志物的发现和蛋白质糖基化修饰的研究。
刘晓慧 博士,高级工程师,复旦大学化学系/生物医学研究院 。 蛋白质组学与系统生物学实验室,2003年毕业于湖南师范大学 获理学学士学位,2006年毕业于湖南师范大学 获生物化学与分子生物学硕士学位,2014年毕业于复旦大学,获化学生物学博士学位。2006年至今,工作于复旦大学化学系,从事基于生物质谱的蛋白质和多肽定量方法的应用和开发,熟悉iTRAQ,MRM,MRM-HR,SWATH等相关技术,参与发表相关论文30余篇。
李溱 博士,副教授。中国农业大学生物学院,植物生理学与生物化学国家重点实验室,中国农业大学“985”功能基因组中心生物质谱实验室。李博士1999年毕业于北京师范大学,获得理学学士学位,2007年毕业于美国德克萨斯州Texas A&M大学,获得博士学位。2008年-2009年在University of Illinois at Urbana-Champaign从事博士后研究,2011年至今,就职于中国农业大学生物学院,负责生物质谱实验室日常运行,对外提供蛋白质组学和代谢组学技术服务,开展基于高分辨质谱技术的植物代谢组学和蛋白质组学研究工作。
廖日晶 博士,副研究员。2006.9-2011.7于中科院上海有机化学研究所硕博连读,研究方向为天然产物抗生素的生物合成机制,2011.8-2015.5于诺华(中国)生物医学研究所从事博士后研究,研究方向为运用生物质谱技术开发组蛋白后修饰的新型分析方法学。2015年6月至今任中科院上海临床研究中心副研究员,从事生物质谱技术在基础以及临床科研方面的运用和开发新型分析方法学的研究。在攻读博士与博士后期间,以第一作者身份在美国化学会志(JACS IF: 13.0)、分析化学(Analytical Chemistry IF: 5.9)、化学和生物学(Chemistry & Biology IF: 6.6)等重要刊物上发表多篇论文。
沈诚频 博士,2005年毕业于复旦大学化学系,获得理学学士学位;同年保送至复旦大学生物医学研究院攻读博士学位,师从复旦大学生物医学研究院常务副院长杨芃原教授,2011年获得理学博士学位,攻读博士学位期间,作为访问学者于2009年-2011年前往美国麻省理工大学生物工程系交流学习。主要开展的工作包括:人肝蛋白质组学,蛋白质组学信息学,糖蛋白质组学。于2011年作为应用科学家加盟康昱盛信息科技有限公司生物信息学部,并于2013年聘为公司高级应用科学家及生物信息学部主管,主要负责蛋白质组学及生物通路分析软件和方法的技术支持及方案咨询。
唐家澍 博士,2006年毕业于南京大学理科强化部,生物化学专业,获得学士学位。2013年毕业于中科院上海生化所,师从曾嵘研究员,主要从事蛋白质组学技术和应用研究。随后在中科院上海生科院系统生物学重点实验室进行了为期两年的博士后训练,主要从事系统生物学和基于分子生物学的功能研究。从2016年1月开始,在赛默飞世尔科技色谱质谱事业部担任应用工程师,主要擅长磷酸化蛋白质组学技术,定量蛋白质组学技术以及质谱数据的生物统计学和生物信息学分析。
吴泽明 赛默飞质谱代谢组学业务发展经理,2012年毕业于中科院大连化物所,同年加入Thermo,先后任Chemist、Application Scientist与北区技术负责人等职。近10年来一直从事和密切介入基于质谱技术的代谢组学、脂质组学相关研究,在PNAS、MOL BIOSYST等杂志发表论文多篇。现专注致力于质谱与各种分离技术在Metabolomics/Lipidomics及其在疾病、生物功能与食品组学等方向的应用方法开发、技术支持和科学项目合作。
张伟 博士,赛默飞转化医学业务发展经理,在Chem. Comm., Anal. Chem., J. Proteome Res., Proteomics, J.Proteomics等知名杂志上发表论文14篇,其中第一作者10篇。2012年毕业于复旦大学生物医学研究院,获博士学位;2012年加入赛默飞公司,从事生物质谱与蛋白质组学领域的研究、技术开发、市场开拓工作。
周岳 毕业于中国科学院生物物理研究所,致力于蛋白质组学,生物制药的应用开发,技术支持和科学研究工作。在生物质谱蛋白定性分析,翻译后修饰以及蛋白定量方面有丰富的经验,参与完成多篇高水平文章的质谱工作。在赛默飞世尔科技担任质谱应用工程师期间,优化了QE系列产品,fusion系列产品在蛋白质组学应用中的质谱参数,并在Orbitrap用户中进行推广。建立了基于QE,Fusion的DIA数据采集以及数据分析流程,实现了7500个蛋白的DIA定量分析。
1、邢廷炎,吕建军,吴亮,城市环境模糊预测与综合评价信息系统[M],武汉:中国地质大学出版社,2006;2、吕建军, 张巧玲,中国地质大学(武汉)地理信息系统科研工作新进展[J],地质科技情报,1997年03期;3、刘云忠,吕建军,发挥学术交流的作用促进基础研究成果的推广应用 [J],地球科学进展,1994年第05期;4、 吕建军,林伟华,刘福江,功能可配制的GIS服务引擎[J],地球科学—中国地质大学学报,2010,35(3);5、陶留锋, 吕建军,马兵侠,移动GPS数据预处理在巡检中的应用[J],地理空间信息,2010年01期;6、吕建军,利用GIS技术管理城市供水管线系统[N],科技日报,2001年;7、吕建军,李青山,MAPGIS的产业化发展[J],地理信息世界,2004年03期;8、吕建军,张巧玲,刘云忠,基础研究成果作用的评估[J],地球科学进展,1994年05期;9、吴信才,刘福江,吕建军,林伟华,罗显刚,黄颖,扈震,周林,标准一致性测试系统及其测试方法[P].CN201010234984.1;10、曾澜,曹彦荣,何建邦,李莉,杜道生,祁国燕,苏山舞,李浩川,李超岭,李景朝,刘修国,吕建军,刘福江,余国宏,马立广,王占宏,李军, 地理信息分类与编码规则,GB/T 25529-2010;11、陶留锋,吕建军,刘福江,嵌入式GIS供水管网数据更新模式研究与实践[J],北京测绘,2010年01期;12、刘晓慧,曾文,吕建军,胡芸珊,基于MAPGIS的武汉市统计GIS设计研究[J],统计与决策,2008年09期;13、吕建军,GIS在环保管理中的应用[N],科技日报,2002年;14、吕建军,邵敏,胡芸珊,基于ArcObjects和Vega的综合仿真研究[J],武汉理工大学学报:信息与管理工程版, 2008年第30卷第3期;15、吕建军,王玲,基于MAPGIS平台的航道信息管理系统设计与实现[J],武汉理工大学学报:信息与管理工程版,2004年第26卷第5期 ;16、吕建军,刘永,MAPGIS地理信息系统产业化发展[J],科技进步与对策,1999年第16卷第2期;17、吕建军,基于MAPGIS的疾病疫情监控系统 科技进步与对策[J],2004;18、张忠贵,吕建军,市政基础设施共享服务平台研究[J],城市数字化关键技术研究与示范北京:中国城市出版社,2011.107-114;19、吕建军,GPS车辆自动导航监控系统[N],科技日报,2002年;20、陶留锋, 邢廷炎, 吕建军, 基于BlazeDS推技术的即时协同标绘系统[J],计算机应用与软件,2012,9月;
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刘晓燕考研英语课程可以在启航教育的网站上购买后进行观看学习。
刘晓燕介绍:
1、属于新晋网红老师。为人大大咧咧,十分接地气,典型的激进派,晓燕老师本科商师考研逆袭清华,努力程度可想而知,成为广大考研人的榜样。
2、口碑上呈正反两个态势,部分学生认为她的课闲话过多,影响听课效果。英语基础较为薄弱的同学,跟着刘晓燕学习,提分效果会很明显。适合大多数考生观看学习。
代表性研究论文:
石油类污染物在土壤中的吸附/解吸机理研究及展望.矿物岩石地球化学学报,2007,26(1)。
生物基因技术修复石油污染土壤研究进展.生物学通报.2007,42(12)。
土壤中石油类有机污染物检测方法研究进展.中国环境监测,2006,22(2)。
大庆土壤中石油类污染物迁移模拟.中国石油大学学报,2006,30(2)。
石油污染地表土壤的微生物降解特征.西安石油大学学报,2005,20(4)。
石油类污染物在土壤中迁移的实验研究进展.土壤,2005,37(5)。
石油污染物在土壤上的吸附/解吸实验研究进展.土壤,2007,39(2)。
柴油车尾气残余物有机污染特征及其环境危害.环境保护科学,2005,31(1)。
市郊公路边土壤中有机污染物分布特征.中国公共卫生.2008,24(3)。
主要承担《大学语文》、《语文》、《文选与写作》、《写作》等专业必修课和《新闻采访与编辑》等公共选修课的教学任务。专业研究方向为民族民间文学,研究专长为民族学、儿童文学、新闻学。主要学术研究成果:论文《彝族史诗<查姆>的艺术特点初探》,《彝族史诗<查姆>的社会化特点初探》,《彝族罗罗虎文化》,《彝族灵魂观念中的幽冥世界》(收入《人大复印资料》目录索引、《民族问题研究》2002年度理论文章目录),《彝族灵魂观念中的善与恶》,《彝族风俗‘姑娘房’》,《彝族灵魂观念透视》,《彝族灵魂观念中的“竹”崇拜》,《八面受敌,一意求之》,《浅谈如何看待语文教学中的练习》,《语文教学评估研究》,《语言交际——语言能力获得的基本方式》等;著作《小学语文板书设计》(参编),《中师课外活动》(参编);文学作品《春天的启示》(组诗),《闪亮在火把节之夜》(组诗),《秋天的心事》(组诗),《潇洒的滋味》(组诗),《感谢生命》(组诗),《罂粟花开》(组诗),《完美的境界》(组诗),《海幻》(散文),《“大灰狼”回来了》(小说)等;出书儿童文学集《醉麂》(收编);散文集《圆梦》(收编);承担科研项目两项:(1)2001-2004完成云南省科研基金项目《彝族民族文化研究》,(2)2005-2007在研云南省科研基金项目《彝族民间文学与彝族传统美德研究》。一九八三年十二月在云南省儿童文学征文评奖中荣获优秀作品二等奖。 一九九一年获楚雄州电视台“三言两语话《渴望》征文比赛”一等奖,同年获学校青年教师优质课评比三等奖,同年10月在教职工《园丁颂》演讲比赛中获二等奖。一九九二年,被学校评为“优秀班主任”,同年被中共云南省教育委员会邀请参加“第四届云南省优秀教师“园丁之家”活动。一九九三年荣获“云南省少数民族讲普通话大赛”演讲词类“三等奖”,同年荣获“楚雄州少数民族讲普通话大赛”小品类“创作三等奖”,演讲词创作“二等奖”。一九九四年,在楚雄州妇联“巾帼建功”演讲比赛中获奖。一九九五年获云南省师范学校青年教师“四个一竞赛”语文学科论文一等奖。一九九六年,被学校评为“工会积极分子”,同年被学校评为“推普先进”。一九九七年,被楚雄州教委授予“楚雄州优秀德育工作者” 荣誉称号,同年,被学校评为“优秀共产党员”、“师德标兵”、“优秀班主任”、“优秀教师”、“五好文明家庭”。一九九八年,被学校评为“师德标兵”、“优秀教师”、“优秀实习指导教师”。二零零零年至二零零一年被楚雄师范学院授予“选进育人工作者”荣誉称号。二零零一年三月在云南省民族团结艺术团首场《新世纪的太阳》演出工作中,成绩突出被楚雄州教委、文化局表彰。二零零四年五月领队参加云南省第二届管乐大赛获比赛一等奖、优秀组织奖和优秀指挥奖。
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刘晓艳,1977年9月出生,东华大学纺织学院、纺织科学与工程学科教授。长期从事纺织材料领域的应用基础研究,特别是纺织面料的功能开发和智能仿生研究。
主持完成了国家自然科学基金、教育部博士点新教师基金等多类科研项目。发表科研论文60余篇,SCI/EI收录30多篇,申请国家发明专利20多项。
上海纺织工程学会会员、江苏省吴江科技局科技人才工作特别顾问、《纺织报告》编委,并担任Fibers and Polymers等期刊审稿人。
刘晓艳资料
本科毕业于河南省商丘师范学院英语专业,硕士研究生毕业于清华大学法学系。从清华大学毕业后,多年来一直从事于考研英语教学研究工作。
坚持用我们所会的语言来诠释复杂的英语知识,是目前国内独一无二考研英语所有模块全讲的女教师,深受广大学子喜爱,被亲切的称为“强悍的考研英语老师”。
教授,硕士生导师。1981年进入四川大学物理系开始本科学习,1985在四川大学物理系开始硕士研究生学习,1988年取得硕士学位后任教于西北工业大学物理系。1995年在西北工业大学凝固技术国家重点实验室开始攻读博士学位,研究方向是红外材料 HgMnTe、CdTe、CdZnTe晶体生长与光电特性研究,1998年取得博士学位。随后在南京大学固体微结构物理国家重点实验室做博士后,主要研究内容是介电、铁电氧化物薄膜的制备及其与半导体的集成。2001年去新加坡数据存储研究院(Data Storage Institute)从事博士后研究,研究内容是过渡金属磁性离子搀杂II–VI族稀磁半导体薄膜及金属/氧化物纳米复合颗粒膜的制备及性能表征。2003-2008年任汕头大学物理系教授。现为广东工业大学物理与光电工程学院教授。数年来发表SCI论文20余篇,荣获省部科技奖4项,主持科研项目5项。目前的研究领域包括纳米发光材料、铁电磁性复合材料等。
主要荣誉 研究项目“凝固过程的分凝行为及其应用”于2004年3月荣获“陕西省科学技术奖 壹等”(第二完成人)研究项目“结晶过程的分凝行为及其相关凝固理论”荣获2005年度“教育部科学技术进步奖 二等”(第三完成人)主要论文 在国外重要SCI刊物上以第一作者发表研究论文十余篇。科研项目 已完成和目前正主持省部级科研项目四项。教学活动 主讲课程:《固体物理》,《高等固体物理》,《铁磁学》,《材料物理》,《大学物理》
《江西教育》1983年02期
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【摘要】:正苏联作家、教育家马卡连柯(1888—1939)的长篇小说《教育诗》,叙述了教养院的流浪儿童,从不遵守纪律的乌合之众,转变为团结战斗的集体的故事。马卡连柯出生在铁路技工家庭,做过小学校长。十月革命以后,苏维埃国家要在沙皇俄国的废墟上建立,处于百废待兴的局面。流浪儿童和青少年罪犯成群,教育和改造他们成了新
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曾丽娟,汉族,国籍中国,博士,汕头大学教授,具有十多年建筑行业的项目实践与科学研究经验,主要研究的领域是工程项目经济与管理。