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LncRNA-Protein相互作用预测预测方法主要基于序列、结构、以及理化性质。SFPEL-LPI是一种机器学习的、基于集成的方法预测LncRNA-Protein相互作用。功能预测仅从序列上预测lncRNA的功能在lncRNA生物学领域一直是一项具有挑战性的任务。
LncRNA，是长度＞200nt的长片段非编码RNA，主要通过转录水平和转录后水平起调控作用。所以做LncRNA的敲除（KO）实验，比做编码基因的敲除（KO）要复杂一些，需要将整个长片段敲除，而不仅仅像编码基因那样造成移码…
该论文首次阐明了互补序列对外显子来源环形RNA产生的调节机制，揭示了哺乳动物转录后调控的复杂性和多样性。研究团队利用特殊核酸酶对富集环形RNA，结合新的计算分析软件，在人胚胎干细胞H9中发现近万条环形RNA，证明内含子RNA互补序列介导的外显子环化现象。
基于论文中模型的分析，目前共有18种病毒被认为具有非常高的人畜共患潜力，其中至少有3种（Auravirus,Ndumuvirus,UgandaSvirus）具有人类感染的血清学证据。.在整个数据集中，77.2%的预测具有非常高的人畜共患病潜力的病毒已知会感染人类。.值得关注的是...
下一种“肆”人类的动物病毒是什么？AI预测出18种高潜力病毒,病毒,冠状病毒,动物,宿主,传染性撰文：库珀编审：寇建超排版：李雪薇新冠病毒自2019年开始席卷全球，至今仍未完全结束。如今，新冠疫情已经给人们的生产生活造成了极大的干扰和破坏，且新冠病毒只是一大批日益增多的动物...
下一种“肆”人类的动物病毒是什么？AI预测出18种“高潜力”病毒,病毒,冠状病毒,动物,宿主,传染性新冠病毒自2019年开始席卷全球，至今仍未完全结束。如今，新冠疫情已经给人们的生产生活造成了极大的干扰和破坏，且新冠病毒只是一大批日益增多的动物传染病病毒中的一种，新冠不是第一...
近一年来，中国科学院神经研究所杨辉团队连续取得突破，在Cell，Protein&Cell，MolecularCell，NatureCommunications，NatureCellBiology，NatureProtocol，NatureMethods等杂志上发表了7项重要研究成果，在基因编辑领域取得重大进展...
在论文中，开发者评估了测序错误对各个软件准确度的影响，结果如下所示...CPC是由北京大学开发的一款lncRNA预测工具，只需要输入fasta格式的转录本序列，该软件就可以判断每条转录本的蛋白编码潜能并进行打分，根据得分将转录本划分...
CPC是一款使用率非常高的lncRNA预测软件，但是它也存在一些问题。.利用二代测序得到的转录组数据，我们组装得到的转录本往往是不完整的，基于非全长的转录本去预测lncRNA，如果这个lncRNA和蛋白编码基因存在overlap,那么很容易造成误判；其次对于没有物种注释...
中国科学院动物研究所康乐研究组的张屹等最近发表的题为Ak-merschemetopredictpiRNAandcharacterizelocustpiRNA的最新研究论文，解决了高精度预测生物...
目前关于lncRNA的功能研究还大多是在细胞水平开展的,动物水平的工作很少。这篇文章完成了小鼠中特异表达的lncRNA的发现、功能鉴定和分子机制解析,、是生物信息学和实验生物学的一个完美结合,...
长链非编码RNA(longnon-codingRNA,lncRNA)是一类由RNA聚合酶Ⅱ转录的副产物,其长度大于200个核苷酸,很少或没有编码蛋白能力.根据近几年来关于LncRNA的研究进展的报道,针对...
且不具有蛋白编码潜能的RNAs,在真核生物基因表达调控中发挥着重要作用.不同物种性染色体和部分印记基因的转录能力受到lncRNA的顺式调控作用.寻找与繁殖相关的lncRNA分子,研究...
锐博生物采用国际一流的寡核酸和修饰技术,可针对lncRNA/circRNA/mRNA不同序列设计高特异性ASO序列,所的ASO序列是经过特殊化学修饰的单链RNA&DNA杂合体,极大地提高了其在细胞...
寻找与繁殖相关的lncRNA分子,研究这些lncRNA分子及其靶基因的生物学功能,阐明lncRNA在动物繁殖中的调控机制,是动物繁殖研究的一个热点。本文主要对繁殖过程中配子发生、胎盘...
答:lncRNA的预测包含基本筛选和潜在编码能力筛选两部分。(1)筛选长度≥200bp,Exon个数≥2,FPKM≥0.1的转录本序列进行后续编码潜能预测;(2)应用主流的CPC分析、CNCI分析、CPAT分析...
20190学科动态氥雄性动物生殖相关IncRNA的研究进展项门们,史颖超,赖振雨,李世鹏,周子惠,吴菲,雷初朝,党瑞华头(西北农林科技大学动物科技学院,陕西杨凌712100)[摘要:长...
许多lncRNA被认为不仅与mRNA的表达调控相关,而且还与生物的生长发育以及生物相关的疾病有联系。lncRNA在哺乳动物中有着大量的研究,相比之下,植物中lncRNA的研究则相对不足。...
(longnon-codingRNA,lncRNA)是一类由RNA聚合酶Ⅱ转录的副产物,其长度大于200个核苷酸,很少或没有编码蛋白能力.根据近几年来关于LncRNA的研究进展的报道,针对LncRNA的发现...
反式作用靶基因预测认为LncRNA的功能跟编码基因的位置关系没有关系,而与其共表达的蛋白编码基因相关。当它与一些距离较远的基因在表达量上存在正相关或负相关的...