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烧卖吃饱了
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靓掣魅影

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probit回归。需要建立三个变量,分别是浓度,抑制率,和总数。小数位数按照实际要求设置。输入数据。总数用1或者100,其他按实际输入开始计算。

分析—回归—probit响应频率为抑制率,观测值汇总会总数,协变量为浓度,转换选择对数底为10,模型选择logit用 SPSS 计算 IC50点击确定即可。在弹出的输出界面的置信限制中找到概率的估计浓度即为IC50。

SPSS统计分析过程

包括描述性统计、均值比较、一般线性模型、相关分析、回归分析、对数线性模型、聚类分析、数据简化、生存分析、时间序列分析、多重响应等几大类,每类中又分好几个统计过程。

比如回归分析中又分线性回归分析、曲线估计、Logistic回归、Probit回归、加权估计、两阶段最小二乘法、非线性回归等多个统计过程,而且每个过程中又允许用户选择不同的方法及参数。SPSS也有专门的绘图系统,可以根据数据绘制各种图形。

以上内容参考:百度百科-多元线性回归

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tastebytaste

IC50(half maximal inhibitory concentration),即半抑制浓度,指某一种物质对某些生物程序抑制达到50%抑制效果时的浓度。对细胞增殖方面,可以理解为对细胞增殖的抑制效果达到细胞正常增殖水平50%时的药物浓度。通常用IC50来衡量药物对细胞的毒性或者细胞对药物的耐受能力,在药物实验中,常用IC50来评估实验中使用的药物浓度。IC50的计算方法很多,常用的有Excel、graphpad prism、SPSS等。

01| 使用Excel计算IC50

首先将数据输入Excel中

抑制率

浓度

Lg(浓度)

21%

5

32%

10

1

47%

20

56%

30

67%

50

因为药物浓度与抑制率的线性关系并不理想,因此需要用药物浓度的对数与抑制率作图。

上图为药物浓度与抑制率作图,线性关系不好

药物浓度的对数与抑制率作图,线性关系理想

根据线性公式计算抑制率为50%时的Y值,计算10为底,计算值为指数的冥,结果即为IC50。

327 评论

蓝缀天堂鸟

IC50:半抑制浓度(或称半抑制率),即IC50,对指定的生物过程(或该过程中的某个组分比如酶、受体、细胞等)抑制一半时所需的药物或者抑制剂的浓度。药学中用于表征拮抗剂(antagonist)在体外实验(in vitro)中的拮抗能力。pIC50:pIC50=-log(IC50)EC50:是指在特定暴露时间后,能达到50%最大生物效应对应的药物、抗体或者毒素等的浓度。药学中除了用于表征体外实验中(in vitro)激动剂(agonist)的激活能力外,还可用于表示达到体内(in vivo)最大生物效应一半时所需的血药浓度。IC50不能直接等效于亲和力,但是两者还是有一定的数学关系的。对于酶促反应:Ki=IC50/(1+[S]/Km), Ki是抑制剂的结合亲和力, IC50是抑制剂的功能强度;[S]为股定的底物浓度,Km为酶促反应速度达到最大反应速度一半时所对应的底物浓度(注意,它不是酶和底物的亲和力),是酶的特征常数。如果底物浓度远小于Km值,IC50等于Ki。对于细胞受体的抑制常数:Ki=IC50/(1+[A]/EC50),[A]是固定的受体激动剂浓度,IC50的值会随这不同实验条件而变化,如酶浓度,底物浓度等。Ki是个常数。Ki:抑制常数(inhibition constant),反映的是抑制剂对靶标的抑制强度,这个值越小说明抑制能力越强,某些情况下可以与后文的Kd等同。Ki为50%的酶E被抑制剂I结合时对应的游离抑制剂的浓度。IC50与实验中所用酶的浓度、底物浓度都有关,而Ki是不受这些变量的影响的。Kd:解离常数(dissociation constant),反映的是化合物对靶标的亲和力大小,值越小亲和力越强。Kd=Koff/konKd为50%的酶E被抑制剂I结合时对应的游离抑制剂的浓度。某些情况下,可与Ki等同。Kd一般通过SPR等实验测定,一般不存在底物;而Ki测定时,是同时存在底物的,有底物参与竞争。所以一般测定的Ki会比Kd要大。Ka:结合常数(association constant),与Kd相反,值越大亲和力越强。Ka=1/KdKm:米氏常数(Michaelis-Menten constant),为酶本身的一种特征参数,其物理意义为当酶促反应达到最大反应速度一半时底物S的浓度。Km的大小只与酶的性质有关,而与酶的浓度无关,但是随着测定的底物不同、温度、离子强度和pH的不同而不同。当k2远远大于k3,Km近似等于ES的解离常数Kd。Km越小,意味着Kd越小,酶与底物的亲和力越高。Kon:结合速率常数(association rate constant),代表分子间结合时的快慢,单位为M-1∙S-1。在Biacore测定亲和力实验中,Kon越大代表达到最大RU时间越短,曲线斜率越陡峭。Koff:解离速率常数(dissociation rate constant),代表分子间解离时的快慢,单位为S-1。在Biacore测定亲和力实验中,Koff越大代表RU下降的速率越慢,曲线斜率越平缓。所以亲和力高的表现就是快结慢离。KD:其实就是Kd,在SPR测定亲和力实验中,经常看到他们的手册中把Kon写成Ka, Koff写成Kd,把Kd写成KD。这样一来,KD=Kd/Ka。

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