首页 > 期刊论文知识库 > 甲基化测序学位论文

甲基化测序学位论文

发布时间:

甲基化测序学位论文

衔接上一篇数据比对后的结果,使用R包DSS进行处理。

我们先来复习一下上一节课得到的数据结果: *. 文件

这里我们使用的R包为DSS,使用 Bioconductor 进行安装。 这个包可以对甲基化数据做两件事:

DSS包对差异甲基化的检测基于β负二项分布的严格沃尔德检验。

输入数据的格式如下:

DML是甲基化差异位点,DMR为甲基化差异区域。 使用DSS包自带的数据进行演示

1. 载入两个包DSS和bsseq(需要该包构建obj对象)

2. 利用DMLtest函数call DML,分为一下几个步骤:

根据甲基化水平进行loci的差异分析

3. 根据dmlTest来call DML

当然,用户也可以指定差异的阈值,只有差异大于阈值的才会被call出来。

4. 根据dmlTest Call DMR

我们可以发现,smoothing前后得到的结果差异还是很大,所以针对不同的实验类型我们需要注意是否使用smoothing。 同理,也可以使用的delta参数以及调整得到合适的结果。

5. 可视化 DSS包提供了一个不是很美观的可视化函数,用户其实可以使用coverage结果在R里面作图。

分析到此就告一段落了,随后就是自行对差异甲基化区域的注释以及可视化文献作图。

后续在处理数据的时候,发现有一个情况,多核跑DMLtest会报错,详情解决方案可见 以下为简单解决方案

近年来,中枢神经系统(CNS)肿瘤的分类变得更加客观、更依托生物学认知。虽然过去的分子诊断包括特定突变、拷贝数变化或基因融合,但DNA甲基化测序的发展显著提高了诊断精度,增加了可靠性,并为发现新的肿瘤类型提供了思路。在大多情况下,基因突变/融合与DNA甲基化间存在着密切关系。在这篇综述中,作者强调了DNA甲基化图谱在中枢神经系统肿瘤分类中的作用,重点介绍了几种肿瘤类型,以及DNA甲基化图谱对目前肿瘤分类的贡献。 CpG 甲基化测定 有多种方法可以量化DNA甲基化,每种方法在临床肿瘤学中都有不同的应用。限制性内切酶酶切、亲和富集方法,如甲基化DNA免疫沉淀(MeDIP)和电化学检测都是用于测定全基因组甲基化的方法。基因组DNA的重亚硫酸盐测序是最常用的方法,重亚硫酸氢钠可以将未甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶,除此之外还有全基因组重亚硫酸盐测序(WGBS)技术。图1概述了目前DNA甲基化图谱的诊断应用及其在外科神经病理学中的作用。生物信息分析 为了将甲基化阵列数据转化为实际应用,需要执行各种分析和计算步骤。用甲基化数据描述肿瘤类型的一个比较常见和实用的方法是降维。类似于主成分分析(PCA),这些算法将高维数据(例如,数千个脑瘤样本,每个样本具有约20-30k数据)降至低维(2或3)以便于可视化(图2)。 值得一提的是,甲基化阵列数据中还可以获得其他对诊断有帮助信息。人们很早就认识到甲基化和非甲基化信号强度的总和可以用来推断全基因组的拷贝数,分段的拷贝数数据以及拷贝数断裂点的分析也会对诊断和基因融合的判断起到帮助作用。诊断准确性及其对临床结果的影响 截止到目前,甲基化图谱已经识别出多个新的中枢神经系统肿瘤类型和亚型,其中许多都与临床病程和临床结果有着重要的关联。在临床中,甲基化数据分析在很多病例诊断结果的确定上起到了重要的辅助作用。 基于的临床检测出的差异甲基化数据,从前被归类为原始神经外胚层肿瘤现在被分类成多个不同的肿瘤类型,这些肿瘤包括具有高频率C19MC改变的多层菊形团胚胎性肿瘤(ETMR),具有 FOXR2 激活的中枢神经母细胞瘤(CNS-NB-FOXR2),BCOR串联重复的CNS肿瘤(CNS-BCOR-ITD)。总体而言,基于DNA甲基化数据的非监督分析对于CNS-PNET亚型间的区别具有重要的临床意义。 新型和罕见的肿瘤类型 除了在识别常见的中枢神经系统肿瘤类型方面的优势外,甲基化特征分析的一个新的优势是它能够发现新的肿瘤类型,并提供现有类型的确认/改进。例如, IDH1/2 突变定义了一个广泛的弥漫性胶质瘤亚型,这些亚型在临床和分子上与异柠檬酸脱氢酶(IDH)野生型弥漫性胶质瘤不同,这种遗传差异通过DNA甲基化图谱得到证实。甲基化图谱针对对于许多新的肿瘤类型在很大程度上已经成为了一种发现工具。 胶质瘤(Gliomas) 毛细胞型星形细胞瘤(HGAP)包括一个独特的甲基化群,包括 ATRX、TERT 启动子突变; CDKN2A/B 缺失/突变、 CDK4 扩增; NF1 缺失/突变、 BRAF 融合等。组织学表现与其他胶质瘤有很大重叠,HGAP多见于年轻人(中位年龄40岁),主要见于颅后窝。值得注意的是,HGAP在儿童(0-16岁)中发病是比较罕见的,这个年龄段的大多数形态学诊断的“毛细胞型星形细胞瘤伴间变”与其他甲基化类别聚集在一起,包括毛细胞型星形细胞瘤和IDH-野生型GBM。 目前,甲基化图谱是诊断这种肿瘤类型的唯一方法。在HGAP中发现的基因改变(如 CDKN2A/B 纯合缺失、 ATRX 突变、 BRAF 融合)是非特异性的,可见于其他中枢神经系统肿瘤类型。然而,检测到这些基因改变,就应该引起对HGAP的怀疑。临床上,HGAP与其他高级别胶质瘤的区别很重要,因为HGAP的预后比PA和PXA更具侵袭性,但总体存活率明显高于IDH-野生型GBM。HGAP被误诊为GBM的情况并不少见,精准诊断在临床上具有十分重要的意义,因此将组织学相似的肿瘤分解为生物学和临床相关的类型是DNA甲基化分类的显著优势之一(图3)。神经胶质瘤(Glioneuronal Tumors) 弥漫性胶质神经元瘤具有少突胶质瘤样特征和核簇(DGONC)是最近提出的一种通过甲基化定义的肿瘤类型,它是通过对>25000个中枢神经系统肿瘤的非监督聚类而发现的。DGONC的组织学表型可能与其他肿瘤类型有显著重叠,包括少突胶质细胞瘤和CNS-PNET。在低级别胶质细胞或神经胶质细胞肿瘤中常见的遗传学改变,如FGFR1和BRAF,尚未在测序病例中发现。由于这种肿瘤类型的遗传驱动因素尚未阐明,DNA甲基化图谱仍然是检测其的唯一方法。在低级别胶质细胞或神经胶质细胞肿瘤中,典型的遗传学改变,如 FGFR1 和 BRAF ,尚未在测序病例中被发现。由于这种肿瘤的遗传驱动因素尚未明确,DNA甲基化图谱仍是其检测的唯一方法。 胚胎肿瘤(Embryonal Tumors) 多层菊形团胚胎性肿瘤(ETMR)是一种高度分级(WHO 4级)的原始中枢神经系统肿瘤,具有明显的组织学特征。ETMR甲基化图谱显示与其他中枢神经系统肿瘤类型明显分离,并形成一个相对同质的群体,无论是C19MC扩增还是 DICER1 突变状态。绝大多数病例存在多层菊形团和神经纤维团混合区域的特征性组织学特征。结合LIN28A免疫组织化学,在显微镜下即可作出诊断。尽管LIN28A具有很高的敏感性,但它的表达不是ETMR所特有的,在AT/RT、生殖细胞肿瘤和HGG中已有报道。因此,DNA甲基化分析是诊断ETMR的一种特异性方法,与潜在的组织病理学或基因突变无关,同时基于甲基化的拷贝数评估也可以作为识别潜在亚型的有用特征。 这些肿瘤类型之间的区别在临床上十分重要,通常可以通过组织病理学和影像学来解决。然而,非典型病例可能会造成诊断困难。AT/RT和PDC(脊椎)的平均OS分别为个月和51个月(AT/RT不同亚型的生存期不同)。CRINET和DMT的生存数据有限,但已报道的平均OS分别为125个月(AT/RT-TYR为37个月)和36个月。尽管有共同的基因改变,AT/RT、PDC和DMT的DNA甲基化特征还是具有明显特异性的(图2)。到目前为止的数据表明,DNA甲基化图谱可以区分可能会构成诊断问题的大多数 SMARCB1 失活的中枢神经系统肿瘤。 间充质肿瘤(Mesenchymal Tumors) 伴有 CIC 基因重排的肉瘤是一种罕见的高级别间叶性肿瘤,同时发生于中枢和中枢神经系统外。在组织学上,伴有 CIC 基因重排肉瘤的特点是肿瘤细胞形态呈梭形或圆形,高度恶性(增殖、坏死),并有数量不等的粘液基质。特征性的基因改变是 CIC 与各种配对基因的易位,导致作为显性癌基因的融合。在中枢神经系统中,最常见的是 CIC-NUTM1 融合,由t(15;19)易位。在 CIC 融合阳性的病例中,有14%的 CIC 裂解FISH呈假阴性。此外,在融合阴性的病例中也发现了 CIC 突变。最近的一份报告还指出,出现了涉及 ATXN1 和 DUX4 的非 CIC 融合基因。在甲基化图谱上根据 CIC 基因将肉瘤重新分成不同的组,与潜在的融合基因/突变或解剖部位无关(图2)。 DICER1 突变的原发性颅内肉瘤是一种新发现的高度恶性肉瘤,由染色体上 DICER1 基因的体细胞或胚系突变所定义。发生在胚系 DICER1 突变背景下的肿瘤可能代表遗传性或综合征性关联(即 DICER1 综合征)。胚胎型横纹肌肉瘤的组织学特征常见于肌源性分化、形态学和免疫表型重叠。因此,初步命名为“具有横纹肌肉瘤样特征的梭形细胞肉瘤, DICER1 突变体”。 DICER1 突变的颅内肉瘤的组织学表现没有特异性,可能与其他肉瘤如滑膜肉瘤、纤维肉瘤和胶质肉瘤重叠。而DNA甲基化分析可以很容易地将 DICER1 突变的原发性颅内肉瘤与其它肿瘤类型区分开来。然而,还需要进一步的研究来评估DNA甲基化分析是否能将其与转移性 DICER1 突变肿瘤区分。已建立的中枢神经系统肿瘤的表观遗传学亚型 作者在这篇文章中还提供了DNA甲基化图谱对已建立的世卫组织中枢神经系统肿瘤亚型的贡献的例子。世界卫生组织对中枢神经系统肿瘤的第5版分类预计将包括更多分子定义的亚型。甲基化阵列分析已被证明能有效地识别并在某些情况下定义这些亚型。 易基因小结 将DNA甲基化分析整合到中枢神经系统肿瘤的常规检查中,可以提高诊断的准确性以及实现明确肿瘤类型的临床意义。捕捉原发性中枢神经系统肿瘤的遗传异质性是DNA甲基化图谱最大的优势。尤其在组织学上不明确的肿瘤类型中具有重要价值,这些肿瘤类型可能含有靶向改变(例如,IHG)。DNA甲基化在确认组织学诊断方面的可靠性已经得到证实。 在骨骼和软组织病理学中实施的基于DNA甲基化阵列的分类可能预示着其他疾病领域得检测也会发生类似的转变。在通过TCGA分析的33种癌症中,全基因分子图谱显示了基于DNA甲基化数据的无监督聚类的所有类型中具有生物学或预后意义的亚群,进一步强调了DNA甲基化在其他癌症中的潜在临床应用价值。鉴于中枢神经系统肿瘤诊断对甲基化特征的日益依赖及其在临床分类标准中的应用,在诊断神经病理学的实践中,特别是对于罕见的中枢神经系统肿瘤,有必要进一步研究和利用DNA甲基化检测这一对临床诊断有巨大帮助作用的技术。

WGBS全称Whole Genome Bisulfite Seuqneicng: 即全基因组重亚硫酸盐测序。该方法通过Bisulfite处理,将原基因组中未发生甲基化的C碱基转换成U的同时,保留所有甲基化C的碱基不发生转变,从而帮助科研人员识别发生甲基化的CpG位点。该种测序技术适用于绘制单碱基分辨率的全基因组DNA甲基化图谱。          RRBS全称Reduced Representation Bisulfite Sequencing: 即简化代表性重亚硫酸盐测序。该方法在Bisulfite处理前,使用MspI(该酶的酶切位点为CCGG)酶切对样本进行处理, 去除低CG含量DNA片段 ,从而使用较小的数据量富集到尽可能多的包含CpG位点的DNA片段。         相比于WGBS技术,RRBS是一种准确、高效且经济的DNA甲基化研究方法,通过酶切,并进行Bisulfite测序,该方法在保证DNA甲基化状态检测的高分辨率的同时提升测序数据的高利用率。 甲基化数据处理流程:

基因测序毕业论文

现代生物技术制药研究及展望生物技术药物(biotech drugs)或称生物药物(biopharmaceutics)是集生物学、医学、药学的先进技术为一体,以组合化学、药学基因(功能抗原学、生物信息学等高技术为依托,以分子遗传学、分子生物、生物物理等基础学科的突破为后盾形成的产业。现在,世界生物制药技术的产业化已进入投资收获期,生物技术药品已应用和渗透到医药、保健食品和日化产品等各个领域,尤其在新药研究、开发、生产和改造传统制药工业中得到日益广泛的应用,生物制药产业已成为最活跃、进展最快的产业之一。 有些学者认为,20世纪的科学技术是以物理学和化学的成就占主导地位,而21世纪的科学技术是以生物学的成就占主导地位。无论这种说法是否得到普遍的认同,生物技术是当今高技术中发展最快的领域似乎是不争的事实。 科学家预测,生命科学到2015年会取得革命性进展。这些进展可以帮助人类解决很多目前无法医治的疾病的治疗问题,彻底消除营养不良,改善食品的生产方式,消除各种污染,延长人类寿命,提高生命质量,为社会安全和刑侦提供新的手段。有些成果还可以帮助人类加速植物和动物的人工进化以及改善生态环境对人类的影响等。产生新的有机生命的研究也会取得进展。 1.生物制药现状 目前生物制药主要集中在以下几个方向: 1 肿瘤 在全世界肿瘤死亡率居首位,美国每年诊断为肿瘤的患者为100万,死于肿瘤者达万。用于肿瘤的治疗费用1020亿美元。肿瘤是多机制的复杂疾病,目前仍用早期诊断、放疗、化疗等综合手段治疗。今后10年抗肿瘤生物药物会急剧增加。如应用基因工程抗体抑制肿瘤,应用导向IL-2受体的融合毒素治疗CTCL肿瘤,应用基因治疗法治疗肿瘤(如应用γ-干扰素基因治疗骨髓瘤)。基质金属蛋白酶抑制剂(TNMPs)可抑制肿瘤血管生长,阻止肿瘤生长与转移。这类抑制剂有可能成为广谱抗肿瘤治疗剂,已有3种化合物进入临床试验。 2 神经退化性疾病 老年痴呆症、帕金森氏病、脑中风及脊椎外伤的生物技术药物治疗,胰岛素生长因子rhIGF-1已进入Ⅲ期临床。神经生长因子(NGF)和BDNF(脑源神经营养因子)用于治疗末稍神经炎,肌萎缩硬化症,均已进入Ⅲ期临床。 美国每年有中风患者60万,死于中风的人数达15万。中风症的有效防治药物不多,尤其是可治疗不可逆脑损伤的药物更少,Cerestal已证明对中风患者的脑力能有明显改善和稳定作用,现已进入Ⅲ期临床。Genentech的溶栓活性酶(Activase重组tPA)用于中风患者治疗,可以消除症状30%。 3 自身免疫性疾病 许多炎症由自身免疫缺陷引起,如哮喘、风湿性关节炎、多发性硬化症、红斑狼疮等。风湿性关节炎患者多于4000万,每年医疗费达上千亿美元,一些制药公司正在积极攻克这类疾病。如 Genentech公司研究一种人源化单克隆抗体免疫球蛋白E用于治疗哮喘,已进入Ⅱ期临床;Cetor′s公司研制一种TNF-α抗体用于治疗风湿性关节炎,有效率达80%。Chiron公司的β-干扰素用于治疗多发性硬化病。还有的公司在应用基因疗法治疗糖尿病,如将胰岛素基因导入患者的皮肤细胞,再将细胞注入人体,使工程细胞产生全程胰岛素供应。 4 冠心病 美国有100万人死于冠心病,每年治疗费用高于1 170亿美元。今后10年,防治冠心病的药物将是制药工业的重要增长点。Centocor′s Reopro公司应用单克隆抗体治疗冠心病的心绞痛和恢复心脏功能取得成功,这标志着一种新型冠心病治疗药物的延生。基因组科学的建立与基因操作技术的日益成熟,使基因治疗与基因测序技术的商业化成为可能,正在达到未来治疗学的新高度。转基因技术用于构造转基因植物和转基因动物,已逐渐进入产业阶段,用转基因绵羊生产蛋白酶抑制剂ATT,用于治疗肺气肿和囊性纤维变性,已进入Ⅱ,Ⅲ期临床。大量的研究成果表明转基因动、植物将成为未来制药工业的另一个重要发展领域。 2.生物制药展望 今后10年生物技术将对当代重大疾病治疗剂创造更多的有效药物,并在所有前沿性的医学领域形成新领域。目前热门的药物生物技术如下 求采纳

转录组测序能作为毕业论文。

转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。

蛋白质是行使细胞功能的主要承担者,蛋白质组是细胞功能和状态的最直接描述,转录组成为研究基因表达的主要手段,转录组是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的必然纽带,转录水平的调控是研究最多的,也是生物体最重要的调控方式。

毕业论文(graduation study):

按一门课程计,是普通中等专业学校、高等专科学校、本科院校、高等教育自学考试本科及研究生学历专业教育学业的最后一个环节,为对本专业学生集中进行科学研究训练而要求学生在毕业前总结性独立作业、撰写的论文。

在医学领域中,药学专业学生需要学习基础医学相关知识,成为社会需要的创新型药学人才。下文是我为大家整理的药学的论文 范文 的内容,欢迎大家阅读参考! 药学的论文范文篇1 试谈生物制药新技术发展分析 [摘 要]生物技术药物(biotech drugs)是集生物学、医学、药学的先进技术为一体,以组合化学、药学基因(功能抗原学、生物信息学等高技术为依托,以分子遗传学、分子生物、生物物理等基础学科的突破为后盾形成的产业。 文章 分析了通过生物制药新技术的创立,可以大大拓宽发明新药的空间,增加发明新药的机遇与速度。 [关键词]生物 制药 新技术 探析 生物技术药物(biotechdrugs)或称生物药物(biopharmaceutics)是集生物学、医学、药学的先进技术为一体,以组合化学、药学基因(功能抗原学、生物信息学等高技术为依托,以分子遗传学、分子生物、生物物理等基础学科的突破为后盾形成的产业。 一 生物制药技术 目前生物制药主要集中在以下几个方向: 1、肿瘤。 在全世界肿瘤死亡率居首位,美国每年诊断为肿瘤的患者为100万,死于肿瘤者达万。用于肿瘤的治疗费用1020亿美元。肿瘤是多机制的复杂疾病,目前仍用早期诊断、放疗、化疗等综合手段治疗。今后10年抗肿瘤生物药物会急剧增加。如应用基因工程抗体抑制肿瘤,应用导向IL-2受体的融合毒素治疗CTCL肿瘤,应用基因治疗法治疗肿瘤(如应用γ-干扰素基因治疗骨髓瘤)。基质金属蛋白酶抑制剂(TNMPs)可抑制肿瘤血管生长,阻止肿瘤生长与转移。这类抑制剂有可能成为广谱抗肿瘤治疗剂,已有3种化合物进入临床试验。 2、神经退化性疾病。 老年痴呆症、帕金森氏病、脑中风及脊椎外伤的生物技术药物治疗,胰岛素生长因子rhIGF-1已进入Ⅲ期临床。神经生长因子(NGF)和BDNF(脑源神经营养因子)用于治疗末稍神经炎,肌萎缩硬化症,均已进入Ⅲ期临床。美国每年有中风患者60万,死于中风的人数达15万。中风症的有效防治药物不多,尤其是可治疗不可逆脑损伤的药物更少,Cerestal已证明对中风患者的脑力能有明显改善和稳定作用,现已进入Ⅲ期临床。Genentech的溶栓活性酶(Activase重组tPA)用于中风患者治疗,可以消除症状30%。 3、自身免疫性疾病。 许多炎症由自身免疫缺陷引起,如哮喘、风湿性关节炎、多发性硬化症、红斑狼疮等。风湿性关节炎患者多于4000万,每年医疗费达上千亿美元,一些制药公司正在积极攻克这类疾病。 4、冠心病。 美国有100万人死于冠心病,每年治疗费用高于1170亿美元。今后10年,防治冠心病的药物将是制药工业的重要增长点。Centocor′sReopro公司应用单克隆抗体治疗冠心病的心绞痛和恢复心脏功能取得成功,这标志着一种新型冠心病治疗药物的延生。 基因组科学的建立与基因操作技术的日益成熟,使基因治疗与基因测序技术的商业化成为可能,正在达到未来治疗学的新高度。转基因技术用于构造转基因植物和转基因动物,已逐渐进入产业阶段,用转基因绵羊生产蛋白酶抑制剂ATT,用于治疗肺气肿和囊性纤维变性,已进入Ⅱ,Ⅲ期临床。大量的研究成果表明转基因动、植物将成为未来制药工业的另一个重要发展领域。 二 生物制药发展分析 未来生物技术将对当代重大疾病治疗剂创造更多的有效药物,并在所有前沿性的医学领域形成新领域。 生物学的革命不仅依赖于生物科学和生物技术的自身发展,而且依赖于很多相关领域的技术走向,例如微机电系统、材料科学、图像处理、传感器和信息技术等。尽管生物技术的高速发展使人们难以作出准确的预测,但是基因组图谱、克隆技术、遗传修改技术、生物医学工程、疾病疗法和药物开发方面的进展正在加快。 除了遗传学之外,生物技术还可以继续改进预防和治疗疾病的疗法。这些新疗法可以封锁病原体进入人体并进行传播的能力,使病原体变得更加脆弱并且使人的免疫功能对新的病原体作出反应。这些 方法 可以克服病原体对抗生素的耐受性越来越强的不良趋势,对感染形成新的攻势。 除了解决传统的细菌和病毒问题之外,人们正在开发解决化学不平衡和化学成分积累的新疗法。例如,正在开发之中的抗体可以攻击体内的可卡因,将来可以用于治疗成瘾问题。这种方法不仅有助于改善瘾君子的状况,而且对于解决全球性非法毒品贸易问题具有重大影响。 各种新技术的出现有助于新药物的开发。计算机模拟和分子图像处理技术(例如原子力显微镜、质量分光仪和扫描探测显微镜)相结合可以继续提高设计具有特定功能特性的分子的能力,成为药物研究和药物设计的得力工具。药物与使用该药物的生物系统相互作用的模拟在理解药效和药物安全方面会成为越来越有用的工具。例如,美国食品药物管理局(FDA)在药物审批的过程中利用DennisNoble的虚拟心脏模拟系统了解心脏药物的机理和临床试验观测结果的意义。这种方法到2015年可能会成为心脏等系统临床药物试验的主流方法,而复杂系统(例如大脑)的药物临床试验需要对这些系统的功能和生物学进行更为深入的研究。 药物的研究开发成本目前已经高到难以为继的程度,每种药物投放市场前的平均成本大约为6亿美元。这样高的成本会迫使医药工业对技术的进步进行巨大的投资,以增强医药工业的长期生存能力。综合利用遗传图谱、基于表现型的定制药物开发、化学模拟程序和工程程序以及药物试验模拟等技术已经使药物开发从尝试型方法转变为定制型开发,即根据服药群体对药物反应的深入了解会设计、试验和使用新的药物。这种方法还可以挽救过去在临床试验中被少数患者排斥但有可能被多数患者接受的药物。这种方法可以改善成功率、降低试验成本、为适用范围较窄的药物开辟新的市场、使药物更加适合适用对症群体的需要。如果这种技术趋于成熟,可以对制药工业和健康 保险 业产生重大影响。 三 结语 总之,综合多学科的努力,通过新技术的创立可以大大拓宽发明新药的空间,增加发明新药的机遇与速度。因为这些手段可以寻找快速鉴定药物作用的靶,更有效地发现更多新的先导物化学实体,从而为发明新药提供更加广阔的前景。 参考文献 [1] 邱芳菊,谈对制药新技术的探析,论文网,2009,08. 药学的论文范文篇2 浅谈我国生物制药产业现状分析及发展战略 【摘要】 本文对我国生物制药产业现状及发展战略进行了研究。指出了我国生物制药产业突出的问题,比如创新研发不足,融资的 渠道 不畅,混乱的产业格局。针对出现的问题,提出了相应的解决方法,有仿制、创新并举,拓宽融资的渠道,进行标准化的管理。全文结构紧凑,希望可以促进相关问题的研究。 【关键词】 生物制药;发展;创新 近20年来,以酶工程、细胞工程、发酵工程、基因工程为代表现代的生物技术得到了迅猛的发展,并日益改变和影响着人们的生活和生产方式。自上世纪的90年代以来,随着基因组等重大技术突破使生物技术产业化的进程明显的加快。当前,有三分之二的生物技术成果被应用于医药行业,用以对传统医药学进行改良或开发特色新药,由此引起医药工业重大的变革。 1 我国的生物制药业现状 总体概述 我国的生物制药业起步比较晚,经过20多年的发展,基因工程药物作为核心研制、开发与产业化己具备了一定的规模。当前我国注册生物技术类公司有400多家,已经取得基因工程类药物试产或者生产批文企业占到四分之一,主要分布于一些经济发达省、市及地区,比如北京、上海、浙江、广东、山东、江苏等地。近十几年来,我国开发了一大批新特效类药物,大大解决过去使用常规方法不能够生产或生产成本非常昂贵药品生产技术的问题,这些药品可分别用来防治诸如遗传性、心脑肺血竹、免疫性、肿瘤、内分泌之类严重威胁到人类健康疑难病症,并且在避免毒副等作用明显要优于传统类药品。 突出的问题 创新研发不足 在加入世界贸易组织以后,中国必须要遵守《同贸易有关知识产权协议》,于专利期内如果仿制某类新药,开发一方有权索要4- 10亿美金赔款。国际的大型生物制药类企业,研发的费用可占到销售收入20%以上,在这个方面我国的生物制药行业长期处在弱势的情况。 引发国内生物的制药业缺乏创新原因就在生物制药类企业于研发思想意识上比较落后,新药的研发过程沿用了学术工作方式,先从文献索引开始,在实际上仍然是走一条模仿的道路,缺少原创性。在一方面,科技研究所研究成果,多数还沉淀于实验室或保险柜;另一方面,比较于产品的创新,企业更加注重于现有产品改革及提高。这样的结果就是,创新的成果市场的转化率很低,离产业化、规模化的需求仍有非常大的距离。 融资的渠道不畅 作为高新技术类行业,生物制药的产业特点决定它需要前期资本的投入很大,因此除了企业的自身盈利积累及政府的资助以外,资本融通问题就变得至关重要。风险投资机构在生物制药投资方面发挥着重要的作用,但是因为投资的收益不理想,最近几年来投资大幅减少,由全面投资转变为重点投资。因为风险投资的明显导向作用,引起其他方面投资纷纷的缩水,这都严重阻碍我国的生物制药业发展。 混乱的产业格局 我国的生物制药业未形成一定的格局,产品生产进入了壁垒期。国内企业于市场风险的估计不足,对于一些国外畅销类产品,生产能力严重过剩,引发整个市场低水平的恶性竞争。除最初几个产品先上市企业得到盈利以外,大多企业难以获得大的毛利率,在些甚至处在亏损的边缘。 2 我国生物制药产业发展战略 仿制、创新并举 制药行业里能销售真正有价值产品只有一种:就是患者使用药物。创新不仅仅是个学术过程,更是个商业过程,企业创新首先应当从需求开始,进而寻找满足此种需求功能,由功能来确认技术构思,由技术构思来考虑技术方案,这样就可降低产品研发技术上的风险。在制药业方面,产业链分成上游创新的阶段、中游物质的分离阶段、产品的加工阶段、下游的 营销策划 阶段及渠道分销等。而生物药品研究开发的方式应该趋向一体化,从研究试验到生产到市场整个的过程要实行一体化,创建企业、研究机构一体化联合体,于技术、资金、市场、人才与管理互动式发展,相互渗透。 拓宽融资的渠道 公开的资本市场里融资可为产品处于成熟的阶段生物制药类企业提供资本的渠道,但对大部分处于初创期或种子期的企业由于缺少稳定的现金、现实商品化的产品、可靠偿债的能力,难以从间接的资本市场来获得支持(比如银行类金融机构提供债权性的资本),并且高额的负债所产生沉重利息负担会极大制约企业后继的发展。 国外风险基金在逐渐地进入中国,包含大型生物制药公司和技术公司在内跨国企业使用联盟等方式对我国的生物制药类企业进行投资,及我国自身的私募基金、风险基金等发展,还有呼之欲出创业板,于我国生物制药类产业发展将会起到强大推动作用。我国的生物制药类企业只有增强项目的运作能力,才会有效地融合金融和生物制药技术,形成围绕企业成长的全面的发展链,进而构成项目运作良好的循环。 进行标准化的管理 国际贸易中,欧美发达国家凭借自身的经济、技术优势,制定苛刻的技术法规、技术标准和技术认证的制度,于发展中国家出口交易产生极大限制作用。医药的贸易也成为欧美国家使用技术壁垒里最频繁领域之一。国内的制药企业环境安全上的意识还很薄弱,实行国际认证企业的数目也极少,这都会在以后的我国医药产品出口上形成“技术壁垒”。为此,国内的生物制药类企业需清醒地认识到: 进行标准化的管理是国内生物制药类企业突破技术的壁垒,提高商品出口根本的途径。积极引进、培养熟悉国际规则又有制药的实践 经验 专家型的人才,进而使企业达到国际的先进水平。 参考文献 [1]董文政,张仕:生物制药业何时是艳阳天.中证网.2010(7).10―14 [2]中国统计年鉴.北京:中国统计出版社.2009(4).20―40。 [3]朱少杰,蔡茂森:论技术贸易壁垒的抑制效应和我国出口行业的对策.国际贸易问题.2008(7).8―11。 [4]令狐谱,黄速建:并购后整合:企业并购成败的关键因素.经济管理.2009(3).3―5 药学的论文范文篇3 浅谈药品不良反应与安全用药 摘要:近年来关于药物不良反应的报道和讨论比较多,已引起了各方面的注意。临床上对药品的要求不仅仅局限于对疾 病的治疗作用,同时也要求在治疗疾病的同时,所使用的药品应当尽可能少地出现药物不良反应(ADR)。根据WHO 报告 ,全球死亡人数中有近1/7的患者是 死于不合理用药。在我国,据有关部门统计,药物不良反应在住院患者中的发生率约为20%,1/4是抗生素所致。 每年由于滥用抗生素引起的耐药菌感染造成的 经济损失就达百亿元以上。药品不良反应[1],是指合格药品在正常用法、规定剂量下出现的有害的和与用药目的无关的反应。随着医药科学的发展,临床上对药 品的要求不仅仅局限于防治作用,更注重使用过程中可能出现的不良反应,如何做好安全、有效的用药,已成为当务之急。合理用药始终与合理治疗伴行,是一个既 古老又新颖的课题,也是医院药学工作者永恒的话题。医院药学工作的宗旨是以服务患者为中心、临床药学为基础,促进临床科学用药,其核心是保障临床治疗中的 安全用药。目前公认的合理用药的基本要素:以当代药物和疾病的系统知识和理论为基础,安全、有效、经济及适当的使用药物。 【关键词】 合理的用药 引言: 随着社会的发展,如何安全、有效、合理的用药已成为社会关注的 热点 。近年来关于药物不良反应(adverse drug reaction,adr)的报道和讨论比较多,已引起了各方面的注意。临床上对药品的要求不仅仅局限于对疾病的治疗作用,同时也要求在治疗疾病的同时,所使用的药品应当尽可能少地出现adr。根据who报告,全球死亡人数中有近1/7的患者是死于不合理用药[1]。在我国,据有关部门统计,药物不良反应在住院患者中的发生率约为20%,1/4是抗生素所致。每年由于滥用抗生素引起的耐药菌感染造成的经济损失就达百亿元以上[2]。 合理用药始终与合理治疗伴行,是一个既古老又新颖的课题,也是医院药学工作者永恒的话题。医院药学工作的宗旨是以服务患者为中心、临床药学为基础,促进临床科学用药,其核心是保障临床治疗中的安全用药。目前公认的合理用药的基本要素:以当代药物和疾病的系统知识和理论为基础,安全、有效、经济及适当的使用药物[2]。 下面结合临床工作实践,并结合文献,浅谈一下临床常见的药品不良反应与安全用药问题。 一、抗生素滥用,导致药物的不合理应用 现如今医疗纠纷频发、医源性或药源性事件居高不下、医疗以及用药成本过高等,已成为多数国家、地区面临的问题,我国在这些方面也有许多相似之处。合理用药的实践步履艰难,进展迟缓,远未引起人们的足够重视。实际上,药物不良反应已成为危及人类健康的主要杀手,而抗生素的滥用现象在我国临床中已非常普遍。有资料表明,我国三级医院住院患者抗生素使用率约为70%,二级医院为80%,一级医院为90%[3]。抗生素的滥用,不仅使药物使用率过高、导致医药费用的急剧上涨,同时也给临床治疗上带来了严重的后果。现在,很少有医生对抗生素进行过系统、全面的了解,使用的盲目性很大,在选择抗生素时不加思考,不重视病原学检查,迷恋于“洋、新、贵”,盲目的大剂量使用广谱抗生素,或几种抗菌药同时应用,致使大量耐药菌产生,使难治性感染越来越多,医疗费用也越来越高。临床上很多严重感染者死亡,多是因为耐药感染使用抗生素无效引起的。adr以抗生素位居首位。 比如说上呼吸道感染,有90%以上是由病毒引起的,但临床上使用抗生素的却不在少数。滥用的后果是在宏观上造成细菌的抗药性增强,抗生素的效力降低 甚至丧失,最终导致人类无药可用;在微观上会对患者的身体造成药源性损害。由于人体内部有许多菌群,正常情况下他们相互制约,形成一种平衡,抗生素的滥用就可能对某些有益菌群造成破坏,使一些有害菌或病毒乘虚而入导致二重感染甚至死亡。另外,临床分科过细,医师缺乏正确的抗菌药物知识;正确的药品信息获取困难;医师缺乏全面的药学知识等,也是导致用药错误的重要原因。长时期以来,人们已经习惯把抗生素当作家庭的常备药,稍微有些头痛脑热就服用;而有一些患者主动要求用好药、贵药,就更造成了资源浪费和细菌耐药的发生。 由此看出,合理用药不仅仅是医学问题,也不仅仅是临床医师需要注意的问题。要真正做到合理用药,医生、患者、药师、药品管理部门需要互相协作才能得以实现。 二、提高自我保护意识,防止药品不良反应的发生 导致adr的原因十分复杂,而且难以预测。主要包括药品因素、患者自身的因素和其他方面的因素。 药品因素 (1)药物本身的作用:如果一种药有两种以上作用时,其中一种作用可能成为副作用。如:麻黄碱兼有平喘和兴奋作用,当用于防治支气管哮喘时可引起失眠。(2)不良药理作用:有些药物本身对人体某些组织器官有伤害,如长期大量使用糖皮质激素能使毛细血管变性出血,以致皮肤、黏膜出现瘀点、瘀斑。(3)药物的质量:生产过程中混入杂质或保管不当使药物污染,均可引起药物的不良反应。(4)药物的剂量:用药量过大,可发生中毒反应,甚至死亡。(5)剂型的影响:同一药物的剂型不同,其在体内的吸收也不同,即生物利用度不同,如不掌握剂量也会引起不良反应。 患者自身的原因 (1)性别:药物性皮炎男性比女性多,其比率约为3∶2;粒细胞减少症则女性比男性多。 (2)年龄:老年人、 儿童 对药物反应与成年人不同,因老年人和儿童对药物的代谢、排泄较慢,易发生不良反应;婴幼儿的机体尚未成熟,对某些药较敏感也易发生不良反应。调查发现,现60岁以下的人,不良反应的发生率为(52/887),而60岁以上的老年人则为(113/713)[4]。 (3)个体差异:不同人种对同一药物的敏感性不同,而同一人种的不同个体对同一药物的反应也不同。(4)疾病因素:肝、肾功能减退时,可增强和延长药物作用,易引起不良反应。 其他因素 (1)不合理用药:误用、滥用、处方配伍不当等,均可发生不良反应。 (2)长期用药:极易发生不良反应,甚至发生蓄积作用而中毒。 (3)合并用药:两种以上药物合用,不良反应的发生率为,6种以上药物合用,不良反应发生率为10%,15种以上药物合用,不良反应发生率为80%[5]。 (4)减药或停药:减药或停药也可引起不良反应。例如治疗严重皮疹,当停用糖皮质激素或减药过速时,会产生反跳现象。 各种药品都可能存在不良反应,中药也不例外,只是程度不同,或是在不同人身上发生的几率不同。出现药品不良反应时也不必过于惊慌,患者用药时,一定要仔细阅读 说明书 ,如果出现了较严重或说明书上没有标明的不良反应,要及时向医生报告。 三、怎样做到安全用药 (1)不能轻信药品 广告 。有些药品广告夸张药品的有效性,而对药品的不良反应却只字不提,容易造成误导。 (2)不要盲目迷信新药、贵药、进口药。有些患者认为,凡是新药、贵药、进口药一定是好药,到医院里点名开药或在不清楚自己病情的情况下就到药店里自己买药,都是不恰当的。 (3)严格按照规定的用法、用量服用药物。用药前应认真阅读说明书,不能自行增加剂量,特别对于传统药,许多人认为多吃少吃没关系,剂量越大越好,这是不合理用药普遍存在的一个重要原因。 (4)药品消费者应提高自我保护意识,用药后如出现异常的感觉或症状,应停药就诊,由临床医生诊断治疗。这里需要告诫药品消费者的是,有些人服用药品后出现可疑的不良反应,不要轻易地下结论,要由有经验的专业技术人员认真地进行因果关系的分析评价。 随着人们对健康和生活质量问题的日益关注,药品不良反应的危害已经越来越引起全社会的重视。国家正在建立、健全药品不良反应监测报告制度,尽量避免和减少药品不良反应给人们造成的各种危害。因此,人们应抱着无病不随便用药,有病要合理用药,正确对待药品的不良反应的态度,正确的服用药物和保管药物,不断提高用药水平,从而达到真正的安全、有效、经济、适当地合理用药。 参考文献 1 徐年卉,林国生,付洁,等.合理应用抗菌药物管理工作的经验探讨.中华医院感染学杂志,2014,12(2):143-144. 2 唐镜波.合理用药的评价与实践要点.全军临床合理用药研讨班论文摘要汇编,1990,64. 3 刘振声,金大鹏,陈增辉.医院感染管理学.北京:军事医学科学出版社,2014,314. 4 孙定人.药物不良反应,第2版.北京:人民卫生出版社,1998,103. 猜你喜欢: 1. 电大药学论文范文 2. 药学论文范文 3. 大专药学毕业论文范文 4. 药学毕业论文范文 5. 药学大专毕业论文范文

基于甲醛检测仪论文怎么写

你好,食品的甲醛检测,是无法通过直接外观观测来判断的,目前准确的方法国标法(分光光度法等),快检法有检测管。 快检法的检测管/试纸很多,我从07起一直做食品安全现场监测工作,我们局里用得是tianjin的“朗,瑞.安”的“食品甲醛快速检测管”,操作上比国标法的方法简单很多,检测成本是国标法的五分之一,检测时间大概是5分钟,比较适合化学小白,老百姓自己想自己在家测没问题,而且比较容易买到,如果问问附近的化学实际商店,或者去“网上”搜一搜,为了准确性最好选择好一点的,比如我用的那个。

买盒销量高的试纸自己在家测不就好了嘛,选朗瑞安!

在桃宝买销量最,高的激素检测试纸啊,我就一直用这个在家测,一测一准

馒头家的花卷 技术图书译者,音乐人ψ如果浓度大到能反应,你已经挂了 测甲醛浓度都是要用专门的空气样本检测装置的。。。

用紫光灯照就可以,也叫荧光剂测试灯,我用的朗 瑞 安 的,还有比对卡

拟写论文提纲也是论文写作过程中的重要一步,可以说从此进入正式的写作阶段。首先,要对学术论文的基本型(常用格式)有一概括了解,并根据自己掌握的资料考虑论文的构成形式。对于初学论文写作者可以参考杂志上发表的论文类型,做到心中有数;其次,要对掌握的资料做进一步的研究,通盘考虑众多材料的取舍和运用,做到论点突出,论据可靠,论证有力,各部分内容衔接得体。第三,要考虑论文提纲的详略程度。论文提纲可分为粗纲和细纲两种,前者只是提示各部分要点,不涉及材料和论文的展开。对于有经验的论文作者可以采用。但对初学论文写作者来说,最好拟一个比较详细的写作提纲,不但提出论文各部分要点、而且对其中所涉及的材料和材料的详略安排以及各部分之间的相互关系等都有所反映,写作时即可得心应手。

去淘宝搜一下,只要几块钱就能搞定,希望你能满意。 六角体甲醛自测盒 甲醛检测仪 产品组成:1、吸收瓶(蓝盖塑料盒);2、稀释液(棕色玻璃瓶); 3、显色剂(无色玻璃瓶);4、比色卡片;5、说明书 产品用途:该试剂盒可应用于消费者对生活环境可能受到的甲醛污染进行快速半定量检测,可对甲醛污染程度进行判定。 产品特点:本产品采用新型的甲醛特异性化学吸收剂,可与空气中甲醛快速结合,通过显色深浅与比色卡对照后直接判读甲醛含量。具有操作方便快速、灵敏检测下限低、无需专用仪器、采用一次性包装无第二次污染、可现场操作等特点。检测时,试剂颜色呈黄色,基本上不含甲醛;黄绿色偏黄也没超;黄绿色偏绿超标不严重;绿色超标有点多,蓝色超标就严重了! 家里“醛”多少?自己检测就知道!操作简单!测值准确!---40分钟出结果! 检测盒是1次性的,可以检测1个相对独立的空间,比如一个房间,一个衣柜等。可以每个房间都检测,也可以针对性的抽样检测一下主卧室客厅就行! 1、装修后的室内(装修后3年内的房屋都建议测一测,日本专家测定甲醛的自然散发期为3 -15年) 2、汽 车(新购的汽车建议测一测,新车甲醛超标相当严重,沪上九成新车未达标) 3、家 具(新购的家具建议测一测,家具污染是室内污染的首要问题,儿童家具甲醛超标更是严重) 一个甲醛自测盒只能检测一次,一般一个10-15平方的房间用一个。房间多可以抽样检测的,因为通用的装修材料,同样的家具,污染的差别也不会太大的。 甲醛自测盒的使用方法(包装盒带有详细图解和说明 超简单快速) 检测前请将待测的房间门窗关闭2小时。注意深度检测需关闭12小时! 1.将棕色玻璃瓶内液体全部倒入塑料盒中。 2.拧紧瓶盖后摇动,内容物完全溶解后将瓶盖打开。 3.放置塑料盒于室内被检测部位或距地面80-150厘米高度位置,暴露40分钟。 4.将无色玻璃瓶内液体完全导入塑料盒中。 5.拧紧瓶盖后用手握紧,边体温加热边摇动5分钟。 6.与比色卡对比,读出被测房间(或家具)每立方米空气中的甲醛浓度值。

有专门测甲醛的仪器!

可以,有快速检测试纸。但是要做非常具体的菌种分析就要在实验室花上一点时间了

原来听过atp荧光检测仪,大概一分钟出来结果。但一般是用来检测表面卫生洁净度的。食品中的检测不确定能否用。

摘要: 目的 了解装修材料销售场所室内空气中有害物质污染状况,为制订防治对策提供依据。方法 检测30家装修材料销售店,分别对其室内空气中甲醛、挥发性有机物(VOCs)进检测。结果 各类装修材料销售店室内空气中甲醛、VOCs浓度均高于室外对照(P<005);甲醛最高值约为室外对照的70倍,VOCs最高值为室外对照的20倍。通风状态甲醛、挥发性有机物低于不通风状态(P<005),尤其是甲醛相差悬殊。面积50m2以下的销售店甲醛、挥发性有机物的超标率高于面积50m2以上的销售店(P<005)。结论 装修材料销售场所室内空气中甲醛、挥发性有机物污染严重,其污染的程度与销售装修材料的类型、店面大小、通风状况等有关。关键词: 装修材料;甲醛;挥发性有机物Investigation on indoor air pollution of ornamental materials marketsYU Zhilin,LI Chunying,DENG Shufang,et of Hygiene,School of Public Health,Nanhua University(Henyang 421001,China)Abstract: Objective To understand the indoor air pollution condition in decorating materials markets,and to offer the corresponding preventive To survey 30 sale stores and detect the concentration of formaldehyde and volatility organic compounds (VOCs) in their indoor In sales stores with different decorating material,the concentration of formaldehyde and VOCs were higher than that of outdoor air (P<),and the tallest values were 70 times and 20 times more than the value of outdoor air, rates above standard of formaldehyde and VOCs in unventilated condition were higher than in ventilated condition (P<),especially formalcehyde differ rate above standard of the area below 50m2 was higher than above 50m2 (P<).Conclusion The indoor air of the ornamental materials markets are badly polluted by formaldehyde and VOCs,and the degree of pollution is correlated to the ornamental material category,the area and ventilation of sale words: decorative material;formaldehyde;volatility organic compounds (VOCs)室内装修材料释放的甲醛、挥发性有机物(VOCs)已成为室内空气不可忽视的污染源〔1,2〕。为了解销售场所的空气污染状况,本文对30家装修材料销售店室内空气质量进行检测。结果报告如下。1 对象与方法11 检测对象 采用单纯随机抽样的方法随机抽取装修材料销售店30家,对30家销售店室内空气质量进行检测,检测项目为甲醛、VOCs(苯、甲苯、二甲苯等)。其中检测人造板材店20家,油漆涂料店6家,其他店包括地毯、避纸、塑料贴面、地板砖店各1家,选择建材店外空气作为对照。12 检测方法 按照公共场所监测规范进行交叉布点和斜线布点的原则,根据销售店面积(x)决定采样点数,x<25m2时采2个点,25m2≤x<50m2时采3个点,x≥50m2时采5个点,采样高度为12~15m。检测时同时记录当日气温、湿度、气流、气压、销售面积,以国家最新颁布的“室内空气质量标准GB/T18883-2002”为参照标准。13 仪器 PPM400甲醛测量仪(英国PPM400-Technology公司)、美国MultiRAE Plus(PGM50)五合一(含VOC)气体监测仪、干湿球温度计、QDF-3型热球式风速仪、氯压计等。14 健康问卷调查 对销售从业人员进行健康问卷调查。问卷调查主要包括从业人员主观感觉,如刺鼻气味、刺眼、流泪等;从业人员呼吸道症状发生率,如咽喉不适,呼吸道发干等。2 结果21 不同类型装修材料销售店室内空气质量状况(表1) 在不同种类装修材料销售店室内空气中甲醛、VOCs均不同程度地高于室外对照(P<005),甲醛最高均值约为室外对照的70倍,VOCs最高值为室外对照的20倍。不同销售店之间甲醛和VOCs差异有统计学意义(P<005),人造板材店甲醛的超标率高于其他2类销售店,油漆涂料店VOCs的超标率高于其他2类销售店。表1 不同种类装修材料销售店室内空气污染状况(略)注:与室外比较,a P<005,b P<00122 通风对板材销售店室内空气质量的影响(表2) 门窗敞开2h后测定为通风,关闭2h后测定为不通风。板材销售店室内空气中甲醛严重超标,最大值超标69倍;通风状态下2项检测指标的平均值和超标率均低于不通风状态(P<005),尤其是甲醛相差悬殊。表2 不同通风条件下板材销售店内空气质量状况(略)注:与不通风状态下比较,P<00523 店面大小对板材销售店空气质量的影响 按面积大小将板材销售店分为3类,面积<25m2的销售店室内空气中质量甲醛和VOCs的超标率分别为692%和484%,面积25~49m2的销售店其2项指标的超标率分别为619%和386%,2类店间2项指标差异均无统计学意义;而面积>50m2的销售店中甲醛和VOCs的超标率为343%和113%,均低于面积50m2以下店(P<005)。24 销售人员健康调查状况 调查板材销售店销售员67人,大多出现咳嗽、打喷嚏、感觉咽喉疼、呼吸道发干、头痛乏力等呼吸道症状,发生率为9403%;记忆迟钝、精力难以集中、头晕、头痛、疲劳等综合征的发生率为4328%。3 讨论各种装修人造板材、新式家具、墙面、地面的装修辅助设备中均使用以甲醛为主要成分的脲醛树脂作为粘合剂,可不断地向环境中释放甲醛〔3,4〕。VOCs主要来自于油漆、含水涂料和各种粘合剂、稀释剂、人造板、壁纸、地毯等〔4〕。本次调查显示,人造板材店甲醛的超标率高于油漆涂料店和其他店,油漆涂料店VOCs的超标率高于人造板材店和其他店,均高于室外对照,甲醛最高值为室外对照的70倍,VOCs最高值为室外对照的20倍;销售场所室内均可闻到刺鼻、刺眼的刺激性异味,其从业人员大多出现咳嗽、打喷嚏、感觉咽喉疼、呼吸道发干等症状,部分人员出现记忆迟钝、精力难以集中、头晕、头痛、疲劳等症状,说明装修材料销售场所室内空气中甲醛、挥发性有机物污染严重,并对劳动者健康产生不同程度的影响。因此,加强建材销售场所室内空气质量监测,对保护劳动者健康和改善居室空气质量具有重要意义。为了彻底改善建材销售场所室内空气的质量和保证居室空气少受装修材料的污染,有关部门应加强对生产厂家的监督与监测,定期公布检测结果,对经营劣质装饰材料的生产商、销售商严厉查处。加大对绿色建材的研究开发〔5,6〕,强制执行装饰材料的环保标准。另外,应加强职业健康教育,提高销售人员的健康销售意识和自我保护意识,自觉采购符合卫生要求的产品,并加强店面开窗通风换气,尽量降低摆材密度,防止有害物质高浓度聚集。本次调查结果显示,通风状态下甲醛、挥发性有机物低于不通风状态,面积50m2以下的销售店甲醛、挥发性有机物的超标率高于50m2以上的销售店,说明加强店面通风,增加销售店的面积、降低摆材密度改善销售场所的空气质量。参考文献〔1〕 Maria P,Baya,Evangelos B,et organic compounds in the air of 25 Greek homes〔J〕.Indoor Built Environ,2004,13:53-61.〔2〕 童智敏,赵进顺,叶明宪,等.居室空气中挥发性化学物的遗传毒性研究〔J〕.中国公共卫生,2004,20(5):575-576.〔3〕 李延红,薄萍,朱颖俐,等.装饰材料对居室空气污染的调查〔J〕.中国公共卫生,1999,9(8):751-752.〔4〕 杨旭,曾庆详,包克光,等.建筑及装修材料卫生学评价系列综述之二:建筑材料释放的室内有机污染物〔J〕.中国卫生工程学杂志,1996,5(1):4-13.〔5〕 程海丽,姜德民,高振林.开发绿色建材-改善室内空气质量〔J〕.建筑技术开发,2002,9(5):51-53.〔6〕 杨静.建筑材料与人居环境〔M〕.北京:清华大学出版社,2001:85-86.

家用甲醛检测仪 是一个很好用的仪器,在新装修过后检测甲醛非常实用。新装修的家庭中,木制 家具 和涂料会大量地散发有毒的甲醛气体。甲醛的危害非常大,是白血病患者增多的主要原因,老人和小孩尤为敏感。今天我就给大家介绍一下 家用甲醛检测仪使用方法 ,这样就可以更了解使用。

家用甲醛检测仪的使用方法:

每个甲醛检测仪的功能都不是一样的,所以今天我挑选出一款比较新的产品来演示一下。

1、首先双击D键开机。

2、开机后,经过传感器的自动校灵,会跳出综合测量的页面。

3、此时,会显示甲醛的浓度、评估目前的危害严重程度,还会显示当的温度与湿度等等。

4、如果这里的显示数值甲醛浓度较大(一般为高于),则尽量不要逗留太久,开窗通风。如果数值超过报警的临界值,甲醛仪会发出声音警报。

甲醛超标症状表现:

1、每天清晨起床时,感到憋闷、恶心、甚至头晕目眩。

2、家里经常有人感冒,小孩常咳嗽、打喷嚏、免疫力下降。

3、虽然不吸烟,但是经常感到嗓子不舒服,有异物感,呼吸不畅。

4、家里人员常有过敏等毛病,而且是群发性的。

6、家人共有一种疾病,而且离开这个环境后,症状有明显变化和好转。

7、新婚夫妇长时间不孕,又查不出原因。

8、孕妇在正常怀孕的情况下发现胎儿畸形。

9、新搬家或者新装修的房子里,室内植物不易成活,叶子容易发黄、枯萎。

10、新装修的家庭和写字楼房间或新买家具有刺鼻、刺眼等刺激性异味,而且异味长期不散。

家用甲醛检测仪 的使用也是比较简单,监测的显示结果大多都非常智能,使用起来没有技术难度。新装修的房子不妨备一个家用甲醛检测仪哦。看了以上甲醛超标的症状介绍和 家用甲醛检测仪 使用方法有没有更了解呢?希望对你们有所帮助。

三聚氰胺检测方法汇总检测方法GC-MS法测定动物食品中的三聚氰胺Spectra-Quad实现三聚氰胺含量在线检测超高效液相色谱_电喷雾串联质谱法测定饲料中残留的三聚氰胺反相高效液相色谱法测定饲料中三聚氰胺的含量高效液相色谱-二极管阵列法测定高蛋白食品中的三聚氰胺高效液相色谱法(HPLC)测定饲料中三聚氰胺的含量高效液相色谱-四极杆质谱联用测定饲料中三聚氰胺含量固相萃取与高效液相色谱联用测定宠物食品中三聚氰胺液相色谱串联质谱法(LC-MSMS)分析宠物食品中三聚氰胺液相色谱-串联质谱法测定饲料中三聚氰胺残留GC-MS法测定动物食品中的三聚氰胺附:三聚氰胺检测方法示例仪器与条件高效液相色谱仪;二极管阵列检测器(DAD),检测波长240nm,柱温:40℃。(1)AgelaVenusilTMASBC18(×250mm);缓冲液:10mM柠檬酸,10mM庚烷磺酸钠;流动相:缓冲溶液:乙腈=85:15;流速:。(2)AgelaVenusilTMASBC8(×250mm);流动相:缓冲液:乙腈=85:15;缓冲液:10mM柠檬酸,10mM辛烷磺酸钠,调pH为;流速:;离子交换固相萃取柱AgelaClearnertTMPCX试剂与样品宠物饲料样品(农业部饲料供应中心提供);甲醇、乙腈为北京艾杰尔科技有限公司提供;氨水、乙酸铅、三氯乙酸、均购于北京化学试剂公司;三聚氰胺标准品、柠檬酸、辛烷磺酸钠(Sigma公司);甲醇为色谱纯,其他均为化学纯。实验方法1、样品前处理方法(1)标准样品配制:取50mg三聚氰胺标准品,以20%甲醇溶解定容至50mL得到1000ppm的标准溶液,使用时,以提取液(三氯乙酸)稀释至所要的浓度。(2)提取:称取饲料样品5g,加入三氯乙酸提取液,充分混匀,加入2mL2%乙酸铅溶液,超声20min。然后取部分溶液转移至10mL离心管中,8000rpm/min离心10min,取上清液3mL过混合型阳离子交换小柱(PCX)。(3)净化(PCX小柱,60mg/3mL):a)活化及平衡:3mL甲醇,3mL水b)上样:加入提取液3mLc)淋洗:3mL水;3mL甲醇;弃去淋洗液并将小柱抽干。d)洗脱:5mL5%氨化甲醇(v/v)洗脱。(5%氨化甲醇的配制:5mL氨水+95mL甲醇)。e)浓缩:50℃,氮气吹干,20%甲醇/水定容至2mL,HPLC分析或衍生后GC/MS分析。2、三聚氰胺被立案三聚氰胺HPLC-UV检测方法三聚氰胺是强极性化合物,在传统的反相C18柱上保留很差,需要用离子对试剂色谱方法才能有良好的保留与分离,按照美国食品药品监督管理局(FDA)的三聚氰胺检测方法和中国农业部公布的三聚氰胺检测方法,采用艾杰尔(Agela)ASB系列亲水色谱柱,可以得到良好的分离效果:(a)色谱柱:×250mm;标准:FDA方法;流动相:缓冲液:乙腈=85:15;缓冲液:10mM柠檬酸,10mM辛烷磺酸钠,调pH为;流速:;柱温:40oC;波长:240nm(b)色谱柱:×250mm;标准:中国农业部颁标准方法;缓冲液:10mM柠檬酸,10mM庚烷磺酸钠;流动相:缓冲溶液:乙腈=85:15;流速:;柱温:40℃;波长:240nm空白加水平(mg/L)回收率三聚氰胺LC-MS检测方法由于FDA公布的HPLC-UV方法中,流动相添加了离子对试剂,因此限制了液质联用方法的使用;但不用离子对试剂色谱方法,三聚氰胺在传统的C18柱上保留很差,不能得到较好的分离定量〔3〕。基于此问题,艾杰尔科技公司自主开发了新的方法,采用艾杰尔(Agela)ASB系列亲水色谱柱,不用离子对试剂也能得到有效的保留与分离。因此方法中流动相不含离子对试剂,可以用于质谱检测。与FDA2007年4月公布的《UpdatedFCCDevelopmentalMelamineQuantitation(HPLC-UV)》相比较,该方法大大降低了最低检测限(MSD:;UV:2ppm),提高了检测灵敏度。以该方法分别在××250mm得到很好的谱图。缓冲液:10mM的NH4AC;流动相:Buffer::ACN=95:5;流速:;进样量:样品先用70%ACN溶解成约1mg/mL,用ACN稀释成,进10uL;柱温:40℃;波长:240nm结果与讨论1、阳离子交换柱(PCX)三聚氰胺呈弱碱性(弱阳离子化合物),净化过程一般应选择阳离子交换柱。混合型的阳离子交换柱(PCX)通过将磺酸基团(-SO3H)键合在极性高聚物聚苯乙烯/二乙烯苯(PEP)吸附剂上,具有阳离子交换和反相吸附两种机理,并具有以下优点:a)可通过两种不同溶液的洗涤(水/一定pH值的缓冲溶液和有机溶剂),使样品更干净,提高检测的灵敏度。b)批次重复性好。c)回收率高,重现性好,即使小柱跑干也可以得到较高回收率。2、LC-MS方法优点:(1)检测过程简便:无须添加离子对试剂,三聚氰胺就可得到良好的保留与分离,避免了配制离子对流动相的复杂过程。(2)提高了检测的灵敏度:无离子对试剂,可以用于质谱检测器,大大降低了最低检测限(MSD:;UV:2ppm)。(3)降低了检测成本:不用离子对试剂,就不再需要买价格较贵的离子对试剂了,从而降低了检测成本。(4)延长了色谱柱的使用寿命:避免了使用离子对试剂减少色谱柱寿命的影响。(5)该方法所使用的色谱柱具有通用性:无论是用FDA方法、中国农业部部颁标准方法和本公司开发的LC-MS方法,使用艾杰尔(Agela)ASB系列亲水色谱柱均能得到一个很好的检测结果,从而给客户提供了多种选择空间。国家食品质量监督检测中心有关人士说,在现有的国家标准奶粉检测中,主要进行蛋白质、脂肪、细菌等检测。三聚氰胺属于化工原料,是不允许添加到食品中的,所以现有标准不会包含相应内容。也就是说,三聚氰胺不属于常规检测项目,正常情况下,很少有人会想到去检测它。

学位论文筛选及测序

估计就以C来记了。录用就可以参加答辩了。但是要见刊后才能拿到毕业证,就是说你可以让期刊先录用,然后答辩完了,等见刊了再回来拿毕业证。。。

学位论文工作是培养博士、硕士研究生的重要一环,是衡量博士、硕士研究生培养质量、学术水平以及独立从事科研工作能力的重要标志,研究生学位论文在导师或导师指导小组的指导下,由研究生独立完成。一、学位论文一般应包括如下内容1.扉页 2.学位论文版权使用授权书3.声明4.中、英题目(不超过30字(词))5.中、英文摘要(不少于500字(词)),中、英文关键词(3~8个)摘要包括研究的目的、意义、论文的主要内容、获得的成果和结论等6.全文目录7.引言、文献评述论文的引言和文献评述部分应比较全面介绍有关该课题在国内外已做的工作,并对其进行评述,阐明本文的目的、意义和所要解决的问题8.理论部分利用前人或本人的理论和方法,解决别人没有做过的或没有解决的问题,应有一定的新见解或新内容,且概念清晰、分析严谨、推导正确9.实验、数据处理与分析建立比较先进的实验装置,采用新的实验方法,并获得实验结果。同时,对实验结果应作理论上的阐述、分析和讨论。如是利用已有的数据、资料,则需应用新的理论、新的数据处理方法对其进行分析、处理并讨论结果10.小结和讨论11.符号表12.参考文献13.附录14.从1999级研究生开始,学位论文最后必须附上“在读期间公开发表的论文和承担科研项目及取得成果一览表”。以上要求《外国语言学及应用语言学》专业可参照执行二、学位论文要求1.文句通顺、条理清晰、有较强的逻辑性,博士学位论文还应有一定的理论完整性和系统性、创新性;2.页面设置正文字体:除每章标题用黑体外,论文所有的文字,中文用宋体,数字和英文用Times New Roman字体行 距:固定值20磅,图表除外页 边 距:上: cm;下: cm;左: cm;右: cm;页 眉: cm (5号宋体,居中)奇数页:第 X 章及其标题偶数页:论文题目页 脚: cm 标注页码(5号Times New Roman,居中) 注: 页眉和页脚均从绪论部分开始直到最后纸张大小:A4纸激光打印论文封面:用研究生部统一的论文封页装订3.示意图采用Word绘图工具或AutoCAD绘制,中文用5号宋体;英文和数字用Times NewRoman字体;图形用1磅线条,尺寸线用磅线条;图题及表题字体:小4号宋体4.答辩完毕博士生速将 “在读期间公开发表的论文和承担科研项目及取得成果”的电子版送至研究生部学位办公室,另博士生需将学位论文原稿及学位论文(至少3份) 交学院研究生秘书,1份论文和论文电子版送交图书馆电子阅览室;硕士生需将学位论文原稿及学位论文(1份) 交学院研究生秘书,1份论文和论文电子版送交图书馆电子阅览室三、学位论文书写顺序与打印要求第一部分 论文外封面格式(下载)(请在下载的WORD文档里进行文字修改务必不能移动原位置)第二部分 论文内封面格式(下载)(请在下载的WORD文档里进行文字修改)第三部分 学位论文版权使用授权书(下载)第四部分 声明(下载)第五部分 中文摘要

ProQuest Dissertations and Theses (PQDT) 学位论文数据库可以通过以下方式对检索结果进行排序:

1、相关度(Relevance):按照搜索词语匹配度高低对检索结果进行排序,将与搜索词相关度最高的条目排在前面。

2、全文可用性(Full text availability):按照学位论文是否提供全文阅读的可用性对检索结果进行排序,将有全文可用的条目排在前面。

3、发表年份(Publication year):按照学位论文的发表年份对检索结果进行排序,将最新的条目排在前面或将最老的条目排在前面。

4、作者(Author):按照学位论文的作者姓名字母顺序或逆序对检索结果进行排序,将A-Z或Z-A的条目排在前面。

5、学校(Institution):按照学位论文所属学校名称字母顺序或逆序对检索结果进行排序,将A-Z或Z-A的条目排在前面。

6、论文类型(Document Type):按照学位论文类型(硕士论文、博士论文等)对检索结果进行排序,将特定类型的条目排在前面。

论文数据库具有以下应用:

1、研究参考:学位论文是研究生在攻读学位过程中提交的正式论文,内容涵盖多个学科领域。因此,在进行研究或写作时,可以通过学位论文数据库获取到大量的相关论文,并利用其成果和经验,从而提高自己的研究水平。

2、学术交流:学位论文数据库不仅提供了丰富的学术资源,同时还为用户提供了学术交流的平台。用户可以通过数据库查找同行专家、学者或其他感兴趣的人,向他们咨询或交流学术问题。

3、招生信息查询:学位论文数据库中包含了各类院校、专业的学位论文,对于考生来说,可以通过查询学位论文来了解不同学校、专业的研究方向和成果情况,从而更好地选择招生单位和方向。

4、非学术领域应用:除了学术研究领域外,学位论文数据库还可应用于其他非学术领域,如企业市场调研、政府政策制定等。通过查询学位论文,了解行业发展状况和趋势,收集相关数据和信息,从而为实际应用提供帮助。

在中国知网的检索结果页面,可以进行分组浏览、排序等处理功能,分组浏览有:学科、发表年度、研究层次、作者、机构和基金信息进行统计分析;排序:主题排序、发表时间、被引、下载等升降排序。中国知网9种分组筛选功能:按来源数据库分组、按学科分组、按发表年度分组、按研究层次分组、按文献作者分组、按机构分组、按基金分组、按文献来源分组、按关键词分组。望采纳~

论文研究甲基化但没有igv图

DNA甲基化是细胞分裂过程中遗传的一种表观遗传标记,影响细胞的生物学功能。而单细胞水平上的全基因组甲基化分析将有助于深入了解转录调控和细胞异质性。 单细胞DNA甲基化研究怎么做? 来自韩国的科研人员在《 Biomolecules 》发表综述文章, 介绍了单细胞DNA甲基化分析方法,包括实验策略和数据分析;此外,还介绍了相关科研应用并讨论了未来的发展。 注:此篇综述没有介绍5mC分析方法,虽然介绍了许多多组学方法,但每种方法的单独分析过程未作深入讨论。 亚硫酸氢盐转化法被认为是DNA甲基化分析的金标准。 由于它的高转化率(>99%)、可重复性和通过商业试剂盒的简单易用性而受到研究人员的青睐。然而,亚硫酸氢盐转化法采用了导致DNA降解的苛刻反应条件,PBAT的开发即是为了解决降解造成的损失问题。RRBS和WGBS是流行的全基因组甲基化分析方法。 这两种方法都包括亚硫酸氢盐转化和NGS制备。主要区别在于,RRBS使用适当的限制性内切酶和大小选择来筛选富含GC的区域。WGBS(特别是MethylC-seq)的优势在于能够覆盖基因组中的大部分CpGs。与RRBS相比,WGBS的纯化和筛选过程相对简单。在WGBS中防止亚硫酸氢盐转化过程中的降解损失被认为是相对重要的,因此许多基于WGBS的单细胞方法往往是基于PBAT的。 多组学方法是根据甲基化分析方法与其他分析方法(RNA、染色质可及性)相结合来区分的。 例如scM&T-seq是基因组和转录组测序(G&T-seq)与scBS-seq的结合,G&T-seq是一种基于Smart-seq2识别DNA和RNA的方法。此外,应用于单细胞甲基化分析方法的技术,如PBAT,也可以类似地应用于NOME-seq,NOMe-seq可以根据核糖体的存在与否,利用GpC甲基转移酶的染色质可及性差异,确认双硫酸盐转化的DNA中开放染色质和CpG甲基化。scCOOL-seq、iscCOOL-seq和scNome-seq可以一起监测染色质可及性和CpG甲基化。通过转化以外的方法观察甲基化主要分为两类:利用甲基胞嘧啶的亲和结合和利用限制性内切酶对甲基胞嘧啶的敏感性。MBD-seq和MeDIP-seq是具有代表性的基于亲和性的方法。 基于亲和力的方法不适合在单细胞规模上应用 ,因为这些方法基于DNA片段产生平均DNA甲基化谱,这不允许区分单个细胞中DNA甲基化模式的差异。然而,与基于亲和力的方法不同, 基于MSRE的方法可以被改进, 使用MSRE的单细胞方法的细化可以在Methyl-seq中看到,scCGI-seq测量甲基化的方式与Methyl-seq类似。在测序实验之后,包括RRBS或WGBS,需要对数据进行预处理。预处理步骤可分为 数据质控(QC)、序列修剪和比对 ,例如使用 FastQC 测量总体的基本测序数据质量,使用 Trim Galore!、fastp和Trimmomatic 等软件修剪,下表列出了常用的比对工具。甲基化分析的主要目的是探索构成样本、器官和疾病状态(包括癌症)之间差异的表观遗传学证据。为了发现这些差异,需要一个暗示此概念的数值,一个广泛使用的术语是β值。在甲基化调用后,进行后续分析,如可视化分析的t-SNE,聚类分析,以及识别差异甲基化胞嘧啶(DMCs)或差异甲基化区域(DMRs) 上述方法主要依赖于单个CpG位点的甲基化水平。最近的甲基化分析利用了每个reads的甲基化模式来诊断疾病,尤其是癌症。这种新的分析概念是基于甲基化的生物学特性,即除非出现从头甲基化,否则相邻CpG位点之间有保持甲基化的趋势。 该读取模式方法能够检测具有疾病信号的DNA分子,并且具有增加疾病信号检测机会的可能性。 例如,一项大型液体活组织检测研究设计了一个集成分类器,根据读取模式分析对肿瘤类型进行分类,并在早期癌症的检测中显示出显著的结果。此外,通过甲基化模式对肿瘤衍生的DNA分子进行量化是观察肿瘤负担的另一种方法。生殖细胞或胚胎细胞的成熟受到特定基因表达的影响,这与DNA中的甲基化水平相关。例如基于植入前的胚胎细胞的甲基化特征,利用单细胞甲基化测序,通过对早期胚胎系追踪的研究,研究植入前细胞甲基化的机制及其现象。研究团队观察到非CpG甲基化在卵母细胞成熟过程中不断积累,说明非CpG甲基化与CpG甲基化在卵母细胞成熟过程中的作用不同。在疾病患者中,DNA甲基化的模式与健康人不同。在各种疾病中,癌症尤其具有正常细胞所不具有的DNA甲基化模式,从而导致基因表达水平的差异。在对具有这种异质性的癌症研究中,需要使用多组学方法,将基因组变异和RNA表达结合起来进行分析。例如一个研究小组最近开发了一种称为scTrio-seq2的方法,它整合了单细胞转录组和单细胞甲基化测序数据。多项研究表明使用单细胞甲基化测序(sc-methyl-seq)的多组学方法可以克服先前方法的局限性,并且具有更好的鉴别能力。因此,sc-methyl-seq可用于各个领域,以解决与生物过程和疾病相关的基本问题。 单细胞DNA甲基化研究仍存在一些问题。其中第一个问题是亚硫酸氢盐转化的降解问题,这是目前的金标准。然而,在数量有限的单细胞尺度上,由于降解而造成的损失比在体积尺度上更严重。为了解决这个问题,采用了PBAT等技术,但其性能无法与使用大量DNA的方法相比。近年来,利用TET酶活性的方法,如TAPS和EM-seq,已经被开发出来,并作为一种解决慢性降解问题的方法而受到关注。另一个问题是一个明确的标准分析过程还没有建立。由于这些挑战,目前最好的方法是引入多组学方法进行交叉验证。 随着数据采集的成本正在逐渐降低和数据联盟的建立(例如国际人类表观基因组联盟(IHEC)等),全面数据的积累可以提供一个了解甲基化的机会。关于甲基化证据的积累将使大家有可能找到因不同组织类型、不同实验或环境条件以及异质性疾病(如癌症)而波动的甲基化热点区域。此外,通过积累的数据发现细胞类型的特异性标记,将有利于通过单细胞DNA甲基化数据的可视化来进行细胞异质性分析,包括在t-SNE图中分配细胞集群。相信对甲基化及其在疾病中的生物学作用之间关系的理解将随着未来进一步的数据而得到揭示。首发公号:国家基因库大数据平台   参考文献 Ahn J, Heo S, Lee J, et al. Introduction to Single-Cell DNA Methylation Profiling Methods[J]. Biomolecules, 2021, 11(7): 1013.

m6A RNA甲基化是最常见、最丰富的真核生物mRNA转录后修饰。研究表明,m6A 在不同组织,细胞系中是一个复杂的调控网路,m6A RNA 甲基化参与 RNA 的代谢过程,并与肿瘤的发生和发展密切相关。本期着重解读两篇癌症中的 m6A 研究,看一下 m6A RNA 甲基化如何玩转高分期刊。 2020年10月,南京医科大学汪秀星课题组和美国 UCSD Jeremy Rich 等课题组在Cancer Discovery上发表题为“The RNA m6A reader YTHDF2  maintains oncogene expression and is a targetable dependency in glioblastoma stem cells”的研究论文。该研究为靶向治疗胶质母细胞瘤提供了新的治疗机会。 研究背景 胶质母细胞瘤(GBM)代表了最常见的原发性,内在性脑肿瘤,患者的平均生存期限制在一年以上。鉴于胶质母细胞瘤干细胞(GSC)在治疗抗性,血管生成,免疫逃逸和侵袭中的作用,临床和临床前观察表明,靶向GSC可以改善肿瘤预后神经肿瘤学上的精准医学研究。 研究方法 研究结果 1. 在 GSC 中上调的致癌转录本以 RNA m6A 修饰为标志 作者利用 MeRIP-seq 对 GSC 和神经干细胞(NSC)进行 m6A 标记的检测,结果发现,与非肿瘤对应物相比,GSCs 的m6A 分布发生了改变。通过38个 GSCs 和5个 NSCs 的队列中的 RNA-seq 数据进行 GSEA 分析,具有 m6A 峰的基因在GSC 高度富集,而且在 GSC 中获得的具有 m6A 峰的基因均被上调。相反,相对于 NSC、GSC 中丢失 m6A 峰的基因通常在 GSC 中被下调。而且,在 GSC 中,与癌症干细胞相关的重要基因上获得了 m6A 峰,包括表达增加的 OLIG2  和 MYC 。 2.  YTHDF2  在 GSC 中表达上调,对 GSC 的维持至关重要 作者为研究 m6A YTHDF  在胶质母细胞瘤中的功能作用,利用 CRIPR 技术检测了 YTHDF2 ,相对于对照 sgRNA,敲除 YTHDF2  会降低细胞活力及减少 GSCs 中细胞球形成。为研究了 YTHDF2  耗竭是否会诱导 GSC 分化,正交实验发现,shRNA 介导的 YTHDF2  敲低会降低 GSC 的活性,过表达的 YTHDF2  可以挽救 GSC 的活性。结果表明, YTHDF2  是胶质母细胞瘤维持的一个特异性和有效的调节因子。 3.  YTHDF2  通过 m6A RNA 修饰支持 GSCs 中的基因表达 作者利用 RNA-seq 检测 YTHDF2  的下游靶点,敲除 YTHDF2  可引起 GSCs 中广泛基因表达的改变, MYC  靶点显著富集,而且,GSCs 中获得 m6A 峰的基因更频繁地下调。通过 qPCR 也验证了 YTHDF2  敲除对 MYC、VEGFA  mRNA 水平降低的作用。为了预测 YTHDF2  在 GSCs 中的作用,作者结合 TCGA 胶质母细胞瘤基因表达数据,发现 YTHDF2  相关基因 MYC  和 E2F  靶点以及 G2M  调节因子和氧化磷酸化介质高度富集。这些数据表明 YTHDF2  作为与 m6A 差异修饰相关的转录程序的调节因子。 4.  YTHDF2  通过保持  MYC  转录稳定发挥 GSC 特异性依赖作用 为了确定 YTHDF2  介导作用于 GSCs 中 MYC 的特异性,作者比较了在 NSCs 和 GSCs 之间 YTHDF2  缺失的影响。NSCs 中 YTHDF2  敲低并不影响 MYC mRNA 水平,但降低了 GSCs 中 MYC mRNA 水平。而且, YTHDF2  耗竭降低了GSC 的活性,而不影响 NSCs。因此, YTHDF2  代表了一种 GSC 特异性依赖,通过 MYC  基因的特异性稳定支持胶质母细胞瘤的生存。 5.  IGFBP3  是 GSCs 中  YTHDF2-MYC  轴的下游靶点 因为 IGFBP3  是 YTHDF2  耗尽后最高下调基因之一,作者研究了 IGFBP3  是否调控 YTHDF2-MYC  轴下游的细胞活力。 IGFBP3  的缺失降低了 GSC 的活性和细胞球形成。 IGFBP3  过表达挽救了 GSCs 免于 YTHDF2  下调介导的细胞死亡。最后,作者利用20个胶质母细胞瘤和20个非肿瘤脑组织中 IGFBP3  的表达进行验证,观察到 GSC 中 IGFBP3  mRNA 表达升高。结果表明, IGFBP3  是 GSCs 中 YTHDF2-MYC  信号轴的关键下游效应子。 6.  YTHDF2-MYC-IGFBP3  轴促进体内肿瘤生长 为了探讨在体内靶向 YTHDF2  治疗的潜在益处,作者利用 CRISPR 敲除技术对原位异种移植物的小鼠进行检测。结果表明,与携带对照 sgRNA 的 GSCs 的小鼠相比,敲除 YTHDF2  延长了肿瘤潜伏期并减少了肿瘤体积。 IGFBP3 过 表达恢复了 YTHDF2  缺失的 GSCs 体内成瘤能力。 研究结论 通过结合体外和体内的 GSCs 研究,该研究阐明了 m6A 介质在 GSCs 中的功能,并确定 YTHDF2  是 GSCs 特异性依赖,通过稳定 MYC  转录物调控 GSCs 中的葡萄糖代谢。这些发现为靶向治疗胶质母细胞瘤提供了新的治疗机会。 2020年4月,上海交通大学医学院附属仁济医院洪洁团队在 Molecular Cancer 上发表了题为“m6A-dependent glycolysis enhances colorectal cancer progression”的研究论文。研究表明,靶向 METTL3  及其通路为高糖代谢的 CRC 患者提供了另一种合理的治疗靶点。 研究背景 结直肠癌 (CRC) 是全球第四大常见恶性肿瘤和第三大癌症死亡原因,而以乳酸作为糖酵解的最终产物,被认为是治疗癌症的一种有前途的方法。m6A 调控基因的改变在多种人类疾病的发病机制中起着重要的作用,但 m6A 修饰是否在 CRC 的葡萄糖代谢中起作用尚不清楚。 研究方法 研究结果 1.  METTL3 与结直肠癌糖酵解密切相关 为了探讨结直肠癌(CRC)中 m6A 修饰与糖酵解代谢之间的相关性,作者对47例 CRC 患者进行 RT-PCR分析,CRC患者中FDG 摄取与 METTL3  表达之间存在最显着的相关性。进一步分析发现 CRC 患者中 FDG 摄取与 METTL3  免疫组化染色存在显著相关性。最后,作者利用 RNA-seq 比较 METTL 3 敲除和野生型(WT) HCT116 CRC 细胞的基因表达谱, METTL3 敲除细胞表现出更高的 METTL3 表达。这些结果表明 METTL3  可能介导 CRC 患者糖溶解代谢和癌变。 2. METTL3  在结直肠癌中促进糖酵解代谢 为了弄清 METTL3  的改变是否直接影响糖酵解代谢,研究发现敲除 METTL3  可显著降低 HCT116 和 SW480 细胞的胞外酸化速率(ECAR)水平,过表达 METTL3 显著提高了 DLD1 细胞的乳酸生成、葡萄糖吸收和 ECAR  水平。为了阐明 Mettl3  诱导的 CRC 糖酵解是否依赖于其甲基转移酶功能,作者通过 Mettl3  野生型和突变型的研究,发现 Mettl3  的 MTase 结构域的缺失阻断了 Mettl3  诱导的糖酵解过程。这些数据表明 Mettl3 通过其甲基转移酶结构域调控结直肠癌糖酵解代谢。 3. 在结直肠癌中, METLC3  诱导的增殖依赖于糖酵解的激活 METLC3  的敲除消除了 HCT116 细胞的细胞增殖和集落形成,并且降低了 HCT116 肿瘤的生长和异种移植小鼠模型中的肿瘤重量。在功能分析中, METTL3  的过表达增加细胞增殖、集落形成、肿瘤的生长和肿瘤的重量。2-DG(糖酵解途径的抑制剂)处理在体外和体内显着阻断了 METTL3  诱导的细胞增殖和菌落形成,这些结果表明 Mettl3 通过调控结直肠癌糖代谢促进 CRC 进展。 4. METTL3  在结直肠癌中的潜在靶点 为了鉴定 METTL 3 的潜在靶标,作者选择了 METTL3  敲除和 WT HCT116 细胞进行 MeRIP-seq和RNA-seq,最常见的motif ' GGAC '在 m6a 峰中显著富集,大部 分 METTL3  结合位点位于 CDS区,在 5'UTR 和 3'UTR 高度富集,并且 m6A在转录水平上发生了全局低甲基化。联合RNA-seq数据,确定了429个低甲基化的 m6A 基因,其 mRNA 转录被下调,595个低甲基化的 m6A 基因,其 mRNA 转录被上调。基于甲基化水平与 mRNA 表达水平都下降,找到与糖酵解密切相关的靶基因 HK2  和 SLC2A1(GLUT1) 。 6.  HK2  和  SLC2A1  是  METTL3  在 CRC 中重要的功能靶基因 作者通过 HCT116 WT 和 mettl3  敲除细胞转染 control、 HK2  或 SLC2A1  过表达实验发现, HK2  或 SLC2A1  的异位表达部分恢复了敲除 mettl3  细胞的增殖、集落形成能力和肿瘤生长,而且,也能恢复 HCT116 mettl3  敲除细胞中乳酸产量的下降。同时,在体外和体内,过表达 SLC2A1  显著恢复了 HCT116 mettl3  敲除细胞葡萄糖摄取下降的趋势。因此, HK2  和 SLC2A1 介导了 CRC 细胞中 METLL3 的调节功能。 研究结论 METTL3  是 CRC 的一种功能性和临床致癌基因。 METTL3  通过 m6A- IGF2BP2/3— 依赖机制稳定 CRC 中 HK2  和 SLC2A1 的表达。靶向 METTL3  及其通路为高糖代谢的 CRC 患者提供了另一种合理的治疗靶点。 参考文献 [1] Dixit D, Prager B, GimpleShen R, et al. The RNA m6A reader YTHDF2  maintains oncogene expression and is a targetable dependency in glioblastoma stem cells[J]. Cancer Discovery, 2020. [2] Shen C, Xuan B, Yan T, et al. M6A-dependent glycolysis enhances colorectal cancer progression[J]. Molecular Cancer, 2020, 19(1).

  • 索引序列
  • 甲基化测序学位论文
  • 基因测序毕业论文
  • 基于甲醛检测仪论文怎么写
  • 学位论文筛选及测序
  • 论文研究甲基化但没有igv图
  • 返回顶部