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该院进行科学研究的领域较宽，包括地方性氟砷中毒的研究；新疆少数民族高血压遗传资源收集及基因多态性的研究；新疆哈萨克族食管癌防治研究；新疆自然长寿相关因素的研究；干旱环境对健康影响的研究；沙漠油田职业性危害的研究；新疆野生植物的抗突变、抗癌、抗衰老的研究；性病及艾滋病的预治研究；新疆特色天然植物资源的基础、开发、利用的研究等均取得了优异成绩。先后获得国家科技进步奖3项，全国科技大会一等奖1项，省部级科技进步奖18项，厅局级科技进步奖12项，获得国家发明专利3项，其中1项已完成专利转让。作为新疆预防医学高等教育和科学研究的重要基地，公共卫生学院全体教职员工正以饱满的热情，昂扬的斗志，抓住西部大开发的有利机遇，开拓进取，奋力拼搏，为21世纪的中国高等预防医学教育事业，再铸新的辉煌。