毕业论文>加权基因共表达网络分析(wgcna)在食管鳞癌中的应用学校代码:10023学号:200601085加权基因共表达网络分析(WGCNA)在食管鳞癌中的应用专业年级:姓名:导师:完成日期:临床医学专业2006级赫捷院士2014...
基于WGCNA的GTEx组织网络的研究.田迎香.【摘要】:GTEx项目即基因型-组织表达项目,该项目为科学界建立资源数据库和相关组织库,以研究人类组织中遗传变异和基因表达之间的关系。.该项目的存在使研究者更多的能关注组织上基因的特殊性和共有性,发掘组织上...
优秀硕士论文库—《基于加权基因共表达分析(WGCNA)鉴定三阴性乳腺癌的关键基因和通路的研究》中文摘要第1-4页Abstract第4-8页符号说明第8-9页1前言第9-11页2资料和方法第11-16页
基于WGCNA方法的肝癌预后及分期研究.李鑫.【摘要】:肝细胞癌(Hepatocellularcarcinoma,HCC)是全球最常见的恶性,也是全球第五大癌症相关死亡原因。.HCC的发生发展是一个多基因参与、多因素作用、多阶段进展的较为复杂的生物学过程,我们对其发展和进步机制...
兰州大学硕士学位论文利用加权基因共表达网络(WGCNA)筛选及鉴定肝细胞癌干细胞相关基因的研究12图2.3HCC的共表达基因模块聚类树及模块划分2.4.4确定关键模块,鉴定hub基因并筛选关键基因为了确定关键模块,需要计算模块显著性。
【摘要】:WGCNA(weightedgeneco-expressionnetworkanalysis)算法是一种构建基因共表达网络的典型系统生物学算法,该算法基于高通量的基因信使RNA(mRNA)表达芯片数据,被广泛应用于国际生物医学领域。本文旨在介绍WGCNA的基本数理原理,并依托R软件包...
基于WGCNA方法对三阴乳腺癌预后相关基因的研究.【摘要】:研究背景三阴乳腺癌(triple-negativebreastcancer,TNBC)是一种临床病理类型的乳腺癌,其细胞表面雌激素受体(estrogenreceptor,ER)、孕激素受体(progesteronereceptor,PR)及人表皮生长因子受体2(humanepidermal...
医学研究生利用WGCNA生物信息数据挖掘发高分SCI文章.9796播放·54弹幕2020-04-0407:44:34.正在缓冲...播放器初始化...加载视频内容...24919669279.动态微博QQQQ空间贴吧.
WGCNA通过分析基因之间的关联性,将基因区分为多个模块。.最后通过这些模块和样本表型之间的关联性分析,寻找特定表型的分子特征。.分析流程.简单说说分析流程:.1、从TCGA数据库下载要研究的癌种的基因、miRNA表达数据。.2、分别针对基因、miRNA进行表达...
为进一步了解前列腺癌发生发展的分子机制以及诊断治疗提供了有用的基础研究资料。【结果】1.前列腺癌症组织数据与前列腺癌细胞系数据之间的结果差别迥异,没有WGCNA特异表达基因modules的交集,说明细胞系与前列腺临床组织样本之间存在很大的差异。
对表达数据进行预处理和差异表达分析,训练集借助加权基因共表达网络(WGCNA)构建模型,聚类出四个模块;再通过逐步Cox风险比例回归,发现turquoise模块与生存期显著相关,并且...
因此,本课题通过使用GTEx项目提供的52种人体组织数据,使用WGCNA方法建立各个组织的基因共表达网络。之后利用假设检验方法对组织间相关性进行研究,并发现最相似组织。之后利用...
论文编号BS3934692,这篇论文共70页会员购买按0.35元/页下载,共需支付24.5元。直接购买按0.5元/页下载,共需要支付35元。我还不是会员,注册会员!会员下载更优惠!充值送钱!...
3刘辉内科学基于网络数据库及WGCNA-LASSO算法胃癌预后lncRNA分子标志物筛选张超4张秋萌内科学肝硬化食管静脉曲张出血非手术二级预防措施疗效评价:系统...
本文应用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和Cox比例风险回归分析,开发了一种基因表达模型,用于鉴定可作为HCC预后标志物的基因。【方法】本文通过加权基因共表达网络对训练集的差异表...
分类号:密级:UDC:学号:405611411042南昌大学硕士研究生学位论文通过共表达网络分析(WGCNA)研究前列腺癌症中的特异表达因子Studyspecificexpression...
生信宝典由中科院、清华、北大、武大等高校的优秀博士共同创立,精心组织面向生信学习的Python、R可视化、Linux/Shell语言系列教程、生信工具精品教程、单细胞数据分析、TCGA/GEO数据...
基因组学与应用生物学,2013年,第32卷,第1期,第135—141页GenomicsandAppliedBiology,2013,Vo1.32,No.1,135—141评述与展望ReviewandProgress基于...
安利一个博士论文,71页的毕业论文,内含20多页的代码手稿,代码相当详细,好评,值得学习。代码涵盖基因注释、edgeR包进行转录组差异分析,WGCNA分析,各种绘图等代码,大家可以试...
基于WGCNA的远端胃癌预后因子的筛选及功能研究下载积分:1500内容提示:中国医科大学硕士学位论文I摘要研究背景:胃癌(gastriccancer,GC)是我国高发...