爱在身边111
以下文章来源于BioMan ,作者mBioMan在临床研究中,生存曲线(又称Kaplan-Meier曲线)是最常用图片之一,旨在描述各组患者的生存状况。一张漂亮的、专业的生存曲线图不仅可以令编辑、读者和审稿专家眼前一亮,同时也能为论文增色不少。然而,对于一些新手而言,生存曲线却显得十分陌生,不知道为何要绘制生存曲线,也不知道该如何解读生存曲线的结果。 如何解读生存曲线呢? (1)对于生存曲线,样本量越大,生存曲线越平滑,误差越小。(2)一般而言,两条曲线之间的距离越大(分叉越大),说明两组患者预后(终点事件发生率)的差别越大,也越容易做出统计学差异。其实这个和t检验差不多:两组数据的均数差异越大,越容易有统计学差异。 (3)随访时间越长,越容易做出统计学差异。这个问题其实也很好理解,一个极端的比方就是,在上述sST2例子中,假定随访时间为1天,而非400天,两组患者生存率的差异显然是没有统计学意义的。国际上,随访时间越长的研究越容易发表在高水平的杂志上,原因与此有关。 (4)样本量越大,越容易做出统计学差异。样本量越大,误差(标准误)越小,当然越有统计学意义。其实这相当于在t检验中,两组数据的标准差越小,当然越容易得到阳性统计学结果。 (5)生存曲线与X轴有交叉,并不意味着研究对象全部死亡(发生终点事件)。实际上,在生存曲线中,每一个时间点上只要有病人死亡(或者发生终点事件),曲线就会下降一定的幅度。(参考知乎oriRNA) 接下来,我们就用Graphpad prism9,和大家一起看看如何绘制生存曲线。 1. Survival curve-生存曲线 在有关差异表达基因和生物标志物模型分析中,经常会见到生存曲线分析。 (1)创建(2)写入/导入数据(3)Graphs(4)结果,治疗组与对照组没有显著性差异。(5)调整后的Graphs 双击图,弹出如下窗口,就可以编辑line的颜色等等。(6)双击Y轴添加参考线。大多数研究会讨论中位生存时间。 双击Y轴,在”Additionalticks and grid lines“中写入 (如果开始作图时选择”Percents“这里应写入50)点选 TickLine在Details按钮中选择参考线的颜色和线型即可。同样,也可以去添加X轴的参考线。沃斯(WOSCI)由耶鲁大学博士团队匠心打造,专注最新科学动态并提供各类科研学术指导,包括:前沿科学新闻、出版信息、期刊解析、论文写作技巧、学术讲座、论文润色等。
我与食俱进
现在很多期刊对图片的分辨率、格式和文字标注都有明确的要求。因此确定好目标期刊后,应该根据期刊的《投稿须知》来修改文章的图片。
处理照片的工具
文章里的图片一般来自照片、作图软件或者数学处理软件做出来的图形。用合适的工具来处理不同类型的图,可以达到事半功倍的效果。处理照片的工具,重量级的有Photoshop,轻量级的有ACDSee跟画图板,个人是比较推荐GIMP。因为它不仅是个功能非常强大的开源软件,而且还支持很多种格式的导入和导出。常用的数学处理软件有MatLab 跟Origin。其中Origin可以做出非常专业的图形。当然Excel也是个很不错的选择。流程图用Visio或者PPT就差不多满足所有需求了。
在图片的使用上,有一些地方容易出问题,需要注意:
其他小细节:
最後最後
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是要投到杂志社吗? 标题 作者姓名1 ,作者姓名2 (1. 作者单位正式对外名称,省份 城市 邮编;2.作者单位正式对外名称,省份 城市 邮编)
有,跟古代的八股文一样,格式讲究起承转合,内容安排上龙头,猪肚、凤尾。
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