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巴德年，1938年10月27日出生于吉林省四平市。1949年，四平解放后巴德年开始上学，11岁的他直插二年级，用四年半读完小学。初中毕业后以优异的成绩被学校保送进四平重点高中。高中一年级时，他自修了几门高考必学的课程，被哈尔滨医科大学破格录取。1957年，巴德年就读于哈尔滨医科大学医学系，1962年毕业。学习期间曾获得卫生部全国医学院校俄语统考第二名。1964年，巴德年考取北京医科大学（原北京医学院）生物化学专业研究生，很快适应了俄语改为英语的转换。1967年以优异成绩毕业，获硕士学位。1978年，在哈尔滨医科大学教学岗位的巴德年，被学校推荐参加中国第一次出国选拔考试，以优异成绩顺利通过，遂前往日本北海道大学癌症研究所深造。1982年毕业获博士学位，成为该校获得医学博士学位的第一个外籍留学生，中国驻日大使馆特意为他举行庆功宴。 巴德年学成回中国后，把先进的思维带回哈尔滨医科大学，逐步从普通教授走上领导岗位，担任了哈尔滨医科大学副校长、黑龙江省肿瘤研究所所长等职务。 二十世纪80年代初，因其免疫学的研究有多项成果在国内国际处于领先水平，成为中国癌生物疗法的学术带头人之一。1990年至1992年，巴德年被派驻日本，任中国驻日本大使馆教育参赞。他在留学生中大力开展“将爱国主义思想转化为爱国主义行动”的活动，被当时中国驻其他国使馆的教育参赞们广为借鉴。 1992年9月，巴德年被国务院任命为中国医学科学院院长、中国协和医科大学校长，至2002年卸任。巴德年在从事医学教育管理、培养高层次医学精英人才的过程中，致力于高等医学教育改革并取得显著成绩。卸任前，他被院职工一致投票选为优秀共产党员。 1994年，巴德年当选为中国工程院院士，成为中国工程院成立后的第一批院士。至此，巴德年开始把目光投向更广范围的全国医疗体制，致力于中国医疗体制改革方案的探讨与研究，先后在中国国内外发表论文百余篇。 1999年，巴德年当选为美国国家科学院医学部外籍院士。 2003年，巴德年任浙江大学医学院院长。他全身心投入肿瘤免疫及机制研究、医疗体制改革方案探讨、医学教育管理等工作，启动了国际教育项目，加快了教育国际化进程。其科研和教改成果在中国处于领先水平 。 2000年至2008年，巴德年任《中华医学杂志》第24、25届编委会总编。在担任总编的8年里，每年通过“总编寄语”、“编者的话”撰写评论，为《中华医学杂志》和中国医学科学技术的提高与发展尽力。 2009年，巴德年卸任浙江大学医学院院长，被聘为名誉院长。同时卸任《中华医学杂志》总编，而任第26届编委会名誉总编。 卸任实职后，巴德年仍担任着一系列社会职务：中华医学会副会长，中国免疫学会名誉理事长，中国生物医学工程学会名誉理事长，国务院学位委员会委员。及至晚年，还躬身笔耕不断写出主题论文，并经常应邀请前往各大院校讲学或演讲。 2000年至2014年间，巴德年先后应邀参加“中国细胞治疗研究进展与临床前沿研讨会” 、“国际健康论坛” 、“海峡两岸医院院长论坛” 等重要峰会，与同仁分享他的学术思想；同时应邀赴复旦大学上海医学院 、内蒙古医科大学等十多所大学做了《关于当代医学与医学生》的讲座，为年轻人传递他的现代医学观，继续用他自己特有的方式为年轻人走向成功架桥铺路。

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