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减肥的小新
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蓝星鬼魅

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随着计算技术和生物技术的进步,当前生物医学文献正在以前所 未有的速度增长。这些文献中蕴含着最新的研究进展和丰富的生物医学知识,对于生物医学研究者具有重要意义。然而数以千万计的文献使得研究者追踪和整理自己 需要的知识和信息变得越来越困难。文本挖掘技术可以解决这一问题,帮助生物医学研究者提高从文献中获取知识和信息的效率。因此针对生物医学文献的文本挖掘 研究具有重要的应用价值。判别式模型是一类直接利用特征来预测目标变量的发生概率的机器学习模型,本文中主要用到的判别式模型有最大熵模型和条件随机域模 型。相对于产生式模型,判别式模型降低了特征之间的独立性假设的要求,并且与很多文本挖掘任务的需求相一致,因而更有可能取得好的效果。本文主要研究如何 利用判别式模型来解决生物医学文献挖掘中的问题。具体地,我们研究了生物医学文本挖掘中的三个任务:生物医学名实体识别、生物医学实体规范化以及生物医学 语义关系抽取。在这3任务中,第二个任务是第一个任务在语义处理上的延伸,前两个任务是第三个任务的基础。本文的主要内容包含以下4个方面。生物医学名实 体识别的目标是确定一个给定的文本集合内的某一类型的实体的名字的所有实例,它是进行深层次文本挖掘的必要步骤之一。本文在考察了生物医学领域实体识别的 特点和难点,分析了目前已有的生物医学实体识别方法的优缺点的基础上,提出了利用条件随机域模型结合丰富特征集来进行生物医学实体识别的方法。这些特征包 括:构词法特征、上下文特征和句法特征。其中,浅层句法特征是首次被引入到条件随机域模型中,同时用来进行实体的边界检测和类别判断。实验表明,这一特征 可以有效地提高名实体识别的效果。有监督的机器学习方法需要大规模的标注语料。大量的电子文献使得在生物医学领域获取未标记的语料已相当容易,但是对语料 进行标注仍然是一件昂贵的工作。针对在生物医学名实体识别中有监督学习所需的大规模训练语料比较难以获取的问题,本文提出了基于最大熵模型的协同训练的半 监督学习方法。该方法可以利用大量的未标注语料来提高在较少的标注语料的基础上学习到的分类器的名实体识别性能。为了进一步提高半监督学习的效果,本文将 主动学习引入到半监督学习的过程中。实验表明,基于最大熵模型的协同训练方法可以有效地提高初始分类器的识别性能。灵活的生物医学实体命名方式使得生物医 学实体具有严重的歧义。这已成为对生物医学文献进行深层自动文本挖掘的主要障碍之一。生物医学实体规范化的提出就是为了解决这一问题。生物医学实体规范化 就是把生物医学文献中表达同一概念的不同变体映射到统一的概念标识符。本文提出了一种用于生物医学实体规范化的多层歧义消解框架。实体规范化过程中不同阶 段有不同的歧义情形,在本文提出的框架中,针对这些情形采用了有针对性的解决策略,包括:基于词典的实体名字检测,基于机器学习方法的候选选择以及基于知 识的歧义消解。在BioCreAtIvE2006基因名字规范化任务的测试集上的实验表明本文提出的框架可以有效地解决规范化过程中的各种歧义。生物医学 语义关系抽取是生物医学文本挖掘的主要研究内容之一,是从无结构的生物医学文献中抽取出生物医学知识的重要手段。在实际应用中,生物医学语义关系的定义有 宽泛和具体之分。本文将宽泛定义和具体定义的生物医学语义关系抽取分别看作二分类和多分类问题,提出基于最大熵模型的生物医学语义关系抽取的方法。针对不 区分类别的蛋白质相互作用这种宽泛定义的关系抽取,提出了一种基于最大熵的二阶段蛋白质相互作用关系抽取方法。针对多类别的蛋白质相互作用这种具体定义的 关系抽取,提出使用最大熵模型结合词特征的抽取方法,该方法在一个具有10种蛋白质相互作用类别的数据集上取得了的总体精确率。同样的方法应用 到疾病与治疗方式关系抽取任务中,也取得了很好的实验结果。此外,本文还通过理论分析和实验对比,从理论和实践两个方面说明了判别式模型比产生式模型更适 合生物医学语义关系抽取问题。参考文献 [1] 王浩畅,赵铁军. 生物医学文本挖掘技术的研究与进展[J]. 中文信息学报. 2008(03) [2] 于中华,陈蓉,胡俊锋,陈源. 基于加权投票K—近邻法的生物医学缩略语消歧[J]. 中文信息学报. 2008(02) [3] 龙军,殷建平,祝恩,赵文涛. 主动学习研究综述[J]. 计算机研究与发展. 2008(S1)

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食尚峰汇

首先,可以去问下学长学姐或者导师,其次也是可以看下(生物医学)这本刊物上的文献

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送我个时光机

论文的大体框架都是一样的~无非你就是要找灵感~我个人是觉得你可以去看下(生物过程、计算生物学、微生物前沿)等等这类的生物领域的期刊~多看下学习下~找灵感总会有自己的思路的

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阳光365家具

温哥华格式出自国际医学期刊《生物医学期刊对原稿的统一要求》主要用于生物医学期刊的文章。

具体格式如:

1.标题:简明扼要、不过度使用术语、吸引读者的标题才是最适合您文章的,标题切忌冗长繁复。2.摘要:总结全文,清楚地阐明研究创新性,且会被广泛阅读,是论文最重要的部分。因此,写好摘要非常重要。3.引言:解释研究的必要性、重要性,必须展现研究的创新性。4.方法:做了什么,如何取得实验结果和结论,描述清楚。5.结果:围绕研究主题,按逻辑顺序分段叙述,层次要清楚,重点要突出。结果用文字、图表或照片加以表达。不引用文献,不对自己的结果进行分析和评价。指标明确,数据准确无误,对原始资料进行统计处理,假设检验应给出统计量、P值和可信区间。实验结果的顺序,不是按获得数据的先后排列,而是要按企图说明问题的逻辑顺序排列要学会合理使用图、表和文字说明。要敢于舍弃不必要的数据!6.讨论:应从结果出发,紧扣题目,以事实为依据,合理分析,肯定论点。实事求是,客观地进行分析,不可夸张,不可炫耀,不可提高自己,贬低别人。可以引用前人的文献中某些观点,结论,要加以注脚,但不可整段的应用。即:①对自己的实验结果进行分析判断,评价升华,从感性认识上升到理性认识,应揭示各种观察结果之间的联系,突出强调研究的创新之处。②可适当概述国内外对本课题的研究动态,从而衬托出新、异、优之处。③对实验或调查中出现的某些出乎意料之外的特殊现象,偶然结果可在讨论中作必要的说明,客观地进行解释。④对本研究的理论意义,实际应用的可能性,实事求是的加以论述,切忌夸张。紧密结合本文结果,突出本文的新发现,突出重点,注意逻辑性,对比本文结果与最新文献资料。

7.参考文献:反映论著的起点和深度,科学技术研究工作的继承性,为审阅者、编者和读者评估论著的价值和水平提供客观依据,方便检索和查找相关图书资料。综述类不低于25条,论著稿件不低于20条;其他稿件一般不少于15条。单条参考文献引用的文字叙述要尽量简短。引用文献的总字数不得超过全文字符数的25%、单篇文献的引用字数不得超过全文字数的10%。

编辑具备专业知识,对于自己工作领域的研究动态洞若观火,对于期刊的作者与读者群了若指掌。他们很清楚知道想要的是哪些类型的文章、哪些文章可以接受,也知道该研究领域读者们感兴趣的点。 多年来,编辑们反复重申几个很明确的要求:

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